MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

< Previous12...2526272829303132333435...197198Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_021984	GCA	2	6	681606	681611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219226
14503	NC_021984	GAG	2	6	681692	681697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219226
14504	NC_021984	CGG	2	6	681817	681822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219226
14505	NC_021984	CCA	2	6	681852	681857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219226
14506	NC_021984	GCCAG	2	10	681918	681927	20 %	0 %	40 %	40 %	529219226
14507	NC_021984	GAG	2	6	681938	681943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219226
14508	NC_021984	CTG	2	6	681973	681978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219226
14509	NC_021984	CGG	2	6	681992	681997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219226
14510	NC_021984	CGA	2	6	682002	682007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219226
14511	NC_021984	AG	3	6	682039	682044	50 %	0 %	50 %	0 %	529219226
14512	NC_021984	GGTAG	2	10	682055	682064	20 %	20 %	60 %	0 %	529219226
14513	NC_021984	ATA	2	6	682099	682104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219226
14514	NC_021984	ATA	2	6	682237	682242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219226
14515	NC_021984	GTG	2	6	682295	682300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219226
14516	NC_021984	GCG	2	6	682301	682306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219226
14517	NC_021984	TGT	2	6	682308	682313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219226
14518	NC_021984	GTGA	2	8	682366	682373	25 %	25 %	50 %	0 %	529219226
14519	NC_021984	CAG	2	6	682447	682452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219226
14520	NC_021984	AAG	2	6	682469	682474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219226
14521	NC_021984	GACT	2	8	682529	682536	25 %	25 %	25 %	25 %	529219226
14522	NC_021984	TGAAGG	2	12	682568	682579	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_021984	AATG	2	8	682594	682601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_021984	CGG	2	6	682650	682655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_021984	ACT	2	6	682701	682706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_021984	ATT	2	6	682736	682741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_021984	GT	3	6	682823	682828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_021984	A	6	6	682832	682837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_021984	A	8	8	682841	682848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_021984	TAA	2	6	682908	682913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_021984	ATG	2	6	682923	682928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_021984	TCA	2	6	682989	682994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_021984	AT	3	6	683026	683031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_021984	A	6	6	683071	683076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_021984	ATT	2	6	683157	683162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_021984	A	6	6	683228	683233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_021984	TAA	2	6	683259	683264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_021984	CCT	2	6	683286	683291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219227
14539	NC_021984	CTG	2	6	683302	683307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14540	NC_021984	GGCG	2	8	683310	683317	0 %	0 %	75 %	25 %	529219227
14541	NC_021984	TAA	2	6	683340	683345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219227
14542	NC_021984	CAA	2	6	683352	683357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219227
14543	NC_021984	ACT	2	6	683390	683395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219227
14544	NC_021984	GAC	2	6	683401	683406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14545	NC_021984	GCA	2	6	683528	683533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14546	NC_021984	ATG	2	6	683621	683626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219227
14547	NC_021984	CCT	2	6	683630	683635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219227
14548	NC_021984	CGG	2	6	683658	683663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219227
14549	NC_021984	GCA	2	6	683691	683696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14550	NC_021984	CTT	2	6	683733	683738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219227
14551	NC_021984	TGG	2	6	683744	683749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219227
14552	NC_021984	CTG	2	6	683824	683829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14553	NC_021984	CGG	2	6	683850	683855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219227
14554	NC_021984	CAC	2	6	683904	683909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219227
14555	NC_021984	AAC	2	6	683932	683937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219227
14556	NC_021984	CGG	2	6	683988	683993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219227
14557	NC_021984	AAC	2	6	684010	684015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219227
14558	NC_021984	ATCT	2	8	684016	684023	25 %	50 %	0 %	25 %	529219227
14559	NC_021984	CAA	2	6	684078	684083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219227
14560	NC_021984	CAA	2	6	684108	684113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219227
14561	NC_021984	CGTC	2	8	684163	684170	0 %	25 %	25 %	50 %	529219227
14562	NC_021984	TAC	2	6	684271	684276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219227
14563	NC_021984	CAA	2	6	684279	684284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219227
14564	NC_021984	CTG	2	6	684319	684324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14565	NC_021984	CGA	2	6	684363	684368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219227
14566	NC_021984	T	6	6	684438	684443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_021984	ACG	2	6	684468	684473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_021984	GT	3	6	684541	684546	0 %	50 %	50 %	0 %	529219228
14569	NC_021984	GGC	3	9	684549	684557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219228
14570	NC_021984	T	6	6	684558	684563	0 %	100 %	0 %	0 %	529219228
14571	NC_021984	ACA	2	6	684595	684600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219228
14572	NC_021984	CGC	2	6	684684	684689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219228
14573	NC_021984	TGA	2	6	684726	684731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219228
14574	NC_021984	TC	3	6	685059	685064	0 %	50 %	0 %	50 %	529219228
14575	NC_021984	GCG	2	6	685084	685089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219228
14576	NC_021984	ATC	2	6	685091	685096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219228
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14578	NC_021984	GCG	2	6	685148	685153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219228
14579	NC_021984	CCGA	2	8	685213	685220	25 %	0 %	25 %	50 %	529219228
14580	NC_021984	GGCAT	2	10	685259	685268	20 %	20 %	40 %	20 %	529219228
14581	NC_021984	GCG	2	6	685464	685469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219228
14582	NC_021984	AAG	2	6	685499	685504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219228
14583	NC_021984	CGC	2	6	685529	685534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219228
