MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 4291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021815	CCTTC	2	10	158585	158594	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3002	NC_021815	TTC	2	6	158668	158673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021815	TTC	2	6	158734	158739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_021815	ATCT	2	8	158850	158857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_021815	GCT	2	6	158888	158893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021815	ACA	2	6	158988	158993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_021815	ATT	2	6	159085	159090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021815	ACC	2	6	159112	159117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_021815	GTG	2	6	159128	159133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021815	ATA	2	6	159164	159169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021815	TTC	2	6	159397	159402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021815	GCA	2	6	159442	159447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_021815	ATC	2	6	159629	159634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832349
3014	NC_021815	AT	3	6	159693	159698	50 %	50 %	0 %	0 %	525832349
3015	NC_021815	T	6	6	159744	159749	0 %	100 %	0 %	0 %	525832349
3016	NC_021815	CAG	2	6	159823	159828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832349
3017	NC_021815	CCAT	2	8	159936	159943	25 %	25 %	0 %	50 %	525832349
3018	NC_021815	CGA	2	6	159956	159961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832349
3019	NC_021815	AG	3	6	160012	160017	50 %	0 %	50 %	0 %	525832349
3020	NC_021815	GCG	2	6	160050	160055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832349
3021	NC_021815	A	7	7	160069	160075	100 %	0 %	0 %	0 %	525832349
3022	NC_021815	TGA	2	6	160114	160119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832349
3023	NC_021815	TTA	2	6	160154	160159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832349
3024	NC_021815	ATT	2	6	160226	160231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832349
3025	NC_021815	GCT	2	6	160258	160263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832349
3026	NC_021815	AAC	2	6	160266	160271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832349
3027	NC_021815	TAT	2	6	160292	160297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832349
3028	NC_021815	TGA	2	6	160317	160322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832349
3029	NC_021815	CCA	2	6	160325	160330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832349
3030	NC_021815	GTT	2	6	160357	160362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832349
3031	NC_021815	TAC	2	6	160442	160447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832349
3032	NC_021815	CGG	2	6	160527	160532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832349
3033	NC_021815	GCT	2	6	160543	160548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832349
3034	NC_021815	GCG	2	6	160627	160632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832349
3035	NC_021815	TGG	2	6	160647	160652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832349
3036	NC_021815	ATC	2	6	160663	160668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832349
3037	NC_021815	TAA	2	6	160797	160802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3038	NC_021815	CAG	2	6	160815	160820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832350
3039	NC_021815	CAG	2	6	160830	160835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832350
3040	NC_021815	AAT	2	6	160902	160907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3041	NC_021815	CGAAA	2	10	160966	160975	60 %	0 %	20 %	20 %	525832350
3042	NC_021815	ATA	2	6	161053	161058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3043	NC_021815	TAAA	2	8	161106	161113	75 %	25 %	0 %	0 %	525832350
3044	NC_021815	CTT	2	6	161240	161245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832350
3045	NC_021815	ACGAGA	2	12	161267	161278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525832350
3046	NC_021815	AAT	2	6	161286	161291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3047	NC_021815	GTGC	2	8	161319	161326	0 %	25 %	50 %	25 %	525832350
3048	NC_021815	TGAA	2	8	161401	161408	50 %	25 %	25 %	0 %	525832350
3049	NC_021815	AAG	2	6	161419	161424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832350
3050	NC_021815	GAAA	2	8	161453	161460	75 %	0 %	25 %	0 %	525832350
3051	NC_021815	GCG	2	6	161467	161472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832350
3052	NC_021815	ATC	2	6	161509	161514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832350
3053	NC_021815	CAC	2	6	161547	161552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832350
3054	NC_021815	ATA	2	6	161576	161581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3055	NC_021815	CCG	2	6	161590	161595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832350
3056	NC_021815	ATA	2	6	161638	161643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3057	NC_021815	TA	3	6	161682	161687	50 %	50 %	0 %	0 %	525832350
3058	NC_021815	TAAA	2	8	161719	161726	75 %	25 %	0 %	0 %	525832350
3059	NC_021815	ATA	2	6	161800	161805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3060	NC_021815	GAT	2	6	161886	161891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832350
3061	NC_021815	TAA	2	6	161900	161905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
3062	NC_021815	GTC	2	6	162069	162074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832350
3063	NC_021815	GAT	2	6	162113	162118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021815	CAG	2	6	162173	162178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021815	GCT	2	6	162201	162206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832351
3066	NC_021815	AAT	2	6	162233	162238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832351
3067	NC_021815	GGA	2	6	162271	162276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832351
3068	NC_021815	GT	3	6	162326	162331	0 %	50 %	50 %	0 %	525832351
3069	NC_021815	GAG	2	6	162383	162388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832351
3070	NC_021815	ATC	2	6	162408	162413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832351
3071	NC_021815	GCC	2	6	162431	162436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
3072	NC_021815	TTC	2	6	162548	162553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832351
3073	NC_021815	ATT	2	6	162578	162583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832351
3074	NC_021815	CGC	2	6	162619	162624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
3075	NC_021815	GCC	2	6	162659	162664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
3076	NC_021815	CAA	2	6	162682	162687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832351
3077	NC_021815	TGA	2	6	162700	162705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832351
3078	NC_021815	AAT	2	6	162719	162724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832351
3079	NC_021815	GCT	2	6	162805	162810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832351
3080	NC_021815	TAT	2	6	162832	162837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832351
3081	NC_021815	CCA	2	6	162838	162843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832351
