MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021820	GA	3	6	351177	351182	50 %	0 %	50 %	0 %	526218290
7502	NC_021820	GGTGC	2	10	351219	351228	0 %	20 %	60 %	20 %	526218290
7503	NC_021820	GCC	2	6	351233	351238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218290
7504	NC_021820	CTGGC	2	10	351292	351301	0 %	20 %	40 %	40 %	526218290
7505	NC_021820	TTG	2	6	351371	351376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218290
7506	NC_021820	CGT	2	6	351381	351386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218290
7507	NC_021820	CTG	2	6	351415	351420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218290
7508	NC_021820	TGC	3	9	351555	351563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218290
7509	NC_021820	GAG	2	6	351576	351581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218290
7510	NC_021820	GCG	2	6	351719	351724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218290
7511	NC_021820	GATA	2	8	351864	351871	50 %	25 %	25 %	0 %	526218290
7512	NC_021820	GGT	2	6	351880	351885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218290
7513	NC_021820	CAG	2	6	351889	351894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218290
7514	NC_021820	CAC	3	9	351957	351965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218290
7515	NC_021820	CTGG	2	8	352025	352032	0 %	25 %	50 %	25 %	526218290
7516	NC_021820	CGG	2	6	352044	352049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218290
7517	NC_021820	GGT	2	6	352063	352068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218290
7518	NC_021820	TTGCG	2	10	352172	352181	0 %	40 %	40 %	20 %	526218290
7519	NC_021820	CGGG	2	8	352217	352224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7520	NC_021820	CAC	2	6	352235	352240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7521	NC_021820	CAAC	2	8	352281	352288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7522	NC_021820	AGC	2	6	352369	352374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_021820	GGC	2	6	352438	352443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218291
7524	NC_021820	GA	3	6	352467	352472	50 %	0 %	50 %	0 %	526218291
7525	NC_021820	T	6	6	352499	352504	0 %	100 %	0 %	0 %	526218291
7526	NC_021820	CCA	3	9	352507	352515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218291
7527	NC_021820	GGC	2	6	352657	352662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218291
7528	NC_021820	GCG	2	6	352678	352683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218291
7529	NC_021820	TTA	2	6	352785	352790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_021820	ACG	3	9	352824	352832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_021820	GAC	2	6	352844	352849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_021820	TAG	2	6	352856	352861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_021820	TAA	2	6	353034	353039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_021820	AGC	2	6	353111	353116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_021820	T	6	6	353241	353246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_021820	GC	3	6	353253	353258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7537	NC_021820	GAA	2	6	353329	353334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_021820	AGA	2	6	353347	353352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_021820	CAA	2	6	353528	353533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_021820	CCG	2	6	353584	353589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218292
7541	NC_021820	GCA	2	6	353606	353611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7542	NC_021820	CAA	2	6	353756	353761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218292
7543	NC_021820	GCG	2	6	353788	353793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218292
7544	NC_021820	ACA	2	6	353886	353891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218292
7545	NC_021820	CCAGCG	2	12	353946	353957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218292
7546	NC_021820	ACAT	2	8	353990	353997	50 %	25 %	0 %	25 %	526218292
7547	NC_021820	TCG	2	6	354007	354012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7548	NC_021820	CCAA	2	8	354022	354029	50 %	0 %	0 %	50 %	526218292
7549	NC_021820	GC	4	8	354033	354040	0 %	0 %	50 %	50 %	526218292
7550	NC_021820	GGC	2	6	354041	354046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218292
7551	NC_021820	GGC	2	6	354069	354074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218292
7552	NC_021820	GGC	2	6	354099	354104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218292
7553	NC_021820	CTG	2	6	354126	354131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7554	NC_021820	CTA	2	6	354257	354262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218292
7555	NC_021820	CGA	2	6	354287	354292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7556	NC_021820	TTC	2	6	354300	354305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218292
7557	NC_021820	CTG	2	6	354354	354359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7558	NC_021820	CAG	2	6	354369	354374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7559	NC_021820	TTGG	2	8	354442	354449	0 %	50 %	50 %	0 %	526218292
7560	NC_021820	TGA	2	6	354502	354507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218292
7561	NC_021820	A	6	6	354507	354512	100 %	0 %	0 %	0 %	526218292
7562	NC_021820	CGTG	2	8	354581	354588	0 %	25 %	50 %	25 %	526218292
7563	NC_021820	TGCCAA	2	12	354617	354628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218292
7564	NC_021820	CCGG	2	8	354634	354641	0 %	0 %	50 %	50 %	526218292
7565	NC_021820	AGA	2	6	354724	354729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218292
7566	NC_021820	CAAAAT	2	12	354746	354757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526218292
7567	NC_021820	ACCA	2	8	354837	354844	50 %	0 %	0 %	50 %	526218292
7568	NC_021820	GGCG	2	8	354873	354880	0 %	0 %	75 %	25 %	526218292
7569	NC_021820	GAA	2	6	354930	354935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218292
7570	NC_021820	AGA	2	6	354950	354955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218292
7571	NC_021820	GTC	2	6	354980	354985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218292
7572	NC_021820	TTA	2	6	355021	355026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218293
7573	NC_021820	CAG	2	6	355036	355041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218293
