MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_021820	CAG	2	6	4399144	4399149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221388
93002	NC_021820	AAC	2	6	4399175	4399180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221388
93003	NC_021820	TGGAGA	2	12	4399181	4399192	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	526221388
93004	NC_021820	ATT	2	6	4399207	4399212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221388
93005	NC_021820	ATA	2	6	4399220	4399225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221388
93006	NC_021820	GCG	2	6	4399240	4399245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221388
93007	NC_021820	GCC	2	6	4399348	4399353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221388
93008	NC_021820	TTGT	2	8	4399381	4399388	0 %	75 %	25 %	0 %	526221388
93009	NC_021820	GAC	2	6	4399392	4399397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221388
93010	NC_021820	A	7	7	4399468	4399474	100 %	0 %	0 %	0 %	526221388
93011	NC_021820	G	6	6	4399528	4399533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93012	NC_021820	GCGCT	2	10	4399541	4399550	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93013	NC_021820	CAT	2	6	4399572	4399577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93014	NC_021820	GACT	2	8	4399638	4399645	25 %	25 %	25 %	25 %	526222451
93015	NC_021820	TCA	2	6	4399646	4399651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222451
93016	NC_021820	CCG	3	9	4399735	4399743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93017	NC_021820	GCTG	2	8	4399794	4399801	0 %	25 %	50 %	25 %	526222451
93018	NC_021820	GCG	2	6	4399814	4399819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222451
93019	NC_021820	GGCTG	2	10	4399887	4399896	0 %	20 %	60 %	20 %	526222451
93020	NC_021820	GC	3	6	4400005	4400010	0 %	0 %	50 %	50 %	526222451
93021	NC_021820	TGC	2	6	4400069	4400074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93022	NC_021820	GCA	2	6	4400196	4400201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93023	NC_021820	TCG	2	6	4400255	4400260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93024	NC_021820	CTG	2	6	4400299	4400304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93025	NC_021820	CGC	2	6	4400331	4400336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93026	NC_021820	GCC	3	9	4400345	4400353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93027	NC_021820	CAA	2	6	4400398	4400403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222451
93028	NC_021820	CCG	2	6	4400445	4400450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93029	NC_021820	CCG	2	6	4400493	4400498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93030	NC_021820	GATCGC	2	12	4400565	4400576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93031	NC_021820	CCCG	2	8	4400589	4400596	0 %	0 %	25 %	75 %	526222451
93032	NC_021820	GCG	2	6	4400598	4400603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222451
93033	NC_021820	AG	3	6	4400606	4400611	50 %	0 %	50 %	0 %	526222451
93034	NC_021820	TCAA	2	8	4400612	4400619	50 %	25 %	0 %	25 %	526222451
93035	NC_021820	CAT	2	6	4400626	4400631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222451
93036	NC_021820	ATCA	2	8	4400638	4400645	50 %	25 %	0 %	25 %	526222451
93037	NC_021820	ACC	2	6	4400660	4400665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222451
93038	NC_021820	ATG	2	6	4400695	4400700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222451
93039	NC_021820	TCC	2	6	4400756	4400761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222451
93040	NC_021820	CGC	2	6	4400806	4400811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93041	NC_021820	GCC	2	6	4400903	4400908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93042	NC_021820	AGC	2	6	4400909	4400914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93043	NC_021820	GGT	3	9	4400923	4400931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222451
93044	NC_021820	CGG	3	9	4400985	4400993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222451
93045	NC_021820	A	6	6	4401094	4401099	100 %	0 %	0 %	0 %	526222451
93046	NC_021820	GC	3	6	4401100	4401105	0 %	0 %	50 %	50 %	526222451
93047	NC_021820	CGTT	2	8	4401113	4401120	0 %	50 %	25 %	25 %	526222451
93048	NC_021820	CAC	2	6	4401122	4401127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222451
93049	NC_021820	CGC	2	6	4401150	4401155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93050	NC_021820	CGC	2	6	4401180	4401185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93051	NC_021820	CCG	2	6	4401192	4401197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93052	NC_021820	CCT	2	6	4401273	4401278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222451
93053	NC_021820	CGTTAA	2	12	4401280	4401291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526222451
93054	NC_021820	AC	3	6	4401307	4401312	50 %	0 %	0 %	50 %	526222451
93055	NC_021820	AGC	2	6	4401338	4401343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93056	NC_021820	GCC	2	6	4401347	4401352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222451
