MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 105084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102004	NC_021818	CGA	2	6	4831988	4831993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859275
102005	NC_021818	CTGG	2	8	4831997	4832004	0 %	25 %	50 %	25 %	525859275
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102007	NC_021818	GC	3	6	4832063	4832068	0 %	0 %	50 %	50 %	525859275
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102093	NC_021818	A	6	6	4835912	4835917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102094	NC_021818	A	7	7	4835937	4835943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102102	NC_021818	AAT	2	6	4836225	4836230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102117	NC_021818	ATT	2	6	4836813	4836818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525859279
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102232	NC_021818	CTT	2	6	4842030	4842035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102233	NC_021818	AGG	2	6	4842074	4842079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102234	NC_021818	GAAA	2	8	4842174	4842181	75 %	0 %	25 %	0 %	525859283
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102240	NC_021818	GCA	2	6	4842328	4842333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859283
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102253	NC_021818	ATT	2	6	4843056	4843061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102254	NC_021818	CGG	2	6	4843198	4843203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859284
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102259	NC_021818	CGG	2	6	4843597	4843602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859284
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102328	NC_021818	T	6	6	4847251	4847256	0 %	100 %	0 %	0 %	525860374
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102331	NC_021818	CAAT	2	8	4847404	4847411	50 %	25 %	0 %	25 %	525860374
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102342	NC_021818	GC	3	6	4848098	4848103	0 %	0 %	50 %	50 %	525860374
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102347	NC_021818	GCG	2	6	4848334	4848339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525860374
102348	NC_021818	GCA	2	6	4848400	4848405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860374
102349	NC_021818	GAT	2	6	4848440	4848445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525860374
102350	NC_021818	GGT	2	6	4848452	4848457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525860374
102351	NC_021818	CAG	2	6	4848482	4848487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860374
102352	NC_021818	CTC	2	6	4848551	4848556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525860374
102353	NC_021818	GCT	2	6	4848574	4848579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860374
102354	NC_021818	TCA	2	6	4848615	4848620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860374
102355	NC_021818	CTG	2	6	4848665	4848670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860374
102356	NC_021818	AAGT	2	8	4848767	4848774	50 %	25 %	25 %	0 %	525860374
102357	NC_021818	AG	3	6	4848791	4848796	50 %	0 %	50 %	0 %	525860374
102358	NC_021818	CAC	2	6	4849016	4849021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525860374
102359	NC_021818	GAA	2	6	4849086	4849091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525860374
102360	NC_021818	CG	3	6	4849110	4849115	0 %	0 %	50 %	50 %	525860374
102361	NC_021818	CTG	2	6	4849151	4849156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860374
102362	NC_021818	AAC	2	6	4849167	4849172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525860374
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102364	NC_021818	GCC	2	6	4849289	4849294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102365	NC_021818	AG	3	6	4849322	4849327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102366	NC_021818	GCGCT	2	10	4849380	4849389	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102367	NC_021818	ACG	2	6	4849400	4849405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102368	NC_021818	GCG	2	6	4849464	4849469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102369	NC_021818	CAG	3	9	4849516	4849524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102370	NC_021818	CTG	2	6	4849549	4849554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102371	NC_021818	CG	3	6	4849613	4849618	0 %	0 %	50 %	50 %	525859287
102372	NC_021818	CTG	2	6	4849637	4849642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102373	NC_021818	CCG	3	9	4849643	4849651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102374	NC_021818	TGGTC	2	10	4849653	4849662	0 %	40 %	40 %	20 %	525859287
102375	NC_021818	TCC	2	6	4849670	4849675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525859287
102376	NC_021818	CCG	2	6	4849683	4849688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102377	NC_021818	TCA	2	6	4849698	4849703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859287
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102379	NC_021818	GCC	2	6	4849788	4849793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102380	NC_021818	TAA	2	6	4849835	4849840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859287
102381	NC_021818	CGG	2	6	4849916	4849921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102382	NC_021818	TAA	2	6	4849946	4849951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859287
102383	NC_021818	CGC	2	6	4850007	4850012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102384	NC_021818	GCC	3	9	4850065	4850073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102385	NC_021818	CGC	2	6	4850085	4850090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102386	NC_021818	TGC	2	6	4850109	4850114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102387	NC_021818	CAG	2	6	4850140	4850145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859287
