MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021902	CGG	2	6	486796	486801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_021902	A	7	7	486931	486937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_021902	AGTA	2	8	487013	487020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_021902	T	6	6	487023	487028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_021902	CTG	2	6	487041	487046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_021902	CAG	2	6	487072	487077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817194
10508	NC_021902	T	6	6	487144	487149	0 %	100 %	0 %	0 %	528817194
10509	NC_021902	CAA	2	6	487179	487184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817194
10510	NC_021902	GAC	2	6	487246	487251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817194
10511	NC_021902	CGTAA	2	10	487277	487286	40 %	20 %	20 %	20 %	528817194
10512	NC_021902	CCG	2	6	487310	487315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817194
10513	NC_021902	CGG	2	6	487330	487335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817194
10514	NC_021902	ATA	3	9	487337	487345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817194
10515	NC_021902	GAA	2	6	487358	487363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817194
10516	NC_021902	AAT	2	6	487387	487392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817194
10517	NC_021902	TAA	2	6	487449	487454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817194
10518	NC_021902	AAAT	2	8	487540	487547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_021902	ATAA	2	8	487557	487564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_021902	GAA	2	6	487609	487614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817195
10521	NC_021902	TAA	2	6	487647	487652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817195
10522	NC_021902	CAT	2	6	487725	487730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817195
10523	NC_021902	CAC	2	6	487738	487743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817195
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10526	NC_021902	CGA	2	6	487875	487880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817195
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10528	NC_021902	CTG	2	6	487924	487929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817195
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10531	NC_021902	TCA	2	6	488054	488059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817195
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10533	NC_021902	A	6	6	488137	488142	100 %	0 %	0 %	0 %	528817195
10534	NC_021902	GCG	2	6	488177	488182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817195
10535	NC_021902	GTT	2	6	488184	488189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817195
10536	NC_021902	GCC	3	9	488257	488265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817195
10537	NC_021902	ATG	2	6	488273	488278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817195
10538	NC_021902	AGA	2	6	488349	488354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817195
10539	NC_021902	TAG	2	6	488495	488500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817195
10540	NC_021902	ACT	2	6	488507	488512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817195
10541	NC_021902	GACT	2	8	488517	488524	25 %	25 %	25 %	25 %	528817195
10542	NC_021902	GAT	2	6	488616	488621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817195
10543	NC_021902	GGCA	2	8	488730	488737	25 %	0 %	50 %	25 %	528817195
10544	NC_021902	ACC	2	6	488894	488899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817195
10545	NC_021902	GTT	2	6	488908	488913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817195
10546	NC_021902	CCA	2	6	488942	488947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817195
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10549	NC_021902	CTT	2	6	489004	489009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817196
10550	NC_021902	TTAGC	2	10	489012	489021	20 %	40 %	20 %	20 %	528817196
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10552	NC_021902	CGC	2	6	489045	489050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817196
10553	NC_021902	TGATC	2	10	489132	489141	20 %	40 %	20 %	20 %	528817196
10554	NC_021902	TTC	2	6	489148	489153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817196
10555	NC_021902	CCG	2	6	489188	489193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817196
10556	NC_021902	ATCGCG	2	12	489256	489267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528817196
10557	NC_021902	CAG	2	6	489328	489333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817196
10558	NC_021902	CTG	2	6	489346	489351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817196
10559	NC_021902	CGC	2	6	489354	489359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817196
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10561	NC_021902	GTT	2	6	489447	489452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817196
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10569	NC_021902	GC	3	6	489865	489870	0 %	0 %	50 %	50 %	528817196
10570	NC_021902	CTG	2	6	489904	489909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817196
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10572	NC_021902	CAGC	2	8	489990	489997	25 %	0 %	25 %	50 %	528817196
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10589	NC_021902	TTA	2	6	490778	490783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817197
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10592	NC_021902	GCGCC	3	15	490923	490937	0 %	0 %	40 %	60 %	528817197
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10603	NC_021902	GC	3	6	491519	491524	0 %	0 %	50 %	50 %	528817198
10604	NC_021902	GACA	2	8	491537	491544	50 %	0 %	25 %	25 %	528817198
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10613	NC_021902	GGGA	2	8	491934	491941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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10621	NC_021902	GCA	2	6	492155	492160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817199
10622	NC_021902	TG	3	6	492169	492174	0 %	50 %	50 %	0 %	528817199
10623	NC_021902	TCC	2	6	492191	492196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817199
10624	NC_021902	TGA	2	6	492212	492217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817199
10625	NC_021902	CCTG	2	8	492249	492256	0 %	25 %	25 %	50 %	528817199
10626	NC_021902	CGT	2	6	492278	492283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817199
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10741	NC_021902	CA	3	6	498311	498316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10742	NC_021902	TGA	2	6	498324	498329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10873	NC_021902	CCCG	2	8	505803	505810	0 %	0 %	25 %	75 %	528817210
10874	NC_021902	GGA	2	6	505819	505824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817210
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10876	NC_021902	GGC	2	6	505893	505898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817210
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10878	NC_021902	GC	3	6	505941	505946	0 %	0 %	50 %	50 %	528817210
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10893	NC_021902	GATGCG	2	12	506432	506443	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528817210
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10896	NC_021902	CTG	2	6	506669	506674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817210
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10901	NC_021902	GCAT	2	8	506830	506837	25 %	25 %	25 %	25 %	528817210
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10909	NC_021902	GCGCT	2	10	507051	507060	0 %	20 %	40 %	40 %	528817211
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10933	NC_021902	CTGG	2	8	508410	508417	0 %	25 %	50 %	25 %	528817212
10934	NC_021902	CAG	2	6	508432	508437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817212
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10971	NC_021902	CTG	3	9	509887	509895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817214
10972	NC_021902	TGG	2	6	509898	509903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817214
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10974	NC_021902	GCGCT	2	10	510202	510211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10975	NC_021902	GCC	2	6	510233	510238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817215
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10978	NC_021902	GTT	2	6	510329	510334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817215
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10982	NC_021902	CGG	2	6	510459	510464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817216
10983	NC_021902	GAA	2	6	510499	510504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817216
10984	NC_021902	CAA	2	6	510552	510557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817216
10985	NC_021902	CTG	2	6	510562	510567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817216
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10989	NC_021902	GCG	2	6	510715	510720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817216
10990	NC_021902	GC	4	8	510730	510737	0 %	0 %	50 %	50 %	528817216
10991	NC_021902	TTG	2	6	510782	510787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817216
10992	NC_021902	TGG	2	6	510875	510880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817216
10993	NC_021902	CCA	2	6	510896	510901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817216
10994	NC_021902	TGG	2	6	510908	510913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817216
10995	NC_021902	GGCGG	2	10	510916	510925	0 %	0 %	80 %	20 %	528817216
10996	NC_021902	CCTGAT	2	12	510927	510938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528817216
10997	NC_021902	GCG	2	6	510970	510975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817216
10998	NC_021902	AGA	2	6	510990	510995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817216
10999	NC_021902	GAC	2	6	511077	511082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817216
11000	NC_021902	GC	3	6	511139	511144	0 %	0 %	50 %	50 %	528817216

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