MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_021820	ACC	2	6	4257602	4257607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222425
90002	NC_021820	GCA	2	6	4257619	4257624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222425
90003	NC_021820	T	7	7	4257656	4257662	0 %	100 %	0 %	0 %	526222425
90004	NC_021820	AGC	2	6	4257705	4257710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222425
90005	NC_021820	CGC	2	6	4257787	4257792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222425
90006	NC_021820	TGG	3	9	4257810	4257818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222425
90007	NC_021820	GTG	2	6	4257914	4257919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222425
90008	NC_021820	GCA	2	6	4257943	4257948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222425
90009	NC_021820	TCC	2	6	4258013	4258018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222425
90010	NC_021820	GCA	2	6	4258081	4258086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222425
90011	NC_021820	CG	3	6	4258101	4258106	0 %	0 %	50 %	50 %	526222425
90012	NC_021820	GCG	2	6	4258113	4258118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222425
90013	NC_021820	GC	3	6	4258194	4258199	0 %	0 %	50 %	50 %	526222425
90014	NC_021820	GCC	2	6	4258226	4258231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222425
90015	NC_021820	CAG	2	6	4258247	4258252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222425
90016	NC_021820	GCG	2	6	4258292	4258297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90017	NC_021820	TGGC	2	8	4258354	4258361	0 %	25 %	50 %	25 %	526222426
90018	NC_021820	AAG	2	6	4258367	4258372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222426
90019	NC_021820	CGG	2	6	4258403	4258408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90020	NC_021820	GATC	2	8	4258446	4258453	25 %	25 %	25 %	25 %	526222426
90021	NC_021820	CGG	2	6	4258467	4258472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90022	NC_021820	ACG	2	6	4258508	4258513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222426
90023	NC_021820	GCG	2	6	4258523	4258528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90024	NC_021820	TC	3	6	4258542	4258547	0 %	50 %	0 %	50 %	526222426
90025	NC_021820	GAA	2	6	4258564	4258569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222426
90026	NC_021820	GGC	2	6	4258611	4258616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90027	NC_021820	CG	3	6	4258620	4258625	0 %	0 %	50 %	50 %	526222426
90028	NC_021820	GCGCG	2	10	4258671	4258680	0 %	0 %	60 %	40 %	526222426
90029	NC_021820	ATT	2	6	4258689	4258694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526222426
90030	NC_021820	CCG	2	6	4258724	4258729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222426
90031	NC_021820	GC	3	6	4258742	4258747	0 %	0 %	50 %	50 %	526222426
90032	NC_021820	GCGA	2	8	4258852	4258859	25 %	0 %	50 %	25 %	526222426
90033	NC_021820	CGC	2	6	4258874	4258879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222426
90034	NC_021820	CG	3	6	4258931	4258936	0 %	0 %	50 %	50 %	526222426
90035	NC_021820	GCG	3	9	4258934	4258942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90036	NC_021820	GCG	2	6	4258966	4258971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90037	NC_021820	GCG	2	6	4259030	4259035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90038	NC_021820	GGC	2	6	4259127	4259132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90039	NC_021820	CG	3	6	4259137	4259142	0 %	0 %	50 %	50 %	526222426
90040	NC_021820	GCG	2	6	4259161	4259166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222426
90041	NC_021820	AGC	2	6	4259273	4259278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222426
90042	NC_021820	GT	3	6	4259382	4259387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90043	NC_021820	GCA	2	6	4259558	4259563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90044	NC_021820	CGG	2	6	4259888	4259893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221283
90045	NC_021820	TGT	2	6	4260028	4260033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221283
90046	NC_021820	TGA	2	6	4260101	4260106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221283
90047	NC_021820	CAC	2	6	4260135	4260140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221283
90048	NC_021820	CCAC	2	8	4260208	4260215	25 %	0 %	0 %	75 %	526221283
90049	NC_021820	TGA	2	6	4260221	4260226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221283
90050	NC_021820	CAT	2	6	4260228	4260233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221283
90051	NC_021820	CGA	2	6	4260257	4260262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90052	NC_021820	TGC	2	6	4260304	4260309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90053	NC_021820	AACG	2	8	4260321	4260328	50 %	0 %	25 %	25 %	526221283
90054	NC_021820	CTG	2	6	4260396	4260401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90055	NC_021820	GAA	2	6	4260453	4260458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221283
90056	NC_021820	ACC	2	6	4260468	4260473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221283
90057	NC_021820	GCT	2	6	4260485	4260490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90058	NC_021820	CGA	2	6	4260575	4260580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221283
