MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_021902	CCAG	2	8	534372	534379	25 %	0 %	25 %	50 %	528817240
11503	NC_021902	CAG	2	6	534427	534432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817240
11504	NC_021902	GC	3	6	534480	534485	0 %	0 %	50 %	50 %	528817240
11505	NC_021902	GCC	3	9	534490	534498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11506	NC_021902	GCG	2	6	534687	534692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11507	NC_021902	TCA	3	9	534818	534826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817240
11508	NC_021902	CGC	2	6	534841	534846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11509	NC_021902	CGC	2	6	534978	534983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11510	NC_021902	GC	3	6	534982	534987	0 %	0 %	50 %	50 %	528817240
11511	NC_021902	CAG	2	6	535114	535119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817240
11512	NC_021902	GCC	2	6	535208	535213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11513	NC_021902	CTT	2	6	535275	535280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817240
11514	NC_021902	GCC	3	9	535342	535350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11515	NC_021902	GCC	2	6	535433	535438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11516	NC_021902	GC	3	6	535452	535457	0 %	0 %	50 %	50 %	528817240
11517	NC_021902	CGC	2	6	535527	535532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11518	NC_021902	ATC	2	6	535538	535543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817240
11519	NC_021902	GGC	3	9	535546	535554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11520	NC_021902	CG	3	6	535625	535630	0 %	0 %	50 %	50 %	528817240
11521	NC_021902	GCC	2	6	535642	535647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11522	NC_021902	CGC	2	6	535651	535656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11523	NC_021902	T	6	6	535752	535757	0 %	100 %	0 %	0 %	528817240
11524	NC_021902	GC	3	6	535769	535774	0 %	0 %	50 %	50 %	528817240
11525	NC_021902	TTTG	2	8	535838	535845	0 %	75 %	25 %	0 %	528817240
11526	NC_021902	TGAG	2	8	535878	535885	25 %	25 %	50 %	0 %	528817240
11527	NC_021902	TAA	2	6	535938	535943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817240
11528	NC_021902	GCT	2	6	535989	535994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_021902	CCAG	2	8	536100	536107	25 %	0 %	25 %	50 %	528817241
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11532	NC_021902	TGCC	2	8	536182	536189	0 %	25 %	25 %	50 %	528817242
11533	NC_021902	CAG	2	6	536258	536263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817242
11534	NC_021902	GCC	2	6	536304	536309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817242
11535	NC_021902	CG	3	6	536352	536357	0 %	0 %	50 %	50 %	528817242
11536	NC_021902	GC	3	6	536358	536363	0 %	0 %	50 %	50 %	528817242
11537	NC_021902	CGG	3	9	536413	536421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817242
11538	NC_021902	TCG	2	6	536473	536478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_021902	ATT	2	6	536522	536527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817243
11540	NC_021902	AAG	2	6	536591	536596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817243
11541	NC_021902	ACC	2	6	536610	536615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817243
11542	NC_021902	GCT	2	6	536642	536647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817243
11543	NC_021902	CGT	2	6	536821	536826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817243
11544	NC_021902	GGCA	2	8	536873	536880	25 %	0 %	50 %	25 %	528817243
11545	NC_021902	TACC	2	8	536890	536897	25 %	25 %	0 %	50 %	528817243
11546	NC_021902	CG	3	6	536957	536962	0 %	0 %	50 %	50 %	528817243
11547	NC_021902	ATT	2	6	536972	536977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817243
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11550	NC_021902	CTG	2	6	537295	537300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817244
11551	NC_021902	GGC	2	6	537385	537390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817244
11552	NC_021902	TGG	2	6	537438	537443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817244
11553	NC_021902	TTCA	2	8	537454	537461	25 %	50 %	0 %	25 %	528817244
11554	NC_021902	TCG	2	6	537485	537490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817244
11555	NC_021902	ATC	2	6	537491	537496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817244
11556	NC_021902	AGCG	2	8	537503	537510	25 %	0 %	50 %	25 %	528817244
11557	NC_021902	CCA	2	6	537553	537558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817244
11558	NC_021902	GCG	2	6	537596	537601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817244
11559	NC_021902	GAG	2	6	537605	537610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817244
11560	NC_021902	CG	4	8	537674	537681	0 %	0 %	50 %	50 %	528817244
11561	NC_021902	CTG	2	6	537736	537741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817244
11562	NC_021902	CCG	2	6	537918	537923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817244
11563	NC_021902	CAA	2	6	537936	537941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817244
11564	NC_021902	CGG	2	6	537945	537950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817244
11565	NC_021902	TGG	2	6	537960	537965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817244
11566	NC_021902	TGC	2	6	538095	538100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817244
11567	NC_021902	TCA	2	6	538154	538159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817244
11568	NC_021902	CCG	2	6	538197	538202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817244
11569	NC_021902	CAC	2	6	538219	538224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817244
