MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021820	CGT	2	6	491053	491058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218395
10502	NC_021820	CGA	2	6	491079	491084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218395
10503	NC_021820	CTT	2	6	491200	491205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218395
10504	NC_021820	GCAG	2	8	491259	491266	25 %	0 %	50 %	25 %	526218395
10505	NC_021820	GAT	2	6	491289	491294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218395
10506	NC_021820	ACA	2	6	491334	491339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221795
10507	NC_021820	GCG	2	6	491367	491372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221795
10508	NC_021820	GCG	3	9	491472	491480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221795
10509	NC_021820	GCGG	2	8	491517	491524	0 %	0 %	75 %	25 %	526221795
10510	NC_021820	GCC	2	6	491531	491536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221795
10511	NC_021820	GGC	2	6	491581	491586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221795
10512	NC_021820	CTG	2	6	491644	491649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221795
10513	NC_021820	GCC	2	6	491663	491668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221795
10514	NC_021820	GCT	2	6	491739	491744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221795
10515	NC_021820	AGA	2	6	491830	491835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221795
10516	NC_021820	CCA	2	6	491967	491972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221795
10517	NC_021820	CG	3	6	492000	492005	0 %	0 %	50 %	50 %	526221795
10518	NC_021820	CAG	2	6	492013	492018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221795
10519	NC_021820	CGC	2	6	492033	492038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221795
10520	NC_021820	AAAG	2	8	492067	492074	75 %	0 %	25 %	0 %	526221795
10521	NC_021820	TC	3	6	492129	492134	0 %	50 %	0 %	50 %	526221795
10522	NC_021820	GCG	2	6	492154	492159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221795
10523	NC_021820	GC	3	6	492174	492179	0 %	0 %	50 %	50 %	526221795
10524	NC_021820	ATA	2	6	492228	492233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221795
10525	NC_021820	GAC	2	6	492237	492242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221795
10526	NC_021820	CAT	3	9	492316	492324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221795
10527	NC_021820	CCCA	2	8	492329	492336	25 %	0 %	0 %	75 %	526221795
10528	NC_021820	T	6	6	492531	492536	0 %	100 %	0 %	0 %	526218396
10529	NC_021820	GCGTC	2	10	492548	492557	0 %	20 %	40 %	40 %	526218396
10530	NC_021820	CGG	2	6	492641	492646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218396
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10532	NC_021820	TGC	2	6	492758	492763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218396
10533	NC_021820	TCA	2	6	492853	492858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218396
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10535	NC_021820	GGC	2	6	492945	492950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218396
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10537	NC_021820	GCA	2	6	492995	493000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218396
10538	NC_021820	TTA	2	6	493021	493026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218396
10539	NC_021820	CAT	2	6	493029	493034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218396
10540	NC_021820	GGT	2	6	493053	493058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218396
10541	NC_021820	CCA	2	6	493169	493174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218396
10542	NC_021820	CCA	3	9	493208	493216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218396
10543	NC_021820	TGC	2	6	493259	493264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218396
10544	NC_021820	CGC	2	6	493277	493282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218396
10545	NC_021820	GAT	2	6	493290	493295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218396
10546	NC_021820	TGC	2	6	493407	493412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_021820	TGA	2	6	493425	493430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_021820	AGA	2	6	493569	493574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218397
10549	NC_021820	ATT	2	6	493579	493584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218397
10550	NC_021820	GCA	2	6	493593	493598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218397
10551	NC_021820	TTA	2	6	493631	493636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218397
10552	NC_021820	GGCT	2	8	493661	493668	0 %	25 %	50 %	25 %	526218397
10553	NC_021820	TCC	2	6	493825	493830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218397
10554	NC_021820	CGG	2	6	493845	493850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218397
10555	NC_021820	TAT	2	6	493884	493889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218397
10556	NC_021820	GCGT	2	8	493925	493932	0 %	25 %	50 %	25 %	526218397
10557	NC_021820	AAGCG	2	10	493940	493949	40 %	0 %	40 %	20 %	526218397
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10560	NC_021820	ATGG	2	8	494056	494063	25 %	25 %	50 %	0 %	526218397
10561	NC_021820	TGA	2	6	494127	494132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218397
10562	NC_021820	ATT	2	6	494209	494214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218397
10563	NC_021820	GGC	2	6	494239	494244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218397
10564	NC_021820	CGG	2	6	494250	494255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218397
10565	NC_021820	GGC	2	6	494346	494351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218397
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10567	NC_021820	CAT	2	6	494478	494483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218397
10568	NC_021820	TCT	2	6	494564	494569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218397
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10571	NC_021820	CCGGAA	2	12	494761	494772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218398
