MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
87001	NC_021820	ATG	2	6	4114209	4114214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222402
87002	NC_021820	ATT	2	6	4114230	4114235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221171
87003	NC_021820	TGA	2	6	4114266	4114271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221171
87004	NC_021820	CCTGT	2	10	4114306	4114315	0 %	40 %	20 %	40 %	526221171
87005	NC_021820	GCG	2	6	4114317	4114322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221171
87006	NC_021820	GCC	2	6	4114393	4114398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221171
87007	NC_021820	CATC	2	8	4114425	4114432	25 %	25 %	0 %	50 %	526221171
87008	NC_021820	T	6	6	4114450	4114455	0 %	100 %	0 %	0 %	526221171
87009	NC_021820	A	6	6	4114462	4114467	100 %	0 %	0 %	0 %	526221171
87010	NC_021820	GTCA	2	8	4114624	4114631	25 %	25 %	25 %	25 %	526221171
87011	NC_021820	ATG	2	6	4114637	4114642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221171
87012	NC_021820	TGCG	2	8	4114648	4114655	0 %	25 %	50 %	25 %	526221171
87013	NC_021820	GCG	2	6	4114675	4114680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221171
87014	NC_021820	ATTC	2	8	4114695	4114702	25 %	50 %	0 %	25 %	526221171
87015	NC_021820	GC	3	6	4114719	4114724	0 %	0 %	50 %	50 %	526221171
87016	NC_021820	CAGG	2	8	4114734	4114741	25 %	0 %	50 %	25 %	526221171
87017	NC_021820	CAG	2	6	4114771	4114776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221171
87018	NC_021820	CAG	2	6	4114882	4114887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221171
87019	NC_021820	GCT	2	6	4114917	4114922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221171
87020	NC_021820	CGG	2	6	4115095	4115100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221171
87021	NC_021820	ACCGGC	2	12	4115162	4115173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526221171
87022	NC_021820	T	6	6	4115196	4115201	0 %	100 %	0 %	0 %	526221171
87023	NC_021820	GCTTGC	2	12	4115238	4115249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221171
87024	NC_021820	TGC	2	6	4115253	4115258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221171
87025	NC_021820	ATC	2	6	4115313	4115318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222403
87026	NC_021820	TGC	2	6	4115376	4115381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222403
87027	NC_021820	TGAC	2	8	4115390	4115397	25 %	25 %	25 %	25 %	526222403
87028	NC_021820	GTCG	2	8	4115452	4115459	0 %	25 %	50 %	25 %	526222403
87029	NC_021820	CGC	2	6	4115559	4115564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222403
87030	NC_021820	TCA	2	6	4115605	4115610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222403
87031	NC_021820	CCAG	2	8	4115623	4115630	25 %	0 %	25 %	50 %	526222403
87032	NC_021820	CG	3	6	4115759	4115764	0 %	0 %	50 %	50 %	526222403
87033	NC_021820	AGC	2	6	4115842	4115847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222403
87034	NC_021820	TGC	2	6	4115876	4115881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222403
87035	NC_021820	TGG	2	6	4116070	4116075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221172
87036	NC_021820	TGGC	2	8	4116093	4116100	0 %	25 %	50 %	25 %	526221172
87037	NC_021820	GCT	2	6	4116140	4116145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87038	NC_021820	CGT	2	6	4116199	4116204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87039	NC_021820	GCC	2	6	4116288	4116293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221172
87040	NC_021820	ACCGAG	2	12	4116323	4116334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87041	NC_021820	CTGC	2	8	4116397	4116404	0 %	25 %	25 %	50 %	526221172
87042	NC_021820	ACC	2	6	4116465	4116470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221172
87043	NC_021820	GGC	2	6	4116471	4116476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221172
87044	NC_021820	ATGG	2	8	4116550	4116557	25 %	25 %	50 %	0 %	526221172
87045	NC_021820	TCC	2	6	4116576	4116581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221172
87046	NC_021820	CTC	2	6	4116617	4116622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221172
87047	NC_021820	TCG	2	6	4116645	4116650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87048	NC_021820	TCA	2	6	4116684	4116689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221172
87049	NC_021820	GGTCGA	2	12	4116709	4116720	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526221172
87050	NC_021820	GCC	2	6	4116766	4116771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221172
87051	NC_021820	AAG	2	6	4116788	4116793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221172
87052	NC_021820	GC	3	6	4116805	4116810	0 %	0 %	50 %	50 %	526221172
87053	NC_021820	GC	3	6	4116849	4116854	0 %	0 %	50 %	50 %	526221172
87054	NC_021820	CCAGA	2	10	4116873	4116882	40 %	0 %	20 %	40 %	526221172
87055	NC_021820	GTT	2	6	4117079	4117084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221172
