MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021820	TAT	2	6	700060	700065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218537
15003	NC_021820	TAA	2	6	700092	700097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218537
15004	NC_021820	GCG	2	6	700099	700104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218537
15005	NC_021820	A	7	7	700120	700126	100 %	0 %	0 %	0 %	526218537
15006	NC_021820	GGA	2	6	700332	700337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218537
15007	NC_021820	TGC	2	6	700340	700345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218537
15008	NC_021820	CAGAT	2	10	700349	700358	40 %	20 %	20 %	20 %	526218537
15009	NC_021820	ACG	2	6	700378	700383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218537
15010	NC_021820	GAA	2	6	700453	700458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218537
15011	NC_021820	CGC	2	6	700518	700523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218537
15012	NC_021820	GAT	2	6	700558	700563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218537
15013	NC_021820	TGA	2	6	700586	700591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218537
15014	NC_021820	AAG	2	6	700650	700655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_021820	TTC	2	6	700718	700723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218538
15016	NC_021820	G	6	6	700739	700744	0 %	0 %	100 %	0 %	526218538
15017	NC_021820	GAA	2	6	700802	700807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218538
15018	NC_021820	CAC	2	6	700887	700892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218538
15019	NC_021820	TCGCTG	2	12	700930	700941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218538
15020	NC_021820	GCC	2	6	700955	700960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218538
15021	NC_021820	CAT	2	6	700976	700981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218538
15022	NC_021820	AT	3	6	700980	700985	50 %	50 %	0 %	0 %	526218538
15023	NC_021820	TCA	2	6	700986	700991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218538
15024	NC_021820	ATT	2	6	701033	701038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218538
15025	NC_021820	GAT	2	6	701039	701044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218538
15026	NC_021820	ATA	2	6	701088	701093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218538
15027	NC_021820	TTA	2	6	701190	701195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218538
15028	NC_021820	ATG	2	6	701210	701215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218538
15029	NC_021820	TAG	2	6	701244	701249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218538
15030	NC_021820	GTCG	2	8	701281	701288	0 %	25 %	50 %	25 %	526218538
15031	NC_021820	GTGCTG	2	12	701319	701330	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	526218538
15032	NC_021820	CGG	2	6	701355	701360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218538
15033	NC_021820	GACG	2	8	701368	701375	25 %	0 %	50 %	25 %	526218538
15034	NC_021820	CAG	2	6	701438	701443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218538
15035	NC_021820	CTTG	2	8	701459	701466	0 %	50 %	25 %	25 %	526218538
15036	NC_021820	GAT	2	6	701473	701478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218538
15037	NC_021820	ATT	2	6	701621	701626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221827
15038	NC_021820	ATG	2	6	701648	701653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221827
15039	NC_021820	CGC	2	6	701681	701686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221827
15040	NC_021820	AAT	2	6	701696	701701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221827
15041	NC_021820	TTC	2	6	701707	701712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221827
15042	NC_021820	GCG	2	6	701739	701744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221827
15043	NC_021820	CCA	2	6	701834	701839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221827
15044	NC_021820	C	6	6	701850	701855	0 %	0 %	0 %	100 %	526221827
15045	NC_021820	TCA	2	6	701978	701983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221827
15046	NC_021820	GAT	2	6	702060	702065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221827
15047	NC_021820	CTG	2	6	702069	702074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221827
15048	NC_021820	TCT	2	6	702079	702084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221827
15049	NC_021820	TGG	2	6	702115	702120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221827
15050	NC_021820	T	6	6	702201	702206	0 %	100 %	0 %	0 %	526221827
15051	NC_021820	CCT	2	6	702233	702238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221827
15052	NC_021820	GACT	2	8	702242	702249	25 %	25 %	25 %	25 %	526221827
15053	NC_021820	TTG	2	6	702256	702261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221827
15054	NC_021820	AAG	2	6	702283	702288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221827
15055	NC_021820	CGC	2	6	702392	702397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221827
15056	NC_021820	CAT	2	6	702408	702413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221827
15057	NC_021820	ATC	2	6	702535	702540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221827
15058	NC_021820	TGC	2	6	702548	702553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221827
15059	NC_021820	AGC	2	6	702561	702566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221827
15060	NC_021820	CGC	2	6	702591	702596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221827
15061	NC_021820	GTG	2	6	702616	702621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221827
15062	NC_021820	TGG	2	6	702649	702654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221827
15063	NC_021820	GCA	2	6	702698	702703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221827
15064	NC_021820	CGG	2	6	702785	702790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221827
15065	NC_021820	TGC	2	6	702805	702810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221827
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15067	NC_021820	CCG	2	6	702910	702915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221827
15068	NC_021820	GCG	2	6	702946	702951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221827
15069	NC_021820	CAT	2	6	703004	703009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221827
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15072	NC_021820	CCG	2	6	703141	703146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221827
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15077	NC_021820	TGC	2	6	703393	703398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221828
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15079	NC_021820	CTG	2	6	703483	703488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221828
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15085	NC_021820	CAT	2	6	703664	703669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221828
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15091	NC_021820	CGC	2	6	703972	703977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221828
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15094	NC_021820	GC	3	6	704043	704048	0 %	0 %	50 %	50 %	526221828
15095	NC_021820	AG	4	8	704121	704128	50 %	0 %	50 %	0 %	526221828
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15102	NC_021820	CAG	2	6	704372	704377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221828
15103	NC_021820	CGA	2	6	704395	704400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221828
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15107	NC_021820	GCC	2	6	704540	704545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221828
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15112	NC_021820	AAGG	2	8	704769	704776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_021820	TAC	2	6	705011	705016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218539
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15117	NC_021820	TTG	2	6	705268	705273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218539
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15119	NC_021820	GTT	2	6	705387	705392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218539
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15356	NC_021820	CTGG	2	8	715451	715458	0 %	25 %	50 %	25 %	526221830
15357	NC_021820	GCGCG	2	10	715495	715504	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15358	NC_021820	ATC	2	6	715539	715544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15481	NC_021820	A	6	6	720924	720929	100 %	0 %	0 %	0 %	526218549
15482	NC_021820	TTGCT	2	10	720930	720939	0 %	60 %	20 %	20 %	526218549
15483	NC_021820	CTG	2	6	720960	720965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
15484	NC_021820	CGCGCA	2	12	720989	721000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218549
15485	NC_021820	ATA	2	6	721034	721039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218549
15486	NC_021820	CCA	2	6	721040	721045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218549
15487	NC_021820	CGT	2	6	721088	721093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
15488	NC_021820	GTC	2	6	721122	721127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
15489	NC_021820	AG	3	6	721184	721189	50 %	0 %	50 %	0 %	526218549
15490	NC_021820	TCGCT	2	10	721223	721232	0 %	40 %	20 %	40 %	526218549
15491	NC_021820	TCG	2	6	721312	721317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
15492	NC_021820	AG	3	6	721318	721323	50 %	0 %	50 %	0 %	526218549
15493	NC_021820	CGC	2	6	721347	721352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218549
15494	NC_021820	CAG	2	6	721385	721390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
15495	NC_021820	GAC	2	6	721481	721486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
15496	NC_021820	TCACT	2	10	721514	721523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15497	NC_021820	G	6	6	721533	721538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_021820	T	8	8	721547	721554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_021820	TAAT	2	8	721563	721570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_021820	A	6	6	721667	721672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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