MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95001	NC_021820	T	6	6	4496846	4496851	0 %	100 %	0 %	0 %	526221453
95002	NC_021820	AAT	2	6	4496852	4496857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221453
95003	NC_021820	TAA	2	6	4496873	4496878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221453
95004	NC_021820	GCT	2	6	4496884	4496889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221453
95005	NC_021820	AAT	2	6	4496924	4496929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95006	NC_021820	CTT	2	6	4496991	4496996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221454
95007	NC_021820	ATT	2	6	4497101	4497106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221454
95008	NC_021820	GCA	2	6	4497291	4497296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221454
95009	NC_021820	CGA	2	6	4497426	4497431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221454
95010	NC_021820	CGC	2	6	4497498	4497503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221454
95011	NC_021820	CCA	2	6	4497546	4497551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221454
95012	NC_021820	GC	3	6	4497588	4497593	0 %	0 %	50 %	50 %	526221454
95013	NC_021820	TC	4	8	4497636	4497643	0 %	50 %	0 %	50 %	526221454
95014	NC_021820	GC	3	6	4497678	4497683	0 %	0 %	50 %	50 %	526221454
95015	NC_021820	CAT	2	6	4497696	4497701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221454
95016	NC_021820	CTG	2	6	4497862	4497867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221454
95017	NC_021820	TTA	2	6	4497902	4497907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221454
95018	NC_021820	TTG	2	6	4497945	4497950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221454
95019	NC_021820	T	6	6	4497995	4498000	0 %	100 %	0 %	0 %	526221455
95020	NC_021820	TTC	2	6	4498014	4498019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221455
95021	NC_021820	TCA	2	6	4498063	4498068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221455
95022	NC_021820	CGCGT	2	10	4498125	4498134	0 %	20 %	40 %	40 %	526221455
95023	NC_021820	GCT	2	6	4498139	4498144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221455
95024	NC_021820	T	6	6	4498160	4498165	0 %	100 %	0 %	0 %	526221455
95025	NC_021820	CCG	2	6	4498227	4498232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221455
95026	NC_021820	GGA	2	6	4498262	4498267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221455
95027	NC_021820	GTC	2	6	4498340	4498345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221455
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95029	NC_021820	GAC	2	6	4498390	4498395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221455
95030	NC_021820	CGCGA	2	10	4498421	4498430	20 %	0 %	40 %	40 %	526221455
95031	NC_021820	CGG	3	9	4498453	4498461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221455
95032	NC_021820	ACC	2	6	4498485	4498490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221455
95033	NC_021820	TGC	2	6	4498500	4498505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221455
95034	NC_021820	GCG	2	6	4498520	4498525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221455
95035	NC_021820	GC	3	6	4498561	4498566	0 %	0 %	50 %	50 %	526221455
95036	NC_021820	GCC	2	6	4498637	4498642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221455
95037	NC_021820	CAG	2	6	4498677	4498682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221455
95038	NC_021820	TTCC	2	8	4498690	4498697	0 %	50 %	0 %	50 %	526221455
95039	NC_021820	TGC	2	6	4498765	4498770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221455
95040	NC_021820	CGC	2	6	4498795	4498800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221455
95041	NC_021820	CG	3	6	4498819	4498824	0 %	0 %	50 %	50 %	526221455
95042	NC_021820	A	6	6	4498832	4498837	100 %	0 %	0 %	0 %	526221455
95043	NC_021820	ATT	2	6	4498961	4498966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221455
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95045	NC_021820	CTG	2	6	4499053	4499058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221456
95046	NC_021820	TGT	2	6	4499061	4499066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221456
95047	NC_021820	GCA	2	6	4499118	4499123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221456
95048	NC_021820	TTTTTA	2	12	4499150	4499161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	526221456
95049	NC_021820	GA	3	6	4499211	4499216	50 %	0 %	50 %	0 %	526221456
95050	NC_021820	AGCC	2	8	4499237	4499244	25 %	0 %	25 %	50 %	526221456
95051	NC_021820	GCCCT	2	10	4499264	4499273	0 %	20 %	20 %	60 %	526221456
95052	NC_021820	CG	3	6	4499280	4499285	0 %	0 %	50 %	50 %	526221456
95053	NC_021820	ATG	2	6	4499470	4499475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221456
95054	NC_021820	CGG	2	6	4499478	4499483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221456
95055	NC_021820	CGT	2	6	4499493	4499498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221456