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11571	NC_021902	CGG	2	6	538518	538523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817245
11572	NC_021902	CGC	2	6	538615	538620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817245
11573	NC_021902	AT	3	6	538638	538643	50 %	50 %	0 %	0 %	528817245
11574	NC_021902	CAG	2	6	538675	538680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817246
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11577	NC_021902	AT	3	6	538769	538774	50 %	50 %	0 %	0 %	528817246
11578	NC_021902	CCAG	2	8	538785	538792	25 %	0 %	25 %	50 %	528817246
11579	NC_021902	C	6	6	538823	538828	0 %	0 %	0 %	100 %	528817246
11580	NC_021902	GTT	2	6	538908	538913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817246
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11583	NC_021902	AT	3	6	539000	539005	50 %	50 %	0 %	0 %	528817246
11584	NC_021902	TGA	2	6	539020	539025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817246
11585	NC_021902	GTAT	2	8	539075	539082	25 %	50 %	25 %	0 %	528817246
11586	NC_021902	GA	3	6	539125	539130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11588	NC_021902	A	6	6	539207	539212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_021902	A	6	6	539225	539230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_021902	ACG	2	6	539245	539250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_021902	TA	3	6	539295	539300	50 %	50 %	0 %	0 %	528817247
11592	NC_021902	CGG	2	6	539351	539356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817247
11593	NC_021902	TC	4	8	539396	539403	0 %	50 %	0 %	50 %	528817247
11594	NC_021902	TTCA	2	8	539461	539468	25 %	50 %	0 %	25 %	528817247
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11598	NC_021902	AATG	2	8	539589	539596	50 %	25 %	25 %	0 %	528817248
11599	NC_021902	GCG	2	6	539681	539686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817248
11600	NC_021902	GCG	2	6	539747	539752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817248
11601	NC_021902	CCG	2	6	539786	539791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817248
11602	NC_021902	T	6	6	539831	539836	0 %	100 %	0 %	0 %	528817248
11603	NC_021902	GC	3	6	539877	539882	0 %	0 %	50 %	50 %	528817248
11604	NC_021902	GC	3	6	539982	539987	0 %	0 %	50 %	50 %	528817248
11605	NC_021902	CG	4	8	540078	540085	0 %	0 %	50 %	50 %	528817248
11606	NC_021902	GC	3	6	540119	540124	0 %	0 %	50 %	50 %	528817248
11607	NC_021902	GGCAA	2	10	540213	540222	40 %	0 %	40 %	20 %	528817249
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11610	NC_021902	ATC	2	6	540250	540255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817249
11611	NC_021902	GCA	2	6	540264	540269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817249
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11616	NC_021902	AAT	2	6	540468	540473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817249
11617	NC_021902	GA	4	8	540502	540509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_021902	GAA	2	6	540532	540537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_021902	TAA	2	6	540550	540555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_021902	A	6	6	540564	540569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_021902	CAA	2	6	540594	540599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_021902	AATA	2	8	540607	540614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_021902	TGC	2	6	540690	540695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_021902	ATA	2	6	540699	540704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_021902	A	7	7	540795	540801	100 %	0 %	0 %	0 %	528817250
11626	NC_021902	A	6	6	540805	540810	100 %	0 %	0 %	0 %	528817250
11627	NC_021902	ATG	2	6	540842	540847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_021902	AAAT	2	8	540876	540883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_021902	AT	6	12	540905	540916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_021902	T	7	7	540916	540922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11631	NC_021902	TA	4	8	540956	540963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11632	NC_021902	T	6	6	540997	541002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11633	NC_021902	GTC	2	6	541020	541025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11743	NC_021902	CAT	2	6	546309	546314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817256
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11986	NC_021902	GCT	2	6	558306	558311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817267
11987	NC_021902	TGC	3	9	558356	558364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817267
11988	NC_021902	GC	3	6	558456	558461	0 %	0 %	50 %	50 %	528817267
11989	NC_021902	GCG	2	6	558542	558547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817267
11990	NC_021902	AGAA	2	8	558557	558564	75 %	0 %	25 %	0 %	528817267
11991	NC_021902	GC	3	6	558565	558570	0 %	0 %	50 %	50 %	528817267
11992	NC_021902	TGGTGC	2	12	558581	558592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528817267
11993	NC_021902	GGC	2	6	558648	558653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817267
11994	NC_021902	CGC	2	6	558753	558758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817267
11995	NC_021902	GCT	2	6	558782	558787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817267
11996	NC_021902	GAT	3	9	558856	558864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817267
11997	NC_021902	TGG	2	6	559010	559015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817267
11998	NC_021902	GC	3	6	559019	559024	0 %	0 %	50 %	50 %	528817267
11999	NC_021902	CGTGAA	2	12	559057	559068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528817267
12000	NC_021902	AT	3	6	559320	559325	50 %	50 %	0 %	0 %	528817268

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