MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022221	GC	3	6	305122	305127	0 %	0 %	50 %	50 %	537435631
6502	NC_022221	GTG	2	6	305145	305150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435631
6503	NC_022221	GCG	2	6	305160	305165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435631
6504	NC_022221	GCG	2	6	305181	305186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435631
6505	NC_022221	GGCGG	2	10	305202	305211	0 %	0 %	80 %	20 %	537435631
6506	NC_022221	TTG	2	6	305242	305247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435631
6507	NC_022221	GAT	2	6	305256	305261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435631
6508	NC_022221	GTG	2	6	305283	305288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435631
6509	NC_022221	ACG	2	6	305289	305294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435631
6510	NC_022221	GCG	2	6	305385	305390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435631
6511	NC_022221	CG	3	6	305389	305394	0 %	0 %	50 %	50 %	537435631
6512	NC_022221	CGA	2	6	305399	305404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435631
6513	NC_022221	TGC	2	6	305470	305475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435631
6514	NC_022221	GTG	2	6	305483	305488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435631
6515	NC_022221	CG	3	6	305530	305535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_022221	GCC	2	6	305613	305618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_022221	GTT	2	6	305676	305681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435632
6518	NC_022221	A	6	6	305719	305724	100 %	0 %	0 %	0 %	537435632
6519	NC_022221	AG	3	6	305737	305742	50 %	0 %	50 %	0 %	537435632
6520	NC_022221	TGG	2	6	305771	305776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435632
6521	NC_022221	AAT	2	6	305788	305793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435632
6522	NC_022221	T	6	6	305800	305805	0 %	100 %	0 %	0 %	537435632
6523	NC_022221	AAG	2	6	305828	305833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435632
6524	NC_022221	GCCTG	2	10	305915	305924	0 %	20 %	40 %	40 %	537435632
6525	NC_022221	GC	3	6	305965	305970	0 %	0 %	50 %	50 %	537435632
6526	NC_022221	CGG	2	6	306052	306057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435632
6527	NC_022221	CAC	2	6	306136	306141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435632
6528	NC_022221	GCG	2	6	306192	306197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435632
6529	NC_022221	TCA	2	6	306272	306277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435632
6530	NC_022221	CTT	2	6	306353	306358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_022221	TCA	2	6	306478	306483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022221	TA	4	8	306543	306550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_022221	CAA	2	6	306559	306564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_022221	CCGA	2	8	306592	306599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_022221	AAT	2	6	306605	306610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_022221	ACG	2	6	306665	306670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435633
6537	NC_022221	CTG	2	6	306673	306678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435633
6538	NC_022221	GCT	2	6	306690	306695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435633
6539	NC_022221	GC	3	6	306715	306720	0 %	0 %	50 %	50 %	537435633
6540	NC_022221	AACGTT	2	12	306850	306861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537435633
6541	NC_022221	CGT	2	6	306865	306870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435633
6542	NC_022221	CAG	2	6	306970	306975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435633
6543	NC_022221	TAA	2	6	307026	307031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_022221	A	6	6	307081	307086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_022221	CAG	2	6	307106	307111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_022221	CA	3	6	307188	307193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_022221	AAT	2	6	307301	307306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_022221	CCG	2	6	307375	307380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_022221	TGG	2	6	307387	307392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_022221	GCCA	2	8	307404	307411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_022221	ATGA	2	8	307445	307452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_022221	CAG	2	6	307496	307501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_022221	GAC	2	6	307505	307510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_022221	TGC	2	6	307571	307576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_022221	A	7	7	307711	307717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_022221	T	6	6	307724	307729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_022221	TGG	2	6	307758	307763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_022221	TTA	2	6	307782	307787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435634
6559	NC_022221	TGC	2	6	307841	307846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435634
6560	NC_022221	CGG	2	6	308029	308034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435634
6561	NC_022221	T	6	6	308196	308201	0 %	100 %	0 %	0 %	537435634
6562	NC_022221	ATG	2	6	308214	308219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435634
6563	NC_022221	GCA	2	6	308233	308238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435634
6564	NC_022221	CGCTGG	2	12	308253	308264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435634
6565	NC_022221	TCA	3	9	308328	308336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435634
6566	NC_022221	GT	3	6	308443	308448	0 %	50 %	50 %	0 %	537435634
