MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 105084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101001	NC_021818	GCGG	2	8	4787973	4787980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101002	NC_021818	TCT	2	6	4787993	4787998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101003	NC_021818	TGGC	2	8	4788154	4788161	0 %	25 %	50 %	25 %	525859243
101004	NC_021818	CGG	2	6	4788194	4788199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859243
101005	NC_021818	TCTT	2	8	4788232	4788239	0 %	75 %	0 %	25 %	525859243
101006	NC_021818	CCG	2	6	4788320	4788325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859243
101007	NC_021818	CCGC	2	8	4788328	4788335	0 %	0 %	25 %	75 %	525859243
101008	NC_021818	GCA	2	6	4788413	4788418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859243
101009	NC_021818	GTA	2	6	4788435	4788440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525859243
101010	NC_021818	GCC	2	6	4788441	4788446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859243
101011	NC_021818	CGG	2	6	4788512	4788517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859243
101012	NC_021818	A	6	6	4788528	4788533	100 %	0 %	0 %	0 %	525859243
101013	NC_021818	GC	3	6	4788576	4788581	0 %	0 %	50 %	50 %	525859243
101014	NC_021818	GAG	2	6	4788676	4788681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525859243
101015	NC_021818	CGG	2	6	4788689	4788694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859243
101016	NC_021818	ATC	2	6	4788754	4788759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859243
101017	NC_021818	CTTCAT	2	12	4788767	4788778	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525859243
101018	NC_021818	GCTG	2	8	4788790	4788797	0 %	25 %	50 %	25 %	525859243
101019	NC_021818	AGA	3	9	4788801	4788809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525859243
101020	NC_021818	CGT	2	6	4788839	4788844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859243
101021	NC_021818	GCCACC	2	12	4788859	4788870	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525859243
101022	NC_021818	CAT	2	6	4788890	4788895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859243
101023	NC_021818	GC	4	8	4788963	4788970	0 %	0 %	50 %	50 %	525859243
101024	NC_021818	ATC	2	6	4789038	4789043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859243
101025	NC_021818	CAA	2	6	4789073	4789078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525859243
101026	NC_021818	TGTTT	2	10	4789142	4789151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101027	NC_021818	T	6	6	4789149	4789154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101028	NC_021818	ATA	2	6	4789237	4789242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101029	NC_021818	ATA	2	6	4789280	4789285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101030	NC_021818	A	8	8	4789310	4789317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101031	NC_021818	AAT	2	6	4789356	4789361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101032	NC_021818	TGC	2	6	4789383	4789388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101033	NC_021818	GTT	2	6	4789427	4789432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101034	NC_021818	A	6	6	4789433	4789438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101035	NC_021818	TAA	2	6	4789440	4789445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101036	NC_021818	A	6	6	4789461	4789466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101037	NC_021818	GCCT	2	8	4789480	4789487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101038	NC_021818	TTC	2	6	4789547	4789552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525860366
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101041	NC_021818	CG	3	6	4789656	4789661	0 %	0 %	50 %	50 %	525860366
101042	NC_021818	TTG	2	6	4789675	4789680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525860366
101043	NC_021818	GC	3	6	4789715	4789720	0 %	0 %	50 %	50 %	525860366
101044	NC_021818	CGTG	2	8	4789734	4789741	0 %	25 %	50 %	25 %	525860366
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101051	NC_021818	A	6	6	4789964	4789969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101052	NC_021818	A	6	6	4789971	4789976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101053	NC_021818	GCC	2	6	4790019	4790024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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101056	NC_021818	GCG	2	6	4790225	4790230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859244
101057	NC_021818	GGT	2	6	4790233	4790238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525859244
101058	NC_021818	TTC	2	6	4790321	4790326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525859244
101059	NC_021818	GCG	2	6	4790426	4790431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859244
101060	NC_021818	CCG	2	6	4790471	4790476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859244
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101062	NC_021818	TCTT	2	8	4790498	4790505	0 %	75 %	0 %	25 %	525859244
101063	NC_021818	GC	3	6	4790509	4790514	0 %	0 %	50 %	50 %	525859244
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101067	NC_021818	CG	4	8	4790602	4790609	0 %	0 %	50 %	50 %	525859244
101068	NC_021818	CTG	2	6	4790626	4790631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859244
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101071	NC_021818	CGC	2	6	4790770	4790775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859244
