MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021984	TCA	2	6	45157	45162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221974
1002	NC_021984	GAC	2	6	45233	45238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221974
1003	NC_021984	AGG	2	6	45306	45311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529221974
1004	NC_021984	CGT	2	6	45358	45363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021984	AAT	2	6	45374	45379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021984	TGA	2	6	45433	45438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530331570
1007	NC_021984	CCG	2	6	45455	45460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530331570
1008	NC_021984	GTG	2	6	45488	45493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530331570
1009	NC_021984	ATGA	2	8	45497	45504	50 %	25 %	25 %	0 %	530331570
1010	NC_021984	GC	3	6	45546	45551	0 %	0 %	50 %	50 %	530331570
1011	NC_021984	CAG	2	6	45587	45592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530331570
1012	NC_021984	TGA	2	6	45631	45636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530331570
1013	NC_021984	GCT	2	6	45712	45717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530331570
1014	NC_021984	TAC	2	6	45782	45787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530331570
1015	NC_021984	AACG	2	8	45799	45806	50 %	0 %	25 %	25 %	530331570
1016	NC_021984	ATC	2	6	45875	45880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021984	TGAC	2	8	45883	45890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_021984	A	6	6	45897	45902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021984	A	6	6	45931	45936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021984	TCA	2	6	45945	45950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021984	TA	3	6	45951	45956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021984	TAG	2	6	45991	45996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021984	GAA	2	6	46001	46006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021984	GA	3	6	46018	46023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021984	T	6	6	46049	46054	0 %	100 %	0 %	0 %	529218813
1026	NC_021984	AGC	2	6	46055	46060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218813
1027	NC_021984	CAT	2	6	46075	46080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218813
1028	NC_021984	TCA	2	6	46083	46088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218813
1029	NC_021984	CGC	2	6	46090	46095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218813
1030	NC_021984	CAA	2	6	46195	46200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218813
1031	NC_021984	TGT	2	6	46209	46214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218813
1032	NC_021984	GCC	2	6	46328	46333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218813
1033	NC_021984	CGG	2	6	46336	46341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218813
1034	NC_021984	GAT	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218813
1035	NC_021984	ACT	2	6	46377	46382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218813
1036	NC_021984	GGGCT	2	10	46402	46411	0 %	20 %	60 %	20 %	529218813
1037	NC_021984	ATC	2	6	46511	46516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218813
1038	NC_021984	GAT	2	6	46517	46522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218813
1039	NC_021984	TTA	2	6	46536	46541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218813
1040	NC_021984	GGC	2	6	46588	46593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218813
1041	NC_021984	GCT	2	6	46615	46620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218813
1042	NC_021984	GCG	2	6	46629	46634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218813
1043	NC_021984	TA	3	6	46650	46655	50 %	50 %	0 %	0 %	529218813
1044	NC_021984	CGG	2	6	46680	46685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218813
1045	NC_021984	GAAA	2	8	46747	46754	75 %	0 %	25 %	0 %	529218813
1046	NC_021984	TCGC	2	8	46762	46769	0 %	25 %	25 %	50 %	529218813
1047	NC_021984	TGC	2	6	46890	46895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218813
1048	NC_021984	ATT	2	6	46904	46909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218813
1049	NC_021984	CTG	2	6	46916	46921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218813
1050	NC_021984	GCTG	2	8	46953	46960	0 %	25 %	50 %	25 %	529218813
1051	NC_021984	TG	3	6	47031	47036	0 %	50 %	50 %	0 %	529218813
1052	NC_021984	TTA	2	6	47100	47105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218813
1053	NC_021984	GTG	2	6	47150	47155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218813
1054	NC_021984	GC	4	8	47170	47177	0 %	0 %	50 %	50 %	529218813
1055	NC_021984	GA	3	6	47252	47257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021984	TAT	2	6	47292	47297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218814
1057	NC_021984	AAG	2	6	47314	47319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218814
1058	NC_021984	CGC	2	6	47356	47361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218814
1059	NC_021984	TGT	2	6	47542	47547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218814
1060	NC_021984	CAG	2	6	47588	47593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218814
1061	NC_021984	GCG	2	6	47604	47609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218814
1062	NC_021984	GTG	3	9	47610	47618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218814
1063	NC_021984	CACG	2	8	47651	47658	25 %	0 %	25 %	50 %	529218814
1064	NC_021984	CAGC	2	8	47678	47685	25 %	0 %	25 %	50 %	529218814
1065	NC_021984	GCA	2	6	47729	47734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218814
1066	NC_021984	CTGC	2	8	47815	47822	0 %	25 %	25 %	50 %	529218814
1067	NC_021984	GTT	2	6	47876	47881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218814
1068	NC_021984	TGA	2	6	47930	47935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218814
1069	NC_021984	GAA	2	6	48060	48065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218814
1070	NC_021984	GA	3	6	48084	48089	50 %	0 %	50 %	0 %	529218814
1071	NC_021984	CGG	2	6	48103	48108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218814
