MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021820	TGG	2	6	467844	467849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218372
10002	NC_021820	AAT	2	6	467872	467877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218372
10003	NC_021820	ACCCA	2	10	467897	467906	40 %	0 %	0 %	60 %	526218372
10004	NC_021820	CCA	2	6	467945	467950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218372
10005	NC_021820	TGGCGG	2	12	467952	467963	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	526218372
10006	NC_021820	AAT	3	9	467968	467976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218372
10007	NC_021820	CGA	3	9	467996	468004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218372
10008	NC_021820	TAAA	2	8	468049	468056	75 %	25 %	0 %	0 %	526218372
10009	NC_021820	TAA	2	6	468156	468161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_021820	TAAT	2	8	468186	468193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021820	ATT	2	6	468195	468200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021820	TAT	2	6	468201	468206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021820	CAT	2	6	468225	468230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_021820	CGC	2	6	468302	468307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_021820	GCT	2	6	468328	468333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218373
10016	NC_021820	TG	3	6	468345	468350	0 %	50 %	50 %	0 %	526218373
10017	NC_021820	TTG	2	6	468468	468473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218373
10018	NC_021820	GGC	2	6	468497	468502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218373
10019	NC_021820	GCT	2	6	468515	468520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218373
10020	NC_021820	TGT	2	6	468553	468558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218373
10021	NC_021820	CAG	2	6	468563	468568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218373
10022	NC_021820	GAT	2	6	468695	468700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218373
10023	NC_021820	TGG	3	9	468708	468716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218373
10024	NC_021820	GGT	2	6	468728	468733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218373
10025	NC_021820	GTC	2	6	468775	468780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218373
10026	NC_021820	GTTGG	2	10	468803	468812	0 %	40 %	60 %	0 %	526218373
10027	NC_021820	CGC	2	6	468829	468834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218373
10028	NC_021820	C	6	6	468858	468863	0 %	0 %	0 %	100 %	526218373
10029	NC_021820	CAG	2	6	469004	469009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218373
10030	NC_021820	AGA	2	6	469013	469018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218373
10031	NC_021820	GA	3	6	469017	469022	50 %	0 %	50 %	0 %	526218373
10032	NC_021820	GCC	2	6	469140	469145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218373
10033	NC_021820	ATAC	2	8	469173	469180	50 %	25 %	0 %	25 %	526218373
10034	NC_021820	AAT	2	6	469185	469190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218373
10035	NC_021820	AG	3	6	469265	469270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021820	TGC	2	6	469285	469290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218374
10037	NC_021820	TGC	2	6	469324	469329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218374
10038	NC_021820	GTT	2	6	469430	469435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218374
10039	NC_021820	GGGAA	2	10	469441	469450	40 %	0 %	60 %	0 %	526218374
10040	NC_021820	TGTT	2	8	469504	469511	0 %	75 %	25 %	0 %	526218374
10041	NC_021820	GAG	2	6	469521	469526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218374
10042	NC_021820	GTT	2	6	469555	469560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218374
10043	NC_021820	GGT	2	6	469565	469570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218374
10044	NC_021820	TCC	2	6	469574	469579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218374
10045	NC_021820	GCT	2	6	469592	469597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218374
10046	NC_021820	TCA	2	6	469628	469633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218374
10047	NC_021820	CCTT	2	8	469649	469656	0 %	50 %	0 %	50 %	526218374
10048	NC_021820	CCG	2	6	469661	469666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218374
10049	NC_021820	TGA	2	6	469676	469681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218374
10050	NC_021820	GC	3	6	469792	469797	0 %	0 %	50 %	50 %	526218374
10051	NC_021820	AAC	2	6	469890	469895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218374
10052	NC_021820	GCA	2	6	469907	469912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218374
10053	NC_021820	GTTT	2	8	469943	469950	0 %	75 %	25 %	0 %	526218374
10054	NC_021820	CTG	2	6	469975	469980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218374
10055	NC_021820	TAC	2	6	470169	470174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218374
10056	NC_021820	ATT	2	6	470229	470234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218375
10057	NC_021820	AGTT	2	8	470292	470299	25 %	50 %	25 %	0 %	526218375
10058	NC_021820	CAT	2	6	470356	470361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218375
10059	NC_021820	T	6	6	470389	470394	0 %	100 %	0 %	0 %	526218375
10060	NC_021820	TGT	2	6	470403	470408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218375
10061	NC_021820	CAT	2	6	470470	470475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218375
10062	NC_021820	GTT	2	6	470497	470502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218375
10063	NC_021820	GC	3	6	470577	470582	0 %	0 %	50 %	50 %	526218375
10064	NC_021820	GTT	2	6	470619	470624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218375
10065	NC_021820	CG	4	8	470658	470665	0 %	0 %	50 %	50 %	526218375
10066	NC_021820	GCC	2	6	470741	470746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218375
10067	NC_021820	GATT	2	8	470778	470785	25 %	50 %	25 %	0 %	526218375
10068	NC_021820	TCG	2	6	470792	470797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218375
10069	NC_021820	GCG	2	6	470819	470824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218375
10070	NC_021820	CTAA	2	8	470825	470832	50 %	25 %	0 %	25 %	526218375
10071	NC_021820	TTCA	2	8	470848	470855	25 %	50 %	0 %	25 %	526218375
10072	NC_021820	GC	3	6	470871	470876	0 %	0 %	50 %	50 %	526218375
10073	NC_021820	GCA	2	6	470895	470900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218375
10074	NC_021820	CG	3	6	470916	470921	0 %	0 %	50 %	50 %	526218375
10075	NC_021820	ACG	2	6	470948	470953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218375
10076	NC_021820	AAGT	2	8	470987	470994	50 %	25 %	25 %	0 %	526218375
