MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021820	CCG	2	6	539501	539506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218430
11502	NC_021820	CAT	2	6	539554	539559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218430
11503	NC_021820	CAG	2	6	539566	539571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11504	NC_021820	GCC	2	6	539656	539661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218430
11505	NC_021820	GCC	2	6	539713	539718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218430
11506	NC_021820	CAAAA	2	10	539740	539749	80 %	0 %	0 %	20 %	526218430
11507	NC_021820	A	6	6	539746	539751	100 %	0 %	0 %	0 %	526218430
11508	NC_021820	AGC	2	6	539842	539847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11509	NC_021820	AGC	3	9	539855	539863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11510	NC_021820	GCAG	2	8	539901	539908	25 %	0 %	50 %	25 %	526218430
11511	NC_021820	CAC	2	6	539920	539925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218430
11512	NC_021820	GTT	2	6	539951	539956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218431
11513	NC_021820	TTA	2	6	539975	539980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218431
11514	NC_021820	CAG	2	6	540159	540164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218431
11515	NC_021820	GA	3	6	540166	540171	50 %	0 %	50 %	0 %	526218431
11516	NC_021820	CCA	2	6	540200	540205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218431
11517	NC_021820	CGTAA	2	10	540323	540332	40 %	20 %	20 %	20 %	526218431
11518	NC_021820	TAA	2	6	540341	540346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218431
11519	NC_021820	TTTC	2	8	540436	540443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_021820	TGA	2	6	540527	540532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_021820	GCG	2	6	540549	540554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218432
11522	NC_021820	TCA	2	6	540566	540571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218432
11523	NC_021820	AT	3	6	540590	540595	50 %	50 %	0 %	0 %	526218432
11524	NC_021820	CAA	2	6	540633	540638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218432
11525	NC_021820	GCG	3	9	540670	540678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218432
11526	NC_021820	TCA	2	6	540707	540712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218432
11527	NC_021820	TCCA	2	8	540771	540778	25 %	25 %	0 %	50 %	526218432
11528	NC_021820	CTG	2	6	540828	540833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218432
11529	NC_021820	AG	3	6	540850	540855	50 %	0 %	50 %	0 %	526218432
11530	NC_021820	GC	3	6	540879	540884	0 %	0 %	50 %	50 %	526218432
11531	NC_021820	GC	3	6	541041	541046	0 %	0 %	50 %	50 %	526218432
11532	NC_021820	GGC	2	6	541092	541097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218432
11533	NC_021820	TCT	2	6	541151	541156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218432
11534	NC_021820	GTA	2	6	541170	541175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218432
11535	NC_021820	CCG	2	6	541225	541230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218432
11536	NC_021820	CGG	2	6	541240	541245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218432
11537	NC_021820	TCG	2	6	541312	541317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218432
11538	NC_021820	GCT	2	6	541346	541351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218432
11539	NC_021820	AG	3	6	541377	541382	50 %	0 %	50 %	0 %	526218432
11540	NC_021820	GCC	2	6	541385	541390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218432
11541	NC_021820	ATA	2	6	541453	541458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218432
11542	NC_021820	TAT	2	6	541466	541471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218432
11543	NC_021820	TTA	2	6	541560	541565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218433
11544	NC_021820	AATG	2	8	541625	541632	50 %	25 %	25 %	0 %	526218433
11545	NC_021820	A	6	6	541654	541659	100 %	0 %	0 %	0 %	526218433
11546	NC_021820	TAA	2	6	541676	541681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218433
11547	NC_021820	TGATT	2	10	541690	541699	20 %	60 %	20 %	0 %	526218433
11548	NC_021820	GCG	2	6	541766	541771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218433
11549	NC_021820	CAG	2	6	541792	541797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218433
11550	NC_021820	GGT	2	6	541805	541810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218433
11551	NC_021820	ATG	2	6	541965	541970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218433
11552	NC_021820	GTC	2	6	542008	542013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221800
11553	NC_021820	CGG	2	6	542030	542035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221800
11554	NC_021820	CAG	2	6	542044	542049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221800
11555	NC_021820	GTC	2	6	542089	542094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221800
11556	NC_021820	GGT	2	6	542107	542112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221800
11557	NC_021820	GCG	2	6	542326	542331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221800
11558	NC_021820	TCG	2	6	542375	542380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221800
11559	NC_021820	CCG	2	6	542384	542389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221800
11560	NC_021820	ACATCG	2	12	542445	542456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526221800
11561	NC_021820	CGA	2	6	542493	542498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221800
11562	NC_021820	C	6	6	542532	542537	0 %	0 %	0 %	100 %	526221800
11563	NC_021820	CGG	2	6	542539	542544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221800
11564	NC_021820	CCG	2	6	542592	542597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221800
11565	NC_021820	GCC	2	6	542614	542619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221800
