MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96001	NC_021820	TCC	2	6	4547123	4547128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222483
96002	NC_021820	CGTG	2	8	4547169	4547176	0 %	25 %	50 %	25 %	526222483
96003	NC_021820	CAA	2	6	4547178	4547183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222483
96004	NC_021820	AT	3	6	4547428	4547433	50 %	50 %	0 %	0 %	526222483
96005	NC_021820	AAT	2	6	4547486	4547491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222483
96006	NC_021820	CTTT	2	8	4547502	4547509	0 %	75 %	0 %	25 %	526222483
96007	NC_021820	GCT	2	6	4547527	4547532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222483
96008	NC_021820	TCTT	2	8	4547579	4547586	0 %	75 %	0 %	25 %	526222483
96009	NC_021820	T	6	6	4547591	4547596	0 %	100 %	0 %	0 %	526222483
96010	NC_021820	AAG	2	6	4547666	4547671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222483
96011	NC_021820	T	6	6	4547846	4547851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96012	NC_021820	AT	3	6	4547867	4547872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96013	NC_021820	TTTA	2	8	4547899	4547906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96014	NC_021820	GAT	2	6	4547925	4547930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96015	NC_021820	AG	3	6	4547942	4547947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96016	NC_021820	ATT	2	6	4547990	4547995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96017	NC_021820	AAT	2	6	4548009	4548014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96018	NC_021820	GTG	2	6	4548193	4548198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221498
96019	NC_021820	GAT	2	6	4548229	4548234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221498
96020	NC_021820	ATA	2	6	4548242	4548247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221498
96021	NC_021820	GAA	2	6	4548268	4548273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221498
96022	NC_021820	ATA	2	6	4548287	4548292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221498
96023	NC_021820	CCAT	2	8	4548333	4548340	25 %	25 %	0 %	50 %	526221498
96024	NC_021820	ACG	2	6	4548413	4548418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221498
96025	NC_021820	TCA	2	6	4548453	4548458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
96026	NC_021820	ATC	2	6	4548509	4548514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
96027	NC_021820	ACG	2	6	4548541	4548546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221498
96028	NC_021820	GAA	2	6	4548580	4548585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221498
96029	NC_021820	CCG	2	6	4548621	4548626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221498
96030	NC_021820	T	6	6	4548799	4548804	0 %	100 %	0 %	0 %	526221498
96031	NC_021820	ACC	2	6	4548998	4549003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221498
96032	NC_021820	GCG	3	9	4549005	4549013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221498
96033	NC_021820	C	6	6	4549052	4549057	0 %	0 %	0 %	100 %	526221498
96034	NC_021820	TCG	2	6	4549074	4549079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221498
96035	NC_021820	CCGG	2	8	4549106	4549113	0 %	0 %	50 %	50 %	526221498
96036	NC_021820	GCC	2	6	4549171	4549176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221498
96037	NC_021820	CAA	2	6	4549210	4549215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221498
96038	NC_021820	AAG	2	6	4549226	4549231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221498
96039	NC_021820	CATC	2	8	4549251	4549258	25 %	25 %	0 %	50 %	526221498
96040	NC_021820	CAC	2	6	4549309	4549314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221498
96041	NC_021820	TTG	2	6	4549324	4549329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221498
96042	NC_021820	TCA	2	6	4549331	4549336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
96043	NC_021820	TCA	2	6	4549350	4549355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
96044	NC_021820	CCA	2	6	4549432	4549437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221498
96045	NC_021820	A	6	6	4549473	4549478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96046	NC_021820	CAAT	2	8	4549539	4549546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96047	NC_021820	GGC	2	6	4549575	4549580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96048	NC_021820	AAAT	2	8	4549604	4549611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96049	NC_021820	AAAT	2	8	4549674	4549681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96050	NC_021820	ATG	2	6	4549700	4549705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96051	NC_021820	TGGC	2	8	4549809	4549816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96052	NC_021820	AAG	2	6	4549845	4549850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96053	NC_021820	AAAC	2	8	4549866	4549873	75 %	0 %	0 %	25 %	526221499
96054	NC_021820	AG	3	6	4550048	4550053	50 %	0 %	50 %	0 %	526221499
96055	NC_021820	ACTGG	2	10	4550183	4550192	20 %	20 %	40 %	20 %	526221499
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96057	NC_021820	CGC	2	6	4550261	4550266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221499
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96064	NC_021820	CGA	2	6	4550531	4550536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221499
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96068	NC_021820	GC	3	6	4550693	4550698	0 %	0 %	50 %	50 %	526221499
96069	NC_021820	GCC	2	6	4550802	4550807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221499
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96071	NC_021820	CGT	2	6	4550868	4550873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221499
