MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021841	GACA	2	8	22916	22923	50 %	0 %	25 %	25 %	525933004
502	NC_021841	TCA	2	6	23148	23153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933004
503	NC_021841	TCA	3	9	23169	23177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933004
504	NC_021841	TGC	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933004
505	NC_021841	CGG	2	6	23342	23347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525933004
506	NC_021841	ATA	2	6	23358	23363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933004
507	NC_021841	CAT	2	6	23410	23415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933004
508	NC_021841	CCA	2	6	23430	23435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525933004
509	NC_021841	TTC	2	6	23541	23546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933005
510	NC_021841	A	6	6	23671	23676	100 %	0 %	0 %	0 %	525933005
511	NC_021841	ATG	2	6	23716	23721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933005
512	NC_021841	TCA	2	6	23725	23730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933005
513	NC_021841	TTA	2	6	23735	23740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525933005
514	NC_021841	CA	3	6	23771	23776	50 %	0 %	0 %	50 %	525933005
515	NC_021841	AGGG	2	8	23784	23791	25 %	0 %	75 %	0 %	525933005
516	NC_021841	ATA	2	6	23802	23807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933005
517	NC_021841	ATC	2	6	23835	23840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933005
518	NC_021841	GCCA	2	8	23848	23855	25 %	0 %	25 %	50 %	525933005
519	NC_021841	ATCTGA	2	12	23889	23900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525933005
520	NC_021841	TAA	2	6	23913	23918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933005
521	NC_021841	CCA	2	6	23923	23928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525933005
522	NC_021841	TCA	2	6	23956	23961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933005
523	NC_021841	TTTC	2	8	23987	23994	0 %	75 %	0 %	25 %	525933005
524	NC_021841	ATA	2	6	24070	24075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933005
525	NC_021841	ACC	2	6	24076	24081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_021841	TA	3	6	24097	24102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021841	TAT	2	6	24152	24157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021841	AATCGT	2	12	24203	24214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525933006
529	NC_021841	GAA	2	6	24233	24238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525933006
530	NC_021841	TGTT	2	8	24246	24253	0 %	75 %	25 %	0 %	525933006
531	NC_021841	ATC	2	6	24298	24303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933006
532	NC_021841	TA	3	6	24479	24484	50 %	50 %	0 %	0 %	525933006
533	NC_021841	GTA	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933006
534	NC_021841	GTT	2	6	24542	24547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933006
535	NC_021841	CTTT	2	8	24554	24561	0 %	75 %	0 %	25 %	525933006
536	NC_021841	AGTT	2	8	24595	24602	25 %	50 %	25 %	0 %	525933007
537	NC_021841	TCG	2	6	24773	24778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933007
538	NC_021841	GTT	2	6	24890	24895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933007
539	NC_021841	TCGGA	2	10	24930	24939	20 %	20 %	40 %	20 %	525933007
540	NC_021841	ACA	2	6	24949	24954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933007
541	NC_021841	CA	3	6	25031	25036	50 %	0 %	0 %	50 %	525933007
542	NC_021841	ACA	2	6	25057	25062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933007
543	NC_021841	TCCC	2	8	25100	25107	0 %	25 %	0 %	75 %	525933008
544	NC_021841	GAAG	2	8	25173	25180	50 %	0 %	50 %	0 %	525933008
545	NC_021841	CAACT	2	10	25193	25202	40 %	20 %	0 %	40 %	525933008
546	NC_021841	ATC	2	6	25244	25249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933008
547	NC_021841	AAC	2	6	25262	25267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933008
548	NC_021841	CTT	2	6	25383	25388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933008
549	NC_021841	GTT	2	6	25435	25440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021841	GCG	2	6	25476	25481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021841	TTC	2	6	25535	25540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933009
552	NC_021841	GAG	2	6	25585	25590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525933009
553	NC_021841	ATGA	2	8	25640	25647	50 %	25 %	25 %	0 %	525933009
554	NC_021841	ATC	2	6	25664	25669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933009
555	NC_021841	AGT	2	6	25736	25741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933009
556	NC_021841	ATC	2	6	25754	25759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933010
557	NC_021841	AGC	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525933010
558	NC_021841	T	6	6	25879	25884	0 %	100 %	0 %	0 %	525933010
559	NC_021841	A	7	7	25900	25906	100 %	0 %	0 %	0 %	525933010
560	NC_021841	CTCC	2	8	25931	25938	0 %	25 %	0 %	75 %	525933010
561	NC_021841	TTG	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933010
562	NC_021841	T	6	6	26051	26056	0 %	100 %	0 %	0 %	525933010
563	NC_021841	A	6	6	26115	26120	100 %	0 %	0 %	0 %	525933011
564	NC_021841	CTG	2	6	26146	26151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933011
565	NC_021841	CAT	2	6	26200	26205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933011
566	NC_021841	TAA	2	6	26244	26249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933011
567	NC_021841	TGA	2	6	26417	26422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933011
568	NC_021841	CTT	2	6	26459	26464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933011
569	NC_021841	CAT	2	6	26465	26470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933011
570	NC_021841	TAC	2	6	26512	26517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933012
571	NC_021841	CGA	2	6	26532	26537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525933012
572	NC_021841	CTTTC	2	10	26575	26584	0 %	60 %	0 %	40 %	525933012
573	NC_021841	TAG	2	6	26654	26659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933012
574	NC_021841	TTC	2	6	26707	26712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933012
575	NC_021841	AGT	2	6	26729	26734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933012
576	NC_021841	TGT	2	6	26740	26745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933012
577	NC_021841	TCC	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525933012
