MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
97001	NC_021820	CGC	2	6	4593875	4593880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221535
97002	NC_021820	TCAT	2	8	4593911	4593918	25 %	50 %	0 %	25 %	526221535
97003	NC_021820	CCT	2	6	4593924	4593929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97004	NC_021820	GGC	2	6	4593951	4593956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97005	NC_021820	TCG	2	6	4594162	4594167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222488
97006	NC_021820	CGA	2	6	4594178	4594183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222488
97007	NC_021820	CT	3	6	4594231	4594236	0 %	50 %	0 %	50 %	526222488
97008	NC_021820	CGT	2	6	4594239	4594244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222488
97009	NC_021820	GCT	2	6	4594245	4594250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222488
97010	NC_021820	CCG	2	6	4594270	4594275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222488
97011	NC_021820	TTGCGT	2	12	4594278	4594289	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526222488
97012	NC_021820	CTG	2	6	4594314	4594319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222488
97013	NC_021820	GCC	2	6	4594321	4594326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222488
97014	NC_021820	T	6	6	4594374	4594379	0 %	100 %	0 %	0 %	526222488
97015	NC_021820	TAA	2	6	4594419	4594424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97016	NC_021820	AAC	2	6	4594435	4594440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97017	NC_021820	A	7	7	4594451	4594457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97018	NC_021820	T	7	7	4594463	4594469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97019	NC_021820	GCG	2	6	4594483	4594488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97020	NC_021820	GAA	2	6	4594525	4594530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97021	NC_021820	AGA	2	6	4594551	4594556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221536
97022	NC_021820	AC	3	6	4594559	4594564	50 %	0 %	0 %	50 %	526221536
97023	NC_021820	GC	3	6	4594658	4594663	0 %	0 %	50 %	50 %	526221536
97024	NC_021820	ATG	2	6	4594667	4594672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221536
97025	NC_021820	GGAC	2	8	4594704	4594711	25 %	0 %	50 %	25 %	526221536
97026	NC_021820	GC	3	6	4594771	4594776	0 %	0 %	50 %	50 %	526221536
97027	NC_021820	CGC	2	6	4594857	4594862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221536
97028	NC_021820	CGC	2	6	4594882	4594887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221536
97029	NC_021820	TCG	2	6	4594949	4594954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221536
97030	NC_021820	CAA	2	6	4595022	4595027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221536
97031	NC_021820	TGC	2	6	4595036	4595041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221536
97032	NC_021820	GAC	2	6	4595080	4595085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221536
97033	NC_021820	TCA	2	6	4595115	4595120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221536
97034	NC_021820	CGC	2	6	4595125	4595130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221536
97035	NC_021820	GAC	2	6	4595294	4595299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221537
97036	NC_021820	CGA	2	6	4595309	4595314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221537
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97038	NC_021820	TGT	2	6	4595335	4595340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221537
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97041	NC_021820	TATCGC	2	12	4595517	4595528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526221537
97042	NC_021820	T	6	6	4595579	4595584	0 %	100 %	0 %	0 %	526221537
97043	NC_021820	CGG	2	6	4595596	4595601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221537
97044	NC_021820	GTATC	2	10	4595609	4595618	20 %	40 %	20 %	20 %	526221537
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97048	NC_021820	TGC	2	6	4595710	4595715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221537
97049	NC_021820	TTA	2	6	4595721	4595726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221537
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97051	NC_021820	CGC	2	6	4595803	4595808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221537
97052	NC_021820	CGAG	2	8	4595827	4595834	25 %	0 %	50 %	25 %	526221537
97053	NC_021820	ATG	2	6	4595886	4595891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221537
97054	NC_021820	CGC	2	6	4595918	4595923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221537
97055	NC_021820	CGA	2	6	4595987	4595992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221537
97056	NC_021820	GATC	2	8	4596035	4596042	25 %	25 %	25 %	25 %	526221537
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97062	NC_021820	CGT	2	6	4596305	4596310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221537
