MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021820	CG	3	6	587008	587013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12502	NC_021820	CG	3	6	587044	587049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_021820	GC	3	6	587074	587079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_021820	GTG	2	6	587098	587103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_021820	GACC	2	8	587116	587123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_021820	GAA	2	6	587179	587184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_021820	CAAC	2	8	587193	587200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_021820	GTCA	2	8	587213	587220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12509	NC_021820	GAT	2	6	587239	587244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_021820	A	6	6	587316	587321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_021820	GAA	2	6	587333	587338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_021820	CTG	2	6	587460	587465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_021820	GAT	2	6	587468	587473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_021820	CGG	2	6	587486	587491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_021820	TTA	2	6	587498	587503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_021820	GCG	2	6	587549	587554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_021820	CGT	2	6	587670	587675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_021820	GAT	2	6	587690	587695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_021820	CGG	2	6	587750	587755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_021820	CAGCGT	2	12	587757	587768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_021820	CGA	2	6	587816	587821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_021820	GC	3	6	587849	587854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_021820	TGA	2	6	587869	587874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_021820	GGT	2	6	587930	587935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_021820	CGCCA	2	10	588050	588059	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12526	NC_021820	CGC	2	6	588127	588132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_021820	ACG	2	6	588208	588213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_021820	TGG	2	6	588220	588225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_021820	GGC	2	6	588294	588299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_021820	TCAA	2	8	588380	588387	50 %	25 %	0 %	25 %	526218462
12531	NC_021820	TAA	2	6	588391	588396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12532	NC_021820	CAA	2	6	588409	588414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218462
12533	NC_021820	AAT	2	6	588496	588501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12534	NC_021820	CGAAA	2	10	588560	588569	60 %	0 %	20 %	20 %	526218462
12535	NC_021820	ATA	2	6	588647	588652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12536	NC_021820	TAAA	2	8	588700	588707	75 %	25 %	0 %	0 %	526218462
12537	NC_021820	GAT	2	6	588763	588768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218462
12538	NC_021820	ACGAGA	2	12	588861	588872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	526218462
12539	NC_021820	AAT	2	6	588880	588885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12540	NC_021820	ATGCG	2	10	588908	588917	20 %	20 %	40 %	20 %	526218462
12541	NC_021820	TGAA	2	8	588995	589002	50 %	25 %	25 %	0 %	526218462
12542	NC_021820	AAG	2	6	589013	589018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218462
12543	NC_021820	GAAA	2	8	589047	589054	75 %	0 %	25 %	0 %	526218462
12544	NC_021820	GCG	2	6	589061	589066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218462
12545	NC_021820	ATC	2	6	589103	589108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218462
12546	NC_021820	ACC	3	9	589142	589150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218462
12547	NC_021820	ATA	2	6	589170	589175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12548	NC_021820	CCG	2	6	589184	589189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218462
12549	NC_021820	CCA	2	6	589200	589205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218462
12550	NC_021820	ATA	2	6	589232	589237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12551	NC_021820	AGG	2	6	589281	589286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218462
12552	NC_021820	ACC	2	6	589298	589303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218462
12553	NC_021820	AATA	2	8	589311	589318	75 %	25 %	0 %	0 %	526218462
12554	NC_021820	ATA	2	6	589394	589399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12555	NC_021820	GAT	2	6	589480	589485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218462
12556	NC_021820	TAA	2	6	589494	589499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218462
12557	NC_021820	GTC	2	6	589663	589668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218462
12558	NC_021820	CT	3	6	589702	589707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_021820	TGC	2	6	589717	589722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_021820	TGC	2	6	589798	589803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_021820	CTG	2	6	589808	589813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_021820	AAT	2	6	589831	589836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_021820	TCG	2	6	589838	589843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_021820	TCG	2	6	589877	589882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_021820	GAG	2	6	589981	589986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_021820	CAG	2	6	590127	590132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_021820	CGG	2	6	590181	590186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_021820	CAA	2	6	590302	590307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_021820	GGC	2	6	590308	590313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_021820	TCT	2	6	590342	590347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221811
12571	NC_021820	CCG	2	6	590443	590448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_021820	CGC	2	6	590529	590534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221812
12573	NC_021820	CAC	2	6	590572	590577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221812
12574	NC_021820	GCT	2	6	590707	590712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12575	NC_021820	GC	3	6	590733	590738	0 %	0 %	50 %	50 %	526221812
12576	NC_021820	A	6	6	590761	590766	100 %	0 %	0 %	0 %	526221812
12577	NC_021820	CGCC	2	8	590772	590779	0 %	0 %	25 %	75 %	526221812
12578	NC_021820	GC	3	6	590847	590852	0 %	0 %	50 %	50 %	526221812
12579	NC_021820	ACG	2	6	590867	590872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12580	NC_021820	AAG	2	6	590912	590917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221812
12581	NC_021820	GC	3	6	590943	590948	0 %	0 %	50 %	50 %	526221812
12582	NC_021820	CCG	2	6	590961	590966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221812
12583	NC_021820	GCA	2	6	591006	591011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12584	NC_021820	AAAG	2	8	591016	591023	75 %	0 %	25 %	0 %	526221812
12585	NC_021820	TTC	2	6	591049	591054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221812
