MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021902	GGCA	2	8	630827	630834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13502	NC_021902	AGG	2	6	630860	630865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817320
13503	NC_021902	AG	3	6	630924	630929	50 %	0 %	50 %	0 %	528817320
13504	NC_021902	TTTTTC	2	12	630935	630946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	528817320
13505	NC_021902	TGC	2	6	630967	630972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13506	NC_021902	TCG	2	6	631019	631024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13507	NC_021902	GGC	2	6	631036	631041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817320
13508	NC_021902	ATA	2	6	631124	631129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817320
13509	NC_021902	TCG	2	6	631172	631177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13510	NC_021902	GTC	2	6	631240	631245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13511	NC_021902	CGC	2	6	631342	631347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817320
13512	NC_021902	CCG	2	6	631401	631406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817320
13513	NC_021902	CGT	2	6	631479	631484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13514	NC_021902	GCT	2	6	631599	631604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13515	NC_021902	GTTTTT	2	12	631686	631697	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	528817320
13516	NC_021902	ATA	2	6	631730	631735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817320
13517	NC_021902	TGC	2	6	631753	631758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817320
13518	NC_021902	AAG	2	6	631897	631902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021902	CTT	3	9	632144	632152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817321
13520	NC_021902	T	6	6	632180	632185	0 %	100 %	0 %	0 %	528817321
13521	NC_021902	CGG	2	6	632196	632201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817321
13522	NC_021902	ACC	2	6	632206	632211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817321
13523	NC_021902	ATG	2	6	632241	632246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817321
13524	NC_021902	ACC	2	6	632281	632286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817321
13525	NC_021902	GCG	2	6	632338	632343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817321
13526	NC_021902	ATCC	2	8	632345	632352	25 %	25 %	0 %	50 %	528817321
13527	NC_021902	TGT	2	6	632424	632429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817321
13528	NC_021902	TCC	2	6	632461	632466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_021902	TCA	2	6	632474	632479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_021902	ATT	2	6	632520	632525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_021902	CGG	2	6	632544	632549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_021902	ATC	2	6	632639	632644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817322
13533	NC_021902	AAT	2	6	632799	632804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817322
13534	NC_021902	TCA	2	6	632832	632837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817322
13535	NC_021902	CCG	3	9	632925	632933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817322
13536	NC_021902	G	6	6	632935	632940	0 %	0 %	100 %	0 %	528817322
13537	NC_021902	AGT	2	6	632966	632971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817322
13538	NC_021902	ATA	2	6	632992	632997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817322
13539	NC_021902	AG	3	6	633028	633033	50 %	0 %	50 %	0 %	528817322
13540	NC_021902	ATG	2	6	633050	633055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817322
13541	NC_021902	TTC	2	6	633265	633270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817323
13542	NC_021902	CAG	2	6	633351	633356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817323
13543	NC_021902	T	6	6	633674	633679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_021902	CAC	2	6	633685	633690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13545	NC_021902	AT	3	6	633735	633740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_021902	GTAA	2	8	633844	633851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_021902	CTCC	2	8	633889	633896	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13548	NC_021902	TA	3	6	633937	633942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_021902	A	7	7	633986	633992	100 %	0 %	0 %	0 %	528817324
13550	NC_021902	CAT	2	6	634021	634026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817324
13551	NC_021902	TGA	2	6	634027	634032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817324
13552	NC_021902	CCG	2	6	634056	634061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817324
13553	NC_021902	TTG	2	6	634110	634115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817324
13554	NC_021902	CGG	2	6	634216	634221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817324
13555	NC_021902	AGA	2	6	634260	634265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817324
13556	NC_021902	CGA	2	6	634332	634337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817324
13557	NC_021902	TGT	2	6	634359	634364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817324
13558	NC_021902	GCTG	2	8	634470	634477	0 %	25 %	50 %	25 %	528817324
13559	NC_021902	GTG	2	6	634517	634522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817324
13560	NC_021902	CGA	2	6	634533	634538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817324
13561	NC_021902	GAG	2	6	634547	634552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817324
13562	NC_021902	CAG	2	6	634655	634660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817324
13563	NC_021902	CCA	2	6	634734	634739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817324
13564	NC_021902	TGT	2	6	634755	634760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817324
13565	NC_021902	CCA	2	6	634782	634787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817324
13566	NC_021902	CTA	2	6	634795	634800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817324
13567	NC_021902	ATC	2	6	634874	634879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817324
13568	NC_021902	TGT	2	6	634896	634901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817324
13569	NC_021902	GCT	2	6	634921	634926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817324
13570	NC_021902	GCA	2	6	634965	634970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817324
13571	NC_021902	TTG	2	6	635045	635050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817324
13572	NC_021902	GC	3	6	635133	635138	0 %	0 %	50 %	50 %	528817324
13573	NC_021902	GGC	3	9	635140	635148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817324