93057	NC_021820	CGG	2	6	4401360	4401365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222451
93058	NC_021820	TCG	2	6	4401368	4401373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222451
93059	NC_021820	CCT	2	6	4401467	4401472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222452
93060	NC_021820	ATC	2	6	4401495	4401500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
93061	NC_021820	TTAA	2	8	4401508	4401515	50 %	50 %	0 %	0 %	526222452
93062	NC_021820	CGC	3	9	4401516	4401524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93063	NC_021820	CTG	2	6	4401546	4401551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93064	NC_021820	AGAT	2	8	4401583	4401590	50 %	25 %	25 %	0 %	526222452
93065	NC_021820	CGC	2	6	4401593	4401598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93066	NC_021820	CGC	2	6	4401702	4401707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93067	NC_021820	GCG	2	6	4401730	4401735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
93068	NC_021820	CCAG	2	8	4401746	4401753	25 %	0 %	25 %	50 %	526222452
93069	NC_021820	CTG	2	6	4401860	4401865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93070	NC_021820	CGA	2	6	4401880	4401885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93071	NC_021820	CGG	2	6	4401905	4401910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
93072	NC_021820	CCAG	2	8	4402022	4402029	25 %	0 %	25 %	50 %	526222452
93073	NC_021820	GCG	2	6	4402178	4402183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
93074	NC_021820	CCG	2	6	4402199	4402204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93075	NC_021820	GCG	2	6	4402219	4402224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
93076	NC_021820	GCT	2	6	4402271	4402276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93077	NC_021820	AC	3	6	4402404	4402409	50 %	0 %	0 %	50 %	526222452
93078	NC_021820	TCG	2	6	4402417	4402422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93079	NC_021820	CATC	2	8	4402457	4402464	25 %	25 %	0 %	50 %	526222452
93080	NC_021820	GC	3	6	4402493	4402498	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93081	NC_021820	GCG	2	6	4402547	4402552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
93082	NC_021820	CT	3	6	4402648	4402653	0 %	50 %	0 %	50 %	526222452
93083	NC_021820	ACCAG	2	10	4402745	4402754	40 %	0 %	20 %	40 %	526222452
93084	NC_021820	GCTG	2	8	4402829	4402836	0 %	25 %	50 %	25 %	526222452
93085	NC_021820	GCCA	2	8	4402870	4402877	25 %	0 %	25 %	50 %	526222452
93086	NC_021820	CCG	2	6	4402970	4402975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93087	NC_021820	CAG	2	6	4402980	4402985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93088	NC_021820	GC	3	6	4403001	4403006	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93089	NC_021820	GC	4	8	4403015	4403022	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93090	NC_021820	CGC	2	6	4403036	4403041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93091	NC_021820	TCA	2	6	4403101	4403106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
93092	NC_021820	CAT	2	6	4403142	4403147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
93093	NC_021820	CTG	2	6	4403323	4403328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93094	NC_021820	CGA	2	6	4403367	4403372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93095	NC_021820	CAG	2	6	4403385	4403390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93096	NC_021820	GC	3	6	4403410	4403415	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93097	NC_021820	TCAT	2	8	4403608	4403615	25 %	50 %	0 %	25 %	526222452
93098	NC_021820	CTGA	2	8	4403616	4403623	25 %	25 %	25 %	25 %	526222452
93099	NC_021820	GC	3	6	4403687	4403692	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93100	NC_021820	TGT	2	6	4403827	4403832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222452
93101	NC_021820	ATC	2	6	4403857	4403862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
93102	NC_021820	CGC	2	6	4403886	4403891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
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93104	NC_021820	CGC	2	6	4403963	4403968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93105	NC_021820	ACAA	2	8	4404073	4404080	75 %	0 %	0 %	25 %	526222452
93106	NC_021820	CGC	2	6	4404098	4404103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
93107	NC_021820	A	6	6	4404124	4404129	100 %	0 %	0 %	0 %	526222452
93108	NC_021820	TCT	2	6	4404178	4404183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222452
93109	NC_021820	CGAT	2	8	4404244	4404251	25 %	25 %	25 %	25 %	526222452
93110	NC_021820	GAT	2	6	4404256	4404261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222452
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93112	NC_021820	TGC	2	6	4404301	4404306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
93113	NC_021820	GC	3	6	4404321	4404326	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93114	NC_021820	TCC	2	6	4404358	4404363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222452
93115	NC_021820	GGC	2	6	4404370	4404375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