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14585	NC_021984	AAGC	2	8	685620	685627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14586	NC_021984	ATG	2	6	685650	685655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_021984	A	6	6	685656	685661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_021984	TTAC	2	8	685665	685672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14589	NC_021984	GAT	2	6	685674	685679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_021984	GCTG	2	8	685684	685691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14591	NC_021984	GC	3	6	685701	685706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14592	NC_021984	CGTTT	2	10	685725	685734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14593	NC_021984	T	6	6	685756	685761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_021984	GCC	2	6	685762	685767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14595	NC_021984	CTT	2	6	685768	685773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_021984	T	6	6	685809	685814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_021984	GC	5	10	685878	685887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14598	NC_021984	CGG	2	6	685893	685898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_021984	GCCTGC	2	12	685911	685922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14600	NC_021984	GCA	2	6	686042	686047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_021984	GC	3	6	686054	686059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14602	NC_021984	CGG	2	6	686061	686066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14603	NC_021984	CGG	2	6	686101	686106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14604	NC_021984	CTA	2	6	686141	686146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14605	NC_021984	GGC	2	6	686196	686201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_021984	ACGG	2	8	686242	686249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14607	NC_021984	TGG	2	6	686254	686259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_021984	GAGC	2	8	686264	686271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14609	NC_021984	CGA	2	6	686303	686308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_021984	AC	3	6	686327	686332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14611	NC_021984	G	11	11	686393	686403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_021984	AC	3	6	686418	686423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14613	NC_021984	TGC	2	6	686430	686435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_021984	CAG	2	6	686474	686479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_021984	GCG	2	6	686508	686513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_021984	CGG	2	6	686559	686564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_021984	CG	3	6	686567	686572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14618	NC_021984	CAG	2	6	686578	686583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14619	NC_021984	GCG	2	6	686589	686594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14620	NC_021984	GC	3	6	686646	686651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14621	NC_021984	GCGT	2	8	686670	686677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14622	NC_021984	TGA	2	6	686742	686747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219229
14623	NC_021984	GGCGC	2	10	686776	686785	0 %	0 %	60 %	40 %	529219229
14624	NC_021984	CAGT	2	8	686817	686824	25 %	25 %	25 %	25 %	529219229
14625	NC_021984	GGC	2	6	686851	686856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219229
14626	NC_021984	ACC	2	6	686902	686907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219229
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14750	NC_021984	TGGCG	2	10	693453	693462	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14751	NC_021984	CG	4	8	693483	693490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14752	NC_021984	GC	3	6	693518	693523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14753	NC_021984	TGAA	2	8	693524	693531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14754	NC_021984	TG	3	6	693550	693555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14755	NC_021984	TG	3	6	693657	693662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14756	NC_021984	TGA	2	6	693724	693729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14757	NC_021984	TGC	2	6	693750	693755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14759	NC_021984	GCTGGA	2	12	693841	693852	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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14761	NC_021984	GGCT	2	8	694019	694026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14775	NC_021984	CACC	2	8	694802	694809	25 %	0 %	0 %	75 %	529222044
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14802	NC_021984	TGA	2	6	696093	696098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14848	NC_021984	TGGCGG	2	12	697311	697322	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	530331564
14849	NC_021984	CGGCG	2	10	697420	697429	0 %	0 %	60 %	40 %	530331564
14850	NC_021984	TGG	2	6	697454	697459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530331564
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14852	NC_021984	TGC	2	6	697491	697496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530331564
14853	NC_021984	GAC	2	6	697538	697543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530331564
14854	NC_021984	GC	3	6	697558	697563	0 %	0 %	50 %	50 %	530331564
14855	NC_021984	GTG	2	6	697589	697594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530331564
14856	NC_021984	GTG	2	6	697624	697629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530331564
14857	NC_021984	GCA	2	6	697660	697665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530331564
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14860	NC_021984	GATGCG	2	12	697744	697755	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530331564
14861	NC_021984	CGC	2	6	697781	697786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530331564
14862	NC_021984	T	6	6	697854	697859	0 %	100 %	0 %	0 %	529222046
14863	NC_021984	T	6	6	697879	697884	0 %	100 %	0 %	0 %	529222046
14864	NC_021984	CTGG	2	8	697887	697894	0 %	25 %	50 %	25 %	529222046
14865	NC_021984	TGC	2	6	697922	697927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222046
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14867	NC_021984	GCG	2	6	697967	697972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222046
14868	NC_021984	GCA	2	6	697977	697982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222046
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14870	NC_021984	AGG	2	6	698024	698029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222046
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14874	NC_021984	GCA	2	6	698183	698188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219237
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14990	NC_021984	GGA	2	6	701725	701730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14991	NC_021984	CCG	2	6	701734	701739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14992	NC_021984	CGG	2	6	701740	701745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14993	NC_021984	GCT	2	6	701749	701754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14994	NC_021984	AGC	3	9	701823	701831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14995	NC_021984	GGC	2	6	701848	701853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14996	NC_021984	GAT	2	6	701860	701865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14997	NC_021984	CTG	2	6	701873	701878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14998	NC_021984	CGG	2	6	701880	701885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14999	NC_021984	CGG	2	6	701894	701899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15000	NC_021984	GGCGC	2	10	701959	701968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

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