MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
89001	NC_021820	ACG	2	6	4209468	4209473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221242
89002	NC_021820	CCGTA	2	10	4209565	4209574	20 %	20 %	20 %	40 %	526221242
89003	NC_021820	CGG	2	6	4209597	4209602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221242
89004	NC_021820	GCC	2	6	4209641	4209646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221242
89005	NC_021820	GCC	2	6	4209653	4209658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221242
89006	NC_021820	GCG	2	6	4209858	4209863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221242
89007	NC_021820	GAC	2	6	4209887	4209892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221242
89008	NC_021820	CGA	2	6	4209979	4209984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221242
89009	NC_021820	GCC	2	6	4210027	4210032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221242
89010	NC_021820	GT	3	6	4210125	4210130	0 %	50 %	50 %	0 %	526221242
89011	NC_021820	A	6	6	4210200	4210205	100 %	0 %	0 %	0 %	526221242
89012	NC_021820	CAA	2	6	4210297	4210302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221242
89013	NC_021820	GC	3	6	4210404	4210409	0 %	0 %	50 %	50 %	526221242
89014	NC_021820	GAC	2	6	4210470	4210475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221243
89015	NC_021820	GCC	2	6	4210572	4210577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221243
89016	NC_021820	CAG	2	6	4210581	4210586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221243
89017	NC_021820	GCT	2	6	4210616	4210621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221243
89018	NC_021820	GC	3	6	4210645	4210650	0 %	0 %	50 %	50 %	526221243
89019	NC_021820	CGT	2	6	4210651	4210656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221243
89020	NC_021820	CGC	2	6	4210675	4210680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221243
89021	NC_021820	GCC	2	6	4210782	4210787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221243
89022	NC_021820	GAA	2	6	4210800	4210805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221243
89023	NC_021820	ATT	2	6	4210833	4210838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221243
89024	NC_021820	TTA	2	6	4211012	4211017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221243
89025	NC_021820	TTG	2	6	4211097	4211102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221243
89026	NC_021820	ACG	2	6	4211167	4211172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221243
89027	NC_021820	CTT	2	6	4211180	4211185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221243
89028	NC_021820	CCG	2	6	4211238	4211243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221243
89029	NC_021820	CGA	2	6	4211294	4211299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221243
89030	NC_021820	CGAAGA	2	12	4211360	4211371	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	526221243
89031	NC_021820	ACA	2	6	4211463	4211468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89032	NC_021820	ATT	2	6	4211493	4211498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89033	NC_021820	GTT	2	6	4211535	4211540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89034	NC_021820	A	6	6	4211543	4211548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89035	NC_021820	TCC	2	6	4211556	4211561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89036	NC_021820	AATTA	2	10	4211744	4211753	60 %	40 %	0 %	0 %	526221244
89037	NC_021820	GAA	2	6	4211759	4211764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221244
89038	NC_021820	AT	3	6	4211807	4211812	50 %	50 %	0 %	0 %	526221244
89039	NC_021820	A	6	6	4211845	4211850	100 %	0 %	0 %	0 %	526221244
89040	NC_021820	GAA	2	6	4211892	4211897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221244
89041	NC_021820	TCA	2	6	4211911	4211916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221244
89042	NC_021820	ACCC	2	8	4211975	4211982	25 %	0 %	0 %	75 %	526221244
89043	NC_021820	ATA	2	6	4212112	4212117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221244
89044	NC_021820	CG	3	6	4212267	4212272	0 %	0 %	50 %	50 %	526221244
89045	NC_021820	TTA	2	6	4212294	4212299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221244
89046	NC_021820	TGA	2	6	4212413	4212418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221244
89047	NC_021820	AAT	2	6	4212498	4212503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221244
89048	NC_021820	TTC	2	6	4212528	4212533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221244
89049	NC_021820	CGTGG	2	10	4212534	4212543	0 %	20 %	60 %	20 %	526221244
89050	NC_021820	ATT	2	6	4212641	4212646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221244
89051	NC_021820	CGT	2	6	4212704	4212709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221244
89052	NC_021820	GCG	2	6	4212759	4212764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221244
89053	NC_021820	CGA	2	6	4212770	4212775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221244
89054	NC_021820	CT	3	6	4212816	4212821	0 %	50 %	0 %	50 %	526221244
89055	NC_021820	GAA	2	6	4212861	4212866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221244
89056	NC_021820	ATT	2	6	4212882	4212887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221244
89057	NC_021820	G	6	6	4212923	4212928	0 %	0 %	100 %	0 %	526221244
89058	NC_021820	TAC	2	6	4212978	4212983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221245
89059	NC_021820	ACGG	2	8	4213027	4213034	25 %	0 %	50 %	25 %	526221245
89060	NC_021820	GC	3	6	4213058	4213063	0 %	0 %	50 %	50 %	526221245
89061	NC_021820	TCT	2	6	4213089	4213094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221245
89062	NC_021820	GTC	2	6	4213156	4213161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221245
89063	NC_021820	CTG	3	9	4213231	4213239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221245
89064	NC_021820	GCCC	2	8	4213245	4213252	0 %	0 %	25 %	75 %	526221245
89065	NC_021820	ATT	2	6	4213261	4213266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221245
89066	NC_021820	GAT	2	6	4213368	4213373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221245
89067	NC_021820	TGT	2	6	4213400	4213405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221245