96072	NC_021820	CGA	2	6	4550888	4550893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221499
96073	NC_021820	TCA	2	6	4550921	4550926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221499
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96076	NC_021820	CTT	2	6	4551049	4551054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96077	NC_021820	CGCC	2	8	4551193	4551200	0 %	0 %	25 %	75 %	526221500
96078	NC_021820	CG	3	6	4551263	4551268	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
96079	NC_021820	CAT	2	6	4551287	4551292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221500
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96082	NC_021820	CG	3	6	4551355	4551360	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
96083	NC_021820	CTG	2	6	4551389	4551394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221500
96084	NC_021820	AAG	2	6	4551453	4551458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221500
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96086	NC_021820	GC	3	6	4551506	4551511	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
96087	NC_021820	GCG	2	6	4551573	4551578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221500
96088	NC_021820	CAG	2	6	4551626	4551631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221500
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96091	NC_021820	CGC	2	6	4551790	4551795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221500
96092	NC_021820	GC	3	6	4551990	4551995	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
96093	NC_021820	GAT	2	6	4552024	4552029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221500
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96096	NC_021820	GCGCTG	2	12	4552139	4552150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526221500
96097	NC_021820	TGA	2	6	4552156	4552161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221500
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96101	NC_021820	CGC	2	6	4552349	4552354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221500
96102	NC_021820	GGAT	2	8	4552373	4552380	25 %	25 %	50 %	0 %	526221500
96103	NC_021820	CGG	2	6	4552390	4552395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221500
96104	NC_021820	GTC	2	6	4552424	4552429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221500
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96108	NC_021820	GAA	2	6	4552537	4552542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221500
96109	NC_021820	TAAG	2	8	4552624	4552631	50 %	25 %	25 %	0 %	526221500
96110	NC_021820	CGC	2	6	4552710	4552715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221501
96111	NC_021820	CGA	2	6	4552767	4552772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221501
96112	NC_021820	CTGG	2	8	4552800	4552807	0 %	25 %	50 %	25 %	526221501
96113	NC_021820	AT	3	6	4552896	4552901	50 %	50 %	0 %	0 %	526221501
96114	NC_021820	CG	4	8	4553067	4553074	0 %	0 %	50 %	50 %	526221501
96115	NC_021820	TAT	2	6	4553076	4553081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221501
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96118	NC_021820	GAC	2	6	4553116	4553121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221501
96119	NC_021820	GCC	2	6	4553155	4553160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221501
96120	NC_021820	GAC	2	6	4553161	4553166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221501
96121	NC_021820	GCG	2	6	4553260	4553265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221501
96122	NC_021820	CGA	2	6	4553289	4553294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221501
96123	NC_021820	CGC	2	6	4553314	4553319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221501
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96125	NC_021820	CG	3	6	4553347	4553352	0 %	0 %	50 %	50 %	526221501
96126	NC_021820	CGA	2	6	4553394	4553399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221501
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96129	NC_021820	CTGG	2	8	4553490	4553497	0 %	25 %	50 %	25 %	526221501
96130	NC_021820	GCC	2	6	4553498	4553503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221501
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96144	NC_021820	AG	3	6	4554111	4554116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96145	NC_021820	GCC	2	6	4554158	4554163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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96147	NC_021820	TCT	2	6	4554241	4554246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96148	NC_021820	T	7	7	4554256	4554262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96149	NC_021820	TGA	2	6	4554312	4554317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96150	NC_021820	TAA	2	6	4554339	4554344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96154	NC_021820	GTA	2	6	4554543	4554548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221502
96155	NC_021820	CTG	2	6	4554558	4554563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221502
96156	NC_021820	GTA	2	6	4554576	4554581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221502
96157	NC_021820	TTTA	2	8	4554633	4554640	25 %	75 %	0 %	0 %	526221502
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96161	NC_021820	TCT	2	6	4555022	4555027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221502
