MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021820	TAA	2	6	745611	745616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218568
16002	NC_021820	ACGGT	2	10	745727	745736	20 %	20 %	40 %	20 %	526218568
16003	NC_021820	TCG	2	6	745738	745743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
16004	NC_021820	GC	3	6	745753	745758	0 %	0 %	50 %	50 %	526218568
16005	NC_021820	CGT	2	6	745770	745775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
16006	NC_021820	CCAGAC	2	12	745790	745801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526218568
16007	NC_021820	GCTC	2	8	745802	745809	0 %	25 %	25 %	50 %	526218568
16008	NC_021820	CTG	2	6	745857	745862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
16009	NC_021820	AT	3	6	745867	745872	50 %	50 %	0 %	0 %	526218568
16010	NC_021820	GCG	2	6	745886	745891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218568
16011	NC_021820	CTG	2	6	745899	745904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
16012	NC_021820	AGC	2	6	745963	745968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218568
16013	NC_021820	TCAATA	2	12	746011	746022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	526218568
16014	NC_021820	CGG	2	6	746081	746086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_021820	GA	3	6	746109	746114	50 %	0 %	50 %	0 %	526218569
16016	NC_021820	CAG	2	6	746242	746247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16017	NC_021820	GTG	2	6	746249	746254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218569
16018	NC_021820	CCA	2	6	746266	746271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218569
16019	NC_021820	TGC	2	6	746306	746311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16020	NC_021820	GCG	2	6	746433	746438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
16021	NC_021820	CCG	2	6	746495	746500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
16022	NC_021820	CG	3	6	746531	746536	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16023	NC_021820	AGC	2	6	746609	746614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16024	NC_021820	CG	3	6	746644	746649	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16025	NC_021820	ACGC	2	8	746707	746714	25 %	0 %	25 %	50 %	526218569
16026	NC_021820	CCG	2	6	746724	746729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
16027	NC_021820	TAA	2	6	746773	746778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218569
16028	NC_021820	CG	3	6	746823	746828	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16029	NC_021820	GTC	2	6	746830	746835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16030	NC_021820	TGGA	2	8	746845	746852	25 %	25 %	50 %	0 %	526218569
16031	NC_021820	GAT	2	6	746938	746943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218569
16032	NC_021820	GAAT	2	8	747002	747009	50 %	25 %	25 %	0 %	526218569
16033	NC_021820	GC	3	6	747102	747107	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16034	NC_021820	CAG	2	6	747160	747165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16035	NC_021820	ACA	2	6	747171	747176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218569
16036	NC_021820	CAG	2	6	747178	747183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16037	NC_021820	TGC	2	6	747204	747209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16038	NC_021820	TGC	2	6	747218	747223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16039	NC_021820	TCA	2	6	747242	747247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218569
16040	NC_021820	GC	3	6	747271	747276	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16041	NC_021820	AATATC	2	12	747295	747306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	526218569
16042	NC_021820	TTG	2	6	747310	747315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218569
16043	NC_021820	GAT	2	6	747367	747372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218569
16044	NC_021820	ATT	2	6	747403	747408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218569
16045	NC_021820	GCG	2	6	747427	747432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
16046	NC_021820	GC	3	6	747465	747470	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16047	NC_021820	CGG	2	6	747478	747483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
16048	NC_021820	CAG	3	9	747511	747519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16049	NC_021820	CGC	2	6	747525	747530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
16050	NC_021820	ATC	2	6	747533	747538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218569
16051	NC_021820	AGG	2	6	747588	747593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218569
16052	NC_021820	CGA	2	6	747594	747599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16053	NC_021820	AAC	2	6	747602	747607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218569
16054	NC_021820	AGCC	2	8	747618	747625	25 %	0 %	25 %	50 %	526218569
16055	NC_021820	GGC	2	6	747627	747632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
16056	NC_021820	TTC	2	6	747643	747648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218569
16057	NC_021820	GCTC	2	8	747684	747691	0 %	25 %	25 %	50 %	526218569
16058	NC_021820	CGC	2	6	747696	747701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
16059	NC_021820	CG	3	6	747744	747749	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
16060	NC_021820	GTT	2	6	747829	747834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218569
16061	NC_021820	TCA	2	6	747836	747841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218569
16062	NC_021820	GGC	2	6	747863	747868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
16063	NC_021820	GTA	2	6	747892	747897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218569
16064	NC_021820	TTA	2	6	747905	747910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218569
16065	NC_021820	TCAGCG	2	12	747981	747992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16066	NC_021820	GCA	2	6	748001	748006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16067	NC_021820	AG	3	6	748178	748183	50 %	0 %	50 %	0 %	526218569
16068	NC_021820	AGC	2	6	748195	748200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
16069	NC_021820	ACC	2	6	748368	748373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16070	NC_021820	AATT	2	8	748438	748445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_021820	TTA	2	6	748447	748452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_021820	TAAA	2	8	748466	748473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_021820	CCA	2	6	748569	748574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218570
