MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021820	AAT	2	6	721734	721739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_021820	CAT	2	6	721748	721753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_021820	TAAT	2	8	721786	721793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_021820	GCT	2	6	721817	721822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_021820	GGC	2	6	721971	721976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_021820	CTC	3	9	722002	722010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15507	NC_021820	GAG	2	6	722030	722035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_021820	GTT	2	6	722072	722077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_021820	TTA	2	6	722078	722083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_021820	GCC	2	6	722138	722143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
15511	NC_021820	GTG	2	6	722203	722208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218550
15512	NC_021820	GCG	2	6	722220	722225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15513	NC_021820	GC	3	6	722244	722249	0 %	0 %	50 %	50 %	526218550
15514	NC_021820	CGA	2	6	722265	722270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15515	NC_021820	GCC	2	6	722316	722321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
15516	NC_021820	CTG	2	6	722405	722410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15517	NC_021820	GGT	2	6	722441	722446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218550
15518	NC_021820	GCC	2	6	722459	722464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
15519	NC_021820	TCGAT	2	10	722472	722481	20 %	40 %	20 %	20 %	526218550
15520	NC_021820	GTCA	2	8	722541	722548	25 %	25 %	25 %	25 %	526218550
15521	NC_021820	TTG	2	6	722550	722555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218550
15522	NC_021820	CGG	2	6	722647	722652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15523	NC_021820	AAG	2	6	722664	722669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218550
15524	NC_021820	CAGGC	2	10	722697	722706	20 %	0 %	40 %	40 %	526218550
15525	NC_021820	ACG	2	6	722805	722810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15526	NC_021820	GCGG	2	8	722821	722828	0 %	0 %	75 %	25 %	526218550
15527	NC_021820	CAG	2	6	722831	722836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15528	NC_021820	CGG	2	6	722889	722894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15529	NC_021820	A	6	6	722897	722902	100 %	0 %	0 %	0 %	526218550
15530	NC_021820	GCA	2	6	722914	722919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15531	NC_021820	CAT	2	6	722963	722968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218550
15532	NC_021820	CTG	2	6	723053	723058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15533	NC_021820	ACCA	2	8	723131	723138	50 %	0 %	0 %	50 %	526218550
15534	NC_021820	CCTGG	2	10	723258	723267	0 %	20 %	40 %	40 %	526218550
15535	NC_021820	GGC	2	6	723364	723369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15536	NC_021820	TGG	2	6	723384	723389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218550
15537	NC_021820	GCG	2	6	723497	723502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15538	NC_021820	A	6	6	723521	723526	100 %	0 %	0 %	0 %	526218550
15539	NC_021820	GAC	2	6	723575	723580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15540	NC_021820	CAG	2	6	723593	723598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15541	NC_021820	TCA	2	6	723642	723647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218550
15542	NC_021820	CG	3	6	723798	723803	0 %	0 %	50 %	50 %	526218550
15543	NC_021820	GGC	2	6	723823	723828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15544	NC_021820	GAA	2	6	723847	723852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218550
15545	NC_021820	CAT	2	6	723853	723858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218550
15546	NC_021820	TAA	2	6	723889	723894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218550
15547	NC_021820	CGG	2	6	723900	723905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15548	NC_021820	GGT	2	6	723922	723927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218550
15549	NC_021820	CGG	3	9	723951	723959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15550	NC_021820	CGG	3	9	723972	723980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
15551	NC_021820	CCG	2	6	724002	724007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
15552	NC_021820	CCGGCA	2	12	724020	724031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218550
15553	NC_021820	GGTG	2	8	724105	724112	0 %	25 %	75 %	0 %	526218550
15554	NC_021820	ATCTTT	2	12	724121	724132	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	526218550
15555	NC_021820	A	6	6	724196	724201	100 %	0 %	0 %	0 %	526218550
15556	NC_021820	TGC	2	6	724281	724286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218550
15557	NC_021820	G	6	6	724303	724308	0 %	0 %	100 %	0 %	526218550
15558	NC_021820	CGC	2	6	724336	724341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
15559	NC_021820	CG	3	6	724398	724403	0 %	0 %	50 %	50 %	526218550
15560	NC_021820	CG	3	6	724420	724425	0 %	0 %	50 %	50 %	526218550
15561	NC_021820	GGCA	2	8	724479	724486	25 %	0 %	50 %	25 %	526218550
15562	NC_021820	GGC	2	6	724537	724542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218551
15563	NC_021820	GGC	2	6	724618	724623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218551
15564	NC_021820	GCACG	2	10	724627	724636	20 %	0 %	40 %	40 %	526218551
15565	NC_021820	ACA	2	6	724637	724642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218551
15566	NC_021820	A	7	7	724688	724694	100 %	0 %	0 %	0 %	526218551
15567	NC_021820	GCT	2	6	724732	724737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15568	NC_021820	A	6	6	724784	724789	100 %	0 %	0 %	0 %	526218551
15569	NC_021820	TAT	2	6	724867	724872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218551