11566	NC_021820	CCA	2	6	542649	542654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221800
11567	NC_021820	CAT	2	6	542695	542700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221800
11568	NC_021820	GC	3	6	542726	542731	0 %	0 %	50 %	50 %	526221800
11569	NC_021820	AAT	2	6	542791	542796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221800
11570	NC_021820	GGT	2	6	542866	542871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221800
11571	NC_021820	GCGA	2	8	542872	542879	25 %	0 %	50 %	25 %	526221800
11572	NC_021820	TCG	2	6	542894	542899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221800
11573	NC_021820	T	7	7	543015	543021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_021820	AT	3	6	543057	543062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_021820	ATC	2	6	543115	543120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_021820	T	6	6	543129	543134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_021820	AC	3	6	543156	543161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11578	NC_021820	GA	3	6	543192	543197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_021820	TGA	2	6	543204	543209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218434
11580	NC_021820	AAC	2	6	543215	543220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218434
11581	NC_021820	TTG	2	6	543359	543364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218434
11582	NC_021820	CGG	2	6	543402	543407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218434
11583	NC_021820	GAC	2	6	543424	543429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218434
11584	NC_021820	ATC	2	6	543473	543478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218434
11585	NC_021820	GCACC	2	10	543488	543497	20 %	0 %	20 %	60 %	526218434
11586	NC_021820	ACC	2	6	543515	543520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218434
11587	NC_021820	ACC	2	6	543587	543592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218434
11588	NC_021820	TGC	2	6	543597	543602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218434
11589	NC_021820	AGATC	2	10	543715	543724	40 %	20 %	20 %	20 %	526218434
11590	NC_021820	GAA	2	6	543815	543820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218434
11591	NC_021820	GCG	2	6	544070	544075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_021820	CT	3	6	544084	544089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_021820	TAT	2	6	544134	544139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218435
11594	NC_021820	GTG	2	6	544189	544194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218435
11595	NC_021820	CAG	2	6	544207	544212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218435
11596	NC_021820	GCG	2	6	544219	544224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218435
11597	NC_021820	GAC	2	6	544227	544232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218435
11598	NC_021820	CAC	2	6	544278	544283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218435
11599	NC_021820	TGG	2	6	544439	544444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218435
11600	NC_021820	GC	3	6	544457	544462	0 %	0 %	50 %	50 %	526218435
11601	NC_021820	GCGT	2	8	544507	544514	0 %	25 %	50 %	25 %	526218435
11602	NC_021820	GCA	2	6	544552	544557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218435
11603	NC_021820	CAGCGC	2	12	544564	544575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218435
11604	NC_021820	CGT	2	6	544598	544603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_021820	ATG	2	6	544614	544619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_021820	TCT	2	6	544661	544666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218436
11607	NC_021820	CGCC	2	8	544680	544687	0 %	0 %	25 %	75 %	526218436
11608	NC_021820	GT	4	8	544732	544739	0 %	50 %	50 %	0 %	526218436
11609	NC_021820	GAAA	2	8	544764	544771	75 %	0 %	25 %	0 %	526218436
11610	NC_021820	CGC	2	6	544794	544799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218436
11611	NC_021820	GC	3	6	544798	544803	0 %	0 %	50 %	50 %	526218436
11612	NC_021820	GGT	2	6	544828	544833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218436
11613	NC_021820	TTC	2	6	544900	544905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218436
11614	NC_021820	CGA	2	6	544916	544921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218436
11615	NC_021820	TAG	2	6	544952	544957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218436
11616	NC_021820	GCA	2	6	544986	544991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218436
11617	NC_021820	CAT	2	6	545017	545022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218436
11618	NC_021820	TGA	2	6	545052	545057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218436
11619	NC_021820	GAT	2	6	545101	545106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218436
11620	NC_021820	ATA	2	6	545159	545164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218436
11621	NC_021820	GC	3	6	545182	545187	0 %	0 %	50 %	50 %	526218436
11622	NC_021820	ATCA	2	8	545230	545237	50 %	25 %	0 %	25 %	526218436
11623	NC_021820	TGT	2	6	545247	545252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218436
11624	NC_021820	TCA	2	6	545277	545282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218436
11625	NC_021820	TCG	2	6	545288	545293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218436
11626	NC_021820	GGTTG	2	10	545308	545317	0 %	40 %	60 %	0 %	526218436
11627	NC_021820	ATC	2	6	545336	545341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218436
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11630	NC_021820	GTC	2	6	545440	545445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218436
11631	NC_021820	ATCCC	2	10	545602	545611	20 %	20 %	0 %	60 %	526218436
11632	NC_021820	AAT	2	6	545736	545741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218436
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11634	NC_021820	CCG	2	6	545771	545776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218436
