MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021814	CTG	2	6	1023275	1023280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837531
21502	NC_021814	GTACC	2	10	1023289	1023298	20 %	20 %	20 %	40 %	525837531
21503	NC_021814	GC	3	6	1023332	1023337	0 %	0 %	50 %	50 %	525837531
21504	NC_021814	GC	3	6	1023373	1023378	0 %	0 %	50 %	50 %	525837531
21505	NC_021814	CGGA	2	8	1023413	1023420	25 %	0 %	50 %	25 %	525837531
21506	NC_021814	GTT	2	6	1023483	1023488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837531
21507	NC_021814	GGC	2	6	1023495	1023500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837531
21508	NC_021814	TCA	2	6	1023635	1023640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837531
21509	NC_021814	TTAA	2	8	1023707	1023714	50 %	50 %	0 %	0 %	525837531
21510	NC_021814	AGA	2	6	1023742	1023747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837532
21511	NC_021814	CGA	2	6	1023809	1023814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837532
21512	NC_021814	TGA	2	6	1023881	1023886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837532
21513	NC_021814	CGC	2	6	1023958	1023963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837532
21514	NC_021814	GCC	2	6	1024048	1024053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21515	NC_021814	TGAC	2	8	1024063	1024070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21516	NC_021814	CGC	2	6	1024131	1024136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21517	NC_021814	GCC	2	6	1024180	1024185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21518	NC_021814	CG	3	6	1024220	1024225	0 %	0 %	50 %	50 %	525837533
21519	NC_021814	GC	3	6	1024232	1024237	0 %	0 %	50 %	50 %	525837533
21520	NC_021814	ATAA	2	8	1024243	1024250	75 %	25 %	0 %	0 %	525837533
21521	NC_021814	CAGGCG	2	12	1024262	1024273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525837533
21522	NC_021814	CCG	2	6	1024274	1024279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21523	NC_021814	TAT	2	6	1024286	1024291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837533
21524	NC_021814	CCA	2	6	1024343	1024348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837533
21525	NC_021814	ACGC	2	8	1024374	1024381	25 %	0 %	25 %	50 %	525837533
21526	NC_021814	TCT	2	6	1024474	1024479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837533
21527	NC_021814	TGC	2	6	1024531	1024536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21528	NC_021814	GCG	2	6	1024553	1024558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837533
21529	NC_021814	CGT	2	6	1024568	1024573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21530	NC_021814	GA	3	6	1024597	1024602	50 %	0 %	50 %	0 %	525837533
21531	NC_021814	GTG	2	6	1024609	1024614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837533
21532	NC_021814	TGAC	2	8	1024621	1024628	25 %	25 %	25 %	25 %	525837533
21533	NC_021814	C	6	6	1024632	1024637	0 %	0 %	0 %	100 %	525837533
21534	NC_021814	ACG	2	6	1024702	1024707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21535	NC_021814	TGGC	2	8	1024714	1024721	0 %	25 %	50 %	25 %	525837533
21536	NC_021814	CAGC	2	8	1024857	1024864	25 %	0 %	25 %	50 %	525837533
21537	NC_021814	TCC	2	6	1024884	1024889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837533
21538	NC_021814	GTC	2	6	1024897	1024902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21539	NC_021814	CGG	2	6	1024952	1024957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837533
21540	NC_021814	CTG	2	6	1024989	1024994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21541	NC_021814	CATCC	2	10	1025003	1025012	20 %	20 %	0 %	60 %	525837533
21542	NC_021814	CGC	2	6	1025024	1025029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21543	NC_021814	GGGCA	2	10	1025052	1025061	20 %	0 %	60 %	20 %	525837533
21544	NC_021814	GGC	2	6	1025112	1025117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837533
21545	NC_021814	GC	3	6	1025144	1025149	0 %	0 %	50 %	50 %	525837533
21546	NC_021814	GGGC	2	8	1025174	1025181	0 %	0 %	75 %	25 %	525837533
21547	NC_021814	ATC	2	6	1025184	1025189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837533
21548	NC_021814	GC	3	6	1025243	1025248	0 %	0 %	50 %	50 %	525837533
21549	NC_021814	GCC	3	9	1025256	1025264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21550	NC_021814	GTT	2	6	1025336	1025341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837533
21551	NC_021814	GACG	2	8	1025423	1025430	25 %	0 %	50 %	25 %	525837533
21552	NC_021814	CCG	2	6	1025435	1025440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21553	NC_021814	GGTC	2	8	1025588	1025595	0 %	25 %	50 %	25 %	525837533
21554	NC_021814	AGCGGC	2	12	1025671	1025682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525837533
21555	NC_021814	GCT	2	6	1025696	1025701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21556	NC_021814	GCGCCA	2	12	1025735	1025746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837533
21557	NC_021814	TCG	2	6	1025749	1025754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837533
21558	NC_021814	CG	3	6	1025753	1025758	0 %	0 %	50 %	50 %	525837533
21559	NC_021814	TGA	2	6	1025780	1025785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837533
21560	NC_021814	AAT	2	6	1025896	1025901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837533
