MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021820	TTC	2	6	839113	839118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218654
18002	NC_021820	GTC	2	6	839119	839124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218654
18003	NC_021820	GCG	2	6	839175	839180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218654
18004	NC_021820	GCA	2	6	839223	839228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218654
18005	NC_021820	GCC	2	6	839302	839307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218654
18006	NC_021820	TG	3	6	839333	839338	0 %	50 %	50 %	0 %	526218654
18007	NC_021820	ATA	3	9	839354	839362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218654
18008	NC_021820	TCC	2	6	839414	839419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218654
18009	NC_021820	CAG	2	6	839452	839457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218654
18010	NC_021820	AAG	2	6	839471	839476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218654
18011	NC_021820	CGA	2	6	839484	839489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218654
18012	NC_021820	CTG	3	9	839548	839556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218654
18013	NC_021820	TGG	2	6	839559	839564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218654
18014	NC_021820	CAG	2	6	839656	839661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218654
18015	NC_021820	GCGCT	2	10	839863	839872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18016	NC_021820	GCC	2	6	839894	839899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18017	NC_021820	GCC	2	6	839931	839936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18018	NC_021820	GTGG	2	8	839956	839963	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_021820	GTT	2	6	839990	839995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_021820	AGC	2	6	840064	840069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18021	NC_021820	AAC	2	6	840077	840082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218655
18022	NC_021820	TGCG	2	8	840083	840090	0 %	25 %	50 %	25 %	526218655
18023	NC_021820	CGG	2	6	840120	840125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18024	NC_021820	GAA	2	6	840160	840165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218655
18025	NC_021820	CAA	2	6	840213	840218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218655
18026	NC_021820	CTG	2	6	840223	840228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18027	NC_021820	CGC	2	6	840252	840257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18028	NC_021820	ATC	2	6	840292	840297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218655
18029	NC_021820	CGG	2	6	840359	840364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18030	NC_021820	GCG	2	6	840376	840381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18031	NC_021820	GC	4	8	840391	840398	0 %	0 %	50 %	50 %	526218655
18032	NC_021820	TTG	2	6	840443	840448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218655
18033	NC_021820	TGG	2	6	840536	840541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18034	NC_021820	CCA	2	6	840557	840562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218655
18035	NC_021820	TGG	2	6	840569	840574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18036	NC_021820	TCTGAT	2	12	840588	840599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526218655
18037	NC_021820	GCG	2	6	840631	840636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18038	NC_021820	AGA	2	6	840651	840656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218655
18039	NC_021820	GGC	2	6	840982	840987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18040	NC_021820	TGC	2	6	840988	840993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18041	NC_021820	CAC	2	6	840996	841001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218655
18042	NC_021820	GCG	2	6	841015	841020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18043	NC_021820	TGC	2	6	841043	841048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18044	NC_021820	GCC	2	6	841079	841084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18045	NC_021820	CGA	2	6	841113	841118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18046	NC_021820	AGA	2	6	841188	841193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218655
18047	NC_021820	CAG	2	6	841225	841230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18048	NC_021820	GCG	2	6	841238	841243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18049	NC_021820	ATT	2	6	841249	841254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218655
18050	NC_021820	GCG	2	6	841291	841296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18051	NC_021820	CTC	2	6	841362	841367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218655
18052	NC_021820	TCA	2	6	841461	841466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218655
18053	NC_021820	GTG	3	9	841498	841506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18054	NC_021820	TGA	2	6	841515	841520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218655
18055	NC_021820	CG	4	8	841540	841547	0 %	0 %	50 %	50 %	526218655
18056	NC_021820	GCC	2	6	841562	841567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18057	NC_021820	CCG	2	6	841603	841608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18058	NC_021820	CAT	2	6	841614	841619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218655
18059	NC_021820	CAA	2	6	841665	841670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218655
18060	NC_021820	CGG	2	6	841737	841742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18061	NC_021820	CTA	2	6	841812	841817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218655
18062	NC_021820	ACG	2	6	841874	841879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18063	NC_021820	CCG	2	6	841886	841891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18064	NC_021820	GCA	2	6	841979	841984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18065	NC_021820	CGA	2	6	841989	841994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18066	NC_021820	CAG	2	6	842008	842013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18067	NC_021820	GAA	2	6	842098	842103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218655
18068	NC_021820	CAG	2	6	842110	842115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18069	NC_021820	GCC	2	6	842116	842121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18070	NC_021820	GGT	2	6	842211	842216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18071	NC_021820	TGA	2	6	842231	842236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218655
18072	NC_021820	GTG	2	6	842362	842367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18073	NC_021820	AAC	2	6	842377	842382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218655
18074	NC_021820	TCG	2	6	842390	842395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18075	NC_021820	GTGAA	2	10	842441	842450	40 %	20 %	40 %	0 %	526218655
18076	NC_021820	CGG	2	6	842556	842561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18077	NC_021820	CGG	2	6	842585	842590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18078	NC_021820	GTG	2	6	842656	842661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18079	NC_021820	GCG	2	6	842662	842667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18080	NC_021820	TGA	2	6	842688	842693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218655