1072	NC_021984	ACT	2	6	48130	48135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218814
1073	NC_021984	TACC	2	8	48162	48169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_021984	CAG	2	6	48222	48227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218815
1075	NC_021984	GCGTA	2	10	48278	48287	20 %	20 %	40 %	20 %	529218815
1076	NC_021984	CCT	2	6	48301	48306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218815
1077	NC_021984	CATG	2	8	48383	48390	25 %	25 %	25 %	25 %	529218815
1078	NC_021984	CAG	2	6	48402	48407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218815
1079	NC_021984	TCC	2	6	48511	48516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218815
1080	NC_021984	CCG	2	6	48781	48786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218815
1081	NC_021984	CGT	2	6	48792	48797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218815
1082	NC_021984	CCA	2	6	48798	48803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218815
1083	NC_021984	CGG	2	6	48833	48838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218815
1084	NC_021984	GAG	2	6	48865	48870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218815
1085	NC_021984	GACCA	2	10	48883	48892	40 %	0 %	20 %	40 %	529218815
1086	NC_021984	A	6	6	48975	48980	100 %	0 %	0 %	0 %	529218815
1087	NC_021984	CCGGC	2	10	49025	49034	0 %	0 %	40 %	60 %	529218815
1088	NC_021984	GTCGTA	2	12	49050	49061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529218815
1089	NC_021984	CG	4	8	49151	49158	0 %	0 %	50 %	50 %	529218815
1090	NC_021984	AAGT	2	8	49177	49184	50 %	25 %	25 %	0 %	529218815
1091	NC_021984	CCAG	2	8	49235	49242	25 %	0 %	25 %	50 %	529218815
1092	NC_021984	CG	3	6	49364	49369	0 %	0 %	50 %	50 %	529218815
1093	NC_021984	AAG	2	6	49405	49410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218815
1094	NC_021984	GCG	2	6	49440	49445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218815
1095	NC_021984	CAG	2	6	49467	49472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218815
1096	NC_021984	CAT	2	6	49530	49535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218815
1097	NC_021984	CGG	2	6	49536	49541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218815
1098	NC_021984	AGT	2	6	49604	49609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218815
1099	NC_021984	GTT	2	6	49680	49685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218815
1100	NC_021984	T	6	6	49814	49819	0 %	100 %	0 %	0 %	529218815
1101	NC_021984	GAT	2	6	49924	49929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218815
1102	NC_021984	TG	3	6	49982	49987	0 %	50 %	50 %	0 %	529218815
1103	NC_021984	TTGA	2	8	50016	50023	25 %	50 %	25 %	0 %	529218815
1104	NC_021984	TGG	2	6	50059	50064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218815
1105	NC_021984	TGC	2	6	50209	50214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218815
1106	NC_021984	CAGAC	2	10	50215	50224	40 %	0 %	20 %	40 %	529218815
1107	NC_021984	TTG	2	6	50235	50240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218815
1108	NC_021984	TGG	2	6	50252	50257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218815
1109	NC_021984	TCT	2	6	50324	50329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021984	GAAA	2	8	50351	50358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021984	AGT	2	6	50359	50364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021984	GCA	2	6	50434	50439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021984	GGC	2	6	50484	50489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021984	TGC	2	6	50531	50536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021984	GGC	2	6	50661	50666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021984	TGT	2	6	50681	50686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021984	GCCA	2	8	50692	50699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_021984	CAT	2	6	50700	50705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021984	CGC	2	6	50708	50713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_021984	CAG	2	6	50727	50732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021984	AAG	2	6	50773	50778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021984	GAT	2	6	50787	50792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021984	TCG	2	6	50807	50812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021984	ATA	2	6	50865	50870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021984	GCT	2	6	50888	50893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021984	AGA	2	6	50906	50911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021984	CGC	2	6	50958	50963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_021984	T	6	6	50969	50974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021984	GC	3	6	51049	51054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1142	NC_021984	GTA	2	6	51607	51612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_021984	ATG	2	6	51619	51624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1156	NC_021984	A	6	6	52067	52072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1164	NC_021984	GCA	2	6	52490	52495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1250	NC_021984	AGCGC	2	10	57073	57082	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1251	NC_021984	GTG	2	6	57095	57100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_021984	AGCC	2	8	57280	57287	25 %	0 %	25 %	50 %	529218819
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1258	NC_021984	AAAG	2	8	57359	57366	75 %	0 %	25 %	0 %	529218819
1259	NC_021984	CGC	2	6	57386	57391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218819
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1262	NC_021984	TTG	2	6	57696	57701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218820
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1497	NC_021984	TAA	2	6	68252	68257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_021984	TAAT	2	8	68307	68314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_021984	ATT	2	6	68318	68323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_021984	TTA	2	6	68325	68330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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