21561	NC_021814	GCC	2	6	1025940	1025945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837533
21562	NC_021814	CAT	2	6	1025996	1026001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837533
21563	NC_021814	TG	3	6	1026116	1026121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21564	NC_021814	TGAA	2	8	1026231	1026238	50 %	25 %	25 %	0 %	525837534
21565	NC_021814	TAA	2	6	1026281	1026286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837534
21566	NC_021814	CAG	2	6	1026288	1026293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837534
21567	NC_021814	TC	3	6	1026337	1026342	0 %	50 %	0 %	50 %	525837534
21568	NC_021814	GCAG	2	8	1026473	1026480	25 %	0 %	50 %	25 %	525837534
21569	NC_021814	CGG	3	9	1026548	1026556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837534
21570	NC_021814	GCCT	2	8	1026663	1026670	0 %	25 %	25 %	50 %	525837534
21571	NC_021814	ACT	2	6	1026700	1026705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837534
21572	NC_021814	GGC	3	9	1026795	1026803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837534
21573	NC_021814	CCA	2	6	1026856	1026861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837534
21574	NC_021814	ATG	2	6	1026898	1026903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837534
21575	NC_021814	GTT	2	6	1026945	1026950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837534
21576	NC_021814	GC	3	6	1026975	1026980	0 %	0 %	50 %	50 %	525837534
21577	NC_021814	GC	3	6	1026982	1026987	0 %	0 %	50 %	50 %	525837534
21578	NC_021814	TCG	2	6	1027003	1027008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837534
21579	NC_021814	TGCA	2	8	1027071	1027078	25 %	25 %	25 %	25 %	525837534
21580	NC_021814	CT	3	6	1027268	1027273	0 %	50 %	0 %	50 %	525837534
21581	NC_021814	GGC	2	6	1027410	1027415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837534
21582	NC_021814	GTA	2	6	1027465	1027470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21583	NC_021814	CAA	2	6	1027472	1027477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21584	NC_021814	T	6	6	1027503	1027508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21585	NC_021814	AAC	2	6	1027518	1027523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21586	NC_021814	TA	3	6	1027539	1027544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21587	NC_021814	TG	3	6	1027588	1027593	0 %	50 %	50 %	0 %	525837535
21588	NC_021814	TTTTTG	2	12	1027619	1027630	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525837535
21589	NC_021814	TA	4	8	1027686	1027693	50 %	50 %	0 %	0 %	525837535
21590	NC_021814	GCC	2	6	1027717	1027722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837535
21591	NC_021814	TATT	2	8	1027728	1027735	25 %	75 %	0 %	0 %	525837535
21592	NC_021814	T	6	6	1027876	1027881	0 %	100 %	0 %	0 %	525837535
21593	NC_021814	GGA	2	6	1027932	1027937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837535
21594	NC_021814	CAG	2	6	1027965	1027970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837535
21595	NC_021814	TAT	3	9	1028004	1028012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837535
21596	NC_021814	TGTT	2	8	1028075	1028082	0 %	75 %	25 %	0 %	525837535
21597	NC_021814	T	6	6	1028081	1028086	0 %	100 %	0 %	0 %	525837535
21598	NC_021814	GTT	2	6	1028101	1028106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837535
21599	NC_021814	ATA	2	6	1028137	1028142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837535
21600	NC_021814	AAT	2	6	1028155	1028160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837535
21601	NC_021814	GTT	2	6	1028167	1028172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837535
21602	NC_021814	T	6	6	1028265	1028270	0 %	100 %	0 %	0 %	525837536
21603	NC_021814	CTT	2	6	1028275	1028280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837536
21604	NC_021814	CCG	2	6	1028471	1028476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837536
21605	NC_021814	CATA	2	8	1028538	1028545	50 %	25 %	0 %	25 %	525837536
21606	NC_021814	AAT	2	6	1028547	1028552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837536
21607	NC_021814	AACGT	2	10	1028620	1028629	40 %	20 %	20 %	20 %	525837536
21608	NC_021814	GGT	2	6	1028641	1028646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837536
21609	NC_021814	GTC	2	6	1028647	1028652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837536
21610	NC_021814	TCGT	2	8	1028666	1028673	0 %	50 %	25 %	25 %	525837536
21611	NC_021814	CGT	2	6	1028677	1028682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837536
21612	NC_021814	TGA	2	6	1028726	1028731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837536
21613	NC_021814	TTC	2	6	1028791	1028796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840654
21614	NC_021814	GGCC	2	8	1028837	1028844	0 %	0 %	50 %	50 %	525840654
21615	NC_021814	GTT	2	6	1028855	1028860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840654
21616	NC_021814	AAT	2	6	1028934	1028939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840654
21617	NC_021814	CG	3	6	1028954	1028959	0 %	0 %	50 %	50 %	525840654
21618	NC_021814	CTT	2	6	1028995	1029000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840654
21619	NC_021814	CCGC	2	8	1029049	1029056	0 %	0 %	25 %	75 %	525840654
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