MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
87501	NC_021820	CGCTC	2	10	4137990	4137999	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87502	NC_021820	GCC	2	6	4138009	4138014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87503	NC_021820	AT	3	6	4138089	4138094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87504	NC_021820	GGC	2	6	4138114	4138119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221200
87505	NC_021820	ATC	2	6	4138120	4138125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221200
87506	NC_021820	CAT	2	6	4138140	4138145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221200
87507	NC_021820	CTT	2	6	4138161	4138166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221200
87508	NC_021820	TCT	2	6	4138169	4138174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221200
87509	NC_021820	TCA	2	6	4138175	4138180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221200
87510	NC_021820	GTC	2	6	4138191	4138196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87511	NC_021820	CCTGCA	2	12	4138223	4138234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526221200
87512	NC_021820	ACG	2	6	4138254	4138259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87513	NC_021820	TGA	2	6	4138274	4138279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221200
87514	NC_021820	CG	3	6	4138290	4138295	0 %	0 %	50 %	50 %	526221200
87515	NC_021820	TGA	2	6	4138316	4138321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221200
87516	NC_021820	CATC	2	8	4138349	4138356	25 %	25 %	0 %	50 %	526221200
87517	NC_021820	TTC	2	6	4138483	4138488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221200
87518	NC_021820	AG	3	6	4138674	4138679	50 %	0 %	50 %	0 %	526221200
87519	NC_021820	CGC	2	6	4138680	4138685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221200
87520	NC_021820	CAC	2	6	4138719	4138724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221200
87521	NC_021820	CGC	2	6	4138767	4138772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221200
87522	NC_021820	CATCG	2	10	4138785	4138794	20 %	20 %	20 %	40 %	526221200
87523	NC_021820	CAT	2	6	4138851	4138856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221200
87524	NC_021820	GAC	2	6	4138874	4138879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87525	NC_021820	CGG	2	6	4138880	4138885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221200
87526	NC_021820	CCA	2	6	4138889	4138894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221200
87527	NC_021820	GCA	2	6	4138895	4138900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87528	NC_021820	CGT	2	6	4138901	4138906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87529	NC_021820	GCTTC	2	10	4138916	4138925	0 %	40 %	20 %	40 %	526221200
87530	NC_021820	GCG	2	6	4138933	4138938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221200
87531	NC_021820	GAA	2	6	4138977	4138982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221200
87532	NC_021820	CAGC	2	8	4139000	4139007	25 %	0 %	25 %	50 %	526221200
87533	NC_021820	CGC	2	6	4139025	4139030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221200
87534	NC_021820	GAC	2	6	4139052	4139057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87535	NC_021820	TCT	2	6	4139066	4139071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221200
87536	NC_021820	TGG	2	6	4139111	4139116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221200
87537	NC_021820	TAC	2	6	4139148	4139153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221200
87538	NC_021820	GGC	2	6	4139158	4139163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221200
87539	NC_021820	CGC	2	6	4139202	4139207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221200
87540	NC_021820	TGA	2	6	4139300	4139305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221200
87541	NC_021820	CAG	2	6	4139340	4139345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221200
87542	NC_021820	TC	3	6	4139459	4139464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87543	NC_021820	CGC	2	6	4139487	4139492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87544	NC_021820	TGT	2	6	4139541	4139546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87545	NC_021820	A	7	7	4139695	4139701	100 %	0 %	0 %	0 %	526221201
87546	NC_021820	GGC	2	6	4139710	4139715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221201
87547	NC_021820	TTCT	2	8	4139725	4139732	0 %	75 %	0 %	25 %	526221201
87548	NC_021820	CGG	2	6	4139786	4139791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221201
87549	NC_021820	CTG	2	6	4139814	4139819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221201
87550	NC_021820	TGA	2	6	4139842	4139847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221201
87551	NC_021820	TGA	2	6	4139857	4139862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221201
87552	NC_021820	GTCGC	2	10	4139868	4139877	0 %	20 %	40 %	40 %	526221201
87553	NC_021820	GGCT	2	8	4139886	4139893	0 %	25 %	50 %	25 %	526221201
87554	NC_021820	AT	3	6	4139960	4139965	50 %	50 %	0 %	0 %	526221201
87555	NC_021820	ATG	2	6	4139991	4139996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221201
87556	NC_021820	CGC	2	6	4140041	4140046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221201
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87559	NC_021820	TGA	2	6	4140127	4140132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221201
87560	NC_021820	CGT	2	6	4140170	4140175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221201
