MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022221	CTG	2	6	231042	231047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
5002	NC_022221	ATT	2	6	231048	231053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435570
5003	NC_022221	GCC	2	6	231060	231065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435570
5004	NC_022221	GCG	2	6	231070	231075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570
5005	NC_022221	CGC	2	6	231082	231087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435570
5006	NC_022221	TGC	2	6	231133	231138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
5007	NC_022221	ATG	2	6	231141	231146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435570
5008	NC_022221	GCG	2	6	231157	231162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570
5009	NC_022221	CGC	2	6	231282	231287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435570
5010	NC_022221	GCG	2	6	231310	231315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570
5011	NC_022221	CG	5	10	231320	231329	0 %	0 %	50 %	50 %	537435570
5012	NC_022221	GCT	2	6	231362	231367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
5013	NC_022221	GGC	2	6	231374	231379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570
5014	NC_022221	CGA	2	6	231397	231402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435570
5015	NC_022221	CGG	2	6	231571	231576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570
5016	NC_022221	GC	3	6	231598	231603	0 %	0 %	50 %	50 %	537435570
5017	NC_022221	A	8	8	231640	231647	100 %	0 %	0 %	0 %	537435570
5018	NC_022221	CAATAT	2	12	231704	231715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537435571
5019	NC_022221	CTGTC	2	10	231771	231780	0 %	40 %	20 %	40 %	537435571
5020	NC_022221	AAG	2	6	231817	231822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435571
5021	NC_022221	GC	3	6	231866	231871	0 %	0 %	50 %	50 %	537435571
5022	NC_022221	TGA	2	6	231924	231929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_022221	AAT	2	6	231952	231957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_022221	TAA	3	9	232046	232054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_022221	ATA	2	6	232075	232080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_022221	ATT	2	6	232085	232090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_022221	T	7	7	232089	232095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_022221	TAA	2	6	232103	232108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_022221	A	6	6	232107	232112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_022221	AAAT	2	8	232124	232131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_022221	A	7	7	232150	232156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_022221	T	6	6	232169	232174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_022221	T	8	8	232176	232183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_022221	AAAT	2	8	232201	232208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_022221	TA	3	6	232224	232229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_022221	T	7	7	232251	232257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_022221	T	7	7	232280	232286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022221	CTTG	2	8	232298	232305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_022221	TTTG	2	8	232307	232314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_022221	T	6	6	232315	232320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_022221	TAT	2	6	232337	232342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_022221	TGA	2	6	232350	232355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022221	TAAA	2	8	232361	232368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_022221	A	6	6	232366	232371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022221	CG	3	6	232408	232413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_022221	TTAT	2	8	232423	232430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_022221	GTT	2	6	232437	232442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022221	CTT	2	6	232445	232450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_022221	ATATA	2	10	232484	232493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_022221	CTA	2	6	232497	232502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_022221	TAA	2	6	232565	232570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022221	CAG	2	6	232587	232592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435572
5053	NC_022221	TGC	2	6	232606	232611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435572
5054	NC_022221	TGC	2	6	232645	232650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435572
5055	NC_022221	CGA	2	6	232720	232725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435572
5056	NC_022221	CAC	2	6	232828	232833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435572
5057	NC_022221	AAG	2	6	232839	232844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435572
5058	NC_022221	CGG	3	9	232915	232923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435572
5059	NC_022221	ACC	2	6	232956	232961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435572
5060	NC_022221	GCG	3	9	233024	233032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435572
5061	NC_022221	CAG	2	6	233104	233109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435572
5062	NC_022221	ATC	2	6	233148	233153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_022221	A	7	7	233188	233194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_022221	TA	3	6	233200	233205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_022221	A	6	6	233238	233243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_022221	GTG	2	6	233268	233273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_022221	GAT	2	6	233355	233360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_022221	TC	3	6	233372	233377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_022221	ATC	2	6	233416	233421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_022221	TTA	2	6	233464	233469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_022221	ATA	2	6	233482	233487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_022221	GCT	2	6	233534	233539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_022221	ATT	2	6	233661	233666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_022221	TAT	2	6	233740	233745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_022221	ATG	2	6	233785	233790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_022221	GGTG	2	8	233825	233832	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_022221	GC	3	6	233855	233860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_022221	GGCG	2	8	233962	233969	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_022221	GGC	2	6	234048	234053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_022221	CGA	2	6	234065	234070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_022221	AT	3	6	234109	234114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_022221	GC	3	6	234123	234128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_022221	GCGG	2	8	234157	234164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_022221	GAA	2	6	234252	234257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022221	GGC	2	6	234381	234386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_022221	CCT	2	6	234406	234411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_022221	CGG	2	6	234440	234445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_022221	GCT	2	6	234503	234508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_022221	TGA	2	6	234623	234628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_022221	GAA	2	6	234669	234674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_022221	TGA	2	6	234950	234955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_022221	CAA	2	6	234989	234994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_022221	ACA	3	9	235030	235038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_022221	CG	3	6	235101	235106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_022221	TCA	2	6	235139	235144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_022221	CGG	2	6	235202	235207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_022221	GCACC	2	10	235256	235265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5098	NC_022221	CGG	2	6	235274	235279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_022221	TGG	2	6	235291	235296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_022221	TA	3	6	235345	235350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022221	ACT	2	6	235390	235395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_022221	CGC	2	6	235497	235502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_022221	A	6	6	235521	235526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_022221	GGC	2	6	235554	235559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022221	CGC	2	6	235561	235566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_022221	ACA	2	6	235585	235590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_022221	GCG	2	6	235701	235706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_022221	TGC	2	6	235747	235752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_022221	TCA	2	6	235770	235775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_022221	GCG	2	6	235826	235831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_022221	CT	3	6	235857	235862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_022221	ATG	2	6	235901	235906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435573
