MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90501	NC_021820	TG	3	6	4281389	4281394	0 %	50 %	50 %	0 %	526221301
90502	NC_021820	ATGACT	2	12	4281432	4281443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526221301
90503	NC_021820	TGC	2	6	4281449	4281454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221301
90504	NC_021820	TAT	2	6	4281512	4281517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221301
90505	NC_021820	TAT	2	6	4281533	4281538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221301
90506	NC_021820	TAT	2	6	4281548	4281553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221301
90507	NC_021820	TAT	2	6	4281569	4281574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221301
90508	NC_021820	AATATT	2	12	4281636	4281647	50 %	50 %	0 %	0 %	526221301
90509	NC_021820	T	6	6	4281672	4281677	0 %	100 %	0 %	0 %	526221301
90510	NC_021820	CCA	2	6	4281679	4281684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221301
90511	NC_021820	AGC	2	6	4281766	4281771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221301
90512	NC_021820	TGG	2	6	4281847	4281852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221301
90513	NC_021820	CGC	3	9	4281879	4281887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221301
90514	NC_021820	CAA	2	6	4281893	4281898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221301
90515	NC_021820	TGC	2	6	4281911	4281916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221301
90516	NC_021820	CCT	2	6	4281980	4281985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221301
90517	NC_021820	TCG	2	6	4281998	4282003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221301
90518	NC_021820	ATA	2	6	4282039	4282044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221301
90519	NC_021820	GCT	2	6	4282052	4282057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221301
90520	NC_021820	GCTTC	2	10	4282073	4282082	0 %	40 %	20 %	40 %	526221301
90521	NC_021820	CTTT	2	8	4282085	4282092	0 %	75 %	0 %	25 %	526221301
90522	NC_021820	TTTC	2	8	4282124	4282131	0 %	75 %	0 %	25 %	526221301
90523	NC_021820	TCA	2	6	4282175	4282180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221301
90524	NC_021820	TGG	2	6	4282208	4282213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221301
90525	NC_021820	ATT	2	6	4282272	4282277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221301
90526	NC_021820	CTT	2	6	4282292	4282297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221301
90527	NC_021820	CGC	2	6	4282440	4282445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221301
90528	NC_021820	G	6	6	4282497	4282502	0 %	0 %	100 %	0 %	526221301
90529	NC_021820	ATT	2	6	4282525	4282530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221301
90530	NC_021820	GCT	2	6	4282578	4282583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221302
90531	NC_021820	TTC	2	6	4282680	4282685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221302
90532	NC_021820	GC	3	6	4282757	4282762	0 %	0 %	50 %	50 %	526221302
90533	NC_021820	T	6	6	4282787	4282792	0 %	100 %	0 %	0 %	526221302
90534	NC_021820	GAC	2	6	4282815	4282820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221302
90535	NC_021820	ATTCA	2	10	4282860	4282869	40 %	40 %	0 %	20 %	526221302
90536	NC_021820	CGCTTC	2	12	4282884	4282895	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526221302
90537	NC_021820	CGC	2	6	4282910	4282915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221302
90538	NC_021820	TATT	2	8	4282963	4282970	25 %	75 %	0 %	0 %	526221302
90539	NC_021820	TGAG	2	8	4282994	4283001	25 %	25 %	50 %	0 %	526221302
90540	NC_021820	TAA	2	6	4283040	4283045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221302
90541	NC_021820	AT	3	6	4283150	4283155	50 %	50 %	0 %	0 %	526221302
90542	NC_021820	GTT	2	6	4283194	4283199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221302
90543	NC_021820	GCT	2	6	4283319	4283324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221302
90544	NC_021820	CTG	2	6	4283331	4283336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221302
90545	NC_021820	GC	3	6	4283337	4283342	0 %	0 %	50 %	50 %	526221302
90546	NC_021820	ATT	2	6	4283358	4283363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221302
90547	NC_021820	CTG	2	6	4283397	4283402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221302
90548	NC_021820	TGG	2	6	4283407	4283412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221302
90549	NC_021820	TAG	2	6	4283417	4283422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221302
90550	NC_021820	AATGA	2	10	4283434	4283443	60 %	20 %	20 %	0 %	526221302
90551	NC_021820	GCTC	2	8	4283495	4283502	0 %	25 %	25 %	50 %	526221302
90552	NC_021820	GAG	2	6	4283543	4283548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221302
90553	NC_021820	AAT	2	6	4283555	4283560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221302
90554	NC_021820	ATA	2	6	4283575	4283580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221302
90555	NC_021820	ATG	2	6	4283620	4283625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90556	NC_021820	AGC	2	6	4283671	4283676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221303
90557	NC_021820	TGC	2	6	4283813	4283818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221303
90558	NC_021820	GCG	2	6	4283837	4283842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221303
90559	NC_021820	ACC	2	6	4283866	4283871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221303
90560	NC_021820	TTC	2	6	4283885	4283890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221303
90561	NC_021820	GC	3	6	4283920	4283925	0 %	0 %	50 %	50 %	526221303
