MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 1606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021817	GGC	2	6	26392	26397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833530
502	NC_021817	T	7	7	26512	26518	0 %	100 %	0 %	0 %	525833530
503	NC_021817	ACC	2	6	26532	26537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833530
504	NC_021817	CAG	2	6	26558	26563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833530
505	NC_021817	CGT	2	6	26564	26569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833530
506	NC_021817	CCG	2	6	26572	26577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833530
507	NC_021817	TGG	2	6	26593	26598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021817	ACG	2	6	26627	26632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021817	TCC	2	6	26654	26659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_021817	AGT	2	6	26738	26743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833531
511	NC_021817	TCA	2	6	26780	26785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
512	NC_021817	TGTTC	2	10	26832	26841	0 %	60 %	20 %	20 %	525833531
513	NC_021817	TCA	2	6	26867	26872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
514	NC_021817	TGAAC	2	10	26878	26887	40 %	20 %	20 %	20 %	525833531
515	NC_021817	GCA	2	6	26946	26951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833531
516	NC_021817	AGG	2	6	26955	26960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833531
517	NC_021817	GCT	2	6	27104	27109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833531
518	NC_021817	CAT	2	6	27126	27131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
519	NC_021817	TGA	2	6	27165	27170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833531
520	NC_021817	GGC	2	6	27183	27188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833531
521	NC_021817	GACC	2	8	27219	27226	25 %	0 %	25 %	50 %	525833531
522	NC_021817	AGC	2	6	27245	27250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833531
523	NC_021817	TCG	2	6	27260	27265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833531
524	NC_021817	TTC	2	6	27278	27283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833531
525	NC_021817	GCG	2	6	27291	27296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833531
526	NC_021817	GAT	2	6	27322	27327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833531
527	NC_021817	CAG	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833531
528	NC_021817	C	6	6	27374	27379	0 %	0 %	0 %	100 %	525833531
529	NC_021817	CAT	2	6	27402	27407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
530	NC_021817	TCG	2	6	27422	27427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833531
531	NC_021817	ATC	2	6	27529	27534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
532	NC_021817	CCT	2	6	27603	27608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833531
533	NC_021817	GCA	3	9	27618	27626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833531
534	NC_021817	CAGC	2	8	27672	27679	25 %	0 %	25 %	50 %	525833531
535	NC_021817	CCA	2	6	27767	27772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833531
536	NC_021817	CCG	2	6	27827	27832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833531
537	NC_021817	GACCA	2	10	27862	27871	40 %	0 %	20 %	40 %	525833531
538	NC_021817	TGT	2	6	27906	27911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833531
539	NC_021817	C	6	6	27986	27991	0 %	0 %	0 %	100 %	525833531
540	NC_021817	CCA	2	6	28011	28016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833531
541	NC_021817	GCA	2	6	28020	28025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833531
542	NC_021817	ATGA	2	8	28099	28106	50 %	25 %	25 %	0 %	525833531
543	NC_021817	ATC	2	6	28112	28117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
544	NC_021817	TTC	2	6	28169	28174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833531
545	NC_021817	CTG	2	6	28192	28197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833531
546	NC_021817	GTG	2	6	28238	28243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833531
547	NC_021817	TTCC	2	8	28300	28307	0 %	50 %	0 %	50 %	525833531
548	NC_021817	T	6	6	28363	28368	0 %	100 %	0 %	0 %	525833531
549	NC_021817	TGA	2	6	28440	28445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833531
550	NC_021817	C	6	6	28499	28504	0 %	0 %	0 %	100 %	525833531
551	NC_021817	GTT	2	6	28528	28533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833531
552	NC_021817	TGA	2	6	28593	28598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833531
553	NC_021817	CAT	2	6	28602	28607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
554	NC_021817	CGATAC	2	12	28620	28631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525833531
555	NC_021817	TCA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
556	NC_021817	GCC	2	6	28754	28759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833531
557	NC_021817	AGA	2	6	28786	28791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833531
558	NC_021817	GCA	2	6	28794	28799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833531
559	NC_021817	TCA	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833531
560	NC_021817	GCC	2	6	28832	28837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833531
561	NC_021817	CTT	2	6	28843	28848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833531
562	NC_021817	CTG	3	9	28921	28929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833531
563	NC_021817	GC	3	6	28934	28939	0 %	0 %	50 %	50 %	525833531