10572	NC_021820	A	6	6	494861	494866	100 %	0 %	0 %	0 %	526218398
10573	NC_021820	CGG	2	6	495006	495011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218398
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10580	NC_021820	CG	3	6	495337	495342	0 %	0 %	50 %	50 %	526218398
10581	NC_021820	AG	3	6	495357	495362	50 %	0 %	50 %	0 %	526218398
10582	NC_021820	ACG	2	6	495368	495373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218398
10583	NC_021820	GC	3	6	495428	495433	0 %	0 %	50 %	50 %	526218398
10584	NC_021820	CGG	2	6	495471	495476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218398
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10586	NC_021820	TGA	2	6	495660	495665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218398
10587	NC_021820	TA	3	6	495737	495742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_021820	AAT	2	6	495748	495753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_021820	GGC	2	6	495768	495773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10590	NC_021820	GAGT	2	8	495778	495785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_021820	ATGG	2	8	495883	495890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_021820	T	6	6	496009	496014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_021820	TGCT	2	8	496124	496131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10594	NC_021820	ATTA	2	8	496145	496152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_021820	GGC	2	6	496154	496159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_021820	TA	3	6	496266	496271	50 %	50 %	0 %	0 %	526218399
10597	NC_021820	CGT	2	6	496302	496307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218399
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10601	NC_021820	GCG	2	6	496472	496477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218399
10602	NC_021820	TGA	2	6	496542	496547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218399
10603	NC_021820	GAT	2	6	496562	496567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218399
10604	NC_021820	CCGA	2	8	496634	496641	25 %	0 %	25 %	50 %	526218399
10605	NC_021820	TGT	2	6	496717	496722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218399
10606	NC_021820	CAT	2	6	496787	496792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218399
10607	NC_021820	CG	3	6	496833	496838	0 %	0 %	50 %	50 %	526218399
10608	NC_021820	TA	3	6	496860	496865	50 %	50 %	0 %	0 %	526218399
10609	NC_021820	ATT	2	6	496957	496962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218399
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10612	NC_021820	AGC	2	6	497158	497163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218399
10613	NC_021820	GCT	2	6	497173	497178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218399
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10616	NC_021820	GCGTA	2	10	497369	497378	20 %	20 %	40 %	20 %	526218400
10617	NC_021820	T	6	6	497394	497399	0 %	100 %	0 %	0 %	526218400
10618	NC_021820	CGC	2	6	497417	497422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218400
10619	NC_021820	GCGCG	2	10	497433	497442	0 %	0 %	60 %	40 %	526218400
10620	NC_021820	GCG	2	6	497453	497458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218400
10621	NC_021820	CCG	2	6	497528	497533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218400
10622	NC_021820	GCA	2	6	497555	497560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218400
10623	NC_021820	GAC	2	6	497642	497647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218400
10624	NC_021820	TCG	2	6	497671	497676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218400
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10652	NC_021820	TGT	2	6	498910	498915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218401
10653	NC_021820	GC	3	6	498996	499001	0 %	0 %	50 %	50 %	526218401
10654	NC_021820	TCT	2	6	499051	499056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218401
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10656	NC_021820	GCG	2	6	499102	499107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218401
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10689	NC_021820	T	6	6	500615	500620	0 %	100 %	0 %	0 %	526218402
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10726	NC_021820	TTTC	2	8	502172	502179	0 %	75 %	0 %	25 %	526221796
10727	NC_021820	TGC	2	6	502286	502291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221796
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10739	NC_021820	GGC	2	6	503015	503020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221797
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10742	NC_021820	CGT	2	6	503358	503363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221797
10743	NC_021820	ATG	2	6	503370	503375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221797
10744	NC_021820	GC	3	6	503401	503406	0 %	0 %	50 %	50 %	526221797
10745	NC_021820	GGT	2	6	503423	503428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221797
10746	NC_021820	AAG	2	6	503449	503454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221797
10747	NC_021820	GTATT	2	10	503514	503523	20 %	60 %	20 %	0 %	526221797
10748	NC_021820	A	6	6	503528	503533	100 %	0 %	0 %	0 %	526221797
10749	NC_021820	CG	4	8	503534	503541	0 %	0 %	50 %	50 %	526221797
10750	NC_021820	GCA	2	6	503544	503549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221797
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10754	NC_021820	CACGC	2	10	503768	503777	20 %	0 %	20 %	60 %	526218405
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10757	NC_021820	AGT	2	6	503869	503874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218405
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10766	NC_021820	GAT	2	6	504188	504193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218405
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10771	NC_021820	CGT	2	6	504346	504351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218405
10772	NC_021820	CGC	2	6	504366	504371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218405