10077	NC_021820	GA	3	6	471114	471119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_021820	CAG	2	6	471226	471231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218376
10079	NC_021820	CG	4	8	471440	471447	0 %	0 %	50 %	50 %	526218376
10080	NC_021820	GGC	2	6	471468	471473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218376
10081	NC_021820	CG	3	6	471500	471505	0 %	0 %	50 %	50 %	526218376
10082	NC_021820	TGCG	2	8	471511	471518	0 %	25 %	50 %	25 %	526218376
10083	NC_021820	TGG	2	6	471691	471696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218376
10084	NC_021820	CGG	2	6	471697	471702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218376
10085	NC_021820	GCA	2	6	471762	471767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218376
10086	NC_021820	CGT	2	6	471782	471787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218376
10087	NC_021820	TAT	2	6	471806	471811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218376
10088	NC_021820	GAA	2	6	471852	471857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218376
10089	NC_021820	TTG	2	6	471867	471872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218376
10090	NC_021820	GGC	2	6	471917	471922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218376
10091	NC_021820	T	8	8	471960	471967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_021820	ATG	2	6	471985	471990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_021820	TTC	2	6	472113	472118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218377
10094	NC_021820	GTT	2	6	472154	472159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218377
10095	NC_021820	TGG	2	6	472183	472188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218377
10096	NC_021820	CTG	2	6	472209	472214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218377
10097	NC_021820	CGA	3	9	472246	472254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218377
10098	NC_021820	CGG	2	6	472255	472260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218377
10099	NC_021820	TGG	2	6	472345	472350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218377
10100	NC_021820	GC	3	6	472354	472359	0 %	0 %	50 %	50 %	526218377
10101	NC_021820	TGG	2	6	472378	472383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218377
10102	NC_021820	ATT	2	6	472428	472433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218377
10103	NC_021820	GCTG	2	8	472451	472458	0 %	25 %	50 %	25 %	526218377
10104	NC_021820	CAT	2	6	472553	472558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218377
10105	NC_021820	GAA	2	6	472587	472592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218377
10106	NC_021820	GGC	2	6	472616	472621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218377
10107	NC_021820	GAA	2	6	472638	472643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218377
10108	NC_021820	CAG	2	6	472856	472861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218378
10109	NC_021820	CGT	2	6	472871	472876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218378
10110	NC_021820	GCCTTC	2	12	472880	472891	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526218378
10111	NC_021820	T	6	6	472900	472905	0 %	100 %	0 %	0 %	526218378
10112	NC_021820	T	7	7	473082	473088	0 %	100 %	0 %	0 %	526218378
10113	NC_021820	CCGA	2	8	473205	473212	25 %	0 %	25 %	50 %	526218378
10114	NC_021820	GCC	2	6	473214	473219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218378
10115	NC_021820	CGT	2	6	473228	473233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218378
10116	NC_021820	CGA	2	6	473295	473300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218378
10117	NC_021820	GTTT	2	8	473313	473320	0 %	75 %	25 %	0 %	526218378
10118	NC_021820	TAT	2	6	473408	473413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021820	TTAC	2	8	473437	473444	25 %	50 %	0 %	25 %	526218379
10120	NC_021820	GCC	2	6	473461	473466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218379
10121	NC_021820	CCA	2	6	473496	473501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218379
10122	NC_021820	AACA	2	8	473527	473534	75 %	0 %	0 %	25 %	526218379
10123	NC_021820	AATC	2	8	473625	473632	50 %	25 %	0 %	25 %	526218379
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10126	NC_021820	CGT	2	6	473749	473754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218379
10127	NC_021820	CGT	2	6	473778	473783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218379
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10231	NC_021820	GTGACC	2	12	478666	478677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526218385
10232	NC_021820	TTC	2	6	478684	478689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218385
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10234	NC_021820	CGG	2	6	478796	478801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218385
10235	NC_021820	GCGG	2	8	478803	478810	0 %	0 %	75 %	25 %	526218385
10236	NC_021820	GCAGC	2	10	478853	478862	20 %	0 %	40 %	40 %	526218385
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10238	NC_021820	GCA	2	6	479117	479122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218385
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10240	NC_021820	AGA	2	6	479248	479253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218385
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10242	NC_021820	GCC	2	6	479434	479439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10486	NC_021820	ATG	2	6	490309	490314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218394
10487	NC_021820	GTTCT	2	10	490409	490418	0 %	60 %	20 %	20 %	526218395
10488	NC_021820	AGC	2	6	490423	490428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218395
10489	NC_021820	TTC	2	6	490440	490445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218395
10490	NC_021820	GCG	2	6	490509	490514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218395
10491	NC_021820	GCCA	2	8	490559	490566	25 %	0 %	25 %	50 %	526218395
10492	NC_021820	CCT	2	6	490579	490584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218395
10493	NC_021820	CCT	2	6	490648	490653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218395
10494	NC_021820	GC	3	6	490660	490665	0 %	0 %	50 %	50 %	526218395
10495	NC_021820	CCA	2	6	490699	490704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218395
10496	NC_021820	ATC	2	6	490745	490750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218395
10497	NC_021820	CTG	2	6	490796	490801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218395
10498	NC_021820	CG	3	6	490882	490887	0 %	0 %	50 %	50 %	526218395
10499	NC_021820	TGT	2	6	490902	490907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218395
10500	NC_021820	ATCA	2	8	491042	491049	50 %	25 %	0 %	25 %	526218395

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