564	NC_021817	ATA	2	6	28942	28947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833531
565	NC_021817	GCTT	2	8	29079	29086	0 %	50 %	25 %	25 %	525833531
566	NC_021817	TGA	2	6	29088	29093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833531
567	NC_021817	T	6	6	29326	29331	0 %	100 %	0 %	0 %	525833531
568	NC_021817	GAA	2	6	29362	29367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833532
569	NC_021817	CCGG	2	8	29399	29406	0 %	0 %	50 %	50 %	525833532
570	NC_021817	CGGTGT	2	12	29525	29536	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525833532
571	NC_021817	GAC	2	6	29546	29551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833532
572	NC_021817	TGA	2	6	29567	29572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833532
573	NC_021817	GGT	2	6	29576	29581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833532
574	NC_021817	GTGTTT	2	12	29631	29642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833532
575	NC_021817	GTG	2	6	29676	29681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833532
576	NC_021817	CGG	2	6	29713	29718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833532
577	NC_021817	C	6	6	29736	29741	0 %	0 %	0 %	100 %	525833532
578	NC_021817	CCGC	2	8	29781	29788	0 %	0 %	25 %	75 %	525833532
579	NC_021817	GCC	2	6	29811	29816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833532
580	NC_021817	CAG	2	6	29918	29923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833532
581	NC_021817	CTGC	2	8	29928	29935	0 %	25 %	25 %	50 %	525833532
582	NC_021817	T	7	7	29950	29956	0 %	100 %	0 %	0 %	525833532
583	NC_021817	CTGG	2	8	29993	30000	0 %	25 %	50 %	25 %	525833533
584	NC_021817	CAG	2	6	30033	30038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833533
585	NC_021817	CATC	2	8	30084	30091	25 %	25 %	0 %	50 %	525833533
586	NC_021817	GCG	2	6	30099	30104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833533
587	NC_021817	TG	4	8	30146	30153	0 %	50 %	50 %	0 %	525833533
588	NC_021817	AAT	2	6	30174	30179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833533
589	NC_021817	GAT	2	6	30190	30195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833533
590	NC_021817	GGAT	2	8	30225	30232	25 %	25 %	50 %	0 %	525833533
591	NC_021817	AAC	2	6	30254	30259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833533
592	NC_021817	GGA	2	6	30333	30338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833533
593	NC_021817	TAA	2	6	30403	30408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833533
594	NC_021817	T	7	7	30446	30452	0 %	100 %	0 %	0 %	525833503
595	NC_021817	ACGC	2	8	30490	30497	25 %	0 %	25 %	50 %	525833503
596	NC_021817	TGT	2	6	30581	30586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833503
597	NC_021817	TCCTGC	2	12	30623	30634	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525833503
598	NC_021817	TGC	2	6	30674	30679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833503
599	NC_021817	ACTA	2	8	30721	30728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_021817	TGT	3	9	30739	30747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021817	TG	3	6	30772	30777	0 %	50 %	50 %	0 %	525833534
602	NC_021817	GTC	2	6	30790	30795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
603	NC_021817	GCT	2	6	30830	30835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
604	NC_021817	TGGCA	2	10	30858	30867	20 %	20 %	40 %	20 %	525833534
605	NC_021817	CG	4	8	30921	30928	0 %	0 %	50 %	50 %	525833534
606	NC_021817	CTT	2	6	30929	30934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
607	NC_021817	GGT	2	6	31007	31012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833534
608	NC_021817	GTA	2	6	31032	31037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833534
609	NC_021817	AG	3	6	31041	31046	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
610	NC_021817	ACC	2	6	31068	31073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833534
611	NC_021817	CCTG	2	8	31081	31088	0 %	25 %	25 %	50 %	525833534
612	NC_021817	GGA	2	6	31140	31145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833534
613	NC_021817	CAG	2	6	31200	31205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833534
614	NC_021817	TCT	2	6	31277	31282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
615	NC_021817	GTC	2	6	31290	31295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
616	NC_021817	ACGA	2	8	31326	31333	50 %	0 %	25 %	25 %	525833534
617	NC_021817	C	6	6	31355	31360	0 %	0 %	0 %	100 %	525833534
618	NC_021817	CCA	2	6	31496	31501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833534
619	NC_021817	GAA	2	6	31525	31530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833534
620	NC_021817	CAT	2	6	31590	31595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833534
621	NC_021817	TCA	2	6	31616	31621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833534
622	NC_021817	CCG	2	6	31642	31647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833534
623	NC_021817	CTG	2	6	31649	31654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
624	NC_021817	GA	3	6	31740	31745	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
625	NC_021817	TTC	2	6	31753	31758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
626	NC_021817	GCA	2	6	31778	31783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833534
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628	NC_021817	TCTG	2	8	31876	31883	0 %	50 %	25 %	25 %	525833534
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