7574	NC_021820	GGC	2	6	355057	355062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
7575	NC_021820	CTC	2	6	355093	355098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218293
7576	NC_021820	CG	4	8	355155	355162	0 %	0 %	50 %	50 %	526218293
7577	NC_021820	CTGC	2	8	355324	355331	0 %	25 %	25 %	50 %	526218293
7578	NC_021820	GAC	2	6	355351	355356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218293
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7581	NC_021820	CGG	2	6	355617	355622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
7582	NC_021820	TAA	2	6	355653	355658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218293
7583	NC_021820	CG	3	6	355663	355668	0 %	0 %	50 %	50 %	526218293
7584	NC_021820	TGG	2	6	355700	355705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218293
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7586	NC_021820	GCA	2	6	355801	355806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218293
7587	NC_021820	GCGT	2	8	355832	355839	0 %	25 %	50 %	25 %	526218293
7588	NC_021820	GAA	2	6	355891	355896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218293
7589	NC_021820	CGG	2	6	355923	355928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
7590	NC_021820	GCG	2	6	356047	356052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
7591	NC_021820	TGC	2	6	356061	356066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218293
7592	NC_021820	GTT	2	6	356071	356076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218293
7593	NC_021820	GC	3	6	356181	356186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7594	NC_021820	AC	4	8	356210	356217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7595	NC_021820	AT	3	6	356238	356243	50 %	50 %	0 %	0 %	526218294
7596	NC_021820	CTAT	2	8	356366	356373	25 %	50 %	0 %	25 %	526218294
7597	NC_021820	TTC	2	6	356447	356452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218294
7598	NC_021820	TTTAC	2	10	356605	356614	20 %	60 %	0 %	20 %	526218294
7599	NC_021820	CGG	2	6	356619	356624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218294
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7601	NC_021820	TTC	2	6	356680	356685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218294
7602	NC_021820	GGCG	2	8	356813	356820	0 %	0 %	75 %	25 %	526218294
7603	NC_021820	CAG	2	6	356863	356868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218294
7604	NC_021820	AGAC	2	8	356921	356928	50 %	0 %	25 %	25 %	526218294
7605	NC_021820	GC	3	6	357026	357031	0 %	0 %	50 %	50 %	526218294
7606	NC_021820	CG	3	6	357050	357055	0 %	0 %	50 %	50 %	526218294
7607	NC_021820	GCGG	2	8	357119	357126	0 %	0 %	75 %	25 %	526218294
7608	NC_021820	GAT	2	6	357145	357150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218294
7609	NC_021820	CTG	2	6	357184	357189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218294
7610	NC_021820	CTC	2	6	357361	357366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218295
7611	NC_021820	GTAT	2	8	357414	357421	25 %	50 %	25 %	0 %	526218295
7612	NC_021820	CAC	2	6	357452	357457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218295
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7616	NC_021820	GAT	2	6	357560	357565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218295
7617	NC_021820	GAA	2	6	357596	357601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
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7619	NC_021820	CGG	2	6	357679	357684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
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7621	NC_021820	AGA	2	6	357979	357984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
7622	NC_021820	GGC	2	6	358001	358006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
7623	NC_021820	TTG	2	6	358017	358022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218295
7624	NC_021820	TCT	2	6	358062	358067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218295
7625	NC_021820	CAA	2	6	358153	358158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218295
7626	NC_021820	CGG	2	6	358174	358179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
7627	NC_021820	GCG	2	6	358202	358207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
7628	NC_021820	AAG	2	6	358239	358244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
7629	NC_021820	A	6	6	358253	358258	100 %	0 %	0 %	0 %	526218295
7630	NC_021820	CGA	2	6	358279	358284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
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7632	NC_021820	CGG	2	6	358383	358388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
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7634	NC_021820	GAAC	2	8	358402	358409	50 %	0 %	25 %	25 %	526218295
7635	NC_021820	CTG	2	6	358424	358429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
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7637	NC_021820	CGC	2	6	358474	358479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218295
7638	NC_021820	GCG	2	6	358493	358498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
7639	NC_021820	CGT	2	6	358520	358525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7640	NC_021820	GC	3	6	358530	358535	0 %	0 %	50 %	50 %	526218295
7641	NC_021820	TGG	2	6	358608	358613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218295
7642	NC_021820	GGC	2	6	358628	358633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
7643	NC_021820	GC	3	6	358709	358714	0 %	0 %	50 %	50 %	526218295
7644	NC_021820	TCC	2	6	358730	358735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218295
7645	NC_021820	CGA	2	6	358783	358788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
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7647	NC_021820	GCT	2	6	358867	358872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7648	NC_021820	CTT	2	6	358879	358884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218295
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7652	NC_021820	GCT	2	6	359155	359160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7653	NC_021820	TGA	2	6	359206	359211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218295
7654	NC_021820	AGC	2	6	359265	359270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7655	NC_021820	CAGT	2	8	359275	359282	25 %	25 %	25 %	25 %	526218295
7656	NC_021820	TCG	2	6	359404	359409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7657	NC_021820	ACC	2	6	359600	359605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218295
