MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021820	CG	4	8	633858	633865	0 %	0 %	50 %	50 %	526218486
13502	NC_021820	CGG	2	6	633876	633881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218486
13503	NC_021820	TGGA	2	8	633886	633893	25 %	25 %	50 %	0 %	526218486
13504	NC_021820	CAT	2	6	634048	634053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218486
13505	NC_021820	CCG	2	6	634073	634078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218486
13506	NC_021820	GCG	2	6	634094	634099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218486
13507	NC_021820	CTG	2	6	634216	634221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218486
13508	NC_021820	GGC	2	6	634233	634238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218486
13509	NC_021820	GGC	2	6	634251	634256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218486
13510	NC_021820	A	6	6	634363	634368	100 %	0 %	0 %	0 %	526218486
13511	NC_021820	GTG	2	6	634378	634383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218486
13512	NC_021820	GGC	2	6	634435	634440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218486
13513	NC_021820	CTA	2	6	634452	634457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218486
13514	NC_021820	GGC	2	6	634482	634487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218486
13515	NC_021820	GAG	2	6	634507	634512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218486
13516	NC_021820	GGT	2	6	634570	634575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218486
13517	NC_021820	TGA	2	6	634778	634783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218487
13518	NC_021820	CGC	2	6	634784	634789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218487
13519	NC_021820	CGA	2	6	634812	634817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218487
13520	NC_021820	CGG	2	6	634827	634832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218487
13521	NC_021820	TCG	2	6	634838	634843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218487
13522	NC_021820	CGG	2	6	634851	634856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218487
13523	NC_021820	CGG	3	9	634881	634889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218487
13524	NC_021820	GCG	2	6	634892	634897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218487
13525	NC_021820	CGTC	2	8	634991	634998	0 %	25 %	25 %	50 %	526218487
13526	NC_021820	GGT	2	6	635031	635036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218487
13527	NC_021820	GCT	2	6	635043	635048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218487
13528	NC_021820	CG	3	6	635063	635068	0 %	0 %	50 %	50 %	526218487
13529	NC_021820	GGC	2	6	635089	635094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218487
13530	NC_021820	CGC	2	6	635156	635161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218487
13531	NC_021820	GGT	2	6	635169	635174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218487
13532	NC_021820	GC	3	6	635210	635215	0 %	0 %	50 %	50 %	526218487
13533	NC_021820	GAA	2	6	635220	635225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218487
13534	NC_021820	TGG	2	6	635249	635254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218487
13535	NC_021820	CTG	2	6	635278	635283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218487
13536	NC_021820	GTG	2	6	635314	635319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218487
13537	NC_021820	GCC	2	6	635340	635345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218487
13538	NC_021820	ATT	2	6	635475	635480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_021820	CAC	2	6	635582	635587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218488
13540	NC_021820	CCG	2	6	635700	635705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218488
13541	NC_021820	GGC	3	9	635714	635722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218488
13542	NC_021820	TGC	2	6	635763	635768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13543	NC_021820	GCG	2	6	635778	635783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218488
13544	NC_021820	GC	3	6	635800	635805	0 %	0 %	50 %	50 %	526218488
13545	NC_021820	CAA	2	6	635810	635815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218488
13546	NC_021820	CGG	5	15	635896	635910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218488
13547	NC_021820	GC	3	6	635923	635928	0 %	0 %	50 %	50 %	526218488
13548	NC_021820	CTTTGC	2	12	635971	635982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526218488
13549	NC_021820	CGA	2	6	636022	636027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13550	NC_021820	ATG	2	6	636089	636094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218488
13551	NC_021820	TTA	2	6	636099	636104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218488
13552	NC_021820	AAG	2	6	636111	636116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218488
13553	NC_021820	ATC	2	6	636168	636173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218488
13554	NC_021820	AGA	2	6	636235	636240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218488
13555	NC_021820	GAC	2	6	636248	636253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13556	NC_021820	GAC	2	6	636326	636331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13557	NC_021820	AGT	2	6	636339	636344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218488
13558	NC_021820	CAG	2	6	636347	636352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13559	NC_021820	CAA	2	6	636439	636444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218488
13560	NC_021820	AGCGAT	2	12	636510	636521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526218488
13561	NC_021820	AG	3	6	636602	636607	50 %	0 %	50 %	0 %	526218488
13562	NC_021820	GCC	2	6	636782	636787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218488
13563	NC_021820	TGC	2	6	636812	636817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13564	NC_021820	TAA	2	6	636832	636837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218488
13565	NC_021820	A	6	6	636932	636937	100 %	0 %	0 %	0 %	526218488
13566	NC_021820	GAA	2	6	636944	636949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218488
13567	NC_021820	TGC	2	6	636960	636965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218488
