MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_021902	GCA	2	6	4744908	4744913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821394
100002	NC_021902	AC	3	6	4745026	4745031	50 %	0 %	0 %	50 %	528821394
100003	NC_021902	CCG	2	6	4745036	4745041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821394
100004	NC_021902	ATG	3	9	4745116	4745124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821394
100005	NC_021902	A	7	7	4745185	4745191	100 %	0 %	0 %	0 %	528821394
100006	NC_021902	TCC	2	6	4745222	4745227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100007	NC_021902	GC	3	6	4745293	4745298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100008	NC_021902	T	7	7	4745309	4745315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100009	NC_021902	GAC	2	6	4745347	4745352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100010	NC_021902	TAG	2	6	4745368	4745373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100011	NC_021902	TTG	2	6	4745406	4745411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100012	NC_021902	AGGT	2	8	4745443	4745450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100013	NC_021902	T	6	6	4745461	4745466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100014	NC_021902	AAG	2	6	4745487	4745492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100015	NC_021902	A	6	6	4745629	4745634	100 %	0 %	0 %	0 %	528821395
100016	NC_021902	GAA	2	6	4745693	4745698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821395
100017	NC_021902	GCATCG	2	12	4745728	4745739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528821395
100018	NC_021902	CTG	2	6	4745763	4745768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821395
100019	NC_021902	CAT	2	6	4745828	4745833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821395
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100021	NC_021902	CG	3	6	4745922	4745927	0 %	0 %	50 %	50 %	528821395
100022	NC_021902	ACA	2	6	4745936	4745941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821395
100023	NC_021902	GCT	2	6	4745972	4745977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821395
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100026	NC_021902	TCAATA	2	12	4746055	4746066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	528821395
100027	NC_021902	CTG	2	6	4746087	4746092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821395
100028	NC_021902	GGT	2	6	4746188	4746193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821395
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100032	NC_021902	GGC	2	6	4746354	4746359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821395
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100037	NC_021902	GC	3	6	4746603	4746608	0 %	0 %	50 %	50 %	528821395
100038	NC_021902	TGT	2	6	4746631	4746636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821395
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100040	NC_021902	CGG	3	9	4746701	4746709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821395
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100042	NC_021902	GGCCG	2	10	4746767	4746776	0 %	0 %	60 %	40 %	528821395
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100048	NC_021902	CGC	2	6	4747015	4747020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821396
100049	NC_021902	GAG	2	6	4747037	4747042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528821396
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100051	NC_021902	CGA	2	6	4747093	4747098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821396
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100053	NC_021902	GGCTGG	2	12	4747344	4747355	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528821396
100054	NC_021902	CT	3	6	4747406	4747411	0 %	50 %	0 %	50 %	528821396
100055	NC_021902	GATC	2	8	4747441	4747448	25 %	25 %	25 %	25 %	528821396
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100063	NC_021902	GCT	3	9	4747813	4747821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821396
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100071	NC_021902	CTG	2	6	4748024	4748029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821396
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100109	NC_021902	CTG	2	6	4750619	4750624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821399
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100112	NC_021902	T	6	6	4750827	4750832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100113	NC_021902	CGC	2	6	4750854	4750859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100114	NC_021902	CGA	2	6	4750997	4751002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821400
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100116	NC_021902	CGG	2	6	4751043	4751048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821400
100117	NC_021902	GA	3	6	4751057	4751062	50 %	0 %	50 %	0 %	528821400
100118	NC_021902	CAG	2	6	4751088	4751093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821400
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100127	NC_021902	ATTC	2	8	4751497	4751504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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100198	NC_021902	ATT	2	6	4754109	4754114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100199	NC_021902	ATC	2	6	4754146	4754151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821405
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100218	NC_021902	GCA	2	6	4754725	4754730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821405
100219	NC_021902	GAA	2	6	4754758	4754763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821405
100220	NC_021902	TGA	2	6	4754836	4754841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821405
100221	NC_021902	GGC	2	6	4754854	4754859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821405
100222	NC_021902	A	6	6	4754990	4754995	100 %	0 %	0 %	0 %	528821405
100223	NC_021902	AGCGGC	2	12	4755056	4755067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528821405
100224	NC_021902	ATC	2	6	4755138	4755143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821405
100225	NC_021902	T	6	6	4755249	4755254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100226	NC_021902	AG	3	6	4755371	4755376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100227	NC_021902	AT	4	8	4755394	4755401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100228	NC_021902	TCG	2	6	4755463	4755468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821406
100229	NC_021902	CCA	2	6	4755490	4755495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821406
100230	NC_021902	CGT	2	6	4755533	4755538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821406
100231	NC_021902	CGC	2	6	4755568	4755573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821406
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100233	NC_021902	GCGCC	2	10	4755622	4755631	0 %	0 %	40 %	60 %	528821406
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100245	NC_021902	G	6	6	4756168	4756173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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100346	NC_021902	GCG	2	6	4760769	4760774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821410
100347	NC_021902	TGC	3	9	4760788	4760796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821410
100348	NC_021902	CGC	2	6	4760927	4760932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821410
100349	NC_021902	TGG	2	6	4760962	4760967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821410
100350	NC_021902	GAA	2	6	4760993	4760998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821410
100351	NC_021902	CGAG	2	8	4761090	4761097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100352	NC_021902	CGG	2	6	4761105	4761110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100353	NC_021902	CCG	2	6	4761119	4761124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821411
100354	NC_021902	CCG	2	6	4761157	4761162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821411
100355	NC_021902	GCTG	2	8	4761181	4761188	0 %	25 %	50 %	25 %	528821411
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100360	NC_021902	TGC	2	6	4761339	4761344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821411
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100365	NC_021902	GC	3	6	4761608	4761613	0 %	0 %	50 %	50 %	528821411
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100385	NC_021902	TAG	2	6	4762653	4762658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100386	NC_021902	AAT	2	6	4762663	4762668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100388	NC_021902	T	6	6	4762742	4762747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100389	NC_021902	CAC	2	6	4762783	4762788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100390	NC_021902	CAA	2	6	4762799	4762804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100391	NC_021902	TACA	3	12	4762821	4762832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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100450	NC_021902	CAAG	2	8	4766133	4766140	50 %	0 %	25 %	25 %	528821419
100451	NC_021902	CTTT	2	8	4766247	4766254	0 %	75 %	0 %	25 %	528821419
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100463	NC_021902	ATA	2	6	4766856	4766861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821419
100464	NC_021902	TGG	2	6	4766951	4766956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821420
100465	NC_021902	TAT	2	6	4767008	4767013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821420
100466	NC_021902	GTC	2	6	4767021	4767026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821420
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100490	NC_021902	TGA	2	6	4768340	4768345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821421
100491	NC_021902	CAA	2	6	4768411	4768416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821421
100492	NC_021902	TCA	2	6	4768451	4768456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821421
100493	NC_021902	AAGA	2	8	4768562	4768569	75 %	0 %	25 %	0 %	528821422
100494	NC_021902	CCCG	2	8	4768595	4768602	0 %	0 %	25 %	75 %	528821422
100495	NC_021902	CGC	2	6	4768635	4768640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821422
100496	NC_021902	GTA	2	6	4768724	4768729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821422
100497	NC_021902	CCA	2	6	4768731	4768736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821422
100498	NC_021902	TGG	2	6	4768757	4768762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821422
100499	NC_021902	CCG	2	6	4768767	4768772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821422
100500	NC_021902	T	7	7	4768843	4768849	0 %	100 %	0 %	0 %	528821422

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