MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_021820	ATC	2	6	4734455	4734460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221651
100002	NC_021820	CTG	2	6	4734466	4734471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221651
100003	NC_021820	AGA	2	6	4734516	4734521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221651
100004	NC_021820	GCC	2	6	4734700	4734705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221651
100005	NC_021820	GC	4	8	4734716	4734723	0 %	0 %	50 %	50 %	526221651
100006	NC_021820	GCT	2	6	4734807	4734812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221651
100007	NC_021820	TCG	2	6	4734830	4734835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221651
100008	NC_021820	T	6	6	4734850	4734855	0 %	100 %	0 %	0 %	526221651
100009	NC_021820	GAA	2	6	4734865	4734870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221651
100010	NC_021820	CCA	2	6	4734926	4734931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221651
100011	NC_021820	CG	3	6	4734968	4734973	0 %	0 %	50 %	50 %	526221651
100012	NC_021820	CG	3	6	4735051	4735056	0 %	0 %	50 %	50 %	526221651
100013	NC_021820	GAA	2	6	4735062	4735067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221651
100014	NC_021820	GCG	2	6	4735075	4735080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221651
100015	NC_021820	CT	3	6	4735119	4735124	0 %	50 %	0 %	50 %	526221651
100016	NC_021820	TGG	2	6	4735145	4735150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221651
100017	NC_021820	CGC	2	6	4735153	4735158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221651
100018	NC_021820	CCG	2	6	4735192	4735197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221651
100019	NC_021820	GAC	2	6	4735306	4735311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221652
100020	NC_021820	GTG	2	6	4735361	4735366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221652
100021	NC_021820	CGG	2	6	4735417	4735422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221652
100022	NC_021820	GCC	2	6	4735460	4735465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221652
100023	NC_021820	TTGA	2	8	4735475	4735482	25 %	50 %	25 %	0 %	526221652
100024	NC_021820	ACA	2	6	4735525	4735530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221652
100025	NC_021820	TGT	2	6	4735567	4735572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100026	NC_021820	GACAG	2	10	4735626	4735635	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100027	NC_021820	ATAA	2	8	4735655	4735662	75 %	25 %	0 %	0 %	526221653
100028	NC_021820	GCG	2	6	4735713	4735718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221653
100029	NC_021820	CG	3	6	4735739	4735744	0 %	0 %	50 %	50 %	526221653
100030	NC_021820	ATC	2	6	4735751	4735756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221653
100031	NC_021820	GGC	2	6	4735765	4735770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221653
100032	NC_021820	CCT	2	6	4735787	4735792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221653
100033	NC_021820	A	6	6	4735824	4735829	100 %	0 %	0 %	0 %	526221653
100034	NC_021820	GAA	2	6	4735880	4735885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221653
100035	NC_021820	GTTC	2	8	4735909	4735916	0 %	50 %	25 %	25 %	526221653
100036	NC_021820	CTG	2	6	4735979	4735984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221653
100037	NC_021820	CCG	2	6	4735989	4735994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221653
100038	NC_021820	TGG	2	6	4736028	4736033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221653
100039	NC_021820	GCC	3	9	4736061	4736069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221653
100040	NC_021820	GC	3	6	4736071	4736076	0 %	0 %	50 %	50 %	526221653
100041	NC_021820	ATG	2	6	4736085	4736090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221653
100042	NC_021820	AAC	2	6	4736142	4736147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221653
100043	NC_021820	ATTT	2	8	4736156	4736163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100044	NC_021820	GAG	2	6	4736174	4736179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100045	NC_021820	TGA	2	6	4736196	4736201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222511
100046	NC_021820	GC	4	8	4736242	4736249	0 %	0 %	50 %	50 %	526222511
100047	NC_021820	CGT	2	6	4736287	4736292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222511
100048	NC_021820	CCG	3	9	4736337	4736345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222511
100049	NC_021820	AAT	2	6	4736402	4736407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222511
100050	NC_021820	CGC	2	6	4736424	4736429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222511
100051	NC_021820	CGC	2	6	4736468	4736473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222511
100052	NC_021820	TCTT	2	8	4736515	4736522	0 %	75 %	0 %	25 %	526222511
100053	NC_021820	AG	3	6	4736524	4736529	50 %	0 %	50 %	0 %	526222511
100054	NC_021820	CGAT	2	8	4736532	4736539	25 %	25 %	25 %	25 %	526222511
100055	NC_021820	AG	3	6	4736542	4736547	50 %	0 %	50 %	0 %	526222511
100056	NC_021820	TCG	2	6	4736586	4736591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222511
100057	NC_021820	GTCC	2	8	4736605	4736612	0 %	25 %	25 %	50 %	526222511
100058	NC_021820	TGC	2	6	4736628	4736633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222511
100059	NC_021820	AC	3	6	4736821	4736826	50 %	0 %	0 %	50 %	526222511
100060	NC_021820	TATC	2	8	4736842	4736849	25 %	50 %	0 %	25 %	526222511
100061	NC_021820	CAA	2	6	4736893	4736898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222511
100062	NC_021820	CGG	2	6	4736932	4736937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222511
100063	NC_021820	ACT	2	6	4736976	4736981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222511