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101079	NC_021818	CGA	2	6	4790937	4790942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859244
101080	NC_021818	ACCGG	2	10	4791029	4791038	20 %	0 %	40 %	40 %	525859244
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101082	NC_021818	GTT	2	6	4791164	4791169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101083	NC_021818	GT	3	6	4791172	4791177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101084	NC_021818	ATT	2	6	4791208	4791213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101085	NC_021818	GCTA	2	8	4791215	4791222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101086	NC_021818	AGC	2	6	4791233	4791238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101087	NC_021818	TAT	2	6	4791266	4791271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101088	NC_021818	AAGCG	2	10	4791346	4791355	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101089	NC_021818	A	6	6	4791409	4791414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101090	NC_021818	CCAG	2	8	4791582	4791589	25 %	0 %	25 %	50 %	525859245
101091	NC_021818	ATA	2	6	4791599	4791604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859245
101092	NC_021818	TCG	2	6	4791617	4791622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859245
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101103	NC_021818	AAC	2	6	4792132	4792137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525859245
101104	NC_021818	GCT	2	6	4792169	4792174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859245
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101106	NC_021818	CGC	2	6	4792249	4792254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859245
101107	NC_021818	GCTAAA	2	12	4792286	4792297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525859245
101108	NC_021818	CAA	2	6	4792359	4792364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101109	NC_021818	CG	3	6	4792485	4792490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101110	NC_021818	ACA	2	6	4792499	4792504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101111	NC_021818	GCCA	2	8	4792600	4792607	25 %	0 %	25 %	50 %	525860367
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101113	NC_021818	CAG	3	9	4792638	4792646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860367
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101115	NC_021818	GAAA	2	8	4792762	4792769	75 %	0 %	25 %	0 %	525860367
101116	NC_021818	CGC	2	6	4792793	4792798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525860367
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101118	NC_021818	ATC	2	6	4792939	4792944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860367
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101186	NC_021818	A	7	7	4795798	4795804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101229	NC_021818	A	6	6	4797246	4797251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101415	NC_021818	GC	3	6	4805026	4805031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101416	NC_021818	AGT	2	6	4805042	4805047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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101418	NC_021818	CAA	2	6	4805098	4805103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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101462	NC_021818	CAT	4	12	4807110	4807121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859258
101463	NC_021818	GAT	2	6	4807221	4807226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525859258
101464	NC_021818	GCG	2	6	4807240	4807245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859258
101465	NC_021818	AGA	2	6	4807277	4807282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525859258
101466	NC_021818	CGT	3	9	4807324	4807332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101467	NC_021818	GCC	2	6	4807354	4807359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101468	NC_021818	AAT	2	6	4807367	4807372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101469	NC_021818	GAA	2	6	4807423	4807428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525859259
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101471	NC_021818	CAG	2	6	4807444	4807449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859259
101472	NC_021818	CGT	2	6	4807525	4807530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859259
101473	NC_021818	ATA	2	6	4807544	4807549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859259
101474	NC_021818	CG	3	6	4807575	4807580	0 %	0 %	50 %	50 %	525859259
101475	NC_021818	CCG	2	6	4807589	4807594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859259
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101492	NC_021818	GGA	2	6	4808383	4808388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525859259
101493	NC_021818	CAG	2	6	4808443	4808448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859259
101494	NC_021818	T	6	6	4808511	4808516	0 %	100 %	0 %	0 %	525859260
101495	NC_021818	CAG	3	9	4808517	4808525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859260
101496	NC_021818	CAC	2	6	4808541	4808546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525859260
101497	NC_021818	ATAA	2	8	4808569	4808576	75 %	25 %	0 %	0 %	525859260
101498	NC_021818	CG	4	8	4808618	4808625	0 %	0 %	50 %	50 %	525859260
101499	NC_021818	GATC	2	8	4808696	4808703	25 %	25 %	25 %	25 %	525859260
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