MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021984	ATG	2	6	516490	516495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219109
11002	NC_021984	AATG	2	8	516502	516509	50 %	25 %	25 %	0 %	529219109
11003	NC_021984	TGC	2	6	516542	516547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11004	NC_021984	GC	4	8	516605	516612	0 %	0 %	50 %	50 %	529219109
11005	NC_021984	CCAA	2	8	516629	516636	50 %	0 %	0 %	50 %	529219109
11006	NC_021984	CTT	2	6	516744	516749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219109
11007	NC_021984	GGCACC	2	12	516751	516762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529219109
11008	NC_021984	TTG	2	6	516776	516781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219109
11009	NC_021984	TAT	2	6	516829	516834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219109
11010	NC_021984	GAT	2	6	516843	516848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219109
11011	NC_021984	TTTG	2	8	517187	517194	0 %	75 %	25 %	0 %	529219109
11012	NC_021984	TGCG	2	8	517289	517296	0 %	25 %	50 %	25 %	529219109
11013	NC_021984	GT	3	6	517333	517338	0 %	50 %	50 %	0 %	529219109
11014	NC_021984	GCT	3	9	517434	517442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11015	NC_021984	AT	3	6	517524	517529	50 %	50 %	0 %	0 %	529219109
11016	NC_021984	TAA	2	6	517542	517547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219109
11017	NC_021984	GCTG	2	8	517655	517662	0 %	25 %	50 %	25 %	529219109
11018	NC_021984	GAC	2	6	517731	517736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11019	NC_021984	TGC	2	6	517745	517750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11020	NC_021984	GCGCG	2	10	517779	517788	0 %	0 %	60 %	40 %	529219109
11021	NC_021984	CGA	2	6	517863	517868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11022	NC_021984	ATG	2	6	517876	517881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219109
11023	NC_021984	CGG	2	6	517982	517987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219109
11024	NC_021984	GCT	2	6	518028	518033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11025	NC_021984	TCA	2	6	518099	518104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219109
11026	NC_021984	GAA	2	6	518116	518121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219109
11027	NC_021984	TC	3	6	518129	518134	0 %	50 %	0 %	50 %	529219109
11028	NC_021984	TGA	2	6	518196	518201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219109
11029	NC_021984	CAT	2	6	518253	518258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219109
11030	NC_021984	GTT	2	6	518270	518275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219109
11031	NC_021984	GAT	2	6	518310	518315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219109
11032	NC_021984	AGCGAA	2	12	518337	518348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	529219109
11033	NC_021984	CGT	2	6	518358	518363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219109
11034	NC_021984	TTG	2	6	518372	518377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219109
11035	NC_021984	GCC	2	6	518444	518449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219109
11036	NC_021984	A	7	7	518477	518483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_021984	AAT	2	6	518648	518653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219110
11038	NC_021984	GA	3	6	518716	518721	50 %	0 %	50 %	0 %	529219110
11039	NC_021984	CAT	2	6	518747	518752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219110
11040	NC_021984	AGA	2	6	518848	518853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219110
11041	NC_021984	AACC	2	8	518892	518899	50 %	0 %	0 %	50 %	529219110
11042	NC_021984	CGC	2	6	518960	518965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219110
11043	NC_021984	GAA	2	6	519017	519022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219110
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11045	NC_021984	CGC	2	6	519212	519217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219110
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11047	NC_021984	GAA	3	9	519452	519460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219110
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11049	NC_021984	T	7	7	519643	519649	0 %	100 %	0 %	0 %	529219110
11050	NC_021984	GCT	2	6	519656	519661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219110
11051	NC_021984	CAG	2	6	519665	519670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219110
11052	NC_021984	CAA	2	6	519682	519687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219110
11053	NC_021984	AC	4	8	519799	519806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_021984	TAA	2	6	519809	519814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_021984	TACTG	2	10	519859	519868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11056	NC_021984	ATGAAA	2	12	519872	519883	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021984	GTC	2	6	519937	519942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_021984	TGAC	2	8	520068	520075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11059	NC_021984	AGC	2	6	520091	520096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_021984	GCG	2	6	520103	520108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_021984	GTG	2	6	520229	520234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021984	ATC	2	6	520373	520378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_021984	TTA	2	6	520448	520453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_021984	CGC	2	6	520506	520511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_021984	CGG	2	6	520538	520543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_021984	CGC	2	6	520559	520564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_021984	TC	3	6	520588	520593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_021984	GCC	2	6	520665	520670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11069	NC_021984	CGA	2	6	520684	520689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_021984	CGG	2	6	520739	520744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_021984	CAA	2	6	520752	520757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_021984	ATG	2	6	520824	520829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_021984	CCG	2	6	520834	520839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_021984	CGG	2	6	520840	520845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_021984	GCG	2	6	520923	520928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_021984	TCC	2	6	520968	520973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_021984	GGT	2	6	521000	521005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_021984	GCA	2	6	521050	521055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11080	NC_021984	TGA	2	6	521116	521121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_021984	TGC	2	6	521128	521133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_021984	GCGCTG	2	12	521148	521159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_021984	ACGCT	2	10	521185	521194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11084	NC_021984	GCG	2	6	521216	521221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_021984	GTC	2	6	521256	521261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_021984	CAG	2	6	521359	521364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_021984	TGA	2	6	521374	521379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219111