16074	NC_021820	GCGT	2	8	748647	748654	0 %	25 %	50 %	25 %	526218570
16075	NC_021820	TGA	2	6	748714	748719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218570
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16078	NC_021820	GC	3	6	748854	748859	0 %	0 %	50 %	50 %	526218570
16079	NC_021820	CTT	2	6	748870	748875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218570
16080	NC_021820	A	7	7	748876	748882	100 %	0 %	0 %	0 %	526218570
16081	NC_021820	GTG	2	6	748925	748930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218570
16082	NC_021820	CGA	2	6	748963	748968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218570
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16084	NC_021820	GC	3	6	749058	749063	0 %	0 %	50 %	50 %	526218570
16085	NC_021820	GCG	2	6	749115	749120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_021820	A	6	6	749178	749183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_021820	T	6	6	749198	749203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_021820	GT	3	6	749218	749223	0 %	50 %	50 %	0 %	526218571
16089	NC_021820	AAT	2	6	749236	749241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218571
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16091	NC_021820	TGT	2	6	749267	749272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218571
16092	NC_021820	CCG	2	6	749315	749320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
16093	NC_021820	CGG	3	9	749368	749376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
16094	NC_021820	GC	3	6	749439	749444	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
16095	NC_021820	CGC	2	6	749451	749456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
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16099	NC_021820	GCC	2	6	749614	749619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
16100	NC_021820	CG	3	6	749640	749645	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
16101	NC_021820	GC	3	6	749700	749705	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
16102	NC_021820	GCG	2	6	749724	749729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
16103	NC_021820	GCG	2	6	749742	749747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
16104	NC_021820	TGC	2	6	749825	749830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218571
16105	NC_021820	CGC	2	6	749955	749960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
16106	NC_021820	TGA	2	6	749982	749987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218571
16107	NC_021820	CCG	2	6	750008	750013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
16108	NC_021820	CG	3	6	750033	750038	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
16109	NC_021820	AGG	2	6	750057	750062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218571
16110	NC_021820	CCAGCG	2	12	750069	750080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218571
16111	NC_021820	CCG	2	6	750132	750137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
16112	NC_021820	GC	3	6	750155	750160	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
16113	NC_021820	CAC	2	6	750175	750180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218571
16114	NC_021820	GCG	2	6	750231	750236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
16115	NC_021820	GCG	2	6	750335	750340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
16116	NC_021820	CG	3	6	750391	750396	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
16117	NC_021820	CCG	2	6	750425	750430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
16118	NC_021820	GCCA	2	8	750500	750507	25 %	0 %	25 %	50 %	526218571
16119	NC_021820	GAC	2	6	750553	750558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218571
16120	NC_021820	CTG	2	6	750586	750591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218571
16121	NC_021820	TTCC	2	8	750624	750631	0 %	50 %	0 %	50 %	526218571
16122	NC_021820	CGG	2	6	750702	750707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
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16221	NC_021820	A	6	6	755208	755213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16222	NC_021820	TTGCC	2	10	755330	755339	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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16224	NC_021820	TGT	2	6	755452	755457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16226	NC_021820	CTG	2	6	755598	755603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16228	NC_021820	A	6	6	755658	755663	100 %	0 %	0 %	0 %	526218576
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16482	NC_021820	GC	3	6	767078	767083	0 %	0 %	50 %	50 %	526221835
16483	NC_021820	CCG	2	6	767110	767115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
16484	NC_021820	ATC	2	6	767154	767159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
16485	NC_021820	CGC	2	6	767216	767221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
16486	NC_021820	CGC	2	6	767315	767320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
16487	NC_021820	GC	3	6	767327	767332	0 %	0 %	50 %	50 %	526221835
16488	NC_021820	T	7	7	767380	767386	0 %	100 %	0 %	0 %	526221835
16489	NC_021820	T	6	6	767443	767448	0 %	100 %	0 %	0 %	526221835
16490	NC_021820	TGA	2	6	767471	767476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221835
16491	NC_021820	CAG	2	6	767499	767504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221835
16492	NC_021820	CGCC	2	8	767507	767514	0 %	0 %	25 %	75 %	526221835
16493	NC_021820	CGG	2	6	767549	767554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221835
16494	NC_021820	TGG	2	6	767591	767596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221835
16495	NC_021820	CGT	2	6	767603	767608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221835
16496	NC_021820	GCC	2	6	767634	767639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
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16498	NC_021820	GCC	2	6	767778	767783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
16499	NC_021820	TTG	2	6	767809	767814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221835
16500	NC_021820	GAT	3	9	767910	767918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221835

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