MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021902	GGC	2	6	821097	821102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817525
17503	NC_021902	GAA	2	6	821122	821127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817525
17504	NC_021902	TAT	2	6	821135	821140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817525
17505	NC_021902	A	6	6	821181	821186	100 %	0 %	0 %	0 %	528817526
17506	NC_021902	CGT	2	6	821200	821205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817526
17507	NC_021902	GCGG	2	8	821258	821265	0 %	0 %	75 %	25 %	528817526
17508	NC_021902	CG	3	6	821267	821272	0 %	0 %	50 %	50 %	528817526
17509	NC_021902	GTC	2	6	821273	821278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817526
17510	NC_021902	TGA	2	6	821316	821321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817526
17511	NC_021902	CATTT	2	10	821344	821353	20 %	60 %	0 %	20 %	528817526
17512	NC_021902	GCG	3	9	821361	821369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817526
17513	NC_021902	AGA	2	6	821494	821499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817526
17514	NC_021902	TGA	3	9	821546	821554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817526
17515	NC_021902	CAC	3	9	821565	821573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817527
17516	NC_021902	CGG	2	6	821642	821647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817527
17517	NC_021902	TGA	2	6	821648	821653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817527
17518	NC_021902	GA	3	6	821652	821657	50 %	0 %	50 %	0 %	528817527
17519	NC_021902	ACG	2	6	821763	821768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817527
17520	NC_021902	TCG	2	6	821834	821839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817527
17521	NC_021902	TTA	2	6	821854	821859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17522	NC_021902	ATA	2	6	821882	821887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817528
17523	NC_021902	GC	3	6	821910	821915	0 %	0 %	50 %	50 %	528817528
17524	NC_021902	AACTC	2	10	822003	822012	40 %	20 %	0 %	40 %	528817528
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17528	NC_021902	GCG	3	9	822140	822148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817528
17529	NC_021902	A	7	7	822194	822200	100 %	0 %	0 %	0 %	528817528
17530	NC_021902	TCG	2	6	822231	822236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817528
17531	NC_021902	CGG	2	6	822288	822293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817528
17532	NC_021902	CGG	2	6	822309	822314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817528
17533	NC_021902	CTG	2	6	822320	822325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817528
17534	NC_021902	TCT	2	6	822348	822353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817528
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17536	NC_021902	A	6	6	822377	822382	100 %	0 %	0 %	0 %	528817528
17537	NC_021902	CGG	2	6	822406	822411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817528
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17541	NC_021902	CTT	2	6	822553	822558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817528
17542	NC_021902	TTG	2	6	822710	822715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817529
17543	NC_021902	CTC	2	6	822723	822728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817529
17544	NC_021902	GGAT	2	8	822815	822822	25 %	25 %	50 %	0 %	528817529
17545	NC_021902	CGC	2	6	822843	822848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817529
17546	NC_021902	CGG	2	6	822912	822917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817529
17547	NC_021902	CTG	2	6	822958	822963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817529
17548	NC_021902	GGCT	2	8	822966	822973	0 %	25 %	50 %	25 %	528817529
17549	NC_021902	TCGCT	2	10	822998	823007	0 %	40 %	20 %	40 %	528817529
17550	NC_021902	CAT	2	6	823044	823049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817529
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17552	NC_021902	CT	3	6	823197	823202	0 %	50 %	0 %	50 %	528817529
17553	NC_021902	GGTG	2	8	823203	823210	0 %	25 %	75 %	0 %	528817529
17554	NC_021902	GCT	2	6	823212	823217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817529
17555	NC_021902	CGG	2	6	823245	823250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817529
17556	NC_021902	GAT	2	6	823266	823271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817529
17557	NC_021902	GCC	2	6	823338	823343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17558	NC_021902	GA	3	6	823355	823360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_021902	CGG	2	6	823467	823472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817530
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17561	NC_021902	GATT	2	8	823519	823526	25 %	50 %	25 %	0 %	528817530
17562	NC_021902	ACG	2	6	823563	823568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817530
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17564	NC_021902	GCAG	2	8	823616	823623	25 %	0 %	50 %	25 %	528817530
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17568	NC_021902	GCT	2	6	823690	823695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817530
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17579	NC_021902	GC	3	6	824064	824069	0 %	0 %	50 %	50 %	528817530
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17621	NC_021902	GGC	2	6	826058	826063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817532
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17983	NC_021902	ATC	2	6	843289	843294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817549
17984	NC_021902	CAC	2	6	843363	843368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817549
17985	NC_021902	GCC	2	6	843378	843383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817549
17986	NC_021902	CGG	2	6	843419	843424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817549
17987	NC_021902	CCG	2	6	843569	843574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817549
17988	NC_021902	TCA	2	6	843587	843592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817549
17989	NC_021902	AAATTT	2	12	843639	843650	50 %	50 %	0 %	0 %	528817549
17990	NC_021902	ATG	2	6	843655	843660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817549
17991	NC_021902	TC	3	6	843662	843667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17992	NC_021902	CCA	2	6	843729	843734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817550
17993	NC_021902	ATTTCG	2	12	843842	843853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	528817550
17994	NC_021902	GCAG	2	8	843888	843895	25 %	0 %	50 %	25 %	528817550
17995	NC_021902	ACC	2	6	843932	843937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817550
17996	NC_021902	TCA	2	6	843960	843965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817550
17997	NC_021902	CTT	2	6	843987	843992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817550
17998	NC_021902	CGC	2	6	844180	844185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817550
17999	NC_021902	CCA	2	6	844188	844193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817550
18000	NC_021902	TGT	2	6	844209	844214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817550

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