578	NC_021841	ACGACT	2	12	26797	26808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525933012
579	NC_021841	CTGC	2	8	26930	26937	0 %	25 %	25 %	50 %	525933012
580	NC_021841	CAA	2	6	26983	26988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933012
581	NC_021841	ATC	2	6	27097	27102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933012
582	NC_021841	GAAA	2	8	27141	27148	75 %	0 %	25 %	0 %	525933012
583	NC_021841	T	6	6	27159	27164	0 %	100 %	0 %	0 %	525933012
584	NC_021841	AAAT	2	8	27197	27204	75 %	25 %	0 %	0 %	525933012
585	NC_021841	AAATCA	2	12	27233	27244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525933012
586	NC_021841	TCC	2	6	27332	27337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525933012
587	NC_021841	AATG	2	8	27343	27350	50 %	25 %	25 %	0 %	525933012
588	NC_021841	TCAT	2	8	27416	27423	25 %	50 %	0 %	25 %	525933012
589	NC_021841	AGA	2	6	27431	27436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525933012
590	NC_021841	ACC	2	6	27571	27576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525933012
591	NC_021841	TTA	2	6	27584	27589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525933012
592	NC_021841	AAT	2	6	27631	27636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933012
593	NC_021841	ATA	2	6	27688	27693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933012
594	NC_021841	AAT	2	6	27811	27816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933012
595	NC_021841	CCA	2	6	27823	27828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525933012
596	NC_021841	TGA	2	6	27846	27851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933012
597	NC_021841	TGC	2	6	27901	27906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933012
598	NC_021841	TTG	2	6	28008	28013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933012
599	NC_021841	TCTT	2	8	28040	28047	0 %	75 %	0 %	25 %	525933012
600	NC_021841	CGC	2	6	28066	28071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525933012
601	NC_021841	GAT	2	6	28078	28083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933012
602	NC_021841	CAA	2	6	28113	28118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933012
603	NC_021841	CTGT	2	8	28163	28170	0 %	50 %	25 %	25 %	525933012
604	NC_021841	ATCC	2	8	28177	28184	25 %	25 %	0 %	50 %	525933012
605	NC_021841	AAAT	2	8	28260	28267	75 %	25 %	0 %	0 %	525933012
606	NC_021841	CAA	2	6	28287	28292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933012
607	NC_021841	TTA	2	6	28325	28330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525933012
608	NC_021841	AAC	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933013
609	NC_021841	GAA	2	6	28438	28443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525933013
610	NC_021841	ATG	2	6	28500	28505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933013
611	NC_021841	GCT	2	6	28656	28661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933013
612	NC_021841	A	6	6	28702	28707	100 %	0 %	0 %	0 %	525933013
613	NC_021841	A	6	6	28730	28735	100 %	0 %	0 %	0 %	525933013
614	NC_021841	GTT	2	6	28812	28817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933013
615	NC_021841	CTG	2	6	28858	28863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933013
616	NC_021841	AGC	2	6	28883	28888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525933013
617	NC_021841	AAG	2	6	28913	28918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525933013
618	NC_021841	TCA	2	6	28920	28925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933013
619	NC_021841	T	7	7	28940	28946	0 %	100 %	0 %	0 %	525933013
620	NC_021841	TC	3	6	29042	29047	0 %	50 %	0 %	50 %	525933013
621	NC_021841	AGG	2	6	29054	29059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525933013
622	NC_021841	ATG	2	6	29140	29145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933013
623	NC_021841	ATT	2	6	29192	29197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525933013
624	NC_021841	ATA	2	6	29410	29415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933014
625	NC_021841	TTG	2	6	29444	29449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933014
626	NC_021841	CCG	5	15	29555	29569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525933014
627	NC_021841	ACC	2	6	29601	29606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525933014
628	NC_021841	ATCC	2	8	29632	29639	25 %	25 %	0 %	50 %	525933014
629	NC_021841	GCT	3	9	29668	29676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933014
630	NC_021841	TAT	2	6	29699	29704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525933014
631	NC_021841	TG	3	6	29811	29816	0 %	50 %	50 %	0 %	525933014
632	NC_021841	TCT	2	6	29836	29841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933014
633	NC_021841	CTTTC	2	10	29996	30005	0 %	60 %	0 %	40 %	525933014
634	NC_021841	CTG	3	9	30034	30042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933014
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653	NC_021841	TGT	2	6	31012	31017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933015
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656	NC_021841	ACA	2	6	31130	31135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933015
657	NC_021841	ATC	2	6	31138	31143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933015
658	NC_021841	TCA	2	6	31202	31207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933015
659	NC_021841	AAC	2	6	31210	31215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525933015
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661	NC_021841	AATA	2	8	31357	31364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_021841	TCA	2	6	31371	31376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933016
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665	NC_021841	TGAAAC	2	12	31503	31514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525933016
666	NC_021841	TCG	2	6	31535	31540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933016
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671	NC_021841	T	6	6	31859	31864	0 %	100 %	0 %	0 %	525933016
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675	NC_021841	GAAG	2	8	32111	32118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
676	NC_021841	CA	3	6	32170	32175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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723	NC_021841	TAA	2	6	35199	35204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
724	NC_021841	TTG	2	6	35289	35294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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