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10774	NC_021820	A	6	6	504513	504518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10775	NC_021820	GAA	2	6	504557	504562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10776	NC_021820	GAT	2	6	504589	504594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218406
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10780	NC_021820	A	6	6	504846	504851	100 %	0 %	0 %	0 %	526218406
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10802	NC_021820	CTC	2	6	505896	505901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10803	NC_021820	GTAAG	2	10	505924	505933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10804	NC_021820	AG	3	6	505932	505937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10825	NC_021820	TAT	2	6	507203	507208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10847	NC_021820	GCC	2	6	508527	508532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10848	NC_021820	AT	3	6	508545	508550	50 %	50 %	0 %	0 %	526218409
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10855	NC_021820	GTC	2	6	508785	508790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218409
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10858	NC_021820	GCG	2	6	508886	508891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218409
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10860	NC_021820	GAT	2	6	508928	508933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218409
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10862	NC_021820	CGG	2	6	508985	508990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218409
10863	NC_021820	ATG	2	6	509022	509027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218409
10864	NC_021820	GGC	2	6	509090	509095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218410
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10866	NC_021820	CAG	2	6	509234	509239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218410
10867	NC_021820	CAG	2	6	509294	509299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218410
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10872	NC_021820	GCCA	2	8	509604	509611	25 %	0 %	25 %	50 %	526218410
10873	NC_021820	CGGT	2	8	509632	509639	0 %	25 %	50 %	25 %	526218410
10874	NC_021820	GC	4	8	509786	509793	0 %	0 %	50 %	50 %	526218410
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10899	NC_021820	CGC	3	9	510849	510857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218411
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10908	NC_021820	ATC	2	6	511207	511212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218412
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10914	NC_021820	GAA	2	6	511417	511422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218412
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10927	NC_021820	CGC	2	6	512045	512050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
10928	NC_021820	GAC	2	6	512111	512116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218412
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10930	NC_021820	CGG	2	6	512273	512278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218412
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10935	NC_021820	CAG	2	6	512535	512540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218412
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10938	NC_021820	GCGAT	2	10	512636	512645	20 %	20 %	40 %	20 %	526218412
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10941	NC_021820	TTG	2	6	512794	512799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10942	NC_021820	ACA	2	6	512813	512818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10943	NC_021820	TTAT	2	8	512835	512842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10944	NC_021820	TTAAT	2	10	512862	512871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10945	NC_021820	GTT	2	6	512989	512994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10946	NC_021820	GCCATC	2	12	513194	513205	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526218413
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10968	NC_021820	CT	3	6	514348	514353	0 %	50 %	0 %	50 %	526218413
10969	NC_021820	TGT	2	6	514357	514362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
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10972	NC_021820	TGC	4	12	514470	514481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
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10982	NC_021820	GCA	2	6	515243	515248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
10983	NC_021820	TAC	2	6	515271	515276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
10984	NC_021820	TGGC	2	8	515282	515289	0 %	25 %	50 %	25 %	526218413
10985	NC_021820	GAAC	2	8	515293	515300	50 %	0 %	25 %	25 %	526218413
10986	NC_021820	GTT	2	6	515303	515308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
10987	NC_021820	TGGT	2	8	515393	515400	0 %	50 %	50 %	0 %	526218413
10988	NC_021820	CGC	2	6	515455	515460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
10989	NC_021820	CAT	2	6	515535	515540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
10990	NC_021820	GTG	2	6	515549	515554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
10991	NC_021820	GTT	2	6	515569	515574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
10992	NC_021820	TGG	2	6	515580	515585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
10993	NC_021820	TGG	2	6	515589	515594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
10994	NC_021820	GTG	2	6	515603	515608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
10995	NC_021820	TGAT	2	8	515612	515619	25 %	50 %	25 %	0 %	526218413
10996	NC_021820	TGG	2	6	515631	515636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
10997	NC_021820	TGG	2	6	515670	515675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
10998	NC_021820	AAC	2	6	515678	515683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
10999	NC_021820	CGC	2	6	515728	515733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
11000	NC_021820	CAT	2	6	515808	515813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413

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