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90060	NC_021820	ATC	2	6	4260633	4260638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221283
90061	NC_021820	AGCGA	2	10	4260645	4260654	40 %	0 %	40 %	20 %	526221283
90062	NC_021820	TGG	2	6	4260682	4260687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221283
90063	NC_021820	CGG	2	6	4260817	4260822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221283
90064	NC_021820	GCT	2	6	4260824	4260829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90065	NC_021820	GCGCG	2	10	4260854	4260863	0 %	0 %	60 %	40 %	526221283
90066	NC_021820	GC	3	6	4260877	4260882	0 %	0 %	50 %	50 %	526221283
90067	NC_021820	GCT	2	6	4260968	4260973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90068	NC_021820	GCA	2	6	4261009	4261014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90069	NC_021820	CGC	2	6	4261046	4261051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221283
90070	NC_021820	A	7	7	4261068	4261074	100 %	0 %	0 %	0 %	526221283
90071	NC_021820	CTA	2	6	4261106	4261111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221283
90072	NC_021820	TCC	2	6	4261139	4261144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221283
90073	NC_021820	ACT	2	6	4261172	4261177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221283
90074	NC_021820	CGCC	2	8	4261202	4261209	0 %	0 %	25 %	75 %	526221283
90075	NC_021820	CCG	2	6	4261237	4261242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221283
90076	NC_021820	AGC	2	6	4261260	4261265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90077	NC_021820	GTC	2	6	4261302	4261307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90078	NC_021820	GC	3	6	4261310	4261315	0 %	0 %	50 %	50 %	526221283
90079	NC_021820	TGC	2	6	4261318	4261323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90080	NC_021820	CG	3	6	4261327	4261332	0 %	0 %	50 %	50 %	526221283
90081	NC_021820	CCG	2	6	4261366	4261371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221283
90082	NC_021820	AAG	2	6	4261411	4261416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221283
90083	NC_021820	TTA	2	6	4261435	4261440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221283
90084	NC_021820	GGCGC	2	10	4261485	4261494	0 %	0 %	60 %	40 %	526221283
90085	NC_021820	ACC	2	6	4261515	4261520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221283
90086	NC_021820	CTG	2	6	4261521	4261526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221283
90087	NC_021820	GAT	2	6	4261600	4261605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90088	NC_021820	GC	3	6	4261606	4261611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90089	NC_021820	CTT	2	6	4261636	4261641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221284
90090	NC_021820	TCG	2	6	4261682	4261687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221284
90091	NC_021820	CAGGA	2	10	4261705	4261714	40 %	0 %	40 %	20 %	526221284
90092	NC_021820	GCC	2	6	4261716	4261721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221284
90093	NC_021820	CGT	2	6	4261872	4261877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221284
90094	NC_021820	T	7	7	4261932	4261938	0 %	100 %	0 %	0 %	526221284
90095	NC_021820	CT	3	6	4261982	4261987	0 %	50 %	0 %	50 %	526221284
90096	NC_021820	TATT	2	8	4262003	4262010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90097	NC_021820	ATT	2	6	4262070	4262075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90098	NC_021820	TA	3	6	4262098	4262103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90099	NC_021820	GAT	2	6	4262124	4262129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90100	NC_021820	TTG	2	6	4262142	4262147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90101	NC_021820	CAC	2	6	4262257	4262262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221285
90102	NC_021820	GGCG	2	8	4262296	4262303	0 %	0 %	75 %	25 %	526221285
90103	NC_021820	GTC	3	9	4262474	4262482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221285
90104	NC_021820	A	6	6	4262703	4262708	100 %	0 %	0 %	0 %	526221285
90105	NC_021820	CCG	2	6	4262712	4262717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221285
90106	NC_021820	TGGT	2	8	4262726	4262733	0 %	50 %	50 %	0 %	526221285
90107	NC_021820	GC	3	6	4262762	4262767	0 %	0 %	50 %	50 %	526221285
90108	NC_021820	TGAT	2	8	4262844	4262851	25 %	50 %	25 %	0 %	526221285
90109	NC_021820	CG	3	6	4262923	4262928	0 %	0 %	50 %	50 %	526221285
90110	NC_021820	GC	3	6	4262937	4262942	0 %	0 %	50 %	50 %	526221285
90111	NC_021820	GGC	2	6	4262948	4262953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221285
90112	NC_021820	CTG	2	6	4263011	4263016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221285
90113	NC_021820	ACG	2	6	4263051	4263056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221285
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90115	NC_021820	CAA	2	6	4263068	4263073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221285
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90117	NC_021820	CAGT	2	8	4263274	4263281	25 %	25 %	25 %	25 %	526222427
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90478	NC_021820	TAC	2	6	4280200	4280205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221300
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