MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101501	NC_021820	GCT	2	6	4803343	4803348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221709
101502	NC_021820	AAC	2	6	4803375	4803380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221709
101503	NC_021820	ATGG	2	8	4803406	4803413	25 %	25 %	50 %	0 %	526221709
101504	NC_021820	GGTACG	2	12	4803524	4803535	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526221709
101505	NC_021820	CAC	2	6	4803541	4803546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221709
101506	NC_021820	CCAG	2	8	4803763	4803770	25 %	0 %	25 %	50 %	526221709
101507	NC_021820	GTC	2	6	4803791	4803796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221709
101508	NC_021820	CTG	2	6	4803866	4803871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221709
101509	NC_021820	GCCA	2	8	4803890	4803897	25 %	0 %	25 %	50 %	526221709
101510	NC_021820	GTC	2	6	4803947	4803952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221709
101511	NC_021820	AGA	2	6	4803958	4803963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221709
101512	NC_021820	AAT	2	6	4803990	4803995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221709
101513	NC_021820	CA	3	6	4804031	4804036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101514	NC_021820	CAT	2	6	4804066	4804071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101515	NC_021820	TCA	2	6	4804077	4804082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101516	NC_021820	AATG	2	8	4804083	4804090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101517	NC_021820	CTT	2	6	4804101	4804106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101518	NC_021820	GCT	2	6	4804131	4804136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101519	NC_021820	GTT	2	6	4804209	4804214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101520	NC_021820	GCA	2	6	4804217	4804222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101521	NC_021820	CT	3	6	4804233	4804238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101522	NC_021820	CATT	2	8	4804373	4804380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101523	NC_021820	A	7	7	4804398	4804404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101524	NC_021820	ATT	2	6	4804409	4804414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101525	NC_021820	GAA	2	6	4804436	4804441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101526	NC_021820	AG	3	6	4804444	4804449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101527	NC_021820	CCG	2	6	4804481	4804486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101528	NC_021820	AATA	2	8	4804489	4804496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101529	NC_021820	ATTT	2	8	4804522	4804529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101530	NC_021820	ACA	2	6	4804559	4804564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101531	NC_021820	A	6	6	4804600	4804605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101532	NC_021820	CGC	2	6	4804617	4804622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101533	NC_021820	TGGC	2	8	4804704	4804711	0 %	25 %	50 %	25 %	526221710
101534	NC_021820	GAT	2	6	4804774	4804779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221710
101535	NC_021820	TCT	2	6	4804781	4804786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221710
101536	NC_021820	TGA	2	6	4804837	4804842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221710
101537	NC_021820	GCG	2	6	4804920	4804925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221710
101538	NC_021820	ATT	2	6	4804931	4804936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221710
101539	NC_021820	GAA	2	6	4804960	4804965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221710
101540	NC_021820	CCAT	2	8	4805154	4805161	25 %	25 %	0 %	50 %	526221710
101541	NC_021820	TGTT	2	8	4805177	4805184	0 %	75 %	25 %	0 %	526221710
101542	NC_021820	TGA	2	6	4805316	4805321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221710
101543	NC_021820	GCT	2	6	4805389	4805394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221710
101544	NC_021820	CCG	2	6	4805396	4805401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221710
101545	NC_021820	GCTT	2	8	4805424	4805431	0 %	50 %	25 %	25 %	526221710
101546	NC_021820	CG	3	6	4805488	4805493	0 %	0 %	50 %	50 %	526221710
101547	NC_021820	GAC	2	6	4805531	4805536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221710
101548	NC_021820	AAC	2	6	4805653	4805658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221711
101549	NC_021820	GAA	2	6	4805750	4805755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221711
101550	NC_021820	TGC	2	6	4805873	4805878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221711
101551	NC_021820	TGA	2	6	4805881	4805886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221711
101552	NC_021820	A	6	6	4805913	4805918	100 %	0 %	0 %	0 %	526221711
101553	NC_021820	A	7	7	4805921	4805927	100 %	0 %	0 %	0 %	526221711
101554	NC_021820	T	6	6	4805998	4806003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101555	NC_021820	GAA	2	6	4806069	4806074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221712
101556	NC_021820	ATT	2	6	4806076	4806081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221712
101557	NC_021820	A	6	6	4806106	4806111	100 %	0 %	0 %	0 %	526221712
101558	NC_021820	TGG	2	6	4806182	4806187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221712