87056	NC_021820	GC	4	8	4117213	4117220	0 %	0 %	50 %	50 %	526221172
87057	NC_021820	GAA	2	6	4117340	4117345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221172
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87059	NC_021820	CG	3	6	4117477	4117482	0 %	0 %	50 %	50 %	526221172
87060	NC_021820	GCC	2	6	4117498	4117503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221172
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87062	NC_021820	GCT	2	6	4117580	4117585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87063	NC_021820	GCT	2	6	4117627	4117632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87064	NC_021820	GCA	2	6	4117663	4117668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87065	NC_021820	AGC	2	6	4117707	4117712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87066	NC_021820	GTC	2	6	4117720	4117725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221172
87067	NC_021820	CAA	2	6	4117736	4117741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221172
87068	NC_021820	TGT	2	6	4117832	4117837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87069	NC_021820	CGT	2	6	4117855	4117860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87070	NC_021820	A	7	7	4117936	4117942	100 %	0 %	0 %	0 %	526221173
87071	NC_021820	CG	3	6	4118040	4118045	0 %	0 %	50 %	50 %	526221173
87072	NC_021820	GAC	2	6	4118147	4118152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221173
87073	NC_021820	GTT	2	6	4118179	4118184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221173
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87075	NC_021820	TGA	2	6	4118314	4118319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221173
87076	NC_021820	GCTG	2	8	4118425	4118432	0 %	25 %	50 %	25 %	526221173
87077	NC_021820	CGA	2	6	4118518	4118523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221173
87078	NC_021820	GC	3	6	4118525	4118530	0 %	0 %	50 %	50 %	526221173
87079	NC_021820	ATG	2	6	4118535	4118540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221173
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87083	NC_021820	CCAG	2	8	4118670	4118677	25 %	0 %	25 %	50 %	526221173
87084	NC_021820	ACC	2	6	4118696	4118701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221173
87085	NC_021820	CAGC	2	8	4118722	4118729	25 %	0 %	25 %	50 %	526221173
87086	NC_021820	GCG	2	6	4118748	4118753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221173
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87088	NC_021820	GCT	2	6	4118767	4118772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221173
87089	NC_021820	CTG	2	6	4118779	4118784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221173
87090	NC_021820	GGC	2	6	4118807	4118812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87091	NC_021820	CCCG	2	8	4118816	4118823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87092	NC_021820	GCTGA	2	10	4118910	4118919	20 %	20 %	40 %	20 %	526221174
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87095	NC_021820	CCGT	2	8	4118964	4118971	0 %	25 %	25 %	50 %	526221174
87096	NC_021820	TGA	2	6	4118983	4118988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221174
87097	NC_021820	CGAC	2	8	4119097	4119104	25 %	0 %	25 %	50 %	526221174
87098	NC_021820	GAT	2	6	4119114	4119119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221174
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87100	NC_021820	CAA	2	6	4119155	4119160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221174
87101	NC_021820	TCA	2	6	4119286	4119291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221174
87102	NC_021820	ACC	2	6	4119309	4119314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221174
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87104	NC_021820	TGC	2	6	4119349	4119354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221174
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87106	NC_021820	TGA	2	6	4119409	4119414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221174
87107	NC_021820	GTCG	2	8	4119462	4119469	0 %	25 %	50 %	25 %	526221174
87108	NC_021820	GATG	2	8	4119503	4119510	25 %	25 %	50 %	0 %	526221174
87109	NC_021820	CAA	2	6	4119515	4119520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221174
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87113	NC_021820	CT	3	6	4119741	4119746	0 %	50 %	0 %	50 %	526221174
87114	NC_021820	CCG	2	6	4119770	4119775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221174
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87116	NC_021820	A	6	6	4119795	4119800	100 %	0 %	0 %	0 %	526221174
87117	NC_021820	GCC	2	6	4119855	4119860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221174
87118	NC_021820	CTG	2	6	4119867	4119872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221174
87119	NC_021820	GCA	2	6	4119906	4119911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221174