18081	NC_021820	A	6	6	842749	842754	100 %	0 %	0 %	0 %	526218655
18082	NC_021820	CGC	2	6	842762	842767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18083	NC_021820	GGC	2	6	842781	842786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18084	NC_021820	GC	3	6	842785	842790	0 %	0 %	50 %	50 %	526218655
18085	NC_021820	CCG	2	6	842827	842832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
18086	NC_021820	AGG	2	6	842855	842860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218655
18087	NC_021820	GGT	2	6	842961	842966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218655
18088	NC_021820	CGTGG	2	10	843046	843055	0 %	20 %	60 %	20 %	526218655
18089	NC_021820	GAC	2	6	843085	843090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18090	NC_021820	CGA	2	6	843105	843110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18091	NC_021820	CCA	2	6	843138	843143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218655
18092	NC_021820	CAG	2	6	843151	843156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18093	NC_021820	ACT	2	6	843179	843184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218655
18094	NC_021820	CGG	2	6	843252	843257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218655
18095	NC_021820	GGA	3	9	843261	843269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218655
18096	NC_021820	ACG	2	6	843299	843304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18097	NC_021820	ACG	2	6	843425	843430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218655
18098	NC_021820	CCTG	2	8	843478	843485	0 %	25 %	25 %	50 %	526218655
18099	NC_021820	AC	3	6	843537	843542	50 %	0 %	0 %	50 %	526218655
18100	NC_021820	ACA	2	6	843769	843774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18101	NC_021820	TCTT	2	8	843802	843809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18102	NC_021820	GAAG	2	8	843829	843836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_021820	GGC	2	6	843860	843865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18104	NC_021820	CAG	2	6	843924	843929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18105	NC_021820	TCGT	2	8	844069	844076	0 %	50 %	25 %	25 %	526218656
18106	NC_021820	GC	3	6	844099	844104	0 %	0 %	50 %	50 %	526218656
18107	NC_021820	CCA	2	6	844198	844203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218656
18108	NC_021820	CGT	2	6	844216	844221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218656
18109	NC_021820	CGC	2	6	844333	844338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218656
18110	NC_021820	TAT	2	6	844556	844561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218656
18111	NC_021820	GGC	2	6	844577	844582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218656
18112	NC_021820	CGG	3	9	844606	844614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218656
18113	NC_021820	GCT	2	6	844673	844678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218656
18114	NC_021820	GCC	2	6	844698	844703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218656
18115	NC_021820	TGC	2	6	844706	844711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218656
18116	NC_021820	CG	3	6	844712	844717	0 %	0 %	50 %	50 %	526218656
18117	NC_021820	GATG	2	8	844799	844806	25 %	25 %	50 %	0 %	526218656
18118	NC_021820	ATT	2	6	844920	844925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218656
18119	NC_021820	TGA	2	6	844928	844933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218656
18120	NC_021820	GC	3	6	844978	844983	0 %	0 %	50 %	50 %	526218656
18121	NC_021820	CGCTGG	2	12	844996	845007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218656
18122	NC_021820	TGC	2	6	845012	845017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218656
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18152	NC_021820	ATG	2	6	846486	846491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18222	NC_021820	AT	3	6	849583	849588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18223	NC_021820	TGG	2	6	849597	849602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18224	NC_021820	GAAG	2	8	849630	849637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18225	NC_021820	CTTTG	2	10	849669	849678	0 %	60 %	20 %	20 %	526221852
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18227	NC_021820	TGCT	2	8	849759	849766	0 %	50 %	25 %	25 %	526221852
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18231	NC_021820	T	9	9	849998	850006	0 %	100 %	0 %	0 %	526221852
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18233	NC_021820	T	7	7	850086	850092	0 %	100 %	0 %	0 %	526221852
18234	NC_021820	CTAT	2	8	850130	850137	25 %	50 %	0 %	25 %	526221852
18235	NC_021820	CCA	2	6	850204	850209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221852
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18237	NC_021820	GCT	2	6	850296	850301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221852
18238	NC_021820	CTTTG	2	10	850335	850344	0 %	60 %	20 %	20 %	526221852
18239	NC_021820	AAT	2	6	850360	850365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221852
18240	NC_021820	CAA	2	6	850435	850440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18241	NC_021820	TTA	2	6	850469	850474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18242	NC_021820	ATTT	2	8	850494	850501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18243	NC_021820	TTA	2	6	850512	850517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18244	NC_021820	AT	3	6	850518	850523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18245	NC_021820	AT	3	6	850581	850586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18246	NC_021820	TGGGA	2	10	850598	850607	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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18248	NC_021820	T	7	7	850703	850709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18486	NC_021820	TTTC	2	8	861644	861651	0 %	75 %	0 %	25 %	526218668
18487	NC_021820	CTTC	2	8	861662	861669	0 %	50 %	0 %	50 %	526218668
18488	NC_021820	T	7	7	861695	861701	0 %	100 %	0 %	0 %	526218668
18489	NC_021820	TCA	2	6	861706	861711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218668
18490	NC_021820	CATC	2	8	861728	861735	25 %	25 %	0 %	50 %	526218668
18491	NC_021820	ACG	2	6	861766	861771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218668
18492	NC_021820	CAG	2	6	861774	861779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218668
18493	NC_021820	GTG	2	6	861847	861852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218668
18494	NC_021820	GCA	2	6	861863	861868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218668
18495	NC_021820	GCC	2	6	861912	861917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218668
18496	NC_021820	GT	3	6	861946	861951	0 %	50 %	50 %	0 %	526218668
18497	NC_021820	TGG	2	6	861952	861957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218668
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18499	NC_021820	CGA	2	6	862217	862222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218668
18500	NC_021820	TGC	2	6	862278	862283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218669

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