MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021814	CTG	2	6	837531	837536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837403
17503	NC_021814	GCG	2	6	837549	837554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837403
17504	NC_021814	CGG	2	6	837737	837742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837403
17505	NC_021814	T	6	6	837783	837788	0 %	100 %	0 %	0 %	525837403
17506	NC_021814	CAA	2	6	837869	837874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837403
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17509	NC_021814	TGG	2	6	837943	837948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837403
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17512	NC_021814	GCGAAC	2	12	838051	838062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837403
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17514	NC_021814	GC	3	6	838086	838091	0 %	0 %	50 %	50 %	525837403
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17520	NC_021814	GC	3	6	838366	838371	0 %	0 %	50 %	50 %	525837403
17521	NC_021814	CGC	2	6	838382	838387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837403
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17543	NC_021814	CGG	2	6	839347	839352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_021814	TAA	2	6	839362	839367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_021814	GC	3	6	839424	839429	0 %	0 %	50 %	50 %	525837406
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17553	NC_021814	CTG	2	6	839775	839780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837406
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17556	NC_021814	TGCC	2	8	839945	839952	0 %	25 %	25 %	50 %	525837406
17557	NC_021814	CGG	2	6	839981	839986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837406
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17592	NC_021814	CCT	2	6	841576	841581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17593	NC_021814	TCTG	2	8	841636	841643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17594	NC_021814	AAG	2	6	841669	841674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17595	NC_021814	GCA	2	6	841731	841736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17597	NC_021814	ATA	2	6	841853	841858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17599	NC_021814	CTG	2	6	841963	841968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17601	NC_021814	T	7	7	842017	842023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_021814	CAT	2	6	842106	842111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17605	NC_021814	GTT	2	6	842191	842196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837408
17606	NC_021814	CATT	2	8	842197	842204	25 %	50 %	0 %	25 %	525837408
17607	NC_021814	T	6	6	842203	842208	0 %	100 %	0 %	0 %	525837408
17608	NC_021814	ATA	2	6	842274	842279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837408
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17610	NC_021814	GCCA	2	8	842310	842317	25 %	0 %	25 %	50 %	525837408
17611	NC_021814	TCAATA	2	12	842466	842477	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525837408
17612	NC_021814	TCA	2	6	842514	842519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837408
17613	NC_021814	GAAT	2	8	842529	842536	50 %	25 %	25 %	0 %	525837408
17614	NC_021814	GAC	2	6	842692	842697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837408
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17616	NC_021814	AATTA	2	10	842759	842768	60 %	40 %	0 %	0 %	525837408
17617	NC_021814	GTGA	2	8	842769	842776	25 %	25 %	50 %	0 %	525837408
17618	NC_021814	A	6	6	842797	842802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17619	NC_021814	AAAACA	2	12	842831	842842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17620	NC_021814	A	6	6	842887	842892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17621	NC_021814	TTA	2	6	842900	842905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17622	NC_021814	AAT	2	6	842912	842917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17623	NC_021814	CG	3	6	843060	843065	0 %	0 %	50 %	50 %	525840630
17624	NC_021814	CGT	2	6	843085	843090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840630
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17745	NC_021814	TGT	2	6	848230	848235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837409
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17852	NC_021814	GCG	2	6	853129	853134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837411
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17856	NC_021814	ATC	2	6	853362	853367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837411
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17862	NC_021814	GCA	3	9	853579	853587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837411
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17970	NC_021814	AAT	2	6	858164	858169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17971	NC_021814	CAA	2	6	858212	858217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17972	NC_021814	TAAC	2	8	858287	858294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17973	NC_021814	GGGC	2	8	858312	858319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17974	NC_021814	TCG	2	6	858328	858333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17981	NC_021814	GAA	2	6	858516	858521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837417
17982	NC_021814	AT	3	6	858563	858568	50 %	50 %	0 %	0 %	525837417
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17985	NC_021814	GC	3	6	858641	858646	0 %	0 %	50 %	50 %	525837417
17986	NC_021814	CGT	2	6	858687	858692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417
17987	NC_021814	A	6	6	858693	858698	100 %	0 %	0 %	0 %	525837417
17988	NC_021814	CTGG	2	8	858725	858732	0 %	25 %	50 %	25 %	525837417
17989	NC_021814	TGG	3	9	858765	858773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837417
17990	NC_021814	GCA	2	6	858788	858793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837417
17991	NC_021814	ACG	2	6	858804	858809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837417
17992	NC_021814	CTGAA	2	10	858829	858838	40 %	20 %	20 %	20 %	525837417
17993	NC_021814	ACG	2	6	858900	858905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837417
17994	NC_021814	CGGCTC	2	12	858916	858927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525837417
17995	NC_021814	CGG	2	6	858949	858954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837417
17996	NC_021814	CGG	3	9	858976	858984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837417
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17998	NC_021814	CTG	2	6	859108	859113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417
17999	NC_021814	TGA	2	6	859132	859137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837417
18000	NC_021814	CTG	2	6	859151	859156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417

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