13568	NC_021820	TTA	2	6	637082	637087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_021820	TTA	2	6	637102	637107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_021820	ATG	2	6	637165	637170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_021820	GAA	2	6	637184	637189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_021820	G	6	6	637190	637195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_021820	GTT	3	9	637223	637231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_021820	GCC	2	6	637296	637301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13575	NC_021820	CGGCA	2	10	637305	637314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13576	NC_021820	CTT	2	6	637324	637329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218489
13577	NC_021820	GC	3	6	637382	637387	0 %	0 %	50 %	50 %	526218489
13578	NC_021820	AGA	2	6	637388	637393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218489
13579	NC_021820	TGA	2	6	637419	637424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218489
13580	NC_021820	CGC	2	6	637486	637491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218489
13581	NC_021820	GTG	2	6	637550	637555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218489
13582	NC_021820	TTC	2	6	637559	637564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218489
13583	NC_021820	GC	3	6	637670	637675	0 %	0 %	50 %	50 %	526218489
13584	NC_021820	ACTTT	2	10	637701	637710	20 %	60 %	0 %	20 %	526218489
13585	NC_021820	GA	3	6	637716	637721	50 %	0 %	50 %	0 %	526218489
13586	NC_021820	GCC	2	6	637809	637814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13587	NC_021820	CTTG	2	8	637914	637921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13588	NC_021820	AGTT	2	8	637924	637931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_021820	A	7	7	637979	637985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_021820	GTA	2	6	638052	638057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_021820	GAG	2	6	638133	638138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_021820	GC	3	6	638198	638203	0 %	0 %	50 %	50 %	526218490
13593	NC_021820	GGC	3	9	638276	638284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218490
13594	NC_021820	CAA	2	6	638308	638313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218490
13595	NC_021820	TGGTA	2	10	638325	638334	20 %	40 %	40 %	0 %	526218490
13596	NC_021820	ATC	2	6	638358	638363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218490
13597	NC_021820	ATG	2	6	638364	638369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218490
13598	NC_021820	GCC	2	6	638400	638405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218490
13599	NC_021820	CTG	2	6	638411	638416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218490
13600	NC_021820	TGG	3	9	638436	638444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218490
13601	NC_021820	A	7	7	638479	638485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_021820	CGC	2	6	638533	638538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13603	NC_021820	AAT	2	6	638619	638624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218491
13604	NC_021820	AAT	2	6	638658	638663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218491
13605	NC_021820	CGC	2	6	638664	638669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218491
13606	NC_021820	CGC	2	6	638726	638731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218491
13607	NC_021820	GCC	2	6	638824	638829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218491
13608	NC_021820	T	6	6	638868	638873	0 %	100 %	0 %	0 %	526218491
13609	NC_021820	ATC	2	6	638917	638922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218491
13610	NC_021820	CAG	2	6	639012	639017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218491
13611	NC_021820	GCT	2	6	639030	639035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218491
13612	NC_021820	GTCG	2	8	639060	639067	0 %	25 %	50 %	25 %	526218491
13613	NC_021820	CAG	2	6	639270	639275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218491
13614	NC_021820	GCT	2	6	639284	639289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218491
13615	NC_021820	TTG	2	6	639307	639312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218491
13616	NC_021820	CG	3	6	639320	639325	0 %	0 %	50 %	50 %	526218491
13617	NC_021820	ACGCC	2	10	639446	639455	20 %	0 %	20 %	60 %	526218491
13618	NC_021820	CGG	2	6	639492	639497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218491
13619	NC_021820	TCTT	2	8	639511	639518	0 %	75 %	0 %	25 %	526218491
13620	NC_021820	GCG	2	6	639576	639581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218491
13621	NC_021820	CCG	2	6	639598	639603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218491
13622	NC_021820	CCA	2	6	639680	639685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218491
13623	NC_021820	TCA	2	6	639698	639703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218491
13624	NC_021820	CGC	2	6	639801	639806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218491
13625	NC_021820	C	6	6	639907	639912	0 %	0 %	0 %	100 %	526218491
13626	NC_021820	A	6	6	639924	639929	100 %	0 %	0 %	0 %	526218491
13627	NC_021820	CCG	2	6	639938	639943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218491
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13633	NC_021820	TTTG	2	8	640214	640221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13634	NC_021820	TA	3	6	640242	640247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13635	NC_021820	GA	3	6	640327	640332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13641	NC_021820	CTG	2	6	640518	640523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218492
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13643	NC_021820	GAT	2	6	640652	640657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218492
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13662	NC_021820	TGA	3	9	641642	641650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13664	NC_021820	TCG	2	6	641725	641730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13665	NC_021820	CTTTT	2	10	641739	641748	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13666	NC_021820	T	6	6	641745	641750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13667	NC_021820	CGG	2	6	641791	641796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13669	NC_021820	CGG	2	6	641832	641837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13670	NC_021820	TGGTG	2	10	641867	641876	0 %	40 %	60 %	0 %	526218493