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96173	NC_021820	TTA	2	6	4555425	4555430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96174	NC_021820	TAT	2	6	4555464	4555469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96175	NC_021820	CCA	2	6	4555545	4555550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96176	NC_021820	AAT	2	6	4555557	4555562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96177	NC_021820	CAA	2	6	4555579	4555584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96178	NC_021820	ATG	2	6	4555599	4555604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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96180	NC_021820	ATT	2	6	4555631	4555636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96181	NC_021820	AAT	2	6	4555649	4555654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96182	NC_021820	AAT	3	9	4555660	4555668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96183	NC_021820	AAT	2	6	4555780	4555785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96184	NC_021820	TCA	2	6	4555797	4555802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96185	NC_021820	AT	3	6	4555803	4555808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96186	NC_021820	AAT	2	6	4555960	4555965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96187	NC_021820	ATT	2	6	4555973	4555978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96188	NC_021820	ACA	2	6	4556029	4556034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96189	NC_021820	CGA	2	6	4556065	4556070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96190	NC_021820	TGA	2	6	4556090	4556095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221503
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96192	NC_021820	T	6	6	4556121	4556126	0 %	100 %	0 %	0 %	526221503
96193	NC_021820	ATC	2	6	4556139	4556144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221503
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96197	NC_021820	TAC	2	6	4556318	4556323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221503
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96201	NC_021820	CCGT	2	8	4556643	4556650	0 %	25 %	25 %	50 %	526221503
96202	NC_021820	GGA	2	6	4556702	4556707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221503
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96220	NC_021820	AAC	2	6	4557720	4557725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221503
96221	NC_021820	CGG	2	6	4557748	4557753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221503
96222	NC_021820	TCG	2	6	4557793	4557798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221503
96223	NC_021820	CGT	4	12	4557818	4557829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221503
96224	NC_021820	CGC	2	6	4557872	4557877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221503
96225	NC_021820	AAT	2	6	4557892	4557897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221503
96226	NC_021820	TGG	2	6	4557920	4557925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221503
96227	NC_021820	AGC	2	6	4557966	4557971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96228	NC_021820	GCT	2	6	4558121	4558126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96229	NC_021820	ACC	2	6	4558140	4558145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96230	NC_021820	ATA	2	6	4558172	4558177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221504
96231	NC_021820	CGG	3	9	4558215	4558223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221504
96232	NC_021820	TAT	2	6	4558341	4558346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221504
96233	NC_021820	TTG	2	6	4558439	4558444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221504
96234	NC_021820	CA	3	6	4558487	4558492	50 %	0 %	0 %	50 %	526221504
96235	NC_021820	CCG	2	6	4558495	4558500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221504
96236	NC_021820	GTT	2	6	4558602	4558607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221504
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96238	NC_021820	CTG	2	6	4558720	4558725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221504
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96354	NC_021820	AACA	2	8	4564657	4564664	75 %	0 %	0 %	25 %	526221512
96355	NC_021820	GCCT	2	8	4564696	4564703	0 %	25 %	25 %	50 %	526221512
96356	NC_021820	GCA	2	6	4564773	4564778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221512
96357	NC_021820	ATC	2	6	4564823	4564828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221512
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96359	NC_021820	GCA	2	6	4564860	4564865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221512
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96372	NC_021820	GT	3	6	4565502	4565507	0 %	50 %	50 %	0 %	526221513
96373	NC_021820	GC	3	6	4565522	4565527	0 %	0 %	50 %	50 %	526221513
96374	NC_021820	CAGATC	2	12	4565555	4565566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526221513
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96401	NC_021820	CGC	2	6	4567011	4567016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221514
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96419	NC_021820	ATA	2	6	4567670	4567675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96466	NC_021820	CGGG	2	8	4569440	4569447	0 %	0 %	75 %	25 %	526221515
96467	NC_021820	GCC	3	9	4569463	4569471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221515
96468	NC_021820	CATC	2	8	4569480	4569487	25 %	25 %	0 %	50 %	526221515
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96472	NC_021820	GCA	2	6	4569690	4569695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221515
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96475	NC_021820	T	7	7	4569797	4569803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96480	NC_021820	AAG	2	6	4569944	4569949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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