87561	NC_021820	CTG	2	6	4140177	4140182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221201
87562	NC_021820	CT	3	6	4140255	4140260	0 %	50 %	0 %	50 %	526221201
87563	NC_021820	CTG	2	6	4140288	4140293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221201
87564	NC_021820	CGG	2	6	4140324	4140329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221201
87565	NC_021820	TAAGC	2	10	4140406	4140415	40 %	20 %	20 %	20 %	526221201
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87567	NC_021820	ATC	2	6	4140472	4140477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87568	NC_021820	TGG	2	6	4140479	4140484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87569	NC_021820	ATG	2	6	4140520	4140525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221202
87570	NC_021820	ACCGTT	2	12	4140533	4140544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526221202
87571	NC_021820	ATT	2	6	4140594	4140599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221202
87572	NC_021820	CGC	2	6	4140780	4140785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221202
87573	NC_021820	CAG	2	6	4140813	4140818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221202
87574	NC_021820	CTG	2	6	4140823	4140828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
87575	NC_021820	TGA	2	6	4140845	4140850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221202
87576	NC_021820	CTG	2	6	4140886	4140891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
87577	NC_021820	TC	3	6	4140986	4140991	0 %	50 %	0 %	50 %	526221202
87578	NC_021820	TGC	2	6	4141007	4141012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
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87581	NC_021820	CGC	2	6	4141130	4141135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221202
87582	NC_021820	TGC	2	6	4141184	4141189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
87583	NC_021820	GCGT	2	8	4141190	4141197	0 %	25 %	50 %	25 %	526221202
87584	NC_021820	A	6	6	4141222	4141227	100 %	0 %	0 %	0 %	526221202
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87586	NC_021820	GC	3	6	4141251	4141256	0 %	0 %	50 %	50 %	526221202
87587	NC_021820	CGC	2	6	4141289	4141294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221202
87588	NC_021820	AAAG	2	8	4141329	4141336	75 %	0 %	25 %	0 %	526221202
87589	NC_021820	GTC	2	6	4141345	4141350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
87590	NC_021820	GAG	2	6	4141399	4141404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221202
87591	NC_021820	CAC	2	6	4141419	4141424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221202
87592	NC_021820	CGC	2	6	4141457	4141462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221202
87593	NC_021820	ACG	2	6	4141466	4141471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221202
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87596	NC_021820	GGA	2	6	4141584	4141589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221202
87597	NC_021820	CG	3	6	4141607	4141612	0 %	0 %	50 %	50 %	526221202
87598	NC_021820	T	6	6	4141744	4141749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87599	NC_021820	AAT	2	6	4141800	4141805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87600	NC_021820	AGA	2	6	4141845	4141850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222406
87601	NC_021820	GAC	2	6	4141882	4141887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222406
87602	NC_021820	CGT	2	6	4141893	4141898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222406
87603	NC_021820	T	7	7	4141907	4141913	0 %	100 %	0 %	0 %	526222406
87604	NC_021820	CA	3	6	4141916	4141921	50 %	0 %	0 %	50 %	526222406
87605	NC_021820	TC	3	6	4141946	4141951	0 %	50 %	0 %	50 %	526222406
87606	NC_021820	TGAAGA	2	12	4142118	4142129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526222406
87607	NC_021820	A	6	6	4142175	4142180	100 %	0 %	0 %	0 %	526222406
87608	NC_021820	TCT	2	6	4142208	4142213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222406
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87610	NC_021820	A	7	7	4142389	4142395	100 %	0 %	0 %	0 %	526222406
87611	NC_021820	T	6	6	4142433	4142438	0 %	100 %	0 %	0 %	526222406
87612	NC_021820	A	7	7	4142444	4142450	100 %	0 %	0 %	0 %	526222406
87613	NC_021820	CTTCGC	2	12	4142483	4142494	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526221203
87614	NC_021820	CGC	2	6	4142507	4142512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221203
87615	NC_021820	ATA	2	6	4142550	4142555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221203
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87854	NC_021820	CGC	2	6	4154813	4154818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
87855	NC_021820	CGC	2	6	4154822	4154827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
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87860	NC_021820	CGA	2	6	4155002	4155007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222408
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87960	NC_021820	CTG	2	6	4159747	4159752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
87961	NC_021820	GGC	2	6	4159770	4159775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
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87964	NC_021820	A	6	6	4159949	4159954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87965	NC_021820	ACG	2	6	4159967	4159972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87966	NC_021820	CAA	2	6	4159980	4159985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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