MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021984	T	6	6	541129	541134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_021984	GCA	2	6	541153	541158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_021984	AGT	2	6	541192	541197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_021984	TAA	2	6	541210	541215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_021984	CTG	2	6	541247	541252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_021984	AAAT	2	8	541292	541299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_021984	TAA	2	6	541335	541340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_021984	AT	3	6	541351	541356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_021984	ATA	2	6	541392	541397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021984	GAT	2	6	541420	541425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_021984	AGA	2	6	541432	541437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_021984	GAAT	2	8	541482	541489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_021984	TAA	2	6	541523	541528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_021984	ACA	2	6	541540	541545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_021984	TAT	2	6	541596	541601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_021984	AG	3	6	541603	541608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_021984	ATT	2	6	541624	541629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_021984	TA	3	6	541632	541637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_021984	AGT	2	6	541799	541804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222026
11520	NC_021984	ATA	2	6	541877	541882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_021984	ACT	2	6	541927	541932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_021984	TA	3	6	541941	541946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_021984	GTA	2	6	541979	541984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_021984	ACTC	2	8	542021	542028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11525	NC_021984	ATC	2	6	542091	542096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_021984	AATA	2	8	542101	542108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_021984	CAA	2	6	542117	542122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_021984	TTTG	2	8	542205	542212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_021984	ATT	2	6	542227	542232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_021984	CAA	2	6	542276	542281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_021984	ACCC	2	8	542282	542289	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11532	NC_021984	AAT	2	6	542293	542298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_021984	AAT	2	6	542306	542311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_021984	A	7	7	542404	542410	100 %	0 %	0 %	0 %	529222027
11535	NC_021984	TAA	2	6	542414	542419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222027
11536	NC_021984	CAT	2	6	542437	542442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222027
11537	NC_021984	TAT	2	6	542495	542500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222027
11538	NC_021984	ATT	2	6	542505	542510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222027
11539	NC_021984	TAA	2	6	542539	542544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222027
11540	NC_021984	TCT	2	6	542616	542621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222027
11541	NC_021984	GAC	2	6	542636	542641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222027
11542	NC_021984	AG	3	6	542643	542648	50 %	0 %	50 %	0 %	529222027
11543	NC_021984	TGA	2	6	542723	542728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219122
11544	NC_021984	TGG	2	6	542739	542744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219122
11545	NC_021984	CCAT	2	8	542762	542769	25 %	25 %	0 %	50 %	529219122
11546	NC_021984	CAA	2	6	542771	542776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219122
11547	NC_021984	CAT	2	6	542808	542813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219122
11548	NC_021984	AGT	2	6	542826	542831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219122
11549	NC_021984	GC	3	6	542850	542855	0 %	0 %	50 %	50 %	529219122
11550	NC_021984	CATA	2	8	542930	542937	50 %	25 %	0 %	25 %	529219122
11551	NC_021984	AGAA	2	8	542939	542946	75 %	0 %	25 %	0 %	529219122
11552	NC_021984	AATG	2	8	542957	542964	50 %	25 %	25 %	0 %	529219122
11553	NC_021984	CGAT	2	8	542981	542988	25 %	25 %	25 %	25 %	529219122
11554	NC_021984	AAT	2	6	543086	543091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_021984	AT	3	6	543126	543131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_021984	T	8	8	543230	543237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_021984	G	6	6	543270	543275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_021984	ATAAA	2	10	543313	543322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021984	A	6	6	543320	543325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_021984	AGT	2	6	543430	543435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_021984	CTG	2	6	543454	543459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_021984	GAA	2	6	543598	543603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_021984	ACG	2	6	543620	543625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_021984	CGT	2	6	543803	543808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_021984	CTGG	2	8	543809	543816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11566	NC_021984	A	6	6	543900	543905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_021984	TG	3	6	544057	544062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_021984	AGG	2	6	544146	544151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_021984	T	6	6	544202	544207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_021984	GCC	2	6	544229	544234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11571	NC_021984	T	6	6	544275	544280	0 %	100 %	0 %	0 %	529219123
11572	NC_021984	CGC	2	6	544301	544306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219123