11088	NC_021984	GAT	2	6	521405	521410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219111
11089	NC_021984	GAT	2	6	521474	521479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219111
11090	NC_021984	CCA	2	6	521496	521501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219111
11091	NC_021984	ACC	2	6	521556	521561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219111
11092	NC_021984	AGT	2	6	521567	521572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219111
11093	NC_021984	ATC	2	6	521580	521585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219111
11094	NC_021984	GCC	2	6	521671	521676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219111
11095	NC_021984	TC	3	6	521701	521706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_021984	GAA	2	6	521792	521797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021984	T	6	6	521803	521808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_021984	GCC	2	6	521853	521858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_021984	TCT	2	6	521892	521897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_021984	GCA	2	6	521950	521955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_021984	CG	3	6	521994	521999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_021984	TTCA	2	8	522005	522012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_021984	CGG	2	6	522037	522042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_021984	CGC	2	6	522077	522082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_021984	GCCC	2	8	522127	522134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11106	NC_021984	GCG	2	6	522139	522144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_021984	CAG	2	6	522185	522190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11108	NC_021984	TGA	2	6	522231	522236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_021984	TCC	2	6	522258	522263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_021984	GCG	2	6	522374	522379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_021984	TCGGGA	2	12	522382	522393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11112	NC_021984	TGG	2	6	522521	522526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_021984	GAT	2	6	522528	522533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_021984	TCA	2	6	522538	522543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_021984	A	6	6	522553	522558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_021984	CGG	3	9	522600	522608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_021984	ATT	2	6	522615	522620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_021984	CG	3	6	522654	522659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_021984	GCA	2	6	522662	522667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_021984	CGC	2	6	522743	522748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11121	NC_021984	CGA	2	6	522760	522765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_021984	TG	3	6	522774	522779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_021984	AATA	2	8	522831	522838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_021984	ATA	2	6	522960	522965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_021984	ACC	2	6	523107	523112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_021984	TGGG	2	8	523124	523131	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_021984	CGC	2	6	523150	523155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11128	NC_021984	GC	3	6	523175	523180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11129	NC_021984	CAC	2	6	523204	523209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11130	NC_021984	TCG	2	6	523284	523289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_021984	GC	3	6	523290	523295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11132	NC_021984	GCA	2	6	523309	523314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11134	NC_021984	CAT	2	6	523480	523485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11143	NC_021984	CAA	2	6	523877	523882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11145	NC_021984	GCC	3	9	524008	524016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11146	NC_021984	CCG	2	6	524025	524030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11147	NC_021984	CAG	2	6	524090	524095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11156	NC_021984	ACC	2	6	524449	524454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11223	NC_021984	ATATG	2	10	527434	527443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11229	NC_021984	T	6	6	527655	527660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_021984	A	6	6	527668	527673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_021984	GAA	2	6	527697	527702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_021984	CCA	2	6	527729	527734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11233	NC_021984	ATCG	2	8	527824	527831	25 %	25 %	25 %	25 %	529219114
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11238	NC_021984	GC	3	6	528273	528278	0 %	0 %	50 %	50 %	529219114
11239	NC_021984	CCGAAA	2	12	528295	528306	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	529219114
11240	NC_021984	ATG	2	6	528307	528312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219114
11241	NC_021984	T	6	6	528361	528366	0 %	100 %	0 %	0 %	529219114
11242	NC_021984	ATG	2	6	528395	528400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219114
11243	NC_021984	TGG	2	6	528404	528409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219114
11244	NC_021984	ACG	2	6	528440	528445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219114
11245	NC_021984	CCAT	2	8	528457	528464	25 %	25 %	0 %	50 %	529219114
11246	NC_021984	GC	4	8	528479	528486	0 %	0 %	50 %	50 %	529219114
11247	NC_021984	TGG	2	6	528554	528559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219114
11248	NC_021984	GC	3	6	528578	528583	0 %	0 %	50 %	50 %	529219114
11249	NC_021984	GC	3	6	528586	528591	0 %	0 %	50 %	50 %	529219114
11250	NC_021984	GGC	2	6	528636	528641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219114
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11498	NC_021984	TA	3	6	541056	541061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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