MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101003	NC_021902	CTTT	2	8	4793237	4793244	0 %	75 %	0 %	25 %	528821442
101004	NC_021902	TTC	2	6	4793271	4793276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821442
101005	NC_021902	TGC	2	6	4793389	4793394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821442
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101008	NC_021902	TTTACC	2	12	4793502	4793513	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	528821442
101009	NC_021902	CGC	2	6	4793666	4793671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821442
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101011	NC_021902	CAG	2	6	4793730	4793735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821442
101012	NC_021902	CCA	2	6	4793837	4793842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821442
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101015	NC_021902	CGT	2	6	4793936	4793941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821442
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101144	NC_021902	CTC	2	6	4800525	4800530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101145	NC_021902	AGG	2	6	4800542	4800547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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101240	NC_021902	GTCC	2	8	4805751	4805758	0 %	25 %	25 %	50 %	528821450
101241	NC_021902	ATT	2	6	4805798	4805803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821451
101242	NC_021902	GAC	2	6	4805852	4805857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821451
101243	NC_021902	ACC	2	6	4805923	4805928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821451
101244	NC_021902	TTA	2	6	4805947	4805952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821451
101245	NC_021902	ATC	2	6	4805985	4805990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821451
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101254	NC_021902	GAT	2	6	4806525	4806530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821451
101255	NC_021902	GCC	2	6	4806585	4806590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821451
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101257	NC_021902	C	6	6	4806780	4806785	0 %	0 %	0 %	100 %	528821451
101258	NC_021902	GCA	2	6	4806848	4806853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821451
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101262	NC_021902	CAC	2	6	4807029	4807034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821451
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101265	NC_021902	AT	3	6	4807158	4807163	50 %	50 %	0 %	0 %	528821451
101266	NC_021902	AGT	2	6	4807213	4807218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821451
101267	NC_021902	ATT	2	6	4807288	4807293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821452
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101270	NC_021902	CCG	2	6	4807545	4807550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821452
101271	NC_021902	GCCC	2	8	4807567	4807574	0 %	0 %	25 %	75 %	528821452
101272	NC_021902	CAG	2	6	4807580	4807585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821452
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101275	NC_021902	ACG	3	9	4807605	4807613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821452
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101278	NC_021902	CCG	2	6	4807675	4807680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821452
101279	NC_021902	CGT	2	6	4807687	4807692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821452
101280	NC_021902	GTC	2	6	4807715	4807720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821452
101281	NC_021902	CCAC	2	8	4807732	4807739	25 %	0 %	0 %	75 %	528821452
101282	NC_021902	CA	3	6	4807742	4807747	50 %	0 %	0 %	50 %	528821452
101283	NC_021902	TGG	2	6	4807749	4807754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821452
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101287	NC_021902	T	7	7	4807846	4807852	0 %	100 %	0 %	0 %	528821452
101288	NC_021902	CAA	2	6	4807861	4807866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821452
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101302	NC_021902	CGG	2	6	4808559	4808564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821453
101303	NC_021902	GTTC	2	8	4808568	4808575	0 %	50 %	25 %	25 %	528821453
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101309	NC_021902	CG	3	6	4808867	4808872	0 %	0 %	50 %	50 %	528821453
101310	NC_021902	GCAG	2	8	4808873	4808880	25 %	0 %	50 %	25 %	528821453
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101314	NC_021902	CAGC	2	8	4809025	4809032	25 %	0 %	25 %	50 %	528821453
101315	NC_021902	TCG	2	6	4809101	4809106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821453
101316	NC_021902	GAAT	2	8	4809131	4809138	50 %	25 %	25 %	0 %	528821453
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101318	NC_021902	CG	3	6	4809174	4809179	0 %	0 %	50 %	50 %	528821453
101319	NC_021902	T	7	7	4809248	4809254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101320	NC_021902	ATTT	2	8	4809339	4809346	25 %	75 %	0 %	0 %	528821454
101321	NC_021902	T	7	7	4809350	4809356	0 %	100 %	0 %	0 %	528821454
101322	NC_021902	AC	3	6	4809367	4809372	50 %	0 %	0 %	50 %	528821454
101323	NC_021902	CTGG	2	8	4809455	4809462	0 %	25 %	50 %	25 %	528821454
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101327	NC_021902	GCC	2	6	4809741	4809746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821454
101328	NC_021902	GCG	2	6	4809766	4809771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821454
101329	NC_021902	AAACT	2	10	4809838	4809847	60 %	20 %	0 %	20 %	528821454
101330	NC_021902	CAT	2	6	4809851	4809856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821454
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101333	NC_021902	AGC	2	6	4810106	4810111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821454