100064	NC_021820	CG	3	6	4736988	4736993	0 %	0 %	50 %	50 %	526222511
100065	NC_021820	GCAT	2	8	4737080	4737087	25 %	25 %	25 %	25 %	526221654
100066	NC_021820	ATTGAA	2	12	4737226	4737237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526221654
100067	NC_021820	AAG	2	6	4737251	4737256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221654
100068	NC_021820	GGC	2	6	4737267	4737272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221654
100069	NC_021820	C	8	8	4737314	4737321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100070	NC_021820	TGA	2	6	4737358	4737363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100071	NC_021820	GCCT	3	12	4737391	4737402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100072	NC_021820	A	6	6	4737484	4737489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100073	NC_021820	CGG	2	6	4737671	4737676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221655
100074	NC_021820	CTA	2	6	4737704	4737709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221655
100075	NC_021820	TTA	2	6	4737755	4737760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221655
100076	NC_021820	GC	3	6	4737823	4737828	0 %	0 %	50 %	50 %	526221655
100077	NC_021820	CGC	2	6	4737851	4737856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221655
100078	NC_021820	GCG	2	6	4737890	4737895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221655
100079	NC_021820	A	6	6	4737903	4737908	100 %	0 %	0 %	0 %	526221655
100080	NC_021820	CTG	2	6	4737921	4737926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221655
100081	NC_021820	GGT	2	6	4738004	4738009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221655
100082	NC_021820	GA	3	6	4738083	4738088	50 %	0 %	50 %	0 %	526221655
100083	NC_021820	GAC	2	6	4738216	4738221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100084	NC_021820	CGC	2	6	4738250	4738255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100085	NC_021820	ATTA	2	8	4738267	4738274	50 %	50 %	0 %	0 %	526221656
100086	NC_021820	CCCA	2	8	4738301	4738308	25 %	0 %	0 %	75 %	526221656
100087	NC_021820	GCA	2	6	4738393	4738398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221656
100088	NC_021820	GCC	2	6	4738401	4738406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221656
100089	NC_021820	CAGA	2	8	4738420	4738427	50 %	0 %	25 %	25 %	526221656
100090	NC_021820	TGC	2	6	4738632	4738637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221656
100091	NC_021820	CCG	2	6	4738747	4738752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221656
100092	NC_021820	CCG	2	6	4738867	4738872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221656
100093	NC_021820	GCC	3	9	4738907	4738915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221656
100094	NC_021820	GCA	2	6	4738932	4738937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221656
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100096	NC_021820	CG	3	6	4739013	4739018	0 %	0 %	50 %	50 %	526221657
100097	NC_021820	GCC	2	6	4739042	4739047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221657
100098	NC_021820	GGT	2	6	4739080	4739085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221657
100099	NC_021820	ATC	2	6	4739116	4739121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221657
100100	NC_021820	CGA	2	6	4739292	4739297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221657
100101	NC_021820	CTGG	2	8	4739326	4739333	0 %	25 %	50 %	25 %	526221657
100102	NC_021820	TTC	2	6	4739348	4739353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221657
100103	NC_021820	ACC	2	6	4739365	4739370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221657
100104	NC_021820	CTC	2	6	4739392	4739397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221657
100105	NC_021820	CGC	2	6	4739443	4739448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221657
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100107	NC_021820	GC	3	6	4739544	4739549	0 %	0 %	50 %	50 %	526221657
100108	NC_021820	CAG	2	6	4739566	4739571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221657
100109	NC_021820	CGC	2	6	4739610	4739615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221657
100110	NC_021820	T	7	7	4739637	4739643	0 %	100 %	0 %	0 %	526221657
100111	NC_021820	TCC	2	6	4739655	4739660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100112	NC_021820	TAA	2	6	4739681	4739686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100113	NC_021820	CA	3	6	4739709	4739714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100114	NC_021820	TGCG	2	8	4739761	4739768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100115	NC_021820	CAT	3	9	4739795	4739803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100116	NC_021820	T	8	8	4739876	4739883	0 %	100 %	0 %	0 %	526222512
100117	NC_021820	TGC	2	6	4739922	4739927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222512
100118	NC_021820	GTT	2	6	4740010	4740015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222512
100119	NC_021820	CGG	2	6	4740040	4740045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222512
100120	NC_021820	CAA	2	6	4740070	4740075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222512
100121	NC_021820	T	6	6	4740080	4740085	0 %	100 %	0 %	0 %	526222512
100122	NC_021820	CAT	2	6	4740131	4740136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222512
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100129	NC_021820	ATC	2	6	4740294	4740299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222512
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100142	NC_021820	TCA	2	6	4740930	4740935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222512
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100144	NC_021820	CTG	2	6	4740962	4740967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222512
