MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22230	NC_021814	TGA	2	6	1057560	1057565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837565
22231	NC_021814	GCGCTG	2	12	1057588	1057599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525837565
22232	NC_021814	AGC	2	6	1057670	1057675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837566
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22351	NC_021814	GGCG	2	8	1063420	1063427	0 %	0 %	75 %	25 %	525837569
22352	NC_021814	ATC	2	6	1063430	1063435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837569
22353	NC_021814	CAC	2	6	1063519	1063524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837569
22354	NC_021814	CTGG	2	8	1063540	1063547	0 %	25 %	50 %	25 %	525837569
22355	NC_021814	GAC	2	6	1063588	1063593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22356	NC_021814	CAG	2	6	1063618	1063623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22357	NC_021814	CCAG	2	8	1063626	1063633	25 %	0 %	25 %	50 %	525837569
22358	NC_021814	GAC	2	6	1063657	1063662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22359	NC_021814	CTG	2	6	1063669	1063674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22360	NC_021814	CAG	2	6	1063711	1063716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22361	NC_021814	CGA	2	6	1063842	1063847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22362	NC_021814	GGT	2	6	1063915	1063920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837569
22363	NC_021814	GCC	2	6	1064128	1064133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837569
22364	NC_021814	AACATA	2	12	1064141	1064152	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525837569
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22369	NC_021814	GAC	2	6	1064383	1064388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837569
22370	NC_021814	A	6	6	1064419	1064424	100 %	0 %	0 %	0 %	525837569
22371	NC_021814	GAT	2	6	1064425	1064430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837569
22372	NC_021814	GACA	2	8	1064482	1064489	50 %	0 %	25 %	25 %	525837569
22373	NC_021814	GCAAA	2	10	1064508	1064517	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22374	NC_021814	GAA	2	6	1064532	1064537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22375	NC_021814	A	6	6	1064573	1064578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22376	NC_021814	CGC	2	6	1064680	1064685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22377	NC_021814	CTG	4	12	1064711	1064722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837570
22378	NC_021814	GC	3	6	1064773	1064778	0 %	0 %	50 %	50 %	525837570
22379	NC_021814	GGT	2	6	1064867	1064872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837570
22380	NC_021814	CGT	2	6	1064971	1064976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837570
22381	NC_021814	ATC	2	6	1064994	1064999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837570
22382	NC_021814	GCT	2	6	1065160	1065165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837570
22383	NC_021814	CGTAAA	2	12	1065199	1065210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525837570
22384	NC_021814	AGA	2	6	1065239	1065244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837570
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22387	NC_021814	GGT	2	6	1065305	1065310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837570
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22390	NC_021814	CAC	2	6	1065464	1065469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837570
22391	NC_021814	CGA	2	6	1065478	1065483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837570
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22394	NC_021814	TCG	2	6	1065615	1065620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837570
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22399	NC_021814	ACG	2	6	1065698	1065703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837570
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22403	NC_021814	GCC	2	6	1065932	1065937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837570
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22418	NC_021814	GTG	2	6	1066689	1066694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837570
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22431	NC_021814	TCAG	2	8	1067290	1067297	25 %	25 %	25 %	25 %	525837571
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22437	NC_021814	TTC	2	6	1067652	1067657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837571
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22442	NC_021814	TCA	2	6	1068049	1068054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837571
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22445	NC_021814	A	7	7	1068159	1068165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22446	NC_021814	CAT	2	6	1068218	1068223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22447	NC_021814	T	7	7	1068233	1068239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22448	NC_021814	ATG	2	6	1068244	1068249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22449	NC_021814	GAA	2	6	1068250	1068255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22450	NC_021814	GAC	2	6	1068318	1068323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22451	NC_021814	GTT	3	9	1068418	1068426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22452	NC_021814	T	6	6	1068436	1068441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22453	NC_021814	T	7	7	1068500	1068506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22454	NC_021814	GCA	2	6	1068524	1068529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22455	NC_021814	TCG	2	6	1068574	1068579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840660
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22458	NC_021814	GCC	2	6	1068764	1068769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840660
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22462	NC_021814	GAT	2	6	1068915	1068920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840660
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22464	NC_021814	CTT	2	6	1068968	1068973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22465	NC_021814	T	7	7	1068972	1068978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22466	NC_021814	ATG	2	6	1069057	1069062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837572
22467	NC_021814	CCA	2	6	1069076	1069081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837572
22468	NC_021814	ACAA	2	8	1069104	1069111	75 %	0 %	0 %	25 %	525837572
22469	NC_021814	CAT	2	6	1069191	1069196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837572
22470	NC_021814	CGA	2	6	1069263	1069268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837572
22471	NC_021814	CGC	2	6	1069296	1069301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837572
22472	NC_021814	GC	3	6	1069309	1069314	0 %	0 %	50 %	50 %	525837572
22473	NC_021814	AC	3	6	1069378	1069383	50 %	0 %	0 %	50 %	525837572
22474	NC_021814	TGCC	2	8	1069443	1069450	0 %	25 %	25 %	50 %	525837572
22475	NC_021814	ACC	2	6	1069460	1069465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837572
22476	NC_021814	ATCA	2	8	1069480	1069487	50 %	25 %	0 %	25 %	525837572
22477	NC_021814	GAG	2	6	1069502	1069507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837572
22478	NC_021814	TGGA	2	8	1069542	1069549	25 %	25 %	50 %	0 %	525837573
22479	NC_021814	GTTG	2	8	1069552	1069559	0 %	50 %	50 %	0 %	525837573
22480	NC_021814	CG	3	6	1069580	1069585	0 %	0 %	50 %	50 %	525837573
22481	NC_021814	ATG	2	6	1069620	1069625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837573
22482	NC_021814	CG	3	6	1069849	1069854	0 %	0 %	50 %	50 %	525837573
22483	NC_021814	GC	3	6	1069856	1069861	0 %	0 %	50 %	50 %	525837573
22484	NC_021814	CCG	2	6	1069902	1069907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837573
22485	NC_021814	TGGCC	2	10	1069966	1069975	0 %	20 %	40 %	40 %	525837573
22486	NC_021814	CGT	2	6	1069987	1069992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837573
22487	NC_021814	AGA	2	6	1069996	1070001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837573
22488	NC_021814	GCTG	2	8	1070026	1070033	0 %	25 %	50 %	25 %	525837573
22489	NC_021814	GCCG	2	8	1070062	1070069	0 %	0 %	50 %	50 %	525837573
22490	NC_021814	CGC	2	6	1070073	1070078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837573
22491	NC_021814	AAC	2	6	1070133	1070138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837573
22492	NC_021814	TGG	2	6	1070151	1070156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837573
22493	NC_021814	AAGA	2	8	1070161	1070168	75 %	0 %	25 %	0 %	525837573
22494	NC_021814	TCT	2	6	1070225	1070230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22495	NC_021814	TGT	2	6	1070246	1070251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837574
22496	NC_021814	TC	3	6	1070273	1070278	0 %	50 %	0 %	50 %	525837574
22497	NC_021814	CGT	2	6	1070294	1070299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837574
22498	NC_021814	GTT	2	6	1070300	1070305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837574
22499	NC_021814	TTG	2	6	1070350	1070355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837574
22500	NC_021814	CGC	2	6	1070429	1070434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837574

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