MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_021902	CTG	2	6	163536	163541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816877
3503	NC_021902	CG	3	6	163594	163599	0 %	0 %	50 %	50 %	528816877
3504	NC_021902	GAT	2	6	163650	163655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816877
3505	NC_021902	ATT	2	6	163710	163715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816877
3506	NC_021902	GA	3	6	163728	163733	50 %	0 %	50 %	0 %	528816877
3507	NC_021902	TAA	2	6	163763	163768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816877
3508	NC_021902	GAA	3	9	163820	163828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816878
3509	NC_021902	CTTT	2	8	163912	163919	0 %	75 %	0 %	25 %	528816878
3510	NC_021902	TACGC	2	10	164045	164054	20 %	20 %	20 %	40 %	528816878
3511	NC_021902	GTT	2	6	164060	164065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816878
3512	NC_021902	ATT	2	6	164151	164156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816878
3513	NC_021902	GCG	2	6	164258	164263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816878
3514	NC_021902	GTT	2	6	164264	164269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816878
3515	NC_021902	GTG	2	6	164287	164292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816878
3516	NC_021902	TTTTA	2	10	164353	164362	20 %	80 %	0 %	0 %	528816878
3517	NC_021902	GTA	2	6	164432	164437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816878
3518	NC_021902	AT	3	6	164472	164477	50 %	50 %	0 %	0 %	528816878
3519	NC_021902	A	6	6	164507	164512	100 %	0 %	0 %	0 %	528816878
3520	NC_021902	TTA	2	6	164556	164561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816878
3521	NC_021902	G	6	6	164625	164630	0 %	0 %	100 %	0 %	528816878
3522	NC_021902	T	6	6	164650	164655	0 %	100 %	0 %	0 %	528816878
3523	NC_021902	ATT	2	6	164775	164780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816878
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3525	NC_021902	TGA	2	6	164877	164882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816879
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3527	NC_021902	TGA	2	6	164895	164900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816879
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3533	NC_021902	TTA	2	6	165092	165097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816879
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3541	NC_021902	GA	3	6	165322	165327	50 %	0 %	50 %	0 %	528816879
3542	NC_021902	GGT	2	6	165349	165354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816879
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3544	NC_021902	A	6	6	165574	165579	100 %	0 %	0 %	0 %	528816879
3545	NC_021902	TAAT	2	8	165590	165597	50 %	50 %	0 %	0 %	528816879
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3549	NC_021902	TCT	2	6	165765	165770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816879
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3551	NC_021902	CTGG	2	8	165799	165806	0 %	25 %	50 %	25 %	528816879
3552	NC_021902	TTCCC	2	10	165844	165853	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3554	NC_021902	A	7	7	165876	165882	100 %	0 %	0 %	0 %	528816880
3555	NC_021902	A	6	6	165908	165913	100 %	0 %	0 %	0 %	528816880
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3557	NC_021902	TTA	2	6	165969	165974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816880
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3559	NC_021902	AT	3	6	166033	166038	50 %	50 %	0 %	0 %	528816880
3560	NC_021902	A	6	6	166063	166068	100 %	0 %	0 %	0 %	528816880
3561	NC_021902	TAC	2	6	166106	166111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816880
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3563	NC_021902	GCG	2	6	166141	166146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816880
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3565	NC_021902	CTG	2	6	166178	166183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816880
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3569	NC_021902	ATGGT	2	10	166326	166335	20 %	40 %	40 %	0 %	528816880
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3572	NC_021902	A	6	6	166514	166519	100 %	0 %	0 %	0 %	528816880
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3575	NC_021902	CTGA	2	8	166597	166604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3591	NC_021902	CTGG	2	8	167176	167183	0 %	25 %	50 %	25 %	528816881
3592	NC_021902	TAT	2	6	167274	167279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816881
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3595	NC_021902	GAT	2	6	167437	167442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816881
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3598	NC_021902	AT	3	6	167500	167505	50 %	50 %	0 %	0 %	528816881
3599	NC_021902	ATT	2	6	167538	167543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021902	TAT	2	6	167619	167624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816882
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3606	NC_021902	AG	3	6	167968	167973	50 %	0 %	50 %	0 %	528816882
3607	NC_021902	CAGT	2	8	168060	168067	25 %	25 %	25 %	25 %	528816882
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3609	NC_021902	TGCC	2	8	168095	168102	0 %	25 %	25 %	50 %	528816882
3610	NC_021902	GCT	2	6	168103	168108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816882
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3612	NC_021902	GTT	2	6	168307	168312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816882
3613	NC_021902	AAAG	2	8	168357	168364	75 %	0 %	25 %	0 %	528816882
3614	NC_021902	TAT	2	6	168399	168404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816882
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3619	NC_021902	G	6	6	168550	168555	0 %	0 %	100 %	0 %	528816882
3620	NC_021902	TAAT	2	8	168623	168630	50 %	50 %	0 %	0 %	528816882
3621	NC_021902	CCA	2	6	168663	168668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816882
3622	NC_021902	TGA	3	9	168777	168785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021902	TAA	2	6	168803	168808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021902	T	7	7	168820	168826	0 %	100 %	0 %	0 %	528816883
3625	NC_021902	CAG	2	6	168843	168848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816883
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3629	NC_021902	TGA	2	6	168998	169003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816883
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3631	NC_021902	TAT	2	6	169130	169135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816883
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3633	NC_021902	CAT	2	6	169151	169156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816883
3634	NC_021902	TCTG	2	8	169243	169250	0 %	50 %	25 %	25 %	528816883
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3645	NC_021902	CT	3	6	169612	169617	0 %	50 %	0 %	50 %	528816883
3646	NC_021902	TAC	2	6	169659	169664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816883
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3649	NC_021902	CTTT	2	8	169765	169772	0 %	75 %	0 %	25 %	528816883
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3654	NC_021902	ATG	2	6	170024	170029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816883
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3994	NC_021902	T	8	8	186875	186882	0 %	100 %	0 %	0 %	528816899
3995	NC_021902	TAT	2	6	186919	186924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816901
3996	NC_021902	GTTGAT	2	12	186948	186959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	528816901
3997	NC_021902	ATA	2	6	187043	187048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816901
3998	NC_021902	ATG	2	6	187053	187058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816901
3999	NC_021902	ATG	2	6	187143	187148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816901
4000	NC_021902	AAT	2	6	187149	187154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816900

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