90562	NC_021820	TTA	2	6	4284029	4284034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221303
90563	NC_021820	CAT	2	6	4284093	4284098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221303
90564	NC_021820	TCG	2	6	4284108	4284113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221303
90565	NC_021820	TTC	2	6	4284128	4284133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221303
90566	NC_021820	GC	3	6	4284261	4284266	0 %	0 %	50 %	50 %	526221303
90567	NC_021820	GC	3	6	4284330	4284335	0 %	0 %	50 %	50 %	526221303
90568	NC_021820	TAC	2	6	4284345	4284350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221303
90569	NC_021820	CAT	2	6	4284376	4284381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221303
90570	NC_021820	CGT	2	6	4284391	4284396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221303
90571	NC_021820	A	6	6	4284526	4284531	100 %	0 %	0 %	0 %	526221303
90572	NC_021820	CTGC	2	8	4284543	4284550	0 %	25 %	25 %	50 %	526221303
90573	NC_021820	ATT	2	6	4284598	4284603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221303
90574	NC_021820	GC	3	6	4284705	4284710	0 %	0 %	50 %	50 %	526221303
90575	NC_021820	CTG	2	6	4284746	4284751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221303
90576	NC_021820	CTGT	2	8	4284801	4284808	0 %	50 %	25 %	25 %	526221303
90577	NC_021820	ATT	2	6	4284829	4284834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221303
90578	NC_021820	GCG	2	6	4284842	4284847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221303
90579	NC_021820	AGA	2	6	4284961	4284966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221304
90580	NC_021820	CCG	2	6	4284984	4284989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221304
90581	NC_021820	CTG	2	6	4285036	4285041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221304
90582	NC_021820	TAA	2	6	4285101	4285106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221304
90583	NC_021820	ACC	2	6	4285123	4285128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221304
90584	NC_021820	TTTA	2	8	4285174	4285181	25 %	75 %	0 %	0 %	526221304
90585	NC_021820	TACC	2	8	4285188	4285195	25 %	25 %	0 %	50 %	526221304
90586	NC_021820	TGC	2	6	4285290	4285295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221304
90587	NC_021820	CTT	2	6	4285333	4285338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221304
90588	NC_021820	CAT	2	6	4285351	4285356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221304
90589	NC_021820	CGC	3	9	4285381	4285389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221304
90590	NC_021820	ACC	2	6	4285409	4285414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221304
90591	NC_021820	CCA	2	6	4285425	4285430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221304
90592	NC_021820	GCG	2	6	4285439	4285444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221304
90593	NC_021820	CAA	2	6	4285455	4285460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221304
90594	NC_021820	TGC	2	6	4285461	4285466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221304
90595	NC_021820	CTG	2	6	4285582	4285587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221304
90596	NC_021820	CGC	2	6	4285606	4285611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221304
90597	NC_021820	CCA	2	6	4285629	4285634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221304
90598	NC_021820	CAGC	2	8	4285653	4285660	25 %	0 %	25 %	50 %	526221304
90599	NC_021820	AGC	2	6	4285712	4285717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221304
90600	NC_021820	GC	3	6	4285716	4285721	0 %	0 %	50 %	50 %	526221304
90601	NC_021820	TTC	2	6	4285867	4285872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221304
90602	NC_021820	GGCG	2	8	4285920	4285927	0 %	0 %	75 %	25 %	526221304
90603	NC_021820	GGC	2	6	4285975	4285980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221304
90604	NC_021820	CTT	2	6	4286103	4286108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221304
90605	NC_021820	ATTT	2	8	4286175	4286182	25 %	75 %	0 %	0 %	526221304
90606	NC_021820	T	6	6	4286197	4286202	0 %	100 %	0 %	0 %	526221304
90607	NC_021820	CCT	2	6	4286271	4286276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221304
90608	NC_021820	ATC	2	6	4286342	4286347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221304
90609	NC_021820	GCG	2	6	4286462	4286467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221304
90610	NC_021820	GGC	2	6	4286474	4286479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221304
90611	NC_021820	CCA	2	6	4286550	4286555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221304
90612	NC_021820	CCG	2	6	4286574	4286579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221304
90613	NC_021820	GCC	2	6	4286618	4286623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221304
90614	NC_021820	ATT	2	6	4286687	4286692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221305
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90734	NC_021820	CGC	2	6	4291347	4291352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221311
90735	NC_021820	TGGT	2	8	4291380	4291387	0 %	50 %	50 %	0 %	526221311
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90740	NC_021820	CAG	2	6	4291734	4291739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221311
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90841	NC_021820	ACG	2	6	4296986	4296991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221315
90842	NC_021820	A	6	6	4297056	4297061	100 %	0 %	0 %	0 %	526221315
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90847	NC_021820	CGTC	2	8	4297222	4297229	0 %	25 %	25 %	50 %	526221315
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