12586	NC_021820	CAG	2	6	591115	591120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12587	NC_021820	TCA	2	6	591144	591149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221812
12588	NC_021820	CCG	2	6	591164	591169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221812
12589	NC_021820	CTT	2	6	591180	591185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221812
12590	NC_021820	GCC	2	6	591193	591198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221812
12591	NC_021820	CAT	2	6	591217	591222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221812
12592	NC_021820	GC	3	6	591323	591328	0 %	0 %	50 %	50 %	526221812
12593	NC_021820	GCC	2	6	591341	591346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221812
12594	NC_021820	TGA	2	6	591465	591470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221812
12595	NC_021820	CGT	2	6	591517	591522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12596	NC_021820	TTC	2	6	591532	591537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221812
12597	NC_021820	GTC	2	6	591578	591583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12598	NC_021820	GGC	2	6	591584	591589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221812
12599	NC_021820	GTC	2	6	591668	591673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12600	NC_021820	TGGC	2	8	591685	591692	0 %	25 %	50 %	25 %	526221812
12601	NC_021820	ATG	2	6	591749	591754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221812
12602	NC_021820	CAG	2	6	591808	591813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12603	NC_021820	TAA	2	6	591843	591848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221812
12604	NC_021820	CGGGC	2	10	591922	591931	0 %	0 %	60 %	40 %	526221812
12605	NC_021820	CAG	2	6	592081	592086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221812
12606	NC_021820	T	6	6	592185	592190	0 %	100 %	0 %	0 %	526221812
12607	NC_021820	GCG	2	6	592212	592217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221813
12608	NC_021820	AGC	2	6	592258	592263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221813
12609	NC_021820	GC	3	6	592296	592301	0 %	0 %	50 %	50 %	526221813
12610	NC_021820	GAAA	2	8	592316	592323	75 %	0 %	25 %	0 %	526221813
12611	NC_021820	GC	3	6	592328	592333	0 %	0 %	50 %	50 %	526221813
12612	NC_021820	A	6	6	592334	592339	100 %	0 %	0 %	0 %	526221813
12613	NC_021820	AAT	2	6	592341	592346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221813
12614	NC_021820	TCA	2	6	592367	592372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221813
12615	NC_021820	GTC	2	6	592391	592396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221814
12616	NC_021820	ACG	2	6	592421	592426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221814
12617	NC_021820	TTA	2	6	592453	592458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221814
12618	NC_021820	GCG	2	6	592486	592491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221814
12619	NC_021820	GCC	2	6	592670	592675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221814
12620	NC_021820	ATA	2	6	592683	592688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221814
12621	NC_021820	CGGTT	2	10	592693	592702	0 %	40 %	40 %	20 %	526221814
12622	NC_021820	CGG	2	6	592780	592785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221814
12623	NC_021820	TCA	2	6	592801	592806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221814
12624	NC_021820	ATGG	2	8	592811	592818	25 %	25 %	50 %	0 %	526221814
12625	NC_021820	GTG	2	6	592884	592889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221814
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12743	NC_021820	GCT	2	6	598787	598792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218465
12744	NC_021820	GC	3	6	598794	598799	0 %	0 %	50 %	50 %	526218465
12745	NC_021820	ATG	2	6	598807	598812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218465
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12753	NC_021820	GCT	2	6	599432	599437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218465
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12761	NC_021820	CTG	2	6	599772	599777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218465
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12851	NC_021820	GCG	2	6	603560	603565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218466
12852	NC_021820	CAG	2	6	603578	603583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218466
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12855	NC_021820	CGGATG	2	12	603750	603761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526218466
12856	NC_021820	ATA	2	6	603771	603776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218466
12857	NC_021820	ACG	2	6	603887	603892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218466
12858	NC_021820	GGC	2	6	603923	603928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218466
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12860	NC_021820	TCG	2	6	603979	603984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218466
12861	NC_021820	GCT	2	6	604000	604005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218466
12862	NC_021820	CAG	2	6	604030	604035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218466
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12978	NC_021820	GCC	2	6	610046	610051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12979	NC_021820	AGCGC	2	10	610065	610074	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12980	NC_021820	CGT	2	6	610110	610115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218469
12981	NC_021820	AAT	2	6	610120	610125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218469
12982	NC_021820	GCC	2	6	610192	610197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218469
12983	NC_021820	AACG	2	8	610203	610210	50 %	0 %	25 %	25 %	526218469
12984	NC_021820	GTG	2	6	610247	610252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218469
12985	NC_021820	ACC	2	6	610346	610351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218469
12986	NC_021820	CTG	2	6	610480	610485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218469
12987	NC_021820	TTC	2	6	610489	610494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218469
12988	NC_021820	TTA	2	6	610523	610528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218469
12989	NC_021820	CCG	2	6	610544	610549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218469
12990	NC_021820	CAG	2	6	610576	610581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218469
12991	NC_021820	GCTC	2	8	610677	610684	0 %	25 %	25 %	50 %	526218469
12992	NC_021820	CCAG	2	8	610686	610693	25 %	0 %	25 %	50 %	526218469
12993	NC_021820	AGT	2	6	610719	610724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218469
12994	NC_021820	TGC	2	6	610820	610825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218469
12995	NC_021820	CGC	2	6	610941	610946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218469
12996	NC_021820	AAT	2	6	611085	611090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12997	NC_021820	ATT	2	6	611107	611112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12998	NC_021820	T	7	7	611111	611117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12999	NC_021820	GAT	2	6	611253	611258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218470
13000	NC_021820	CAG	2	6	611272	611277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218470

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