6567	NC_022221	GCT	2	6	308450	308455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435634
6568	NC_022221	GC	3	6	308535	308540	0 %	0 %	50 %	50 %	537435634
6569	NC_022221	CAT	2	6	308570	308575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435634
6570	NC_022221	A	7	7	308648	308654	100 %	0 %	0 %	0 %	537435634
6571	NC_022221	ATC	2	6	308679	308684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435635
6572	NC_022221	GCTTG	2	10	308719	308728	0 %	40 %	40 %	20 %	537435635
6573	NC_022221	T	6	6	308744	308749	0 %	100 %	0 %	0 %	537435635
6574	NC_022221	CG	3	6	308772	308777	0 %	0 %	50 %	50 %	537435635
6575	NC_022221	T	6	6	308797	308802	0 %	100 %	0 %	0 %	537435635
6576	NC_022221	T	6	6	308827	308832	0 %	100 %	0 %	0 %	537435635
6577	NC_022221	TCA	2	6	308885	308890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435635
6578	NC_022221	CG	3	6	308895	308900	0 %	0 %	50 %	50 %	537435635
6579	NC_022221	CAG	2	6	308935	308940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435635
6580	NC_022221	GTCG	2	8	309100	309107	0 %	25 %	50 %	25 %	537435635
6581	NC_022221	TTG	2	6	309194	309199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435635
6582	NC_022221	GTA	2	6	309337	309342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435635
6583	NC_022221	CAG	2	6	309406	309411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435635
6584	NC_022221	ATCGC	2	10	309431	309440	20 %	20 %	20 %	40 %	537435635
6585	NC_022221	TCT	2	6	309587	309592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435635
6586	NC_022221	TA	3	6	309595	309600	50 %	50 %	0 %	0 %	537435635
6587	NC_022221	GCA	2	6	309603	309608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435635
6588	NC_022221	CGT	2	6	309616	309621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435635
6589	NC_022221	CGC	2	6	309678	309683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435635
6590	NC_022221	GCG	2	6	309786	309791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435635
6591	NC_022221	T	6	6	309799	309804	0 %	100 %	0 %	0 %	537435635
6592	NC_022221	TGC	2	6	309824	309829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435635
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6594	NC_022221	GCC	2	6	309848	309853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435635
6595	NC_022221	GGC	2	6	309916	309921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435635
6596	NC_022221	CAG	2	6	309970	309975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435635
6597	NC_022221	TCG	2	6	309980	309985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435635
6598	NC_022221	TG	3	6	310028	310033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_022221	T	6	6	310125	310130	0 %	100 %	0 %	0 %	537435636
6600	NC_022221	GTT	2	6	310136	310141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435636
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6602	NC_022221	T	6	6	310198	310203	0 %	100 %	0 %	0 %	537435636
6603	NC_022221	CTG	2	6	310315	310320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435637
6604	NC_022221	CGGA	2	8	310339	310346	25 %	0 %	50 %	25 %	537435637
6605	NC_022221	TTA	2	6	310499	310504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435637
6606	NC_022221	TTA	2	6	310518	310523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435637
6607	NC_022221	CGC	2	6	310547	310552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435637
6608	NC_022221	GCG	2	6	310609	310614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435637
6609	NC_022221	T	7	7	310636	310642	0 %	100 %	0 %	0 %	537435637
6610	NC_022221	GCA	2	6	310680	310685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435637
6611	NC_022221	GC	3	6	310741	310746	0 %	0 %	50 %	50 %	537435637
6612	NC_022221	ATT	2	6	310832	310837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435637
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6614	NC_022221	CT	3	6	310963	310968	0 %	50 %	0 %	50 %	537435638
6615	NC_022221	CAT	2	6	310974	310979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435638
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6618	NC_022221	GC	3	6	311104	311109	0 %	0 %	50 %	50 %	537435638
6619	NC_022221	TCG	2	6	311120	311125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435638
6620	NC_022221	CAG	2	6	311154	311159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435638
6621	NC_022221	CAC	2	6	311187	311192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435638
6622	NC_022221	TGC	2	6	311283	311288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435638
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6624	NC_022221	GAC	2	6	311415	311420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435638
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6626	NC_022221	ATCC	2	8	311478	311485	25 %	25 %	0 %	50 %	537435638
6627	NC_022221	ATC	2	6	311509	311514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435638
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6992	NC_022221	CGC	2	6	329744	329749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435657
6993	NC_022221	GCT	2	6	329793	329798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435657
6994	NC_022221	CGC	2	6	329828	329833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435657
6995	NC_022221	GCA	2	6	329844	329849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435657
6996	NC_022221	GCC	2	6	329886	329891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6997	NC_022221	GCC	2	6	330065	330070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435658
6998	NC_022221	AAT	2	6	330093	330098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435658
6999	NC_022221	TG	3	6	330175	330180	0 %	50 %	50 %	0 %	537435658
7000	NC_022221	GC	4	8	330230	330237	0 %	0 %	50 %	50 %	537435658

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