MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021814	CTGC	2	8	905274	905281	0 %	25 %	25 %	50 %	525837434
19003	NC_021814	ATC	2	6	905313	905318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837434
19004	NC_021814	GGT	2	6	905435	905440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837434
19005	NC_021814	CGC	2	6	905494	905499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837434
19006	NC_021814	TGG	2	6	905572	905577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837434
19007	NC_021814	A	6	6	905595	905600	100 %	0 %	0 %	0 %	525837434
19008	NC_021814	CGA	2	6	905653	905658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837434
19009	NC_021814	TTC	2	6	905670	905675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837434
19010	NC_021814	ACC	2	6	905691	905696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837434
19011	NC_021814	CGG	2	6	905753	905758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837434
19012	NC_021814	GGC	3	9	905801	905809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837434
19013	NC_021814	GCG	2	6	905839	905844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837434
19014	NC_021814	GCT	2	6	905849	905854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837434
19015	NC_021814	ATCGA	2	10	905895	905904	40 %	20 %	20 %	20 %	525837434
19016	NC_021814	ACA	2	6	905914	905919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837434
19017	NC_021814	ATC	2	6	905955	905960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837434
19018	NC_021814	GCG	2	6	905968	905973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837434
19019	NC_021814	TCG	2	6	906025	906030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837434
19020	NC_021814	GCCTGA	2	12	906037	906048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525837434
19021	NC_021814	GAA	2	6	906078	906083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837434
19022	NC_021814	ATG	2	6	906100	906105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837434
19023	NC_021814	TGC	2	6	906144	906149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19024	NC_021814	AC	3	6	906224	906229	50 %	0 %	0 %	50 %	525837435
19025	NC_021814	CT	3	6	906238	906243	0 %	50 %	0 %	50 %	525837435
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19028	NC_021814	AT	3	6	906351	906356	50 %	50 %	0 %	0 %	525837435
19029	NC_021814	CGC	2	6	906402	906407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837435
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19031	NC_021814	GT	3	6	906534	906539	0 %	50 %	50 %	0 %	525837435
19032	NC_021814	GC	3	6	906747	906752	0 %	0 %	50 %	50 %	525837435
19033	NC_021814	CGC	2	6	906924	906929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19034	NC_021814	CGG	2	6	906932	906937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19035	NC_021814	GC	3	6	906990	906995	0 %	0 %	50 %	50 %	525837436
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19041	NC_021814	CGG	2	6	907187	907192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837436
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19046	NC_021814	GGCGCT	2	12	907446	907457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525837437
19047	NC_021814	GTC	2	6	907484	907489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837437
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19052	NC_021814	GCA	2	6	907676	907681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837437
19053	NC_021814	CGT	2	6	907727	907732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837437
19054	NC_021814	GC	3	6	907824	907829	0 %	0 %	50 %	50 %	525837437
19055	NC_021814	CAG	2	6	907920	907925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837437
19056	NC_021814	GC	4	8	907969	907976	0 %	0 %	50 %	50 %	525837437
19057	NC_021814	CGG	2	6	907994	907999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837437
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19061	NC_021814	GGCG	2	8	908092	908099	0 %	0 %	75 %	25 %	525837437
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19068	NC_021814	AGCT	2	8	908418	908425	25 %	25 %	25 %	25 %	525837437
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19109	NC_021814	TGA	2	6	910153	910158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_021814	T	8	8	910184	910191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_021814	GCT	2	6	910243	910248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19115	NC_021814	TGA	2	6	910588	910593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840640
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19118	NC_021814	TCAA	2	8	910763	910770	50 %	25 %	0 %	25 %	525837439
19119	NC_021814	CA	3	6	910842	910847	50 %	0 %	0 %	50 %	525837439
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19121	NC_021814	T	6	6	910957	910962	0 %	100 %	0 %	0 %	525837439
19122	NC_021814	TCA	2	6	911161	911166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837440
19123	NC_021814	TGT	2	6	911167	911172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837440
19124	NC_021814	GAC	2	6	911181	911186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837440
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19126	NC_021814	TGCG	2	8	911323	911330	0 %	25 %	50 %	25 %	525837440
19127	NC_021814	TTCAT	2	10	911350	911359	20 %	60 %	0 %	20 %	525837440
19128	NC_021814	CGGG	2	8	911445	911452	0 %	0 %	75 %	25 %	525837440
19129	NC_021814	TCA	2	6	911471	911476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837440
19130	NC_021814	CAG	2	6	911481	911486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837440
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19132	NC_021814	ACA	2	6	911552	911557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837440
19133	NC_021814	ATA	2	6	911560	911565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837440
19134	NC_021814	CTG	2	6	911623	911628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837440
19135	NC_021814	TGA	2	6	911700	911705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837440
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19137	NC_021814	ACA	2	6	911774	911779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19138	NC_021814	GCTT	2	8	911798	911805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19139	NC_021814	GATG	2	8	911895	911902	25 %	25 %	50 %	0 %	525837441
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19142	NC_021814	TGA	3	9	912038	912046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837441
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19144	NC_021814	TAC	2	6	912175	912180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837441
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19146	NC_021814	GTC	2	6	912305	912310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837441
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19151	NC_021814	GCG	2	6	912487	912492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837441
19152	NC_021814	CG	3	6	912491	912496	0 %	0 %	50 %	50 %	525837441
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19181	NC_021814	GCA	2	6	913692	913697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837442
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19222	NC_021814	CGA	2	6	915524	915529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837444
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19228	NC_021814	CGCC	2	8	915847	915854	0 %	0 %	25 %	75 %	525837445
19229	NC_021814	GCT	2	6	915887	915892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837445
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19233	NC_021814	CTG	2	6	915996	916001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837445
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19236	NC_021814	CT	3	6	916111	916116	0 %	50 %	0 %	50 %	525837445
19237	NC_021814	GCT	2	6	916133	916138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837445
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19363	NC_021814	CG	4	8	921226	921233	0 %	0 %	50 %	50 %	525837448
19364	NC_021814	AACA	2	8	921251	921258	75 %	0 %	0 %	25 %	525837448
19365	NC_021814	GC	3	6	921260	921265	0 %	0 %	50 %	50 %	525837448
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19487	NC_021814	GCG	2	6	928147	928152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837450
19488	NC_021814	GCG	3	9	928157	928165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837450
19489	NC_021814	TCA	2	6	928175	928180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837450
19490	NC_021814	TGG	2	6	928223	928228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837450
19491	NC_021814	ATC	2	6	928351	928356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837450
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19494	NC_021814	TTA	2	6	928405	928410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837450
19495	NC_021814	TGA	2	6	928444	928449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837450
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19499	NC_021814	ATGGG	2	10	928645	928654	20 %	20 %	60 %	0 %	525837450
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