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13737	NC_021820	AGG	2	6	644962	644967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218494
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13740	NC_021820	CGCTAT	2	12	645024	645035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526218494
13741	NC_021820	CGG	2	6	645070	645075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218494
13742	NC_021820	GCT	3	9	645083	645091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
13743	NC_021820	ATG	2	6	645093	645098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218494
13744	NC_021820	GTG	2	6	645126	645131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218494
13745	NC_021820	GAT	2	6	645152	645157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218494
13746	NC_021820	CGA	2	6	645175	645180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218494
13747	NC_021820	AAC	2	6	645205	645210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218494
13748	NC_021820	CTT	2	6	645239	645244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218494
13749	NC_021820	GC	3	6	645253	645258	0 %	0 %	50 %	50 %	526218494
13750	NC_021820	GCT	2	6	645320	645325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
13751	NC_021820	TCA	2	6	645331	645336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218494
13752	NC_021820	GCT	2	6	645353	645358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
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13755	NC_021820	GATC	2	8	645446	645453	25 %	25 %	25 %	25 %	526218494
13756	NC_021820	CG	4	8	645524	645531	0 %	0 %	50 %	50 %	526218494
13757	NC_021820	TTAT	2	8	645573	645580	25 %	75 %	0 %	0 %	526218494
13758	NC_021820	GGT	2	6	645602	645607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218494
13759	NC_021820	CTG	3	9	645624	645632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
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13762	NC_021820	CTG	2	6	645701	645706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218495
13763	NC_021820	CTC	2	6	645760	645765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218495
13764	NC_021820	ATCGCC	2	12	645803	645814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526218495
13765	NC_021820	GCC	2	6	645877	645882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218495
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13771	NC_021820	GGC	2	6	646178	646183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218495
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13774	NC_021820	ATG	2	6	646310	646315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218495
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13776	NC_021820	GATC	2	8	646410	646417	25 %	25 %	25 %	25 %	526218495
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13782	NC_021820	CTG	2	6	646700	646705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218495
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13786	NC_021820	GGC	2	6	646790	646795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13787	NC_021820	AAGCG	2	10	646845	646854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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13814	NC_021820	GAG	2	6	647963	647968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13839	NC_021820	CAG	2	6	648992	648997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218498
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13842	NC_021820	ACT	2	6	649103	649108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13844	NC_021820	AGAAA	2	10	649131	649140	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13845	NC_021820	TGT	2	6	649144	649149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13849	NC_021820	T	6	6	649446	649451	0 %	100 %	0 %	0 %	526218499
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13853	NC_021820	GCGTCG	2	12	649583	649594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218499
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13857	NC_021820	GTATG	2	10	649833	649842	20 %	40 %	40 %	0 %	526218499
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13862	NC_021820	GTG	2	6	650146	650151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218499
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13864	NC_021820	GCG	2	6	650185	650190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218499
13865	NC_021820	TGA	2	6	650255	650260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218499
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13984	NC_021820	C	6	6	655364	655369	0 %	0 %	0 %	100 %	526218503
13985	NC_021820	GGC	2	6	655370	655375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218503
13986	NC_021820	ATA	2	6	655383	655388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218503
13987	NC_021820	GGC	2	6	655502	655507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218503
13988	NC_021820	CAG	2	6	655538	655543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218503
13989	NC_021820	GCC	2	6	655554	655559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218503
13990	NC_021820	CCG	2	6	655561	655566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218503
13991	NC_021820	GC	3	6	655582	655587	0 %	0 %	50 %	50 %	526218503
13992	NC_021820	GGC	2	6	655592	655597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218503
13993	NC_021820	TCA	2	6	655603	655608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218503
13994	NC_021820	TCA	2	6	655639	655644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218503
13995	NC_021820	GACC	2	8	655675	655682	25 %	0 %	25 %	50 %	526218503
13996	NC_021820	GTG	2	6	655686	655691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218503
13997	NC_021820	GGT	2	6	655717	655722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218503
13998	NC_021820	CAT	2	6	655751	655756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218503
13999	NC_021820	TAA	2	6	655768	655773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218503
14000	NC_021820	GCG	2	6	655806	655811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218503

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