MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 105084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021818	AGAA	2	8	163501	163508	75 %	0 %	25 %	0 %	525859395
3502	NC_021818	GTG	2	6	163537	163542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525859395
3503	NC_021818	AT	3	6	163552	163557	50 %	50 %	0 %	0 %	525859395
3504	NC_021818	CGC	2	6	163640	163645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859395
3505	NC_021818	GCA	2	6	163706	163711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859395
3506	NC_021818	CAT	3	9	163758	163766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859395
3507	NC_021818	CCG	2	6	163771	163776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859395
3508	NC_021818	ACG	2	6	163786	163791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859395
3509	NC_021818	GC	3	6	163826	163831	0 %	0 %	50 %	50 %	525859395
3510	NC_021818	GACGC	2	10	163875	163884	20 %	0 %	40 %	40 %	525859395
3511	NC_021818	CAGC	3	12	163898	163909	25 %	0 %	25 %	50 %	525859395
3512	NC_021818	ATA	2	6	163951	163956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859395
3513	NC_021818	TGG	2	6	164024	164029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525859395
3514	NC_021818	AAG	2	6	164047	164052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525859395
3515	NC_021818	CGC	2	6	164058	164063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859395
3516	NC_021818	GCCA	2	8	164076	164083	25 %	0 %	25 %	50 %	525859395
3517	NC_021818	GC	3	6	164088	164093	0 %	0 %	50 %	50 %	525859395
3518	NC_021818	T	6	6	164094	164099	0 %	100 %	0 %	0 %	525859395
3519	NC_021818	TC	3	6	164132	164137	0 %	50 %	0 %	50 %	525855855
3520	NC_021818	AAC	2	6	164151	164156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855855
3521	NC_021818	CAA	2	6	164206	164211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855855
3522	NC_021818	ACC	2	6	164235	164240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855855
3523	NC_021818	AAGT	2	8	164262	164269	50 %	25 %	25 %	0 %	525855855
3524	NC_021818	CGC	2	6	164456	164461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855855
3525	NC_021818	CAG	2	6	164462	164467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855855
3526	NC_021818	ACC	2	6	164514	164519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855855
3527	NC_021818	TGA	2	6	164520	164525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855855
3528	NC_021818	TTC	2	6	164531	164536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855855
3529	NC_021818	CCA	2	6	164543	164548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855855
3530	NC_021818	CAG	2	6	164552	164557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855855
3531	NC_021818	GAA	2	6	164713	164718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525855855
3532	NC_021818	TTG	2	6	164804	164809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855855
3533	NC_021818	TTC	2	6	164830	164835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021818	TTA	2	6	164853	164858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021818	TGA	2	6	164934	164939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021818	A	6	6	164939	164944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021818	ATT	2	6	164959	164964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021818	CCA	2	6	165008	165013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_021818	AAC	2	6	165023	165028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_021818	GCC	2	6	165038	165043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_021818	CGC	2	6	165134	165139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_021818	AAGCG	2	10	165147	165156	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3543	NC_021818	TG	3	6	165188	165193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021818	GGC	2	6	165342	165347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021818	AGC	2	6	165382	165387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021818	TGC	2	6	165389	165394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021818	ACT	2	6	165456	165461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021818	TTG	2	6	165553	165558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021818	CGA	2	6	165581	165586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021818	GCA	2	6	165655	165660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021818	GAA	2	6	165714	165719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021818	GGA	2	6	165750	165755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021818	TAA	2	6	165768	165773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021818	GCA	2	6	165776	165781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021818	AGA	2	6	165797	165802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021818	CAG	2	6	165823	165828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021818	G	6	6	165970	165975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021818	GGA	2	6	166014	166019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021818	GGC	2	6	166034	166039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021818	GAA	2	6	166277	166282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021818	TGC	2	6	166353	166358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021818	GTC	2	6	166365	166370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_021818	TTG	2	6	166426	166431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021818	CCGG	2	8	166440	166447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_021818	GGA	2	6	166478	166483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021818	TCA	2	6	166503	166508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3568	NC_021818	CGT	2	6	166597	166602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_021818	AC	3	6	166698	166703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_021818	GTAG	2	8	166739	166746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021818	CCT	2	6	166839	166844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_021818	AAG	2	6	166852	166857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021818	CA	3	6	166874	166879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_021818	TGA	2	6	166887	166892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021818	CGG	2	6	166970	166975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_021818	AAC	2	6	167123	167128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_021818	GTT	2	6	167133	167138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021818	TC	3	6	167145	167150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_021818	GAT	2	6	167166	167171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021818	GCG	2	6	167445	167450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021818	GAG	2	6	167461	167466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021818	TG	3	6	167486	167491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021818	GC	3	6	167513	167518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_021818	G	6	6	167606	167611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021818	TCC	2	6	167616	167621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_021818	CTGA	2	8	167636	167643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_021818	GTAC	2	8	167720	167727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_021818	TG	3	6	167752	167757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021818	GGA	2	6	167927	167932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021818	AC	3	6	168145	168150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_021818	CGTC	2	8	168163	168170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_021818	AAC	2	6	168182	168187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021818	AGC	2	6	168272	168277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_021818	CAT	2	6	168278	168283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_021818	AAAG	2	8	168286	168293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021818	TG	3	6	168375	168380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021818	TTG	2	6	168381	168386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021818	G	6	6	168622	168627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021818	TGA	2	6	168721	168726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021818	CAA	2	6	168748	168753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_021818	GGT	2	6	168820	168825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021818	GA	3	6	168850	168855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021818	AGTC	2	8	168946	168953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_021818	GCTG	2	8	168964	168971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_021818	TTA	2	6	168979	168984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021818	CGG	2	6	169103	169108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021818	ATG	2	6	169179	169184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021818	ACC	2	6	169374	169379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_021818	TGG	2	6	169434	169439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021818	TCC	2	6	169460	169465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_021818	GGA	2	6	169477	169482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021818	AGG	2	6	169515	169520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021818	GGT	2	6	169597	169602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021818	CGG	2	6	169684	169689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_021818	TCA	2	6	169712	169717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_021818	CGT	2	6	169792	169797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_021818	G	6	6	169841	169846	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021818	GAC	3	9	170023	170031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_021818	GT	3	6	170045	170050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021818	GA	3	6	170132	170137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021818	GGC	2	6	170202	170207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021818	GGT	2	6	170216	170221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021818	CCTG	2	8	170396	170403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_021818	CCGT	2	8	170431	170438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_021818	TC	3	6	170513	170518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_021818	AAT	2	6	170532	170537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021818	T	10	10	170557	170566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021818	CTT	2	6	170610	170615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_021818	TCA	2	6	170623	170628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_021818	GTT	2	6	170843	170848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855856
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3878	NC_021818	GGC	2	6	182250	182255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855865
3879	NC_021818	CAGA	2	8	182298	182305	50 %	0 %	25 %	25 %	525855865
3880	NC_021818	AT	3	6	182350	182355	50 %	50 %	0 %	0 %	525855865
3881	NC_021818	TGT	2	6	182377	182382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3882	NC_021818	ACA	2	6	182435	182440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3883	NC_021818	CAT	2	6	182459	182464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855866
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3997	NC_021818	CGCTG	2	10	187095	187104	0 %	20 %	40 %	40 %	525855870
3998	NC_021818	GAC	2	6	187186	187191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855870
3999	NC_021818	GCG	2	6	187264	187269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855870
4000	NC_021818	ACG	2	6	187319	187324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855870

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