MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
94001	NC_021820	GCG	2	6	4447763	4447768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221415
94002	NC_021820	TGC	2	6	4447772	4447777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221415
94003	NC_021820	ACTG	2	8	4447802	4447809	25 %	25 %	25 %	25 %	526221415
94004	NC_021820	CCTG	2	8	4447853	4447860	0 %	25 %	25 %	50 %	526221415
94005	NC_021820	TCA	2	6	4447878	4447883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221415
94006	NC_021820	T	6	6	4447987	4447992	0 %	100 %	0 %	0 %	526221415
94007	NC_021820	CTT	2	6	4447998	4448003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221415
94008	NC_021820	TTA	2	6	4448021	4448026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221415
94009	NC_021820	CAT	2	6	4448031	4448036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221415
94010	NC_021820	TCT	2	6	4448060	4448065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221415
94011	NC_021820	T	6	6	4448119	4448124	0 %	100 %	0 %	0 %	526221415
94012	NC_021820	CAGT	2	8	4448147	4448154	25 %	25 %	25 %	25 %	526221415
94013	NC_021820	GTT	2	6	4448193	4448198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221415
94014	NC_021820	AAC	2	6	4448222	4448227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221415
94015	NC_021820	ATT	2	6	4448287	4448292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221415
94016	NC_021820	TGTT	2	8	4448313	4448320	0 %	75 %	25 %	0 %	526221415
94017	NC_021820	ATA	2	6	4448327	4448332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221415
94018	NC_021820	ATA	2	6	4448372	4448377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221415
94019	NC_021820	CAT	2	6	4448393	4448398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94020	NC_021820	T	6	6	4448414	4448419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94021	NC_021820	ACT	2	6	4448540	4448545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222464
94022	NC_021820	CAG	2	6	4448566	4448571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222464
94023	NC_021820	AAT	2	6	4448628	4448633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222464
94024	NC_021820	TTAT	2	8	4448667	4448674	25 %	75 %	0 %	0 %	526222464
94025	NC_021820	TAA	2	6	4448703	4448708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222464
94026	NC_021820	GTT	2	6	4448712	4448717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222464
94027	NC_021820	GTT	2	6	4448810	4448815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222464
94028	NC_021820	GCA	2	6	4448919	4448924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222464
94029	NC_021820	CAG	2	6	4448927	4448932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222464
94030	NC_021820	TCT	3	9	4448971	4448979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222464
94031	NC_021820	TAAA	2	8	4449048	4449055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94032	NC_021820	AT	3	6	4449128	4449133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94033	NC_021820	TAA	3	9	4449153	4449161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94034	NC_021820	AT	3	6	4449204	4449209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94035	NC_021820	AAT	2	6	4449216	4449221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94036	NC_021820	GGC	2	6	4449236	4449241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94037	NC_021820	GAGT	2	8	4449246	4449253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94038	NC_021820	CAA	2	6	4449290	4449295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94039	NC_021820	ATGG	2	8	4449351	4449358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94040	NC_021820	TA	3	6	4449406	4449411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94041	NC_021820	AAG	2	6	4449418	4449423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94042	NC_021820	A	7	7	4449540	4449546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94043	NC_021820	TATT	2	8	4449604	4449611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94044	NC_021820	A	7	7	4449659	4449665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94045	NC_021820	ACC	2	6	4449667	4449672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94046	NC_021820	ACC	2	6	4449692	4449697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94047	NC_021820	TTGT	2	8	4449829	4449836	0 %	75 %	25 %	0 %	526221416
94048	NC_021820	GAC	3	9	4449837	4449845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221416
94049	NC_021820	ATC	2	6	4449874	4449879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221416
94050	NC_021820	GTAT	2	8	4449937	4449944	25 %	50 %	25 %	0 %	526221416
94051	NC_021820	ACG	2	6	4449997	4450002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221416
94052	NC_021820	T	6	6	4450028	4450033	0 %	100 %	0 %	0 %	526221416
94053	NC_021820	GTT	2	6	4450204	4450209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222465
94054	NC_021820	TTCTGC	2	12	4450288	4450299	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526222465
94055	NC_021820	TCC	2	6	4450329	4450334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222465
94056	NC_021820	A	8	8	4450382	4450389	100 %	0 %	0 %	0 %	526222465
94057	NC_021820	TG	3	6	4450394	4450399	0 %	50 %	50 %	0 %	526222465
94058	NC_021820	CCT	2	6	4450408	4450413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94059	NC_021820	A	6	6	4450481	4450486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94060	NC_021820	A	6	6	4450585	4450590	100 %	0 %	0 %	0 %	526222466
94061	NC_021820	CAT	2	6	4450665	4450670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222466
94062	NC_021820	CG	3	6	4450731	4450736	0 %	0 %	50 %	50 %	526222466
94063	NC_021820	GGT	2	6	4450779	4450784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222466
94064	NC_021820	CGA	2	6	4450838	4450843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94065	NC_021820	AGCC	2	8	4450912	4450919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94066	NC_021820	A	6	6	4450951	4450956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94067	NC_021820	ATG	2	6	4450976	4450981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222467
94068	NC_021820	ATC	3	9	4450994	4451002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222467
94069	NC_021820	GGTAAA	2	12	4451069	4451080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526222467
94070	NC_021820	A	6	6	4451078	4451083	100 %	0 %	0 %	0 %	526222467
94071	NC_021820	GAT	2	6	4451104	4451109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94072	NC_021820	A	6	6	4451217	4451222	100 %	0 %	0 %	0 %	526222468
94073	NC_021820	CGC	2	6	4451476	4451481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222468