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100170	NC_021820	TCA	2	6	4742295	4742300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100221	NC_021820	CAT	2	6	4744791	4744796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221659
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100224	NC_021820	GC	3	6	4744860	4744865	0 %	0 %	50 %	50 %	526221659
100225	NC_021820	CTT	2	6	4744866	4744871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221659
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100230	NC_021820	GCC	2	6	4745156	4745161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221659
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100233	NC_021820	TGA	2	6	4745223	4745228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221659
100234	NC_021820	CGA	2	6	4745364	4745369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221659
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100248	NC_021820	TACCG	2	10	4745986	4745995	20 %	20 %	20 %	40 %	526221659
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100251	NC_021820	GAT	2	6	4746115	4746120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221659
100252	NC_021820	CGG	2	6	4746159	4746164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221659
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100262	NC_021820	CGA	2	6	4746438	4746443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221659
100263	NC_021820	CGG	2	6	4746552	4746557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221659
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100300	NC_021820	TTG	2	6	4748456	4748461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221660
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100318	NC_021820	CGG	2	6	4749505	4749510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221660
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100322	NC_021820	TGGC	2	8	4749595	4749602	0 %	25 %	50 %	25 %	526221660
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100326	NC_021820	TC	3	6	4749858	4749863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100327	NC_021820	ATGAC	2	10	4749994	4750003	40 %	20 %	20 %	20 %	526221661
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100331	NC_021820	CAT	2	6	4750109	4750114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221661
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100334	NC_021820	TC	3	6	4750329	4750334	0 %	50 %	0 %	50 %	526221661
100335	NC_021820	A	6	6	4750400	4750405	100 %	0 %	0 %	0 %	526221661
100336	NC_021820	ACGA	2	8	4750495	4750502	50 %	0 %	25 %	25 %	526221661
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100342	NC_021820	TTC	2	6	4750764	4750769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221661
100343	NC_021820	TCG	2	6	4750772	4750777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221661
100344	NC_021820	CAT	2	6	4750973	4750978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221661
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100463	NC_021820	GCA	2	6	4756398	4756403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221667
100464	NC_021820	CCG	2	6	4756409	4756414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221667
100465	NC_021820	ACC	2	6	4756534	4756539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221667
100466	NC_021820	GCT	2	6	4756575	4756580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221667
100467	NC_021820	AGT	2	6	4756615	4756620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221667
100468	NC_021820	GCA	2	6	4756639	4756644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221667
100469	NC_021820	CAGCG	2	10	4756674	4756683	20 %	0 %	40 %	40 %	526221667
100470	NC_021820	GCG	4	12	4756681	4756692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221667
100471	NC_021820	TGA	2	6	4756709	4756714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221667
100472	NC_021820	CGTA	2	8	4756749	4756756	25 %	25 %	25 %	25 %	526221667
100473	NC_021820	CTTCCG	2	12	4756790	4756801	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526221667
100474	NC_021820	AG	3	6	4756820	4756825	50 %	0 %	50 %	0 %	526221667
100475	NC_021820	GC	4	8	4756859	4756866	0 %	0 %	50 %	50 %	526221667
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100478	NC_021820	TGG	2	6	4757054	4757059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221667
100479	NC_021820	ATG	2	6	4757107	4757112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221667
100480	NC_021820	CTG	2	6	4757113	4757118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221667
100481	NC_021820	GAC	2	6	4757129	4757134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221667
100482	NC_021820	TAA	2	6	4757163	4757168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221667
100483	NC_021820	CCG	2	6	4757170	4757175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221667
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100485	NC_021820	GCC	2	6	4757212	4757217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221667
100486	NC_021820	CGT	2	6	4757223	4757228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221667
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100489	NC_021820	CGA	2	6	4757395	4757400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100490	NC_021820	TGT	2	6	4757405	4757410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100491	NC_021820	GGC	2	6	4757424	4757429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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100493	NC_021820	TTC	2	6	4757509	4757514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221668
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100499	NC_021820	CGCC	2	8	4757790	4757797	0 %	0 %	25 %	75 %	526221668
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