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101337	NC_021902	TAT	2	6	4810388	4810393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821454
101338	NC_021902	GCG	2	6	4810396	4810401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821454
101339	NC_021902	TCA	2	6	4810438	4810443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821454
101340	NC_021902	GCT	2	6	4810496	4810501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821454
101341	NC_021902	AACA	2	8	4810503	4810510	75 %	0 %	0 %	25 %	528821454
101342	NC_021902	GGCG	2	8	4810544	4810551	0 %	0 %	75 %	25 %	528821454
101343	NC_021902	TGT	3	9	4810604	4810612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821454
101344	NC_021902	A	6	6	4810641	4810646	100 %	0 %	0 %	0 %	528821454
101345	NC_021902	CCA	2	6	4810708	4810713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821454
101346	NC_021902	CTT	2	6	4810772	4810777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821454
101347	NC_021902	GTC	2	6	4810851	4810856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821454
101348	NC_021902	CTT	2	6	4810910	4810915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821454
101349	NC_021902	CTG	2	6	4810959	4810964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821454
101350	NC_021902	GTG	2	6	4811049	4811054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821454
101351	NC_021902	CAC	2	6	4811070	4811075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821454
101352	NC_021902	GGC	2	6	4811090	4811095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821454
101353	NC_021902	CGCGA	2	10	4811127	4811136	20 %	0 %	40 %	40 %	528821454
101354	NC_021902	A	7	7	4811170	4811176	100 %	0 %	0 %	0 %	528821454
101355	NC_021902	AGA	2	6	4811201	4811206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821454
101356	NC_021902	GAA	2	6	4811222	4811227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821454
101357	NC_021902	AGA	3	9	4811228	4811236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821454
101358	NC_021902	CTG	2	6	4811253	4811258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821454
101359	NC_021902	GTCA	2	8	4811265	4811272	25 %	25 %	25 %	25 %	528821454
101360	NC_021902	CGA	3	9	4811291	4811299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821454
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101362	NC_021902	GAT	2	6	4811324	4811329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821454
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101367	NC_021902	GCA	2	6	4811483	4811488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821454
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101439	NC_021902	AAAT	2	8	4814863	4814870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101440	NC_021902	AT	3	6	4814876	4814881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101444	NC_021902	TAGG	2	8	4815012	4815019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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101467	NC_021902	CAT	2	6	4816176	4816181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821458
101468	NC_021902	CGG	2	6	4816251	4816256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821458
101469	NC_021902	CGA	2	6	4816268	4816273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101470	NC_021902	TC	3	6	4816481	4816486	0 %	50 %	0 %	50 %	528821458
101471	NC_021902	GGCA	2	8	4816524	4816531	25 %	0 %	50 %	25 %	528821458
101472	NC_021902	GCA	2	6	4816580	4816585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101473	NC_021902	TCG	2	6	4816643	4816648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101474	NC_021902	CG	3	6	4816696	4816701	0 %	0 %	50 %	50 %	528821458
101475	NC_021902	GC	3	6	4816724	4816729	0 %	0 %	50 %	50 %	528821458
101476	NC_021902	CGC	3	9	4816727	4816735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821458
101477	NC_021902	CAGC	2	8	4816743	4816750	25 %	0 %	25 %	50 %	528821458
101478	NC_021902	CTG	2	6	4816779	4816784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101479	NC_021902	CGGCG	2	10	4816854	4816863	0 %	0 %	60 %	40 %	528821458
101480	NC_021902	CAT	2	6	4816907	4816912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821458
101481	NC_021902	CTG	2	6	4816929	4816934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101482	NC_021902	GC	3	6	4816940	4816945	0 %	0 %	50 %	50 %	528821458
101483	NC_021902	TCG	2	6	4816958	4816963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101484	NC_021902	CGG	2	6	4817022	4817027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821458
101485	NC_021902	TAA	2	6	4817049	4817054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821458
101486	NC_021902	CAT	2	6	4817081	4817086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821458
101487	NC_021902	CTG	2	6	4817268	4817273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821458
101488	NC_021902	CAT	2	6	4817344	4817349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101489	NC_021902	TCA	2	6	4817360	4817365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101490	NC_021902	CAAC	2	8	4817406	4817413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101491	NC_021902	TACTG	2	10	4817526	4817535	20 %	40 %	20 %	20 %	528821459
101492	NC_021902	GAT	2	6	4817602	4817607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821459
101493	NC_021902	A	6	6	4817616	4817621	100 %	0 %	0 %	0 %	528821459
101494	NC_021902	ATAC	2	8	4817699	4817706	50 %	25 %	0 %	25 %	528821459
101495	NC_021902	CG	3	6	4817724	4817729	0 %	0 %	50 %	50 %	528821459
101496	NC_021902	GC	3	6	4817754	4817759	0 %	0 %	50 %	50 %	528821459
101497	NC_021902	TCA	2	6	4817788	4817793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821459
101498	NC_021902	TCTA	2	8	4817798	4817805	25 %	50 %	0 %	25 %	528821459
101499	NC_021902	TCA	3	9	4817856	4817864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821459
101500	NC_021902	AAG	2	6	4817952	4817957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821459

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