93116	NC_021820	CGAT	2	8	4404409	4404416	25 %	25 %	25 %	25 %	526222452
93117	NC_021820	ACC	2	6	4404457	4404462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222452
93118	NC_021820	CG	3	6	4404473	4404478	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
93119	NC_021820	CGC	2	6	4404496	4404501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
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93126	NC_021820	TTC	2	6	4404831	4404836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222452
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93130	NC_021820	TCAA	2	8	4404940	4404947	50 %	25 %	0 %	25 %	526222452
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93149	NC_021820	CGT	2	6	4406001	4406006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
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93180	NC_021820	CGTTCG	2	12	4407398	4407409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
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93212	NC_021820	TCA	2	6	4409123	4409128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221389
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93223	NC_021820	CTG	2	6	4409590	4409595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221389
93224	NC_021820	TCAA	2	8	4409597	4409604	50 %	25 %	0 %	25 %	526221389
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93229	NC_021820	TGC	2	6	4409870	4409875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221389
93230	NC_021820	CTT	2	6	4409970	4409975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221389
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93232	NC_021820	TGAC	2	8	4410094	4410101	25 %	25 %	25 %	25 %	526221389
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93295	NC_021820	CG	3	6	4413331	4413336	0 %	0 %	50 %	50 %	526222457
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93300	NC_021820	GCGCCA	2	12	4413730	4413741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526221391
93301	NC_021820	ATA	2	6	4413777	4413782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221391
93302	NC_021820	CGA	2	6	4413783	4413788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221391
93303	NC_021820	GGC	2	6	4413841	4413846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221391
93304	NC_021820	ATT	2	6	4413935	4413940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221391
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93320	NC_021820	GTGGC	2	10	4414457	4414466	0 %	20 %	60 %	20 %	526221392
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93322	NC_021820	CG	3	6	4414532	4414537	0 %	0 %	50 %	50 %	526221392
93323	NC_021820	ATC	2	6	4414704	4414709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221392
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93327	NC_021820	C	6	6	4414830	4414835	0 %	0 %	0 %	100 %	526221392
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93330	NC_021820	GC	3	6	4415094	4415099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93331	NC_021820	AAT	2	6	4415129	4415134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93332	NC_021820	CT	3	6	4415238	4415243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93333	NC_021820	CTC	2	6	4415268	4415273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221393
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93335	NC_021820	C	6	6	4415282	4415287	0 %	0 %	0 %	100 %	526221393
93336	NC_021820	CGC	2	6	4415308	4415313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221393
93337	NC_021820	TGA	2	6	4415318	4415323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221393
93338	NC_021820	GCA	2	6	4415397	4415402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221393
93339	NC_021820	CGCC	2	8	4415487	4415494	0 %	0 %	25 %	75 %	526221393
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93343	NC_021820	AT	3	6	4415630	4415635	50 %	50 %	0 %	0 %	526221393
93344	NC_021820	CCGA	2	8	4415654	4415661	25 %	0 %	25 %	50 %	526221393
93345	NC_021820	GCA	2	6	4415691	4415696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221393
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93347	NC_021820	CGC	2	6	4415798	4415803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221393
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93349	NC_021820	GCA	2	6	4415838	4415843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221393
93350	NC_021820	CGC	2	6	4415863	4415868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221393
93351	NC_021820	GC	3	6	4415873	4415878	0 %	0 %	50 %	50 %	526221393
93352	NC_021820	CG	3	6	4415884	4415889	0 %	0 %	50 %	50 %	526221393
93353	NC_021820	GCA	2	6	4416045	4416050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221393
93354	NC_021820	CTT	2	6	4416075	4416080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221393
93355	NC_021820	GCA	2	6	4416099	4416104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221393
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93469	NC_021820	CGC	2	6	4422009	4422014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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