MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021816	TCCTG	2	10	145	154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021816	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021816	GGC	2	6	240	245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021816	GCA	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021816	GACA	2	8	305	312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021816	AGC	3	9	339	347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832830
7	NC_021816	GCT	2	6	394	399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832830
8	NC_021816	CGA	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832830
9	NC_021816	GCC	2	6	434	439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832830
10	NC_021816	TG	3	6	441	446	0 %	50 %	50 %	0 %	525832830
11	NC_021816	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832830
12	NC_021816	GCG	2	6	646	651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021816	CTCA	2	8	663	670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021816	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021816	C	6	6	784	789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_021816	TG	3	6	1019	1024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021816	C	6	6	1031	1036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_021816	GCA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021816	GAT	2	6	1147	1152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021816	TAC	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021816	CTG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021816	TAGGT	2	10	1252	1261	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021816	TAAC	2	8	1275	1282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021816	ACC	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021816	T	6	6	1309	1314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021816	GGA	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021816	T	6	6	1412	1417	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
28	NC_021816	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	525832831
29	NC_021816	T	8	8	1460	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
30	NC_021816	A	6	6	1473	1478	100 %	0 %	0 %	0 %	525832831
31	NC_021816	AAAT	2	8	1496	1503	75 %	25 %	0 %	0 %	525832831
32	NC_021816	TCT	2	6	1516	1521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832831
33	NC_021816	TAT	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
34	NC_021816	AT	4	8	1565	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	525832831
35	NC_021816	GAT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832831
36	NC_021816	ATTTG	2	10	1619	1628	20 %	60 %	20 %	0 %	525832831
37	NC_021816	TAG	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832831
38	NC_021816	ATC	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832831
39	NC_021816	ACA	2	6	1743	1748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832831
40	NC_021816	TTTAT	2	10	1770	1779	20 %	80 %	0 %	0 %	525832831
41	NC_021816	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
42	NC_021816	TC	3	6	1873	1878	0 %	50 %	0 %	50 %	525832831
43	NC_021816	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832831
44	NC_021816	TTA	2	6	1989	1994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
45	NC_021816	TTG	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832831
46	NC_021816	TTC	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832831
47	NC_021816	AACA	2	8	2081	2088	75 %	0 %	0 %	25 %	525832831
48	NC_021816	CAG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832831
49	NC_021816	GGT	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832831
50	NC_021816	ATTTC	2	10	2163	2172	20 %	60 %	0 %	20 %	525832831
51	NC_021816	ACA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832831
52	NC_021816	AACC	2	8	2284	2291	50 %	0 %	0 %	50 %	525832831
53	NC_021816	TC	3	6	2302	2307	0 %	50 %	0 %	50 %	525832831
54	NC_021816	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832831
55	NC_021816	A	7	7	2393	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	525832831
56	NC_021816	TAT	3	9	2443	2451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
57	NC_021816	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
58	NC_021816	ATT	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
59	NC_021816	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
60	NC_021816	GA	3	6	2776	2781	50 %	0 %	50 %	0 %	525832831
61	NC_021816	AGA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832831
62	NC_021816	T	8	8	2892	2899	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
63	NC_021816	A	9	9	2972	2980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021816	A	7	7	2988	2994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021816	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021816	TCA	3	9	3090	3098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021816	CAC	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021816	AGGA	2	8	3211	3218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021816	T	6	6	3439	3444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021816	CTT	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021816	ATC	2	6	3484	3489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021816	GCC	2	6	3521	3526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021816	A	6	6	3530	3535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021816	CAG	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021816	TCT	3	9	3584	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.