89068	NC_021820	CGT	2	6	4213410	4213415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221245
89069	NC_021820	CTGG	2	8	4213437	4213444	0 %	25 %	50 %	25 %	526221245
89070	NC_021820	CG	3	6	4213454	4213459	0 %	0 %	50 %	50 %	526221245
89071	NC_021820	GCT	2	6	4213479	4213484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221245
89072	NC_021820	GATGC	2	10	4213486	4213495	20 %	20 %	40 %	20 %	526221245
89073	NC_021820	GTG	3	9	4213564	4213572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221245
89074	NC_021820	ATT	2	6	4213576	4213581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221245
89075	NC_021820	CCG	2	6	4213591	4213596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221245
89076	NC_021820	TGCC	2	8	4213631	4213638	0 %	25 %	25 %	50 %	526221245
89077	NC_021820	TGT	2	6	4213685	4213690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221245
89078	NC_021820	CCA	2	6	4213718	4213723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221245
89079	NC_021820	CT	3	6	4213757	4213762	0 %	50 %	0 %	50 %	526221245
89080	NC_021820	GTC	2	6	4213768	4213773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221245
89081	NC_021820	GAT	2	6	4213782	4213787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221245
89082	NC_021820	CGG	2	6	4213794	4213799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221245
89083	NC_021820	TAC	2	6	4213814	4213819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221245
89084	NC_021820	GTC	2	6	4213829	4213834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221245
89085	NC_021820	CGG	2	6	4213857	4213862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221245
89086	NC_021820	CAT	2	6	4213884	4213889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221245
89087	NC_021820	ACC	2	6	4213954	4213959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221245
89088	NC_021820	AAC	2	6	4214061	4214066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89089	NC_021820	CCTG	2	8	4214136	4214143	0 %	25 %	25 %	50 %	526221246
89090	NC_021820	CCG	2	6	4214312	4214317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221246
89091	NC_021820	ATG	2	6	4214336	4214341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221246
89092	NC_021820	GCA	2	6	4214353	4214358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221246
89093	NC_021820	ACA	2	6	4214366	4214371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221246
89094	NC_021820	A	7	7	4214428	4214434	100 %	0 %	0 %	0 %	526221246
89095	NC_021820	CCG	2	6	4214435	4214440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221246
89096	NC_021820	ACA	2	6	4214447	4214452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221246
89097	NC_021820	ATG	2	6	4214527	4214532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221246
89098	NC_021820	GCT	2	6	4214534	4214539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221246
89099	NC_021820	GGGCTG	2	12	4214544	4214555	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	526221246
89100	NC_021820	AATC	2	8	4214565	4214572	50 %	25 %	0 %	25 %	526221246
89101	NC_021820	A	6	6	4214597	4214602	100 %	0 %	0 %	0 %	526221246
89102	NC_021820	GCG	2	6	4214629	4214634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221246
89103	NC_021820	ATG	2	6	4214635	4214640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221246
89104	NC_021820	AAG	2	6	4214663	4214668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221246
89105	NC_021820	GTC	2	6	4214737	4214742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221246
89106	NC_021820	TCC	2	6	4214761	4214766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221246
89107	NC_021820	CGG	3	9	4214879	4214887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221246
89108	NC_021820	CAT	2	6	4214901	4214906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221246
89109	NC_021820	ATG	2	6	4214944	4214949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221246
89110	NC_021820	CAG	3	9	4215013	4215021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221246
89111	NC_021820	AAG	2	6	4215038	4215043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221246
89112	NC_021820	T	6	6	4215069	4215074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89113	NC_021820	TC	3	6	4215121	4215126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89114	NC_021820	TCA	2	6	4215142	4215147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89115	NC_021820	TCA	2	6	4215167	4215172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89116	NC_021820	AAT	2	6	4215200	4215205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89117	NC_021820	ACT	2	6	4215307	4215312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221247
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89228	NC_021820	CAA	2	6	4220336	4220341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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89355	NC_021820	GCG	2	6	4227136	4227141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89356	NC_021820	AACG	2	8	4227144	4227151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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89456	NC_021820	A	7	7	4232489	4232495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89457	NC_021820	CA	3	6	4232503	4232508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89458	NC_021820	AAAC	2	8	4232519	4232526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89459	NC_021820	AT	3	6	4232589	4232594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89473	NC_021820	CG	3	6	4233236	4233241	0 %	0 %	50 %	50 %	526221260
89474	NC_021820	GAT	2	6	4233372	4233377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221260
89475	NC_021820	GAT	2	6	4233384	4233389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221260
89476	NC_021820	CGG	2	6	4233393	4233398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221260
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89491	NC_021820	GA	3	6	4234087	4234092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89492	NC_021820	TTC	2	6	4234184	4234189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221261
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