15570	NC_021820	CGC	2	6	724881	724886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218551
15571	NC_021820	GCT	2	6	724906	724911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15572	NC_021820	A	6	6	724919	724924	100 %	0 %	0 %	0 %	526218551
15573	NC_021820	G	6	6	724929	724934	0 %	0 %	100 %	0 %	526218551
15574	NC_021820	A	7	7	724965	724971	100 %	0 %	0 %	0 %	526218551
15575	NC_021820	CGG	2	6	725029	725034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218551
15576	NC_021820	CTCGT	2	10	725107	725116	0 %	40 %	20 %	40 %	526218551
15577	NC_021820	GCTG	2	8	725118	725125	0 %	25 %	50 %	25 %	526218551
15578	NC_021820	AT	4	8	725132	725139	50 %	50 %	0 %	0 %	526218551
15579	NC_021820	TGG	2	6	725189	725194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218551
15580	NC_021820	CA	3	6	725206	725211	50 %	0 %	0 %	50 %	526218551
15581	NC_021820	GC	3	6	725228	725233	0 %	0 %	50 %	50 %	526218551
15582	NC_021820	CGA	2	6	725317	725322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15583	NC_021820	GGC	2	6	725383	725388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218551
15584	NC_021820	AGC	2	6	725427	725432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15585	NC_021820	TGGC	2	8	725543	725550	0 %	25 %	50 %	25 %	526218551
15586	NC_021820	CGC	2	6	725563	725568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218551
15587	NC_021820	CTG	2	6	725569	725574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15588	NC_021820	GGC	2	6	725642	725647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218551
15589	NC_021820	GC	3	6	725697	725702	0 %	0 %	50 %	50 %	526218551
15590	NC_021820	GCC	2	6	725743	725748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218551
15591	NC_021820	CTG	2	6	725798	725803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15592	NC_021820	GCG	2	6	725823	725828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218551
15593	NC_021820	CATGT	2	10	725843	725852	20 %	40 %	20 %	20 %	526218551
15594	NC_021820	TGC	2	6	725856	725861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218551
15595	NC_021820	TGG	2	6	725867	725872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218551
15596	NC_021820	GAT	2	6	725924	725929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218551
15597	NC_021820	CG	3	6	726089	726094	0 %	0 %	50 %	50 %	526218551
15598	NC_021820	CAA	2	6	726110	726115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218551
15599	NC_021820	GGA	2	6	726409	726414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218551
15600	NC_021820	CTGG	2	8	726415	726422	0 %	25 %	50 %	25 %	526218551
15601	NC_021820	GAA	3	9	726571	726579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218551
15602	NC_021820	ATA	2	6	726580	726585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218551
15603	NC_021820	TAT	2	6	726608	726613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_021820	AGCGC	2	10	726637	726646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15605	NC_021820	TGC	2	6	726670	726675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_021820	GCC	2	6	726692	726697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15607	NC_021820	ACC	2	6	726706	726711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218552
15608	NC_021820	CAG	2	6	726720	726725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218552
15609	NC_021820	GAT	2	6	726750	726755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218552
15610	NC_021820	GA	3	6	726845	726850	50 %	0 %	50 %	0 %	526218552
15611	NC_021820	ACCG	2	8	726867	726874	25 %	0 %	25 %	50 %	526218552
15612	NC_021820	GCG	2	6	726917	726922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218552
15613	NC_021820	GCC	2	6	726930	726935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218552
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15615	NC_021820	CCG	2	6	726983	726988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218552
15616	NC_021820	GA	3	6	727013	727018	50 %	0 %	50 %	0 %	526218552
15617	NC_021820	CAT	2	6	727032	727037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218552
15618	NC_021820	CGC	2	6	727058	727063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218552
15619	NC_021820	GCC	4	12	727089	727100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218552
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15621	NC_021820	CAG	2	6	727107	727112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218552
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15762	NC_021820	TTAA	2	8	734781	734788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15765	NC_021820	ATTA	2	8	734840	734847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15766	NC_021820	TTAA	2	8	734876	734883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15985	NC_021820	TC	3	6	744928	744933	0 %	50 %	0 %	50 %	526218566
15986	NC_021820	TCTT	2	8	744990	744997	0 %	75 %	0 %	25 %	526218567
15987	NC_021820	GC	3	6	745043	745048	0 %	0 %	50 %	50 %	526218567
15988	NC_021820	T	6	6	745057	745062	0 %	100 %	0 %	0 %	526218567
15989	NC_021820	CCG	2	6	745081	745086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218567
15990	NC_021820	CCGT	2	8	745153	745160	0 %	25 %	25 %	50 %	526218567
15991	NC_021820	CGA	2	6	745201	745206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218567
15992	NC_021820	ATC	2	6	745257	745262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218567
15993	NC_021820	CG	3	6	745274	745279	0 %	0 %	50 %	50 %	526218567
15994	NC_021820	CG	3	6	745293	745298	0 %	0 %	50 %	50 %	526218567
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15996	NC_021820	TTTC	2	8	745339	745346	0 %	75 %	0 %	25 %	526218567
15997	NC_021820	CGG	2	6	745381	745386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218568
15998	NC_021820	GCG	3	9	745480	745488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218568
15999	NC_021820	GC	3	6	745558	745563	0 %	0 %	50 %	50 %	526218568
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