MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
91501	NC_021820	CCG	2	6	4328471	4328476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221341
91502	NC_021820	AGGT	2	8	4328553	4328560	25 %	25 %	50 %	0 %	526221341
91503	NC_021820	GC	3	6	4328593	4328598	0 %	0 %	50 %	50 %	526221341
91504	NC_021820	CAC	2	6	4328645	4328650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221341
91505	NC_021820	GCG	2	6	4328679	4328684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221341
91506	NC_021820	TCA	2	6	4328718	4328723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221341
91507	NC_021820	CAGCTC	2	12	4328796	4328807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526221342
91508	NC_021820	GCG	2	6	4328828	4328833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221342
91509	NC_021820	GTCG	2	8	4328891	4328898	0 %	25 %	50 %	25 %	526221342
91510	NC_021820	GCCC	2	8	4328909	4328916	0 %	0 %	25 %	75 %	526221342
91511	NC_021820	CCA	2	6	4328972	4328977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221342
91512	NC_021820	TTG	2	6	4329025	4329030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221342
91513	NC_021820	CG	4	8	4329061	4329068	0 %	0 %	50 %	50 %	526221342
91514	NC_021820	CGT	2	6	4329092	4329097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91515	NC_021820	CCAT	2	8	4329128	4329135	25 %	25 %	0 %	50 %	526221342
91516	NC_021820	GCC	2	6	4329181	4329186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221342
91517	NC_021820	AGC	2	6	4329187	4329192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91518	NC_021820	CGC	2	6	4329197	4329202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221342
91519	NC_021820	GTC	2	6	4329216	4329221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91520	NC_021820	CTT	3	9	4329257	4329265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221342
91521	NC_021820	GCA	2	6	4329317	4329322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91522	NC_021820	GCG	2	6	4329517	4329522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221342
91523	NC_021820	TTG	2	6	4329655	4329660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221342
91524	NC_021820	CCA	3	9	4329665	4329673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221342
91525	NC_021820	CG	3	6	4329739	4329744	0 %	0 %	50 %	50 %	526221342
91526	NC_021820	ATA	2	6	4329829	4329834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221342
91527	NC_021820	CAG	2	6	4329918	4329923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91528	NC_021820	AGAGA	2	10	4329976	4329985	60 %	0 %	40 %	0 %	526221342
91529	NC_021820	GCA	2	6	4330016	4330021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91530	NC_021820	TCA	2	6	4330048	4330053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221342
91531	NC_021820	A	6	6	4330069	4330074	100 %	0 %	0 %	0 %	526221342
91532	NC_021820	GCA	2	6	4330076	4330081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221342
91533	NC_021820	ATC	2	6	4330102	4330107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221342
91534	NC_021820	CGC	2	6	4330118	4330123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221342
91535	NC_021820	TGT	2	6	4330138	4330143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221342
91536	NC_021820	GGC	2	6	4330161	4330166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91537	NC_021820	T	6	6	4330188	4330193	0 %	100 %	0 %	0 %	526221343
91538	NC_021820	ATC	2	6	4330225	4330230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221343
91539	NC_021820	TGG	2	6	4330247	4330252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221343
91540	NC_021820	T	7	7	4330355	4330361	0 %	100 %	0 %	0 %	526221343
91541	NC_021820	CCA	2	6	4330400	4330405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221343
91542	NC_021820	TCA	2	6	4330406	4330411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221343
91543	NC_021820	CAG	2	6	4330442	4330447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221343
91544	NC_021820	CGATGT	2	12	4330463	4330474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526221343
91545	NC_021820	CCAG	2	8	4330478	4330485	25 %	0 %	25 %	50 %	526221343
91546	NC_021820	TTA	2	6	4330549	4330554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221343
91547	NC_021820	GCC	2	6	4330677	4330682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221343
91548	NC_021820	GT	3	6	4330747	4330752	0 %	50 %	50 %	0 %	526221343
91549	NC_021820	GAAC	2	8	4330766	4330773	50 %	0 %	25 %	25 %	526221343
91550	NC_021820	GCA	2	6	4330946	4330951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221343
91551	NC_021820	GGTG	2	8	4331054	4331061	0 %	25 %	75 %	0 %	526221343
