MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_021814	TTTG	2	8	998640	998647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_021814	AAGT	2	8	998671	998678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_021814	T	6	6	998696	998701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21004	NC_021814	GAA	2	6	998736	998741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21005	NC_021814	CCA	2	6	998768	998773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21006	NC_021814	ATCG	2	8	998863	998870	25 %	25 %	25 %	25 %	525837512
21007	NC_021814	ATT	2	6	998938	998943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837512
21008	NC_021814	TTG	2	6	998987	998992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837512
21009	NC_021814	CGC	2	6	999064	999069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837512
21010	NC_021814	ATG	2	6	999098	999103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837512
21011	NC_021814	TTC	2	6	999295	999300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837512
21012	NC_021814	GC	3	6	999312	999317	0 %	0 %	50 %	50 %	525837512
21013	NC_021814	CCGAAA	2	12	999334	999345	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525837512
21014	NC_021814	ATG	2	6	999346	999351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837512
21015	NC_021814	T	6	6	999400	999405	0 %	100 %	0 %	0 %	525837512
21016	NC_021814	ATG	2	6	999434	999439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837512
21017	NC_021814	ACG	2	6	999479	999484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837512
21018	NC_021814	CCAT	2	8	999496	999503	25 %	25 %	0 %	50 %	525837512
21019	NC_021814	TGG	2	6	999593	999598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837512
21020	NC_021814	GC	3	6	999617	999622	0 %	0 %	50 %	50 %	525837512
21021	NC_021814	GC	3	6	999625	999630	0 %	0 %	50 %	50 %	525837512
21022	NC_021814	GGC	2	6	999675	999680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837512
21023	NC_021814	CGC	2	6	999684	999689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837512
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21025	NC_021814	TGCG	2	8	999709	999716	0 %	25 %	50 %	25 %	525837512
21026	NC_021814	CGT	2	6	999739	999744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837512
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21029	NC_021814	CTG	2	6	999874	999879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837512
21030	NC_021814	TGC	2	6	1000022	1000027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837512
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21032	NC_021814	AAATG	2	10	1000157	1000166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21033	NC_021814	TC	3	6	1000193	1000198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21034	NC_021814	ACTTAC	2	12	1000225	1000236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21035	NC_021814	AG	3	6	1000245	1000250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21036	NC_021814	ATA	2	6	1000261	1000266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21037	NC_021814	ATT	2	6	1000278	1000283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21038	NC_021814	TGA	2	6	1000442	1000447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21039	NC_021814	CGC	2	6	1000463	1000468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21040	NC_021814	A	6	6	1000478	1000483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21041	NC_021814	GC	3	6	1000662	1000667	0 %	0 %	50 %	50 %	525837513
21042	NC_021814	AAT	2	6	1000682	1000687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837513
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21046	NC_021814	T	7	7	1000937	1000943	0 %	100 %	0 %	0 %	525837513
21047	NC_021814	GC	3	6	1000945	1000950	0 %	0 %	50 %	50 %	525837513
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21053	NC_021814	AG	3	6	1001253	1001258	50 %	0 %	50 %	0 %	525837513
21054	NC_021814	TTC	2	6	1001288	1001293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837513
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21056	NC_021814	CG	3	6	1001480	1001485	0 %	0 %	50 %	50 %	525837513
21057	NC_021814	AAT	2	6	1001533	1001538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_021814	AGA	2	6	1001546	1001551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21059	NC_021814	CAT	2	6	1001585	1001590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21060	NC_021814	ACTT	2	8	1001620	1001627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21061	NC_021814	TCA	2	6	1001636	1001641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21062	NC_021814	CAT	2	6	1001674	1001679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21063	NC_021814	CAGG	2	8	1001746	1001753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21064	NC_021814	ACC	2	6	1001761	1001766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840651
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21067	NC_021814	A	7	7	1001908	1001914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21069	NC_021814	TAT	2	6	1002023	1002028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21070	NC_021814	GAT	2	6	1002030	1002035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837514
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21073	NC_021814	ATT	2	6	1002204	1002209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837514
21074	NC_021814	ATT	2	6	1002238	1002243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837514
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21079	NC_021814	TA	3	6	1002479	1002484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21080	NC_021814	ATAG	2	8	1002497	1002504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21093	NC_021814	CAGC	2	8	1002993	1003000	25 %	0 %	25 %	50 %	525837515
21094	NC_021814	CGC	2	6	1003023	1003028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837515
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21108	NC_021814	CGA	2	6	1003495	1003500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837515
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21117	NC_021814	GTG	2	6	1004091	1004096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21118	NC_021814	ATT	2	6	1004105	1004110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21307	NC_021814	CTTT	2	8	1014416	1014423	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21311	NC_021814	T	7	7	1014488	1014494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21353	NC_021814	ACTGG	2	10	1016583	1016592	20 %	20 %	40 %	20 %	525840653
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21463	NC_021814	TCA	2	6	1021868	1021873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837529
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21475	NC_021814	GCT	3	9	1022392	1022400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837530
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