94074	NC_021820	GCC	2	6	4451502	4451507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222468
94075	NC_021820	CTT	2	6	4451512	4451517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222468
94076	NC_021820	CGC	2	6	4451530	4451535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222468
94077	NC_021820	GTT	2	6	4451588	4451593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222468
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94079	NC_021820	GGC	2	6	4451621	4451626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222468
94080	NC_021820	CATC	2	8	4451647	4451654	25 %	25 %	0 %	50 %	526222468
94081	NC_021820	AAAT	2	8	4451661	4451668	75 %	25 %	0 %	0 %	526222468
94082	NC_021820	CAG	2	6	4451693	4451698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222468
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94084	NC_021820	A	6	6	4451713	4451718	100 %	0 %	0 %	0 %	526222468
94085	NC_021820	ATG	2	6	4451790	4451795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222468
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94087	NC_021820	GTG	2	6	4451843	4451848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222468
94088	NC_021820	AC	3	6	4451850	4451855	50 %	0 %	0 %	50 %	526222468
94089	NC_021820	TGC	2	6	4451895	4451900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222468
94090	NC_021820	ATA	2	6	4451939	4451944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94091	NC_021820	AGA	2	6	4452029	4452034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94092	NC_021820	GCG	2	6	4452219	4452224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221417
94093	NC_021820	TGC	2	6	4452300	4452305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221417
94094	NC_021820	T	6	6	4452318	4452323	0 %	100 %	0 %	0 %	526221417
94095	NC_021820	ATT	2	6	4452346	4452351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221417
94096	NC_021820	GTAAT	2	10	4452383	4452392	40 %	40 %	20 %	0 %	526221417
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94101	NC_021820	CGG	2	6	4452592	4452597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221417
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94103	NC_021820	GCA	2	6	4452635	4452640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221417
94104	NC_021820	TTG	2	6	4452645	4452650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221417
94105	NC_021820	GC	3	6	4452788	4452793	0 %	0 %	50 %	50 %	526221417
94106	NC_021820	CGC	2	6	4452813	4452818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221417
94107	NC_021820	CAG	3	9	4452880	4452888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221417
94108	NC_021820	AGC	2	6	4452985	4452990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94109	NC_021820	GAT	3	9	4453037	4453045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94110	NC_021820	ATA	2	6	4453070	4453075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94111	NC_021820	CTTT	2	8	4453134	4453141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94112	NC_021820	TGGCC	2	10	4453174	4453183	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94113	NC_021820	TGC	2	6	4453185	4453190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94114	NC_021820	CTG	2	6	4453326	4453331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221418
94115	NC_021820	ACG	2	6	4453365	4453370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221418
94116	NC_021820	CAA	2	6	4453429	4453434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221418
94117	NC_021820	ACC	2	6	4453441	4453446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221418
94118	NC_021820	ATC	2	6	4453456	4453461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221418
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94120	NC_021820	GT	3	6	4453598	4453603	0 %	50 %	50 %	0 %	526221418
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94236	NC_021820	CCA	2	6	4459483	4459488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221423
94237	NC_021820	GCG	2	6	4459567	4459572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221423
94238	NC_021820	GC	3	6	4459648	4459653	0 %	0 %	50 %	50 %	526221423
94239	NC_021820	ATC	2	6	4459658	4459663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221423
94240	NC_021820	ATC	2	6	4459781	4459786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221423
94241	NC_021820	GAT	2	6	4459816	4459821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221423
94242	NC_021820	CGA	2	6	4459851	4459856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221423
94243	NC_021820	T	6	6	4460068	4460073	0 %	100 %	0 %	0 %	526221424
94244	NC_021820	ACG	2	6	4460191	4460196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221424
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94247	NC_021820	GCT	2	6	4460649	4460654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221425
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94253	NC_021820	AGT	2	6	4460906	4460911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221425
94254	NC_021820	ATC	2	6	4460912	4460917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221425
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94262	NC_021820	ATG	2	6	4461216	4461221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222469
94263	NC_021820	CGA	2	6	4461246	4461251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222469
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94267	NC_021820	ATT	2	6	4461532	4461537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94268	NC_021820	CCA	2	6	4461557	4461562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221426
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94297	NC_021820	AAATT	2	10	4463391	4463400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94298	NC_021820	TAT	2	6	4463406	4463411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94303	NC_021820	GAAT	2	8	4463886	4463893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94304	NC_021820	TAAA	2	8	4463904	4463911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94333	NC_021820	A	6	6	4465146	4465151	100 %	0 %	0 %	0 %	526221429
94334	NC_021820	CAC	2	6	4465220	4465225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221429
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94345	NC_021820	AGTG	2	8	4465802	4465809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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94349	NC_021820	TAA	2	6	4466150	4466155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94350	NC_021820	TTCC	2	8	4466158	4466165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94351	NC_021820	ACC	2	6	4466177	4466182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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