101559	NC_021820	CTGGC	2	10	4806211	4806220	0 %	20 %	40 %	40 %	526221712
101560	NC_021820	TGA	2	6	4806234	4806239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221712
101561	NC_021820	GAA	2	6	4806255	4806260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221712
101562	NC_021820	CAT	2	6	4806276	4806281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221712
101563	NC_021820	A	6	6	4806385	4806390	100 %	0 %	0 %	0 %	526221712
101564	NC_021820	TATG	2	8	4806402	4806409	25 %	50 %	25 %	0 %	526221712
101565	NC_021820	TGA	2	6	4806419	4806424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221712
101566	NC_021820	A	6	6	4806429	4806434	100 %	0 %	0 %	0 %	526221712
101567	NC_021820	GC	4	8	4806495	4806502	0 %	0 %	50 %	50 %	526221712
101568	NC_021820	A	6	6	4806516	4806521	100 %	0 %	0 %	0 %	526221712
101569	NC_021820	A	6	6	4806544	4806549	100 %	0 %	0 %	0 %	526221712
101570	NC_021820	GATG	2	8	4806591	4806598	25 %	25 %	50 %	0 %	526221712
101571	NC_021820	GC	3	6	4806629	4806634	0 %	0 %	50 %	50 %	526221712
101572	NC_021820	CAC	2	6	4806705	4806710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221712
101573	NC_021820	GCG	2	6	4806724	4806729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221712
101574	NC_021820	AAT	2	6	4806760	4806765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221712
101575	NC_021820	AGA	2	6	4806787	4806792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221712
101576	NC_021820	ATT	2	6	4806809	4806814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221712
101577	NC_021820	AGC	2	6	4806869	4806874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221712
101578	NC_021820	GAT	2	6	4806994	4806999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221713
101579	NC_021820	TGG	2	6	4807010	4807015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221713
101580	NC_021820	GTT	2	6	4807019	4807024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221713
101581	NC_021820	ATT	2	6	4807183	4807188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101582	NC_021820	AAG	2	6	4807249	4807254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101583	NC_021820	GCG	2	6	4807446	4807451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221714
101584	NC_021820	CTC	2	6	4807573	4807578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221714
101585	NC_021820	CTGCGC	2	12	4807613	4807624	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526221714
101586	NC_021820	GC	3	6	4807638	4807643	0 %	0 %	50 %	50 %	526221714
101587	NC_021820	GGC	2	6	4807687	4807692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221714
101588	NC_021820	CT	3	6	4807739	4807744	0 %	50 %	0 %	50 %	526221714
101589	NC_021820	GCG	2	6	4807770	4807775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221714
101590	NC_021820	GCAT	2	8	4807869	4807876	25 %	25 %	25 %	25 %	526221714
101591	NC_021820	CTGG	2	8	4807945	4807952	0 %	25 %	50 %	25 %	526221714
101592	NC_021820	CTG	2	6	4807997	4808002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221714
101593	NC_021820	ACT	2	6	4808041	4808046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221714
101594	NC_021820	CTT	2	6	4808129	4808134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221714
101595	NC_021820	AACC	2	8	4808288	4808295	50 %	0 %	0 %	50 %	526221714
101596	NC_021820	GGC	2	6	4808327	4808332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221714
101597	NC_021820	TGC	2	6	4808343	4808348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221714
101598	NC_021820	GC	3	6	4808361	4808366	0 %	0 %	50 %	50 %	526221714
101599	NC_021820	GC	3	6	4808391	4808396	0 %	0 %	50 %	50 %	526221714
101600	NC_021820	GTC	2	6	4808444	4808449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221714
101601	NC_021820	A	6	6	4808488	4808493	100 %	0 %	0 %	0 %	526221714
101602	NC_021820	TTTC	2	8	4808566	4808573	0 %	75 %	0 %	25 %	526221714
101603	NC_021820	AATG	2	8	4808614	4808621	50 %	25 %	25 %	0 %	526221714
101604	NC_021820	TGGC	2	8	4808627	4808634	0 %	25 %	50 %	25 %	526221714
101605	NC_021820	ATC	2	6	4808727	4808732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221714
101606	NC_021820	A	6	6	4808778	4808783	100 %	0 %	0 %	0 %	526221714
101607	NC_021820	AGC	2	6	4808907	4808912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221714
101608	NC_021820	GAC	2	6	4809071	4809076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221714
101609	NC_021820	AGGC	2	8	4809168	4809175	25 %	0 %	50 %	25 %	526221714
101610	NC_021820	TTG	2	6	4809189	4809194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221714
101611	NC_021820	GCA	2	6	4809262	4809267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221714
101612	NC_021820	AT	3	6	4809369	4809374	50 %	50 %	0 %	0 %	526221714
101613	NC_021820	AT	3	6	4809386	4809391	50 %	50 %	0 %	0 %	526221714
101614	NC_021820	AAT	2	6	4809405	4809410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221714
101615	NC_021820	CTT	2	6	4809417	4809422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221715
101616	NC_021820	TGT	2	6	4809428	4809433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221715
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101618	NC_021820	AAT	2	6	4809580	4809585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221715
101619	NC_021820	T	6	6	4809622	4809627	0 %	100 %	0 %	0 %	526221715
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