MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021902	GTT	2	6	749288	749293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817451
16003	NC_021902	TCG	2	6	749319	749324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817451
16004	NC_021902	GCG	2	6	749400	749405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817451
16005	NC_021902	GGC	2	6	749434	749439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817451
16006	NC_021902	CGT	2	6	749443	749448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817451
16007	NC_021902	GCTG	2	8	749464	749471	0 %	25 %	50 %	25 %	528817451
16008	NC_021902	GCTCCT	2	12	749497	749508	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528817451
16009	NC_021902	GCTG	2	8	749536	749543	0 %	25 %	50 %	25 %	528817451
16010	NC_021902	ATT	2	6	749618	749623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817451
16011	NC_021902	GC	3	6	749631	749636	0 %	0 %	50 %	50 %	528817451
16012	NC_021902	CG	3	6	749687	749692	0 %	0 %	50 %	50 %	528817451
16013	NC_021902	CGC	2	6	749771	749776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817451
16014	NC_021902	TTTG	2	8	749803	749810	0 %	75 %	25 %	0 %	528817451
16015	NC_021902	GCG	2	6	749826	749831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817451
16016	NC_021902	TC	3	6	749893	749898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_021902	GTC	2	6	749909	749914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817452
16018	NC_021902	T	6	6	749915	749920	0 %	100 %	0 %	0 %	528817452
16019	NC_021902	CGT	2	6	749941	749946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817452
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16021	NC_021902	CGA	2	6	749998	750003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817452
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16023	NC_021902	TGA	2	6	750196	750201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817452
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16025	NC_021902	ACAG	2	8	750307	750314	50 %	0 %	25 %	25 %	528817452
16026	NC_021902	TCT	2	6	750567	750572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817452
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16030	NC_021902	TTG	2	6	750888	750893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_021902	A	6	6	750925	750930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_021902	ACG	2	6	750944	750949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_021902	GTC	2	6	750966	750971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817453
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16037	NC_021902	TCG	2	6	751513	751518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817453
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16040	NC_021902	CGAT	2	8	751588	751595	25 %	25 %	25 %	25 %	528817453
16041	NC_021902	GGC	2	6	751653	751658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817453
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16057	NC_021902	GC	3	6	752542	752547	0 %	0 %	50 %	50 %	528817454
16058	NC_021902	GCAC	2	8	752588	752595	25 %	0 %	25 %	50 %	528817454
16059	NC_021902	GATG	2	8	752601	752608	25 %	25 %	50 %	0 %	528817454
16060	NC_021902	TAC	2	6	752638	752643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817454
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16089	NC_021902	A	6	6	754217	754222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16091	NC_021902	TTTTTA	2	12	754284	754295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16107	NC_021902	GC	3	6	755284	755289	0 %	0 %	50 %	50 %	528817457
16108	NC_021902	TTGT	2	8	755314	755321	0 %	75 %	25 %	0 %	528817457
16109	NC_021902	GC	3	6	755351	755356	0 %	0 %	50 %	50 %	528817457
16110	NC_021902	CTG	2	6	755380	755385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817457
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16122	NC_021902	GCG	2	6	755705	755710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817456
16123	NC_021902	GAA	2	6	755759	755764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817456
16124	NC_021902	GCG	2	6	755765	755770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817456
16125	NC_021902	GC	3	6	755774	755779	0 %	0 %	50 %	50 %	528817456
16126	NC_021902	GGC	2	6	755798	755803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817456
16127	NC_021902	TGC	2	6	755812	755817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817456
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16130	NC_021902	CTG	2	6	755969	755974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817456
16131	NC_021902	CTG	2	6	756050	756055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817456
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16137	NC_021902	GTC	2	6	756216	756221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817456
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16141	NC_021902	GGC	2	6	756277	756282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817456
16142	NC_021902	GCCC	2	8	756350	756357	0 %	0 %	25 %	75 %	528817456
16143	NC_021902	AG	3	6	756397	756402	50 %	0 %	50 %	0 %	528817456
16144	NC_021902	GCA	2	6	756445	756450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817456
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16156	NC_021902	TG	3	6	756848	756853	0 %	50 %	50 %	0 %	528817456
16157	NC_021902	CGGCG	2	10	756859	756868	0 %	0 %	60 %	40 %	528817456
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16238	NC_021902	CGA	3	9	760031	760039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817460
16239	NC_021902	CGG	2	6	760113	760118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817460
16240	NC_021902	GC	3	6	760226	760231	0 %	0 %	50 %	50 %	528817460
16241	NC_021902	CAA	2	6	760288	760293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817460
16242	NC_021902	TCAG	2	8	760329	760336	25 %	25 %	25 %	25 %	528817460
16243	NC_021902	GCA	2	6	760341	760346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817460
16244	NC_021902	ACA	2	6	760380	760385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817460
16245	NC_021902	GCT	2	6	760524	760529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817460
16246	NC_021902	GCC	2	6	760569	760574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817460
16247	NC_021902	ATGA	2	8	760628	760635	50 %	25 %	25 %	0 %	528817460
16248	NC_021902	GCCT	2	8	760650	760657	0 %	25 %	25 %	50 %	528817461
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16251	NC_021902	CGG	3	9	760866	760874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817461
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16262	NC_021902	ATG	2	6	761418	761423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817461
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16270	NC_021902	TTA	2	6	762022	762027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16271	NC_021902	ATG	2	6	762054	762059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817463
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16275	NC_021902	TCTTA	2	10	762355	762364	20 %	60 %	0 %	20 %	528817463
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16290	NC_021902	A	6	6	763397	763402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16291	NC_021902	GCC	2	6	763403	763408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16345	NC_021902	GC	3	6	765697	765702	0 %	0 %	50 %	50 %	528817465
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16349	NC_021902	GGT	2	6	765854	765859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16350	NC_021902	CAA	2	6	765888	765893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817466
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