11635	NC_021820	ATG	2	6	545783	545788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218436
11636	NC_021820	GCGT	2	8	545796	545803	0 %	25 %	50 %	25 %	526218436
11637	NC_021820	CGT	2	6	545808	545813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218436
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11639	NC_021820	CTGT	2	8	545902	545909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11640	NC_021820	GGT	2	6	545963	545968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11641	NC_021820	T	6	6	546005	546010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11642	NC_021820	GAG	2	6	546035	546040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11643	NC_021820	GCG	2	6	546060	546065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218437
11644	NC_021820	GCCC	2	8	546066	546073	0 %	0 %	25 %	75 %	526218437
11645	NC_021820	GAC	2	6	546075	546080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218437
11646	NC_021820	TCG	2	6	546091	546096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218437
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11648	NC_021820	CGGCTG	2	12	546209	546220	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218437
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11652	NC_021820	CTG	2	6	546447	546452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218437
11653	NC_021820	CGC	2	6	546492	546497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218437
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11664	NC_021820	GC	3	6	547094	547099	0 %	0 %	50 %	50 %	526218437
11665	NC_021820	TAC	2	6	547152	547157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218437
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11697	NC_021820	A	7	7	548627	548633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11698	NC_021820	CG	4	8	548745	548752	0 %	0 %	50 %	50 %	526221802
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11732	NC_021820	AT	3	6	550468	550473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11733	NC_021820	ATG	2	6	550536	550541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11734	NC_021820	ATT	2	6	550546	550551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11735	NC_021820	TCA	2	6	550577	550582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11736	NC_021820	CGG	2	6	550590	550595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11737	NC_021820	TA	3	6	550618	550623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11738	NC_021820	T	6	6	550630	550635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11739	NC_021820	CGATCG	2	12	550653	550664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11740	NC_021820	T	6	6	550666	550671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11742	NC_021820	CGA	2	6	550912	550917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218438
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11865	NC_021820	GCC	2	6	556920	556925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218441
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11883	NC_021820	GACC	2	8	557867	557874	25 %	0 %	25 %	50 %	526218441
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11950	NC_021820	ACG	2	6	560956	560961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11954	NC_021820	T	7	7	561246	561252	0 %	100 %	0 %	0 %	526218443
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11959	NC_021820	AG	3	6	561536	561541	50 %	0 %	50 %	0 %	526218443
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11965	NC_021820	A	8	8	561912	561919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11966	NC_021820	CAGG	2	8	561930	561937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11967	NC_021820	TCA	2	6	562103	562108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218444
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11970	NC_021820	T	6	6	562235	562240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11971	NC_021820	GGCG	2	8	562362	562369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11972	NC_021820	TTTTA	2	10	562377	562386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11973	NC_021820	CGGG	2	8	562410	562417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11974	NC_021820	CTTA	2	8	562480	562487	25 %	50 %	0 %	25 %	526218445
11975	NC_021820	CTG	2	6	562527	562532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218445
11976	NC_021820	GCT	2	6	562717	562722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218445
11977	NC_021820	CAG	2	6	562723	562728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218445
11978	NC_021820	CA	3	6	562773	562778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11979	NC_021820	G	6	6	562834	562839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11980	NC_021820	CGC	2	6	562845	562850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11981	NC_021820	TACGC	2	10	562882	562891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11982	NC_021820	AAT	2	6	562945	562950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11983	NC_021820	A	7	7	562961	562967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11984	NC_021820	T	6	6	563003	563008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11985	NC_021820	AATAA	2	10	563035	563044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11986	NC_021820	TGT	2	6	563232	563237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218446
11987	NC_021820	TTA	2	6	563242	563247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218446
11988	NC_021820	AAG	2	6	563279	563284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218446
11989	NC_021820	A	6	6	563371	563376	100 %	0 %	0 %	0 %	526218446
11990	NC_021820	GCA	2	6	563424	563429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218446
11991	NC_021820	GGT	2	6	563463	563468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218446
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