13574	NC_021902	ATTG	2	8	635164	635171	25 %	50 %	25 %	0 %	528817324
13575	NC_021902	GGC	2	6	635191	635196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817324
13576	NC_021902	CTGG	2	8	635197	635204	0 %	25 %	50 %	25 %	528817324
13577	NC_021902	TGA	2	6	635223	635228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817324
13578	NC_021902	TAT	2	6	635237	635242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817324
13579	NC_021902	GAAA	2	8	635287	635294	75 %	0 %	25 %	0 %	528817324
13580	NC_021902	GCG	2	6	635327	635332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817324
13581	NC_021902	ATA	2	6	635376	635381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817324
13582	NC_021902	CGA	2	6	635395	635400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817324
13583	NC_021902	TC	3	6	635501	635506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13584	NC_021902	CTC	2	6	635518	635523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13585	NC_021902	GGA	2	6	635533	635538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_021902	GAC	2	6	635572	635577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_021902	CAG	2	6	635599	635604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_021902	TG	3	6	635614	635619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_021902	ACG	2	6	635624	635629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_021902	CGCTT	2	10	635793	635802	0 %	40 %	20 %	40 %	528817325
13591	NC_021902	TCA	2	6	635821	635826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817325
13592	NC_021902	ATA	2	6	635854	635859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817325
13593	NC_021902	CCA	2	6	635927	635932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817325
13594	NC_021902	CAC	3	9	635973	635981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817325
13595	NC_021902	CCG	2	6	635984	635989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817325
13596	NC_021902	GCA	2	6	635999	636004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817325
13597	NC_021902	AGG	2	6	636050	636055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817325
13598	NC_021902	GGA	2	6	636056	636061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817325
13599	NC_021902	CAG	2	6	636072	636077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817325
13600	NC_021902	CG	3	6	636119	636124	0 %	0 %	50 %	50 %	528817325
13601	NC_021902	CAT	2	6	636153	636158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817325
13602	NC_021902	GCG	2	6	636179	636184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817325
13603	NC_021902	AAT	2	6	636211	636216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817325
13604	NC_021902	GCG	2	6	636242	636247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817325
13605	NC_021902	CGG	2	6	636269	636274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817325
13606	NC_021902	GTG	2	6	636298	636303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817325
13607	NC_021902	TTGA	2	8	636321	636328	25 %	50 %	25 %	0 %	528817325
13608	NC_021902	GAC	2	6	636336	636341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817325
13609	NC_021902	CCG	2	6	636392	636397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817325
13610	NC_021902	AGC	2	6	636469	636474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817325
13611	NC_021902	CAG	2	6	636645	636650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817325
13612	NC_021902	CTGC	2	8	636892	636899	0 %	25 %	25 %	50 %	528817326
13613	NC_021902	AGC	2	6	636919	636924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817326
13614	NC_021902	GGC	2	6	636977	636982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817326
13615	NC_021902	TTA	2	6	637030	637035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817326
13616	NC_021902	GGC	2	6	637037	637042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817326
13617	NC_021902	GCA	2	6	637043	637048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817326
13618	NC_021902	GC	3	6	637049	637054	0 %	0 %	50 %	50 %	528817326
13619	NC_021902	CTC	2	6	637071	637076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817326
13620	NC_021902	ATC	2	6	637101	637106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817326
13621	NC_021902	T	6	6	637182	637187	0 %	100 %	0 %	0 %	528817326
13622	NC_021902	CGG	2	6	637283	637288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817326
13623	NC_021902	GCG	2	6	637333	637338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817326
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13743	NC_021902	GGC	2	6	642273	642278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817330
13744	NC_021902	CAGCG	2	10	642295	642304	20 %	0 %	40 %	40 %	528817330
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13753	NC_021902	AGT	2	6	642806	642811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817330
13754	NC_021902	TG	4	8	642813	642820	0 %	50 %	50 %	0 %	528817330
13755	NC_021902	GTGG	2	8	642823	642830	0 %	25 %	75 %	0 %	528817330
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13984	NC_021902	TGC	2	6	653598	653603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
13985	NC_021902	CAG	3	9	653623	653631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817338
13986	NC_021902	GAT	2	6	653644	653649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817338
13987	NC_021902	CGCGG	2	10	653658	653667	0 %	0 %	60 %	40 %	528817338
13988	NC_021902	CCA	2	6	653697	653702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817338
13989	NC_021902	AGC	2	6	653765	653770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817338
13990	NC_021902	CGC	2	6	653802	653807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817338
13991	NC_021902	ATC	2	6	653809	653814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817338
13992	NC_021902	GCA	2	6	653844	653849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817338
13993	NC_021902	GTT	2	6	653859	653864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817338
13994	NC_021902	TAA	2	6	653941	653946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817338
13995	NC_021902	CCA	2	6	653949	653954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817338
13996	NC_021902	ATA	2	6	653978	653983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817338
13997	NC_021902	TTG	2	6	653996	654001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817338
13998	NC_021902	CTG	2	6	654004	654009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
13999	NC_021902	GGT	2	6	654057	654062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817338
14000	NC_021902	TCA	2	6	654065	654070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817338

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