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87121	NC_021820	A	6	6	4120067	4120072	100 %	0 %	0 %	0 %	526221175
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87123	NC_021820	GCTG	2	8	4120148	4120155	0 %	25 %	50 %	25 %	526221175
87124	NC_021820	TGA	2	6	4120183	4120188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221175
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87132	NC_021820	GC	3	6	4120499	4120504	0 %	0 %	50 %	50 %	526221175
87133	NC_021820	GGC	2	6	4120580	4120585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221175
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87136	NC_021820	GCA	2	6	4120635	4120640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221175
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87143	NC_021820	GTG	2	6	4120827	4120832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221176
87144	NC_021820	GC	3	6	4120944	4120949	0 %	0 %	50 %	50 %	526221176
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87152	NC_021820	TGA	2	6	4121280	4121285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221176
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87208	NC_021820	TG	3	6	4123701	4123706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87209	NC_021820	CG	3	6	4123722	4123727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87210	NC_021820	CCAGA	2	10	4123741	4123750	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87211	NC_021820	CG	4	8	4123794	4123801	0 %	0 %	50 %	50 %	526221183
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87218	NC_021820	TGG	2	6	4123980	4123985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221183
87219	NC_021820	TGC	2	6	4124006	4124011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221183
87220	NC_021820	T	6	6	4124018	4124023	0 %	100 %	0 %	0 %	526221183
87221	NC_021820	CGA	2	6	4124025	4124030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221183
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87229	NC_021820	TGA	2	6	4124346	4124351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221183
87230	NC_021820	CACGGT	2	12	4124353	4124364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526221183
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87232	NC_021820	CTG	2	6	4124490	4124495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221184
87233	NC_021820	CGT	2	6	4124520	4124525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221184
87234	NC_021820	GCTC	2	8	4124533	4124540	0 %	25 %	25 %	50 %	526221184
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87349	NC_021820	GGC	2	6	4130914	4130919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221190
87350	NC_021820	TGC	2	6	4130955	4130960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221190
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87353	NC_021820	T	6	6	4131049	4131054	0 %	100 %	0 %	0 %	526221190
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87366	NC_021820	ACA	2	6	4131665	4131670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221192
87367	NC_021820	GC	3	6	4131701	4131706	0 %	0 %	50 %	50 %	526221192
87368	NC_021820	GCA	2	6	4131715	4131720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
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87376	NC_021820	GGC	2	6	4132042	4132047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
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87378	NC_021820	GCT	2	6	4132103	4132108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
87379	NC_021820	CTG	2	6	4132109	4132114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
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87381	NC_021820	CCG	3	9	4132197	4132205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221192
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87399	NC_021820	GGC	2	6	4132877	4132882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
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87415	NC_021820	ATG	2	6	4133648	4133653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221192
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87434	NC_021820	GC	3	6	4134922	4134927	0 %	0 %	50 %	50 %	526221194
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87437	NC_021820	GC	3	6	4134989	4134994	0 %	0 %	50 %	50 %	526221194
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87444	NC_021820	ATG	2	6	4135403	4135408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221195
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87450	NC_021820	GCC	2	6	4135671	4135676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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87452	NC_021820	A	6	6	4135697	4135702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87453	NC_021820	ACA	2	6	4135733	4135738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87454	NC_021820	GTA	2	6	4135817	4135822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221196
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