7658	NC_021820	GCC	2	6	359619	359624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218295
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7660	NC_021820	TGC	2	6	359656	359661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7661	NC_021820	CGT	2	6	359705	359710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
7662	NC_021820	GAG	2	6	359720	359725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218295
7663	NC_021820	AGC	2	6	359737	359742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
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7666	NC_021820	GGCG	2	8	359849	359856	0 %	0 %	75 %	25 %	526218296
7667	NC_021820	GC	3	6	359862	359867	0 %	0 %	50 %	50 %	526218296
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7672	NC_021820	GTTT	2	8	360192	360199	0 %	75 %	25 %	0 %	526218296
7673	NC_021820	T	6	6	360265	360270	0 %	100 %	0 %	0 %	526218296
7674	NC_021820	TGC	2	6	360318	360323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218296
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7677	NC_021820	CAA	2	6	360379	360384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218296
7678	NC_021820	T	6	6	360398	360403	0 %	100 %	0 %	0 %	526218296
7679	NC_021820	CAA	2	6	360451	360456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218296
7680	NC_021820	GGC	2	6	360464	360469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218296
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7682	NC_021820	GGC	2	6	360605	360610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218296
7683	NC_021820	CG	3	6	360644	360649	0 %	0 %	50 %	50 %	526218296
7684	NC_021820	CTGC	2	8	360760	360767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7685	NC_021820	GCAG	2	8	360771	360778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7686	NC_021820	TGGT	2	8	360802	360809	0 %	50 %	50 %	0 %	526218297
7687	NC_021820	T	6	6	360812	360817	0 %	100 %	0 %	0 %	526218297
7688	NC_021820	TTC	2	6	360824	360829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218297
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7690	NC_021820	CAG	2	6	360923	360928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218297
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7692	NC_021820	TTC	2	6	361065	361070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218297
7693	NC_021820	GCC	2	6	361082	361087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218297
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7695	NC_021820	GTA	2	6	361250	361255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218297
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7707	NC_021820	T	6	6	361747	361752	0 %	100 %	0 %	0 %	526218297
7708	NC_021820	GAT	2	6	361787	361792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218297
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7714	NC_021820	CTC	2	6	361985	361990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7715	NC_021820	TAAT	2	8	361992	361999	50 %	50 %	0 %	0 %	526218298
7716	NC_021820	T	6	6	362001	362006	0 %	100 %	0 %	0 %	526218298
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7718	NC_021820	AAAT	2	8	362093	362100	75 %	25 %	0 %	0 %	526218298
7719	NC_021820	AG	3	6	362127	362132	50 %	0 %	50 %	0 %	526218298
7720	NC_021820	CGC	2	6	362156	362161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218298
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7723	NC_021820	AGGAG	2	10	362249	362258	40 %	0 %	60 %	0 %	526218298
7724	NC_021820	CCG	2	6	362261	362266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218298
7725	NC_021820	AT	3	6	362269	362274	50 %	50 %	0 %	0 %	526218298
7726	NC_021820	CGA	2	6	362363	362368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218298
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7728	NC_021820	CAG	2	6	362529	362534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218298
7729	NC_021820	GCT	2	6	362586	362591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218298
7730	NC_021820	TGT	2	6	362656	362661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218298
7731	NC_021820	GCG	2	6	362716	362721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218298
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7734	NC_021820	A	6	6	362770	362775	100 %	0 %	0 %	0 %	526218298
7735	NC_021820	GACT	2	8	362796	362803	25 %	25 %	25 %	25 %	526218298
7736	NC_021820	CGA	2	6	362807	362812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218298
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7738	NC_021820	TAA	2	6	362861	362866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218298
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7740	NC_021820	ATA	2	6	362923	362928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218298
7741	NC_021820	ATG	2	6	362939	362944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218298
7742	NC_021820	CAT	2	6	362994	362999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218298
7743	NC_021820	ATA	2	6	363035	363040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218298
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7745	NC_021820	AAG	2	6	363127	363132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218298
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7865	NC_021820	TTCA	2	8	369736	369743	25 %	50 %	0 %	25 %	526218304
7866	NC_021820	CG	3	6	369752	369757	0 %	0 %	50 %	50 %	526218304
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7991	NC_021820	TGG	2	6	375855	375860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218307
7992	NC_021820	AGC	2	6	375879	375884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218307
7993	NC_021820	CAG	2	6	375956	375961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218307
7994	NC_021820	TGG	2	6	375968	375973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218307
7995	NC_021820	GCG	2	6	376029	376034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218307
7996	NC_021820	TCA	2	6	376044	376049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218307
7997	NC_021820	GTC	2	6	376061	376066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218307
7998	NC_021820	CACG	2	8	376072	376079	25 %	0 %	25 %	50 %	526218307
7999	NC_021820	CTGGCG	2	12	376145	376156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218307
8000	NC_021820	ACT	2	6	376203	376208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218307

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