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97065	NC_021820	CGC	2	6	4596500	4596505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221537
97066	NC_021820	GTA	2	6	4596525	4596530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221537
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97070	NC_021820	GCT	2	6	4596735	4596740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221538
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97076	NC_021820	A	7	7	4596879	4596885	100 %	0 %	0 %	0 %	526221538
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97084	NC_021820	TGA	2	6	4597440	4597445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221539
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97086	NC_021820	GATGC	2	10	4597601	4597610	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97087	NC_021820	GCG	2	6	4597631	4597636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97088	NC_021820	CAA	2	6	4597689	4597694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97089	NC_021820	CAG	2	6	4597770	4597775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221540
97090	NC_021820	CAT	2	6	4597782	4597787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221540
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97094	NC_021820	TCT	2	6	4597963	4597968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221540
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97098	NC_021820	GC	3	6	4598078	4598083	0 %	0 %	50 %	50 %	526221540
97099	NC_021820	TCG	2	6	4598164	4598169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221540
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97101	NC_021820	CG	3	6	4598300	4598305	0 %	0 %	50 %	50 %	526221540
97102	NC_021820	CCGC	2	8	4598320	4598327	0 %	0 %	25 %	75 %	526221540
97103	NC_021820	CAC	2	6	4598430	4598435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221540
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97106	NC_021820	CGC	2	6	4598455	4598460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221540
97107	NC_021820	GC	3	6	4598462	4598467	0 %	0 %	50 %	50 %	526221540
97108	NC_021820	GTT	2	6	4598489	4598494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221540
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97115	NC_021820	CGC	2	6	4598810	4598815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221540
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97117	NC_021820	GA	3	6	4599044	4599049	50 %	0 %	50 %	0 %	526221540
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97472	NC_021820	CTC	2	6	4616750	4616755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221556
97473	NC_021820	CG	3	6	4616783	4616788	0 %	0 %	50 %	50 %	526221556
97474	NC_021820	TACC	2	8	4616842	4616849	25 %	25 %	0 %	50 %	526221556
97475	NC_021820	CGCC	2	8	4616854	4616861	0 %	0 %	25 %	75 %	526221556
97476	NC_021820	CGC	2	6	4616903	4616908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221556
97477	NC_021820	CGC	2	6	4616915	4616920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221556
97478	NC_021820	CAT	2	6	4616956	4616961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221556
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97480	NC_021820	GCG	2	6	4616992	4616997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221556
97481	NC_021820	GCA	2	6	4617010	4617015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221556
97482	NC_021820	CAG	2	6	4617155	4617160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221556
97483	NC_021820	CGCC	2	8	4617217	4617224	0 %	0 %	25 %	75 %	526221556
97484	NC_021820	GC	3	6	4617227	4617232	0 %	0 %	50 %	50 %	526221556
97485	NC_021820	GC	3	6	4617292	4617297	0 %	0 %	50 %	50 %	526221556
97486	NC_021820	CGAT	2	8	4617298	4617305	25 %	25 %	25 %	25 %	526221556
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97489	NC_021820	TCG	2	6	4617421	4617426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221556
97490	NC_021820	GC	5	10	4617487	4617496	0 %	0 %	50 %	50 %	526221556
97491	NC_021820	TCA	2	6	4617501	4617506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221556
97492	NC_021820	CGC	2	6	4617569	4617574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221556
97493	NC_021820	GCC	2	6	4617575	4617580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221556
97494	NC_021820	GA	3	6	4617742	4617747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97495	NC_021820	GC	3	6	4617758	4617763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97496	NC_021820	ATA	2	6	4617765	4617770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97497	NC_021820	GC	4	8	4617819	4617826	0 %	0 %	50 %	50 %	526221557
97498	NC_021820	GGT	2	6	4617879	4617884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221557
97499	NC_021820	TCA	2	6	4617890	4617895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221557
97500	NC_021820	GTG	2	6	4617902	4617907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221557

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