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102391	NC_021818	CGT	2	6	4850254	4850259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
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102393	NC_021818	CATCCG	2	12	4850385	4850396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525859287
102394	NC_021818	CGTC	2	8	4850447	4850454	0 %	25 %	25 %	50 %	525859287
102395	NC_021818	GCC	2	6	4850509	4850514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
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102400	NC_021818	TCA	2	6	4850624	4850629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859287
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102403	NC_021818	GGC	2	6	4850792	4850797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102404	NC_021818	CGC	3	9	4850836	4850844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102405	NC_021818	CTGCGC	2	12	4850866	4850877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525859287
102406	NC_021818	GCAG	2	8	4850915	4850922	25 %	0 %	50 %	25 %	525859287
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102408	NC_021818	GC	4	8	4850936	4850943	0 %	0 %	50 %	50 %	525859287
102409	NC_021818	GCG	2	6	4851035	4851040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102410	NC_021818	GCC	2	6	4851044	4851049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
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102414	NC_021818	CTGG	2	8	4851232	4851239	0 %	25 %	50 %	25 %	525859287
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102419	NC_021818	CGA	2	6	4851449	4851454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102420	NC_021818	CTG	2	6	4851508	4851513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102421	NC_021818	TCG	2	6	4851548	4851553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102422	NC_021818	GCTG	2	8	4851564	4851571	0 %	25 %	50 %	25 %	525859287
102423	NC_021818	CGG	2	6	4851594	4851599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102424	NC_021818	GCG	2	6	4851606	4851611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102425	NC_021818	CTG	2	6	4851613	4851618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102426	NC_021818	CTG	2	6	4851679	4851684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102427	NC_021818	ATA	2	6	4851685	4851690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859287
102428	NC_021818	CGG	3	9	4851696	4851704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102429	NC_021818	GC	3	6	4851715	4851720	0 %	0 %	50 %	50 %	525859287
102430	NC_021818	CCCCAG	2	12	4851733	4851744	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525859287
102431	NC_021818	CTG	2	6	4851781	4851786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102432	NC_021818	ATT	2	6	4851811	4851816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525859287
102433	NC_021818	CTG	2	6	4851838	4851843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102434	NC_021818	CAG	2	6	4851871	4851876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102435	NC_021818	GCT	3	9	4851895	4851903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102436	NC_021818	GCG	2	6	4851906	4851911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102437	NC_021818	GGCGCG	2	12	4851943	4851954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102438	NC_021818	TGCC	2	8	4851973	4851980	0 %	25 %	25 %	50 %	525859287
102439	NC_021818	GC	3	6	4851984	4851989	0 %	0 %	50 %	50 %	525859287
102440	NC_021818	GTC	2	6	4852003	4852008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102441	NC_021818	CTG	2	6	4852027	4852032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102442	NC_021818	CCG	2	6	4852071	4852076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
102443	NC_021818	GC	3	6	4852090	4852095	0 %	0 %	50 %	50 %	525859287
102444	NC_021818	TGC	2	6	4852124	4852129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102445	NC_021818	GCGG	2	8	4852144	4852151	0 %	0 %	75 %	25 %	525859287
102446	NC_021818	CTG	2	6	4852237	4852242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102447	NC_021818	CGC	2	6	4852319	4852324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859287
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102449	NC_021818	TTA	2	6	4852367	4852372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525859287
102450	NC_021818	CGG	2	6	4852421	4852426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102451	NC_021818	GTC	2	6	4852445	4852450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102452	NC_021818	CGG	2	6	4852477	4852482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102453	NC_021818	AAC	2	6	4852493	4852498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525859287
102454	NC_021818	GTC	2	6	4852535	4852540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102455	NC_021818	CCT	2	6	4852554	4852559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525859287
102456	NC_021818	GCG	2	6	4852578	4852583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859287
102457	NC_021818	AGC	2	6	4852589	4852594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859287
102458	NC_021818	CAA	2	6	4852690	4852695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525859287
102459	NC_021818	TGC	2	6	4852823	4852828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859287
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102461	NC_021818	A	6	6	4852940	4852945	100 %	0 %	0 %	0 %	525859287
102462	NC_021818	TAA	2	6	4852995	4853000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859288
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