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95058	NC_021820	GAC	2	6	4499646	4499651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221456
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95065	NC_021820	GCTG	2	8	4500196	4500203	0 %	25 %	50 %	25 %	526221456
95066	NC_021820	CCA	2	6	4500210	4500215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221456
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95068	NC_021820	TGA	2	6	4500338	4500343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221456
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95070	NC_021820	TGTTT	2	10	4500476	4500485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95071	NC_021820	ATTT	2	8	4500591	4500598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95075	NC_021820	TAT	2	6	4500853	4500858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95078	NC_021820	GAG	2	6	4500925	4500930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95079	NC_021820	GCC	2	6	4500934	4500939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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95081	NC_021820	TGA	2	6	4500989	4500994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95082	NC_021820	ATA	2	6	4501071	4501076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95085	NC_021820	AGGG	2	8	4501155	4501162	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95086	NC_021820	GAT	2	6	4501177	4501182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95087	NC_021820	CGT	2	6	4501289	4501294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95088	NC_021820	GGC	2	6	4501388	4501393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95089	NC_021820	CGA	2	6	4501402	4501407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95090	NC_021820	GCTC	2	8	4501426	4501433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95091	NC_021820	TGG	2	6	4501531	4501536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95092	NC_021820	CT	3	6	4501627	4501632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95093	NC_021820	GGC	2	6	4501647	4501652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95094	NC_021820	GAA	2	6	4501710	4501715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221457
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95103	NC_021820	CTG	2	6	4502064	4502069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221457
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95105	NC_021820	GCT	2	6	4502087	4502092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221457
95106	NC_021820	TGAT	2	8	4502209	4502216	25 %	50 %	25 %	0 %	526221457
95107	NC_021820	T	6	6	4502216	4502221	0 %	100 %	0 %	0 %	526221457
95108	NC_021820	AAGT	2	8	4502236	4502243	50 %	25 %	25 %	0 %	526221457
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95112	NC_021820	TC	4	8	4502341	4502348	0 %	50 %	0 %	50 %	526221457
95113	NC_021820	TCGC	2	8	4502358	4502365	0 %	25 %	25 %	50 %	526221457
95114	NC_021820	AGT	2	6	4502389	4502394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221457
95115	NC_021820	TCT	2	6	4502395	4502400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221457
95116	NC_021820	AG	3	6	4502535	4502540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95117	NC_021820	TTTC	2	8	4502547	4502554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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95119	NC_021820	CCA	2	6	4502592	4502597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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95237	NC_021820	A	6	6	4508349	4508354	100 %	0 %	0 %	0 %	526221461
95238	NC_021820	GCG	2	6	4508442	4508447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221461
95239	NC_021820	ATC	3	9	4508471	4508479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221461
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95348	NC_021820	CG	3	6	4514295	4514300	0 %	0 %	50 %	50 %	526221468
95349	NC_021820	TGA	2	6	4514410	4514415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221468
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95470	NC_021820	T	6	6	4519798	4519803	0 %	100 %	0 %	0 %	526221474
95471	NC_021820	GAT	2	6	4520002	4520007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95472	NC_021820	ATA	2	6	4520018	4520023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95473	NC_021820	GTTG	2	8	4520026	4520033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95474	NC_021820	GAA	2	6	4520254	4520259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221475
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95493	NC_021820	AG	3	6	4521226	4521231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95494	NC_021820	T	6	6	4521234	4521239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95495	NC_021820	A	6	6	4521263	4521268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95496	NC_021820	TCT	2	6	4521354	4521359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221476
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