MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1 plasmid

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021832	T	17	17	1	17	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021832	AAT	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021832	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021832	A	7	7	69	75	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021832	TAA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021832	TAA	3	9	141	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021832	T	7	7	185	191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021832	GAT	2	6	209	214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
9	NC_021832	AT	3	6	257	262	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
10	NC_021832	T	6	6	271	276	0 %	100 %	0 %	0 %	525905725
11	NC_021832	CTA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905725
12	NC_021832	AGAA	2	8	288	295	75 %	0 %	25 %	0 %	525905725
13	NC_021832	A	7	7	339	345	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
14	NC_021832	GAGTTA	2	12	378	389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
15	NC_021832	AT	3	6	415	420	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
16	NC_021832	A	6	6	434	439	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
17	NC_021832	TTA	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
18	NC_021832	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
19	NC_021832	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
20	NC_021832	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
21	NC_021832	ATA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
22	NC_021832	A	6	6	636	641	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
23	NC_021832	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
24	NC_021832	TTTG	2	8	654	661	0 %	75 %	25 %	0 %	525905725
25	NC_021832	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
26	NC_021832	ATA	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
27	NC_021832	TTA	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
28	NC_021832	TTTAAA	2	12	797	808	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
29	NC_021832	ACAA	2	8	811	818	75 %	0 %	0 %	25 %	525905725
30	NC_021832	T	6	6	888	893	0 %	100 %	0 %	0 %	525905725
31	NC_021832	TGT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
32	NC_021832	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905725
33	NC_021832	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
34	NC_021832	TAAA	2	8	967	974	75 %	25 %	0 %	0 %	525905725
35	NC_021832	TAAAT	2	10	983	992	60 %	40 %	0 %	0 %	525905725
36	NC_021832	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
37	NC_021832	TA	3	6	1015	1020	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
38	NC_021832	A	6	6	1063	1068	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
39	NC_021832	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
40	NC_021832	AAC	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905725
41	NC_021832	AT	3	6	1096	1101	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
42	NC_021832	C	7	7	1108	1114	0 %	0 %	0 %	100 %	525905725
43	NC_021832	AT	3	6	1124	1129	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
44	NC_021832	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021832	AAATT	2	10	1189	1198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021832	AAC	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021832	TAA	2	6	1210	1215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021832	AT	3	6	1240	1245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021832	TTTTA	2	10	1248	1257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021832	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021832	TAAC	2	8	1300	1307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021832	ATC	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021832	ATT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905726
54	NC_021832	A	7	7	1493	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	525905726
55	NC_021832	TAC	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905726
56	NC_021832	AAT	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
57	NC_021832	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
58	NC_021832	ATA	2	6	1561	1566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021832	TA	3	6	1565	1570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021832	A	6	6	1575	1580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021832	ATAA	2	8	1584	1591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021832	TAAT	2	8	1600	1607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021832	AGC	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021832	ATA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021832	CTT	2	6	1730	1735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021832	A	6	6	1739	1744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021832	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021832	ATT	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021832	A	6	6	1850	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021832	GTT	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021832	T	7	7	1870	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021832	A	7	7	1905	1911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021832	A	9	9	1937	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021832	GCGA	2	8	1956	1963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021832	GT	3	6	1987	1992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021832	A	8	8	2003	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021832	ATTTT	2	10	2060	2069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021832	T	6	6	2066	2071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021832	ATT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021832	TAA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021832	TCT	3	9	2101	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021832	TTA	3	9	2114	2122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
83	NC_021832	TTA	2	6	2159	2164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
84	NC_021832	T	7	7	2209	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	525905727
85	NC_021832	TTTCA	2	10	2223	2232	20 %	60 %	0 %	20 %	525905727
86	NC_021832	CCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525905727
87	NC_021832	TAT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
88	NC_021832	ATTTG	2	10	2303	2312	20 %	60 %	20 %	0 %	525905727
89	NC_021832	ATT	2	6	2314	2319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
90	NC_021832	TTAT	2	8	2339	2346	25 %	75 %	0 %	0 %	525905727
91	NC_021832	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905727
92	NC_021832	ATAA	2	8	2361	2368	75 %	25 %	0 %	0 %	525905727
93	NC_021832	T	6	6	2374	2379	0 %	100 %	0 %	0 %	525905727
94	NC_021832	ATT	3	9	2389	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
95	NC_021832	AT	3	6	2435	2440	50 %	50 %	0 %	0 %	525905727
96	NC_021832	T	6	6	2440	2445	0 %	100 %	0 %	0 %	525905727
97	NC_021832	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
98	NC_021832	ATT	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
99	NC_021832	TCA	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
100	NC_021832	TAT	2	6	2518	2523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
101	NC_021832	AATTTT	2	12	2563	2574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
102	NC_021832	TAAA	2	8	2592	2599	75 %	25 %	0 %	0 %	525905727
103	NC_021832	TGG	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525905727
104	NC_021832	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
105	NC_021832	TCA	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
106	NC_021832	TTTAA	2	10	2708	2717	40 %	60 %	0 %	0 %	525905727
107	NC_021832	ATT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
108	NC_021832	ATT	2	6	2755	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
109	NC_021832	AT	3	6	2813	2818	50 %	50 %	0 %	0 %	525905727
110	NC_021832	A	9	9	2830	2838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021832	CCT	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021832	AAGG	2	8	2875	2882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021832	ATA	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021832	A	7	7	2925	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021832	T	6	6	2938	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021832	T	6	6	2948	2953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021832	TAA	2	6	2999	3004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021832	ATTA	2	8	3006	3013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021832	AGG	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021832	A	7	7	3033	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
121	NC_021832	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905728
122	NC_021832	ACA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905728
123	NC_021832	AGT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
124	NC_021832	AGA	2	6	3134	3139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
125	NC_021832	AGC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905728
126	NC_021832	A	6	6	3156	3161	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
127	NC_021832	GAA	2	6	3168	3173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
128	NC_021832	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905728
129	NC_021832	A	6	6	3271	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
130	NC_021832	TA	3	6	3277	3282	50 %	50 %	0 %	0 %	525905728
131	NC_021832	TAG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
132	NC_021832	GAA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
133	NC_021832	AAG	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
134	NC_021832	A	6	6	3438	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
135	NC_021832	T	7	7	3488	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021832	T	7	7	3496	3502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021832	TAAT	2	8	3511	3518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021832	A	6	6	3535	3540	100 %	0 %	0 %	0 %	525905729
139	NC_021832	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
140	NC_021832	TTA	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
141	NC_021832	GTA	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
142	NC_021832	TA	3	6	3635	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
143	NC_021832	ATA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
144	NC_021832	AAG	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905729
145	NC_021832	ATA	2	6	3698	3703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
146	NC_021832	TAAT	2	8	3716	3723	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
147	NC_021832	AAT	3	9	3721	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
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150	NC_021832	AT	3	6	3774	3779	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
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280	NC_021832	A	6	6	7650	7655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021832	A	9	9	7662	7670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021832	A	9	9	7684	7692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.