91552	NC_021820	T	6	6	4331100	4331105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91553	NC_021820	TGAA	2	8	4331148	4331155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91554	NC_021820	AGT	2	6	4331172	4331177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91555	NC_021820	A	6	6	4331214	4331219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91556	NC_021820	CGC	2	6	4331344	4331349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221344
91557	NC_021820	TCCT	2	8	4331384	4331391	0 %	50 %	0 %	50 %	526221344
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91559	NC_021820	T	6	6	4331455	4331460	0 %	100 %	0 %	0 %	526221344
91560	NC_021820	CCG	2	6	4331483	4331488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221344
91561	NC_021820	TGT	2	6	4331492	4331497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221344
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91566	NC_021820	ATC	2	6	4331662	4331667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221344
91567	NC_021820	TACG	2	8	4331685	4331692	25 %	25 %	25 %	25 %	526221344
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91573	NC_021820	GCT	2	6	4331919	4331924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221344
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91576	NC_021820	CGC	2	6	4332051	4332056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221344
91577	NC_021820	ATCC	2	8	4332077	4332084	25 %	25 %	0 %	50 %	526221344
91578	NC_021820	ATG	2	6	4332110	4332115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221344
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91583	NC_021820	TGC	2	6	4332329	4332334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221344
91584	NC_021820	A	6	6	4332362	4332367	100 %	0 %	0 %	0 %	526221344
91585	NC_021820	TCGC	2	8	4332556	4332563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91586	NC_021820	TTA	2	6	4332604	4332609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91587	NC_021820	TTAA	2	8	4332618	4332625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91588	NC_021820	AAT	2	6	4332668	4332673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91589	NC_021820	TTCG	2	8	4332689	4332696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91590	NC_021820	TGC	2	6	4332796	4332801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91591	NC_021820	ACGTT	2	10	4333192	4333201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91592	NC_021820	GCG	2	6	4333215	4333220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91593	NC_021820	TGA	2	6	4333276	4333281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91594	NC_021820	CAA	3	9	4333631	4333639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91595	NC_021820	AC	3	6	4333678	4333683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91596	NC_021820	ATT	2	6	4333816	4333821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91597	NC_021820	AC	3	6	4333862	4333867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91598	NC_021820	TA	3	6	4333874	4333879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91599	NC_021820	T	6	6	4333896	4333901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91600	NC_021820	TTA	3	9	4333940	4333948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91603	NC_021820	TTG	2	6	4334069	4334074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221345
91604	NC_021820	TAC	2	6	4334085	4334090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221345
91605	NC_021820	TG	3	6	4334110	4334115	0 %	50 %	50 %	0 %	526221345
91606	NC_021820	GCG	2	6	4334216	4334221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221345
91607	NC_021820	ACC	2	6	4334242	4334247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221345
91608	NC_021820	TCA	2	6	4334252	4334257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221345
91609	NC_021820	GGC	2	6	4334310	4334315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221346
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91616	NC_021820	TGA	2	6	4334506	4334511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221346
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91618	NC_021820	CGC	2	6	4334582	4334587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221346
91619	NC_021820	CGC	2	6	4334627	4334632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221346
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91622	NC_021820	GGCG	2	8	4334786	4334793	0 %	0 %	75 %	25 %	526221346
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91634	NC_021820	CTG	3	9	4335343	4335351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222441
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91659	NC_021820	CGG	2	6	4336267	4336272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222442
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91974	NC_021820	ATCGA	2	10	4350942	4350951	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91975	NC_021820	AAT	2	6	4350967	4350972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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