11573	NC_021984	CTT	2	6	544316	544321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219123
11574	NC_021984	TCA	2	6	544364	544369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219123
11575	NC_021984	GCC	2	6	544386	544391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219123
11576	NC_021984	CGA	2	6	544490	544495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219123
11577	NC_021984	GGT	2	6	544503	544508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219123
11578	NC_021984	TCA	2	6	544532	544537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219123
11579	NC_021984	AAT	2	6	544539	544544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219123
11580	NC_021984	CTG	2	6	544565	544570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219123
11581	NC_021984	GAT	2	6	544596	544601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219123
11582	NC_021984	CCAG	2	8	544602	544609	25 %	0 %	25 %	50 %	529219123
11583	NC_021984	TCA	2	6	544693	544698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219123
11584	NC_021984	AT	3	6	544708	544713	50 %	50 %	0 %	0 %	529219123
11585	NC_021984	CGC	2	6	544725	544730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219123
11586	NC_021984	CAG	2	6	544782	544787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219123
11587	NC_021984	CGG	2	6	544829	544834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219123
11588	NC_021984	AAT	2	6	544852	544857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219123
11589	NC_021984	ATG	2	6	544870	544875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219123
11590	NC_021984	GCC	2	6	544920	544925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219123
11591	NC_021984	CATCG	2	10	545019	545028	20 %	20 %	20 %	40 %	529219123
11592	NC_021984	GAAG	2	8	545086	545093	50 %	0 %	50 %	0 %	529219123
11593	NC_021984	TTC	2	6	545133	545138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219123
11594	NC_021984	TCG	2	6	545179	545184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219123
11595	NC_021984	ATG	2	6	545197	545202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219123
11596	NC_021984	CTG	2	6	545207	545212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_021984	TAA	2	6	545225	545230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_021984	A	6	6	545273	545278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_021984	GTT	2	6	545330	545335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_021984	ATGG	2	8	545443	545450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_021984	GGCGCT	2	12	545504	545515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529219124
11602	NC_021984	CTG	2	6	545526	545531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219124
11603	NC_021984	CAG	2	6	545559	545564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219124
11604	NC_021984	CAACTT	2	12	545606	545617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219124
11605	NC_021984	TGT	2	6	545636	545641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219124
11606	NC_021984	CGGTCG	2	12	545647	545658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529219124
11607	NC_021984	GAA	2	6	545721	545726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219124
11608	NC_021984	TTC	2	6	545793	545798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219124
11609	NC_021984	TTA	2	6	545808	545813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219124
11610	NC_021984	CG	3	6	546063	546068	0 %	0 %	50 %	50 %	529219124
11611	NC_021984	TGC	2	6	546091	546096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219124
11612	NC_021984	TAT	2	6	546116	546121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219124
11613	NC_021984	TAAA	2	8	546250	546257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_021984	TTA	2	6	546433	546438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219125
11615	NC_021984	GTA	2	6	546564	546569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219125
11616	NC_021984	GGT	2	6	546573	546578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219125
11617	NC_021984	CGG	2	6	546638	546643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219125
11618	NC_021984	CGC	2	6	546788	546793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219125
11619	NC_021984	GCT	2	6	546846	546851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219125
11620	NC_021984	TTA	2	6	546958	546963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219125
11621	NC_021984	CG	3	6	547081	547086	0 %	0 %	50 %	50 %	529219125
11622	NC_021984	GCC	2	6	547191	547196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219125
11623	NC_021984	C	6	6	547250	547255	0 %	0 %	0 %	100 %	529219125
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11625	NC_021984	CAT	2	6	547457	547462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219125
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11985	NC_021984	G	6	6	564151	564156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11989	NC_021984	T	6	6	564378	564383	0 %	100 %	0 %	0 %	529219142
11990	NC_021984	CG	3	6	564397	564402	0 %	0 %	50 %	50 %	529219142
11991	NC_021984	GAC	2	6	564412	564417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219142
11992	NC_021984	GGCG	2	8	564476	564483	0 %	0 %	75 %	25 %	529219142
11993	NC_021984	GCT	2	6	564536	564541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219142
11994	NC_021984	GCT	2	6	564581	564586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219142
11995	NC_021984	GC	3	6	564673	564678	0 %	0 %	50 %	50 %	529219142
11996	NC_021984	GGC	2	6	564680	564685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219142
11997	NC_021984	GAC	2	6	564743	564748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219142
11998	NC_021984	GCT	2	6	564761	564766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219142
11999	NC_021984	GGGCCT	2	12	564860	564871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529219142
12000	NC_021984	GGC	2	6	565026	565031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219142

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