5113	NC_022221	TGC	2	6	235938	235943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435573
5114	NC_022221	GGC	2	6	235952	235957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435573
5115	NC_022221	GCC	2	6	235973	235978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435573
5116	NC_022221	TCACC	2	10	236109	236118	20 %	20 %	0 %	60 %	537435573
5117	NC_022221	TCG	2	6	236124	236129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435573
5118	NC_022221	T	6	6	236226	236231	0 %	100 %	0 %	0 %	537435573
5119	NC_022221	T	6	6	236310	236315	0 %	100 %	0 %	0 %	537435573
5120	NC_022221	GCA	2	6	236347	236352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435573
5121	NC_022221	TAC	2	6	236420	236425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435573
5122	NC_022221	GTG	2	6	236426	236431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435573
5123	NC_022221	GC	3	6	236577	236582	0 %	0 %	50 %	50 %	537435573
5124	NC_022221	ACA	2	6	236610	236615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435573
5125	NC_022221	GCA	2	6	236744	236749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435574
5126	NC_022221	GCCGC	2	10	236792	236801	0 %	0 %	40 %	60 %	537435574
5127	NC_022221	CGG	2	6	236815	236820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435574
5128	NC_022221	GAC	2	6	236845	236850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435574
5129	NC_022221	GC	3	6	237027	237032	0 %	0 %	50 %	50 %	537435574
5130	NC_022221	GCG	2	6	237075	237080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435574
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5134	NC_022221	TAA	2	6	237206	237211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_022221	GCA	2	6	237212	237217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_022221	CGG	3	9	237458	237466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5165	NC_022221	A	8	8	239077	239084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5244	NC_022221	CTTC	2	8	242419	242426	0 %	50 %	0 %	50 %	537435579
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5250	NC_022221	CGC	2	6	242769	242774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435580
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5252	NC_022221	TTGG	2	8	242913	242920	0 %	50 %	50 %	0 %	537435580
5253	NC_022221	CAG	2	6	242926	242931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435580
5254	NC_022221	CGA	2	6	242958	242963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435580
5255	NC_022221	CGC	2	6	243030	243035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435580
5256	NC_022221	ACG	2	6	243047	243052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435580
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5259	NC_022221	ATA	2	6	243242	243247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435581
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5261	NC_022221	GTC	2	6	243452	243457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435581
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5264	NC_022221	CTGC	2	8	243591	243598	0 %	25 %	25 %	50 %	537435581
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5271	NC_022221	CGGG	2	8	243831	243838	0 %	0 %	75 %	25 %	537435581
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5285	NC_022221	CGT	2	6	244390	244395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435582
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5293	NC_022221	ATCG	2	8	244777	244784	25 %	25 %	25 %	25 %	537435583
5294	NC_022221	TCG	2	6	244810	244815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435583
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5322	NC_022221	A	7	7	246422	246428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5323	NC_022221	CGG	2	6	246492	246497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5324	NC_022221	CAG	2	6	246527	246532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5328	NC_022221	CAG	2	6	246638	246643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435584
5329	NC_022221	GCG	2	6	246711	246716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435584
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5331	NC_022221	CGG	2	6	246730	246735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435584
5332	NC_022221	CAA	2	6	246737	246742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435584
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5345	NC_022221	GCA	2	6	247500	247505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435584
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5352	NC_022221	TTA	2	6	247716	247721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435584
5353	NC_022221	CAG	2	6	247733	247738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435584
5354	NC_022221	GTG	2	6	247812	247817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435584
5355	NC_022221	TATT	2	8	247825	247832	25 %	75 %	0 %	0 %	537435584
5356	NC_022221	C	6	6	247898	247903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5357	NC_022221	TGCTC	2	10	247976	247985	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5358	NC_022221	AGG	2	6	247988	247993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5359	NC_022221	TGGC	2	8	248000	248007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5360	NC_022221	GC	3	6	248040	248045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5361	NC_022221	CAT	2	6	248054	248059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5362	NC_022221	TAT	2	6	248096	248101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_022221	GCG	2	6	248107	248112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5364	NC_022221	GC	3	6	248143	248148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5365	NC_022221	GT	3	6	248316	248321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_022221	ATG	2	6	248334	248339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_022221	TGA	2	6	248401	248406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_022221	GAA	2	6	248421	248426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_022221	TGG	2	6	248440	248445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_022221	GGC	2	6	248489	248494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NC_022221	GGT	2	6	248495	248500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_022221	CAG	2	6	248550	248555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_022221	AAC	2	6	248586	248591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NC_022221	TGG	2	6	248620	248625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_022221	ATC	2	6	248671	248676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5376	NC_022221	AGC	2	6	248689	248694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5377	NC_022221	CCGGG	2	10	248758	248767	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5378	NC_022221	GC	3	6	248793	248798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5379	NC_022221	GAT	2	6	248804	248809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_022221	TGC	2	6	248863	248868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5383	NC_022221	GC	3	6	248916	248921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5384	NC_022221	AAC	2	6	248949	248954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5385	NC_022221	TTA	2	6	248958	248963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_022221	CGG	2	6	249156	249161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5387	NC_022221	AT	3	6	249187	249192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_022221	AC	3	6	249232	249237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5389	NC_022221	CTTA	2	8	249240	249247	25 %	50 %	0 %	25 %	537435585
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5399	NC_022221	CCA	2	6	249686	249691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5400	NC_022221	A	7	7	249700	249706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_022221	AGA	2	6	249721	249726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_022221	GCG	2	6	249754	249759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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