3082	NC_021815	TAA	2	6	162845	162850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832351
3083	NC_021815	CGC	3	9	162872	162880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
3084	NC_021815	ACT	2	6	162933	162938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832351
3085	NC_021815	CGA	2	6	162988	162993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832351
3086	NC_021815	TG	3	6	163024	163029	0 %	50 %	50 %	0 %	525832351
3087	NC_021815	GTT	2	6	163107	163112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832351
3088	NC_021815	T	6	6	163175	163180	0 %	100 %	0 %	0 %	525832351
3089	NC_021815	GCGG	2	8	163247	163254	0 %	0 %	75 %	25 %	525832351
3090	NC_021815	GC	3	6	163312	163317	0 %	0 %	50 %	50 %	525832351
3091	NC_021815	TTG	2	6	163437	163442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021815	AT	3	6	163462	163467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021815	CAA	2	6	163521	163526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_021815	A	6	6	163547	163552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021815	TG	3	6	163578	163583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021815	TTTTTC	2	12	163593	163604	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3097	NC_021815	ATG	2	6	163681	163686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832540
3098	NC_021815	AT	3	6	163790	163795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021815	TAA	2	6	163887	163892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021815	AAC	2	6	163921	163926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021815	CT	3	6	163927	163932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_021815	GAAA	2	8	163972	163979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021815	ATG	2	6	163994	163999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021815	CAG	2	6	164027	164032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_021815	TGG	2	6	164070	164075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021815	GCTTT	2	10	164082	164091	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_021815	A	6	6	164093	164098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021815	AT	3	6	164104	164109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021815	AGA	2	6	164151	164156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021815	GT	3	6	164171	164176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021815	ATT	2	6	164299	164304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021815	GTG	2	6	164312	164317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021815	TGG	2	6	164334	164339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021815	CCTG	2	8	164401	164408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_021815	ATA	2	6	164414	164419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021815	CA	3	6	164453	164458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_021815	TAA	2	6	164530	164535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021815	GTT	2	6	164577	164582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021815	A	6	6	164588	164593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_021815	ATT	2	6	164657	164662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021815	AGG	2	6	164707	164712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021815	GAA	2	6	164794	164799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021815	AAT	2	6	164827	164832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021815	TGAAAA	2	12	164833	164844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021815	GGT	2	6	164871	164876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021815	AAC	2	6	164913	164918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_021815	CAA	2	6	164934	164939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_021815	TCT	2	6	164963	164968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_021815	TTG	2	6	164980	164985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021815	AAC	2	6	165011	165016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_021815	AGG	2	6	165020	165025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_021815	CCT	2	6	170696	170701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832543
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3252	NC_021815	CGG	2	6	170742	170747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832543
3253	NC_021815	CTG	2	6	170790	170795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832543
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3360	NC_021815	GCCAT	2	10	175813	175822	20 %	20 %	20 %	40 %	525832544
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3370	NC_021815	GC	3	6	176206	176211	0 %	0 %	50 %	50 %	525832544
3371	NC_021815	GGC	2	6	176219	176224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
3372	NC_021815	CGTC	2	8	176250	176257	0 %	25 %	25 %	50 %	525832544
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3374	NC_021815	CGG	2	6	176314	176319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
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3379	NC_021815	CG	3	6	176464	176469	0 %	0 %	50 %	50 %	525832544
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3469	NC_021815	AG	3	6	180599	180604	50 %	0 %	50 %	0 %	525832544
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3472	NC_021815	CGCGG	2	10	180737	180746	0 %	0 %	60 %	40 %	525832544
3473	NC_021815	GGTA	2	8	180835	180842	25 %	25 %	50 %	0 %	525832544
3474	NC_021815	GCT	2	6	180943	180948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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3477	NC_021815	CAG	2	6	181127	181132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
3478	NC_021815	CGAT	2	8	181225	181232	25 %	25 %	25 %	25 %	525832544
3479	NC_021815	CTG	2	6	181246	181251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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3483	NC_021815	TGTTT	2	10	181407	181416	0 %	80 %	20 %	0 %	525832545
3484	NC_021815	GAC	2	6	181427	181432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
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3488	NC_021815	CCG	2	6	181645	181650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3489	NC_021815	TG	3	6	181654	181659	0 %	50 %	50 %	0 %	525832545
3490	NC_021815	CG	3	6	181681	181686	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3491	NC_021815	GCG	2	6	181734	181739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3492	NC_021815	GCG	2	6	181836	181841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3493	NC_021815	GCG	2	6	181906	181911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3494	NC_021815	GC	3	6	181981	181986	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3495	NC_021815	GAC	2	6	181994	181999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3496	NC_021815	GGT	2	6	182071	182076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832545
3497	NC_021815	GCT	2	6	182095	182100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3498	NC_021815	GC	3	6	182110	182115	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3499	NC_021815	CAGC	2	8	182120	182127	25 %	0 %	25 %	50 %	525832545
3500	NC_021815	CAG	2	6	182147	182152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545

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